Thiamine pyrophosphate (TPP) riboswitches are the only riboswitch class identified in eukaryotes. They therefore provide a unique model for reconstructing the evolution of RNA-based gene regulation across life's domains. We investigated the molecular evolution, structural diversification, and genomic-context reassignment of the TPP riboswitch across archaea, bacteria, cyanobacteria, fungi, algae, and land plants using phylogenetic reconstruction, covariance-model-guided sequence analysis, comparative secondary-structure analysis, genomic-context annotation, and covariation-based inference. Our
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A longitudinal study was designed in five dairy cattle farms to assess the within-farm dynamics of ESBL-/AmpC-/carbapenemase-producing E. coli and their resistance profiles, along with the genes conferring the resistance phenotypes. Twelve samplings were performed over a period of 16 months, collecting rectal feces from apparently healthy animals in three age groups (calves, heifers, and lactating cows) that were subjected to selective isolation in cefotaxime-containing media. Minimum inhibitory concentrations were determined by broth microdilution for 197 cefotaxime-resistant E. coli (1-3 iso
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Carbapenem-resistant Klebsiella aerogenes (CRKA) has posed a serious threat for clinical anti-infective therapy. However, the molecular characteristics of CRKA in Shanghai are rarely reported. Objective: This study aimed to investigate the resistance profiles, dissemination mechanism, and molecular characteristics of CRKA strains isolated from children in a pediatric hospital, Shanghai. Method: Fifty CRKA isolates were collected in 2019. Antimicrobial susceptibility of the strains was determined by broth microdilution method. The β-lactamases and outer membrane porin genes were cha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of blaNDM particularly in Gram-negative bacteria is a burden on the health care system in developing countries. Hence, this study was initiated to screen New Delhi Metallo-β-lactamase (NDM)-producing Gram-negative bacterial strains from neonatal intensive care unit (NICU) of an Indian Hospital. A total of 18 blaNDM-producing isolates were detected in the present study. Out of 18 blaNDM variant isolates, 6 were Klebsiella pneumoniae, 4 Escherichia coli, 2 Enterobacter aerogenes, 1 Acinetobacter lwoffii, 1 Enterobacter cloacae, 3 Acinobacter baumannii, and 1 Cedecea davisae from NI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The emergence and diffusion of strains of pathogenic bacteria resistant to antibiotics constitutes a real public health challenge. Antibiotic resistance genes (ARGs) can be carried by both pathogenic and non-pathogenic bacteria, including commensal bacteria from the human microbiota, which require special monitoring in the fight against antimicrobial resistance.
METHODS: We analyzed the proteomes of 335 new bacterial species from human microbiota to estimate its whole range of ARGs using the BLAST program against ARGs reference databases.
RESULTS: We found 278 bacteria that harbo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence and spread of carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae (CR-hvKP) is causing worldwide concern. Sequence type (ST) 86 K. pneumoniae, a major hvKP clone, is rarely resistant to carbapenem. In this study, we report the genomic features and virulence characteristics of a community-acquired bloodstream infection (CA-BSI)-causing CR-hvKP ST86 strain (KPN55602). This strain is resistant to carbapenem but sensitive to amikacin, gentamicin, tigecycline, and colistin. According to in vitro and in vivo virulence assessments, it was classified as hypervirulent. Whole-genome s
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thiamine (vitamin B1) biosynthesis involves enzymatic activities that exhibit remarkable diversity across the tree of life, including deep sequence divergence, domain rearrangements, lineage-specific duplications and losses, and horizontal gene transfer events. These features complicate computational inference based on single evidence types. This chapter describes a reproducible, modular bioinformatics workflow for pathway-scale comparative analysis of thiamine biosynthesis genes across Bacteria, Archaea, and Eukarya. The workflow integrates four complementary evidence streams: (i) profile-bas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The escalating rise of multi-drug-resistant (MDR) bacterial strains significantly threatens global health, creating a "silent pandemic" prompted by natural selection, gene mutation, and horizontal gene transfer. This crisis is worsened by the deficit in the development of new treatments, necessitating the innovative discovery of new potent antibacterial agents.
OBJECTIVE: This review examines animal venom, a complex mixture of an evolutionary array of bioactive molecules, as an important emergent source of broad-spectrum antimicrobial peptides (AMPs), creating potential drug templ
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis infections cause chronic and debilitating diseases of the eye and genital tract. Recent data suggest that infections are common at other tissue sites, including the lower intestinal tract of both men and women. Our previous work demonstrated tropism-predicting sequences in male rectal isolates, with modification in the PmpE sequence and predicted structure being highly correlated with male rectal infection. An expanded collection of strains from five different tissue sites was used to identify novel tropism-predicting markers for the different tissues. These data demonstr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae, a waterborne pathogen, causes global cholera pandemics. Data on its prevalence and antimicrobial resistance in Chinese aquatic products are limited, highlighting an urgent need for systematic surveillance. We isolated fifteen V. cholerae (25.86%, 15/58) strains isolated from Macrobrachium rosenbergii (giant freshwater prawn) collected in Zhejiang Province, China, between 2024 and 2025. The antimicrobial resistance phenotype and genotype of V. cholerae strains were characterized. Ampicillin (100%), colistin (100%), trimethoprim-sulfamethoxazole (93.33%), ceftiofur (93.33%), cef
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An extensive use of antibiotics has evolved bacterial antimicrobial resistance (AMR) and its spread through horizontal gene transfer within microbial communities of the natural environment. The water bodies receiving wastewater from sewage treatment plant (STP) serve as a conducive reservoir for the spread of antibiotic-resistant bacteria (ARB). This study revealed occurrence of multidrug-resistant and extended spectrum β-lactamase (ESBL) producing bacteria present in STP inlet (SI1), outlet (SO1), riverine environment receiving the STP wastewater (MP1), and control site (C1) of the river Moha
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rising antimicrobial resistance (AMR) is an enormous challenge for global healthcare systems. The effects of elevated CO2 (eCO2) on AMR are poorly characterized. Using a free-air CO2 enrichment system and high-throughput qPCR arrays, we investigated the response of soil antibiotic resistome and bacterial communities to eCO2 (ambient + 200 ppm) in soils amended with sulfamethazine (SMZ) at 0.1 and 1 mg kg-1 via chemical-organic fertilizer (COL, COH). Results showed that under ambient condition, COH significantly enhanced the diversity of high-risk antibiotic resistance genes (ARGs), relative ab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mercury (Hg) methylation is a microbially mediated process that produces methylmercury (MeHg), a bioaccumulative neurotoxin. A highly conserved gene pair, hgcAB, is required for Hg methylation, which provides a basis for identifying Hg methylators and evaluating their genomic composition. In this study, we conducted a large-scale omics analysis in which 281 metagenomic freshwater and marine sediment samples from 46 geographic locations across the globe were queried. Specific objectives were to examine the prevalence of Hg methylators, to identify horizontal gene transfer (HGT) events involving
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among the quinolones, fluoroquinolones are broad spectrum antimicrobial agents used for treating many clinical infections including Salmonellosis. Although high level of resistance to fluoroquinolones remains low in Salmonella but reduced susceptibility is increasing worldwide. Plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) of qnr type (qnrA, B and S) has been identified now a day in several enterobacterial species including Salmonella spp. This cross-sectional study was held at department of Microbiology, Mymensingh Medical College, Mymensingh, Bangladesh from March 2019 to February 2020. This
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prophage 919TP is widely distributed among Vibrio cholera and is induced to produce free φ919TP phage particles. However, the interactions between prophage φ919TP, the induced phage particle, and its host remain unknown. In particular, phage resistance mechanisms and potential fitness trade-offs, resulting from phage resistance, are unresolved. In this study, we examined a prophage 919TP-deleted variant of V. cholerae and its interaction with a modified lytic variant of the induced prophage (φ919TP cI-). Specifically, the phage-resistant mutant was isolated by challenging a prophage-deleted va
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aims of this study were to evaluate the prevalence of Salmonella spp., including S. Enteritidis and S. Typhimurium, their antibiotic resistance profiles, and the presence/absence of class 1 integron (intI1) in 50 raw ground beef and 50 raw, meatball samples collected in the Samsun Province, Turkey. For the detection of Salmonella, conventional culture technique and PCR assay were used. The antibiotic resistance profiles of the isolates against nine antibiotics were tested. Salmonella spp. was detected in 20 (n = 86 isolates) samples, namely 12 ground beef and 8 meatball samples. Salmonella
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During a decade-long, high endemic situation with severe group A streptococcal disease in western Norway, a cluster of 16 patients with invasive streptococcal disease was hospitalized during a period of 11 weeks. A study including clinical characteristics and molecular epidemiology of the outbreak was initiated. Relevant clinical information was obtained from the medical records of the patients. Nine of the 16 patients had soft tissue infection, and seven of these had streptococcal toxic shock syndrome (STSS). Mortality, both overall and among those with STSS, was 25%. Streptococcal isolates f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acidaminococcus fermentans belongs to the group of strictly anaerobic gram-negative cocci. All previously described Acidaminococcus strains are susceptible to beta-lactam antibiotics. An A. fermentans strain (RYC-MR95) resistant to penicillin and expanded-spectrum cephalosporin (amoxicillin and cefotaxime MICs, 64 microgram/ml) was isolated from a human perianal abscess. A fragment encoding a beta-lactamase from genomic DNA was cloned in Escherichia coli K-12 strain HB101, and the recombinant strain expressed resistance to amoxicillin (MIC, 1,024 microgram/ml) and cefotaxime (MIC, 4 microgram/
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the present study was to investigate, for the first time, the diversity of the genes encoding aminoglycoside-modifying enzymes (AME) and their association with class 1 integrons in Iranian Acinetobacter baumannii strains. A total of 100 multidrug resistant A. baumannii, isolated from eight distinct hospitals in Tehran, were enrolled in this study. Susceptibility of these isolates to antimicrobial agents including gentamicin and amikacin was determined by E-test. Aminoglycoside resistant isolates were then tested by PCR for AME genes, including aphA6, aacC1, aacC2, aacA4, aadB, aadA1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria gonorrhoeae can acquire antimicrobial resistance (AMR) through horizontal gene transfer (HGT) from other Neisseria spp. such as commensals like Neisseria subflava. Low doses of antimicrobials in food could select for AMR in N. subflava, which could then be transferred to N. gonorrhoeae. In this study, we aimed to determine the lowest concentration of ciprofloxacin that can induce ciprofloxacin resistance (minimum selection concentration-MSC) in a N. subflava isolate (ID-Co000790/2, a clinical isolate collected from a previous community study conducted at ITM). In this study, Neisseri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования