BackgroundRecent technologies enabling the study of spatial biology include multiple high-dimensional spatial imaging methods that have rapi … ocol for processing FFPE bone marrow core specimens to preserve nucleic acids for effective spatial proteomics and transcriptomics. This study characterizes a multicancer tissue microarray (TMA) and a molecular- and protein-friendly decalcification protocol that supports downstream spatial biology investigations.MethodsWe developed a multi-cancer tissue micr …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanocytes play a crucial role in skin pigmentation and protection against UV radiation. Understanding the molecular mechanisms regulating melanocyte function is essential for elucidating skin pigmentation disorders and melanoma progression. This protocol details a comprehensive methodology for characterizing the cell surface subproteome of melanocytes and melanoma cell lines, utilizing aminooxy biotinylation followed by mass spectrometry analysis. The initial step involves selectively labeling cell surface proteins with aminooxy biotin on live melanocytes and melanoma cell lines to specifica
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rising incidence of fluconazole-resistant C. albicans presents a substantial challenge to global health, especially in resource-limited settings.
AIM: To delineate the proteomic and β-hydroxybutyrylome changes associated with fluconazole resistance and identify potential novel therapeutic approaches.
METHODS: We performed comprehensive proteomic and β-hydroxybutyrylome analyses on fluconazole-resistant and -susceptible C. albicans strains. Lysine β-hydroxybutyrylation levels were quantified using Western blotting (WB), and the synergistic interactions between β-hydroxybutyrat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xiaoaiping (XAP) Injection demonstrates the anti-prostate cancer (PCa) effects, yet the underlying mechanism remains unclear. This study aims to investigate the impact of XAP on PCa and elucidate its mechanism of action. PCa cell proliferation was evaluated using a cell counting kit-8 (CCK-8) assay. Cell apoptosis was assessed through Hoechst staining and Western blotting assays. Proteomics technology was employed to identify key molecules and significant signaling pathways modulated by XAP in PCa cells. To further validate potential key genes and important pathways, a series of assays were co…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify and validate novel biomarkers for the early diagnosis of sepsis-associated acute kidney injury (SA-AKI) and precise continuous renal replacement therapy (CRRT) using proteomics.
METHODS: A prospective multicenter cohort study was conducted. Patients with sepsis admitted to five hospitals in Taizhou City of Zhejiang Province from April 2019 to December 2021 were continuously enrolled, based on the occurrence of acute kidney injury (AKI). Sepsis patients were divided into SA-AKI group and non-SA-AKI group, and healthy individuals who underwent physical examinations during…
СтатьяМногоцентровое исследованиеАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ability to bring spatial resolution to omics studies enables a deeper understanding of cell populations and interactions in biological tissues. In the case of proteomics, single-cell and spatial approaches have been particularly challenging, due to limitations in sensitivity and throughput relative to other omics fields. Recent developments at the level of sample handling, chromatography, and mass spectrometry have set the stage for proteomics to be established in these new disciplines.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Single ventricle congenital heart disease like hypoplastic left heart syndrome with a Fontan circulation constitutes, the largest group of children hospitalized with circulation failure, experiencing an in-hospital mortality rate of 20% to 50%. We investigated the mechanisms leading to Fontan failure to identify novel therapeutic targets.
METHODS: Blood was collected from patients with hypoplastic left heart syndrome post-Fontan and controls (n=6/group). Plasma microvesicles were isolated, and proteomics assessed using data-independent acquisition mass spectroscopy. Dysregulated p…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Snake envenomation is a major public health issue in Nigeria, primarily due to bites from Echis ocellatus, Naja nigricollis, and Bitis arietans. Understanding their venom composition is essential for effective antivenom development. This study characterizes and compares the venom proteomes of these snakes using iTRAQ-based proteomics, focusing on key toxin families and their relative abundances. Methods: Venom samples were ethically collected from adult snakes, pooled by species, lyophilized, and stored for proteomic analysis. Proteins were extracted, digested with trypsin, and lab…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Radiation cystitis (RC) is a chronic debilitating complication that impacts 8-11% of patients with prostate cancer (PCa) after radiotherapy … abrogated by the CRISPR/Cas9-mediated deletion of MPO or the EV release regulator Rab27α. Serum EV proteomics from these same patients further validated the neutrophil-related RC risk signature, and enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) gave additional support to MPO and other neutrophil-related proteins, including defensin α3 (DEFA3) and neutrophil e …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The tissues of origin and molecular mechanisms underlying human complex diseases remain incompletely understood. Previous studies have leveraged transcriptomic data to interpret genome-wide association studies (GWASs) for identifying disease-relevant tissues and fine-mapping causal genes. However, according to the central dogma, proteins more directly reflect cellular molecular activities than RNA. Therefore, in this study, we integrated proteomic data with GWAS to identify disease-associated tissues and genes.
METHODS: We compiled proteomic and paired transcriptomic data for 12,2
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral infections are commonly diagnosed by the detection of viral genome fragments or proteins using targeted methods such as PCR and immunoassays. In contrast, metagenomics enables the untargeted identification of viral genomes, expanding its applicability across a broader spectrum. In this study, we introduce proteomics as a complementary approach for the untargeted identification of human-pathogenic viruses from patient samples. The viral proteomics workflow (vPro-MS) is based on an in-silico derived peptide library covering the human virome in UniProtKB (331 viruses, 20,386 genomes, 121,97…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABSTRACT: Ductal carcinoma in situ (DCIS) is the most common type (80%) of noninvasive breast lesions in women. The lack of validated prognostic markers, limited patient numbers, and variable tissue quality have a significant impact on the diagnosis, risk stratification, patient enrollment, and results of clinical studies. In this study, we performed label-free quantitative proteomics on 50 clinical formalin-fixed, paraffin-embedded biopsies, validating 22 putative biomarkers from independent genetic studies. Our comprehensive proteomic phenotyping reveals more than 380 differentially expresse…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrial fibrillation (AF) is a common cardiac arrhythmia with strong genetic components, yet its underlying molecular mechanisms and potential therapeutic targets remain incompletely understood. We conducted a cross-population genome-wide meta-analysis of 168,007 AF cases and identified 525 loci that met genome-wide significance. Two loci of PITX2 and ZFHX3 genes were identified as shared across populations of different ancestries. Comprehensive gene prioritization approaches reinforced the role of muscle development and heart contraction while also uncovering additional pathways, including cel
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Essential tremor (ET) stands as one of the most prevalent movement disorders originating from cerebellar dysfunction. However, effective treatment remains limited, largely due to a poor understanding of its molecular pathology. The harmaline-induced tremor in mice is a well-established model for ET research, though its mechanisms remain unclear. This study aimed to get insight into the molecular intricacies underlying cerebellar dysfunction in this model. Combining LC-MS/MS and RNA-Seq approach, we delved into the cerebellar alterations in harmaline-induced tremor in mouse. Multi-omics profili
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic hepatitis B (CHB) is clinically classified into different clinical stages during which dynamic interactions occur among the virus, host immune system, and hepatic tissue. The lack of systematic proteomic analysis of liver tissue and functional change characteristics across different stages of CHB has prevented the provision of novel critical clues for precise staging interventions in HBV infection. In this study, we performed the first comprehensive proteome comparison of liver tissue across four clinical phases of CHB: the immune-tolerant (IT) phase, immune-active (IA), inactive carri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the last decade, advanced developments of mass spectrometry-based assays have made spatial measurements of hundreds of metabolites and thousands of proteins not only possible, but routine. The information obtained from such mass spectrometry imaging experiments traces metabolic events and helps decipher feedback loops across anatomical regions, connecting genetic and metabolic networks that define phenotypes. Herein we overview developments in the field over the past decade, highlighting several case studies demonstrating direct measurement of metabolites, proteins, and proteoforms from thi
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In crime investigations, the unambiguous identification of biological traces can be decisive for framing the events. In this study, we applied proteomics to analyze scant amounts of biological residues in the context of an alleged rape case, focusing on the detection of traces of vomit. We used high-performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry (HPLC-MS/MS) and two distinct proteomic workflows to identify proteins and possible proteolytic peptides in biological residues from clothing, bedding, and car upholstery from the alleged crime scene. Specifically, a fragment of pillowcase …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pulmonary arterial hypertension (PAH) ultimately leads to right ventricular failure and premature death. The identification of circulating biomarkers with prognostic utility is considered a priority. As chronic inflammation is recognized as key pathogenic driver, we sought to identify inflammation-related circulating proteins that add incremental value to current risk stratification models for long-term survival in patients with PAH.
METHODS AND RESULTS: Plasma levels of 384 inflammatory proteins were measured with the proximity extension assay technology in patients with PAH (n=6
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Primary aldosteronism (PA), a significant cause of secondary hypertension affecting ∼10% of patients with severe hypertension, exacerbates cardiovascular, and cerebrovascular complications even after blood pressure control. PA is categorized into two main subtypes: unilateral aldosterone-producing adenomas (APA) and bilateral hyperaldosteronism (BHA), each requiring distinct treatment approaches. Accurate subtype classification is crucial for selecting the most effective treatment. The goal of this study was to develop novel blood-based proteomic biomarkers to differentiate between
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid and comprehensive analysis of complex proteomes across large sample sets is vital for unlocking the potential of systems biology. We present UFP-MS, an ultra-fast mass spectrometry (MS) proteomics method that integrates narrow-window data-independent acquisition (nDIA) with short-gradient micro-flow chromatography, enabling profiling of >240 samples per day. This optimized MS approach identifies 6,201 and 7,466 human proteins with 1- and 2-min gradients, respectively. Our streamlined sample preparation workflow features high-throughput homogenization, adaptive focused acoustics (AFA)-ass…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования