Cystic Fibrosis is an autosomal recessive disorder caused by mutations in the CFTR gene. CRISPR mediated, template-dependent homology-directed gene editing has been used to correct the most common mutation, c.1521_1523delCTT / p.Phe508del (F508del) which affects ~70% of individuals, but the efficiency was relatively low. Here, we describe a high efficiency strategy for editing of three different rare CFTR mutations which together account for about 3% of individuals with Cystic Fibrosis. The mutations cause aberrant splicing of CFTR mRNA due to the creation of cryptic splice signals that result
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AfrAbia (Sub-Saharan Africa and Arab world), is undergoing a significant demographic shift characterized by increased longevity and rising dementia rates. Despite this, molecular insights into brain aging in these regions, especially in RNA processing pathways like alternative splicing (AS), are virtually absent. AS promotes transcriptomic and proteomic complexity and is pivotal for brain function, with its dysregulation connected to neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease (AD), frontotemporal dementia (FTD), and Parkinson's disease (PD). However, current knowledge is overwhelmi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ring sideroblasts show abnormal mitochondrial iron accumulation, and their emergence in the bone marrow is a characteristic of sideroblastic … g with specific somatic mutations in splicing factor 3b subunit 1 (SF3B1), which is involved in the RNA splicing machinery. Recent reports have indicated that common defects in iron/heme metabolism underlie in the mechanisms of ring sideroblast formation in congenital and acquired SAs. Current understanding of SA pathophysiology, including the mechanisms of ri …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fragile X syndrome (FXS) is a neurodevelopmental disorder caused by loss of fragile X messenger ribonucleoprotein (FMRP). In most cases, this results from a CGG expansion exceeding 200 repeats in the 5' untranslated region of the fragile X messenger ribonucleoprotein 1 (FMR1) gene, known as the "full mutation". While the trinucleotide expansion has long been thought to induce epigenetic silencing of this locus, studies have shown that many males with a full mutation still express FMR1 mRNA. However, these individuals produce little to no FMRP protein, due to mechanisms that remain
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RBFOX1 is an RNA-binding protein that regulates alternative splicing and RNA processing in the neurons, skeletal muscle, and heart. We intended to define the role of RBFOX1 in regulating calcium homeostasis to maintain normal cardiac function. We generated cardiomyocyte-specific Rbfox1 gene-deletion mice (cKO). The cardiomyocyte-specific deletion of RBFOX1 was confirmed by Western blotting and immunohistochemistry. The cKO mice showed mild hypertrophy and depressed cardiac function under homeostatic conditions, which did not deteriorate with age. Pressure overload by trans-aortic constriction
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in RNA binding motif protein 20 (RBM20) are a common cause of familial dilated cardiomyopathy (DCM). Many RBM20 mutations cluster within an arginine/serine-rich (RS-rich) domain, which mediates nuclear localization. These mutations induce RBM20 mis-localization to form aberrant ribonucleoprotein (RNP) granules in the cytoplasm of cardiomyocytes and abnormal alternative splicing of cardiac genes, contributing to DCM. We used adenine base editing (ABE) and prime editing (PE) to correct pathogenic p.R634Q and p.R636S mutations in the RS-rich domain in human isogenic induced pluripotent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA sequencing (RNA-Seq) and mass-spectrometry-based proteomics data are often integrated in proteogenomic studies to assist in the prediction of eukaryote genome features, such as genes, splicing, single-nucleotide (SNVs), and single-amino-acid variants (SAAVs). Most genomes of parasite nematodes are draft versions that lack transcript- and protein-level information and whose gene annotations rely only on computational predictions. Angiostrongylus costaricensis is a roundworm species that causes an intestinal inflammatory disease, known as abdominal angiostrongyliasis (AA). Currently, there i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homozygous mutation of the RNA kinase CLP1 (cleavage factor polyribonucleotide kinase subunit 1) causes pontocerebellar hypoplasia type 10 ( … motor neurons and neurons of the deep cerebellar nuclei. To explore whether Clp1 mutation impacts tRNA splicing, we profiled the products of intron-containing tRNA genes. While mature tRNAs were expressed at normal levels in mutant mice, numerous other products of intron-containing tRNA genes were dysregulated, with pre-tRNAs, introns, and certain tRNA fragme …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myotonic dystrophy type 1 (DM1), the most common adult muscular dystrophy, is an autosomal dominant disorder caused by an expansion of a (CTG)n tract within the 3' untranslated region (3'UTR) of the dystrophia myotonica protein kinase (DMPK) gene. Mutant DMPK mRNAs are toxic, present in nuclear RNA foci and correlated with a plethora of RNA splicing defects. Cardinal features of DM1 are myotonia and cardiac conduction abnormalities. Using transgenic mice, we have demonstrated that expression of the mutant DMPK 3'UTR is sufficient to elicit these features of DM1. Here, using these mice, we pres…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-coding RNAs are emerging as critical molecules in the genesis, progression, and therapy resistance of cutaneous melanoma. This includes circular RNAs (circRNAs), a class of non-coding RNAs with distinct characteristics that forms through non-canonical back-splicing. In this review, we summarize the features and functions of circRNAs and introduce the current knowledge of the roles of circRNAs in melanoma. We also highlight the various mechanisms of action of the well-studied circRNA CDR1as and describe how it acts as a melanoma tumor suppressor. We further discuss the utility of circRNAs a
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
When stress strikes, cells initiate adaptive responses, including perturbation of RNA splicing, modulation of nuclear RNA export, and formation of stress granules (SGs). Despite their central role, the composition and regulation of fungal SGs remain poorly understood. Here, we report the formation of heat shock-induced SG-like structures in Fusarium graminearum. Through purification of SG-like structures followed by RNA-sequencing, we performed a transcriptome-wide characterization of their associated transcripts and found that heat shock induces a distinct enrichment of intron-containing tran…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cellular protein, previously described as p35/38, binds to the complementary (-)-strand of the leader RNA and intergenic (IG) sequence of … RNP A1 shuttles between the nucleus and cytoplasm and plays a role in the regulation of alternative RNA splicing. The MHV(-)-strand leader and IG sequences conform to the consensus binding motifs of hnRNP A1. Recombinant hnRNP A1 bound to these two RNA regions in vitro in a sequence-specific manner. During MHV infection, hnRNP A1 relocalizes from the nucleus t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DEAD Box RNA helicases are essential enzymes that are involved in RNA metabolic processes such as transcription, pre-mRNA splicing, translation initiation and RNA decay. We have previously over-expressed and biochemically characterized an immunodominant cDNA clone encoding DEAD box RNA helicase (BmL3-Helicase) isolated by immunoscreening of the larval stage cDNA library of Brugia malayi. In the current study, the 3D structure was determined and the immunoprophylactic efficacy of BmL3-Helicase was investigated by immunizing Mastomys coucha with the recombinant protein and subsequently challengi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this issue, Wally et al. (2008) report successful gene expression repair by spliceosome-mediated RNA trans-splicing (SMaRT), a novel achievement in molecular medicine. In their model, SMaRT was able to replace a mutation of the plectin gene in epidermolysis bullosa simplex with muscular dystrophy. This approach is particularly attractive for skin gene therapy of dominant-negative mutations present in a number of blistering genodermatoses.
КомментарийСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a key N6-methyladenosine (m6A)-binding protein, YT521-B Homology (YTH) Domain-Containing Protein 2 (YTHDC2) plays a central role in the epitranscriptomic regulatory network. This protein specifically recognizes and binds to m6A modification sites on RNA molecules through its highly conserved YTH domain. This recognition exhibits high selectivity and affinity, thereby enabling precise control over the fate of target RNAs. At the molecular level, YTHDC2 is widely involved in various stages of the RNA life cycle, including core biological processes such as RNA splicing and processing, nuclear-…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The splicing factor SRSF1 emerges as a mater regulator of cell proliferation, displaying high expression in actively proliferative satellite cells (SCs). In SRSF1 knockout mice (KO) generated via MyoD-Cre, early mortality and muscle atrophy are observed during postnatal muscle growth. Despite these findings, the precise mechanisms through which SRSF1 loss influences SCs' functions and its role in muscle regeneration remain to be elucidated.
METHODS: To unravel the exact mechanisms underlying the impact of SRSF1 deficiency SC functions, we employed single-cell RNA sequencing (scRNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The NSUN2-intellectual disability syndrome is a rare disorder of the cellular transcriptome that prevents proper t-RNA splicing. This disorder interrupts cellular function and leads to an accumulation of RNA fragments, producing a constellation of symptoms including dysmorphic facies, hypotonia, microcephaly, and short stature. Eye manifestations have been reported but not well characterized. Our study presents a new case involving a 4-year-old boy with novel NSUN2 variants and clinical features consistent with the syndrome. In addition, through a systemic review, we discuss the 24 previously …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is an age-related neurodegenerative disorder characterized by neuronal and synaptic loss in the brain, which leads to cognitive impairment and dementia. Therefore, early diagnosis by employing various biomarkers is crucial for preventing and treating AD. Although retinal pathology is an emerging biomarker associated with AD, detailed molecular mechanisms of retinal impairments remain unclear. Herein, we identified genome-wide dysfunction of alternative splicing in the early stage of 5xFAD transgenic mouse retina by performing RNA sequencing analysis. Notably, retained
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Granulosa cell abnormalities are characteristics of premature ovarian insufficiency (POI). Abnormal expression of serine/arginine-rich splicing factor 1 (SRSF1) can cause various diseases, but the role of SRSF1 in mouse granulosa cells remains largely unclear. In this study, we found that SRSF1 was expressed in the nuclei of both mouse oocytes and granulosa cells. The specific knockout of Srsf1 in granulosa cells led to follicular development inhibition, decreased granulosa cell proliferation, and increased apoptosis. Gene Ontology (GO) analysis of RNA-seq results revealed abnormal expression
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The U1 small nuclear RNA (snRNA) forms ribonucleoprotein particles (RNPs) such as U1 snRNP and U1-TAF15 snRNP. U1 snRNP is one of the most studied RNPs due to its critical role in pre-mRNA splicing in defining the 5' splice site (5'ss) of every exon through direct interactions with sequences at exon/intron junctions. Recent reports support the role of U1 snRNP in all steps of transcription, namely initiation, elongation, and termination. Functions of U1-TAF15 snRNP are less understood, though it associates with the transcription machinery and may modulate pre-mRNA splicing by int…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования