Genomics has emerged as a powerful tool for addressing the global scenario of antimicrobial resistance (AMR) in the world. The chances of st … sistance genes namely mphA, sul1, blaCMY-59, qnrS1, and tetA on predominantly IncF (IA, IB, IC, II) replicons. Resistance genes and mobile genetic elements (IS3, IS5, and IS66) were classified by co-location confidence. Potential transmission events and co-circulation both within and across niches were indicated by overlapping clusters. Genomic clustering …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nitrofurantoin is an antibiotic that demonstrates good efficacy in the treatment of uncomplicated urinary tract infections (UTIs … ty islands (PAIs) IV536, ICFT073, IICFT073, and I536 were variably present. Incompatibility plasmid replicons Frep, FII, FIA, FIB, I1, and A/C were detected across isolates. Virulence-associated genes (VAGs) including iutA, fyuA, papG, traT, fimH, kpsMT II, papC, and afa/draBC were identified.
CONCLUSION: We concluded that in our studied isolates, deleter …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recovery and characterization of a multidrug-resistant, KPC-3-producing Klebsiella michiganensis that was obtained from Venus clam samples is reported in this study. A whole-genome sequencing (WGS) analysis using Illumina and Nanopore technologies of the K. michiganensis 23999A2 isolate revealed that the strain belonged to the new sequence type 382 (ST382) and carried seven plasmid replicon sequences, including four IncF type plasmids (FII, FIIY, FIIk, and FIB), one IncHI1 plasmid, and two Col plasmids. The FIB and FIIk plasmids showed high homology to each other and to multireplicon pKpQI…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nontyphoidal Salmonella (NTS) is the most reported cause of bacterial foodborne zoonoses in Vietnam, and contaminated pork is one of the mai … The observed phenotype and genotype of antimicrobial resistance were not always concordant. Plasmid replicons were found in almost all strains [95.6% (22/23)], and the phylogenetic analysis detected nine clusters (S. Derby, n = 5; S. Rissen, n = 4). ARGs and plasmid content were almost identical within clusters. We found six MDR IncHI1s with identical plas …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Hepatitis C virus (HCV) is one of the leading causes of chronic liver inflammatory disease (hepatitis), which often leads to mor … ls. To understand the molecular basis of TGF-β1 production in HCV-infected hepatocytes, we used HCV replicons and various stable cell lines. Finally, we elucidated that HCV E2 triggered TGF-β1 secretion via GRP94 mediated NF-κB activation. This study contributes to the understanding of liver fibrosis by HCV and suggests a new potential target (GRP94) for b …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human papillomavirus-16 (HPV-16) genomes in cell culture and in situ are affected by polymorphic methylation patterns, which can repress the … products. Our data support a model wherein (i) the DNA methylation state of extrachromosomal HPV16 replicons and epithelial differentiation are inversely coupled during the viral life cycle, (ii) integration of the viral genome into the host chromosome events leads to an alteration in methylation patterns on the viral genome that is dependent upon the typ …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha/beta interferons (IFN-alpha/beta) are key mediators of the innate immune response against viral infection. The ability of viruses to circumvent IFN-alpha/beta responses plays a crucial role in determining the outcome of infection. In a previous study using subgenomic replicons of the Kunjin subtype of West Nile virus (WNV(KUN)), we demonstrated that the nonstructural protein NS2A is a major inhibitor of IFN-beta promoter-driven transcription and that a single amino acid substitution in NS2A (Ala30 to Pro [A30P]) dramatically reduced its inhibitory effect (W. J. Liu, H. B. Chen, X. J. Wan…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carbapenemase-producing bacteria represent a critical global public health threat, yet their presence and molecular characterist … rboring the intrinsic carbapenemase bla POM-1. The K. pneumoniae isolate contained multiple plasmid replicons and a broad resistome. Virulence analysis revealed a complete yersiniabactin locus, enterobactin operon, ompA, and ECP-like pilus genes. Comparative genomic analysis demonstrated that the bla NDM-5 genetic environment was highly conserved and nearl …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella Typhimurium (S. Typhimurium) is a leading cause of bacterial gastroenteritis worldwide, and its escalating antimicrobial resistan … chloramphenicol, trimethoprim-sulfamethoxazole, and tetracycline (Kappa: 0.48-0.74). Twenty plasmid replicons were detected, with IncF (24.3%), IncI1-I (15.5%), and IncHI2 (13.6%) being the most prevalent. Notably, ARGs associated with resistance to critically important antibiotics (such as qnr variants, bla CTX-M and bla CMY-2 , and mphA/mrx) were freque …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Kentucky ST198 is a globally distributed, multidrug-resistant clone with growing concern due to its zoonotic pot … lar antimicrobial resistance and virulence genes profiles, with variable presence of SPI-4, plasmid replicons and integrons. Combined results from pan-genome analysis, core-genome phylogeny, and principal component analysis (PCA) indicated distinct source-associated clustering: poultry isolates formed a tightly clustered, highly clonal group; migratory bir …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Dublin (S. Dublin) is a cattle-adapted pathogen that can cause severe systemic infections in humans and animals. … were detected in only one cattle isolate. Plasmid analysis revealed that IncX1, IncFII(S), and IncC replicons were common among the isolates, highlighting their potential role in facilitating AMR dissemination via horizontal gene transfer. Virulence gene profiling revealed conserved Salmonella pathogenicity islands, type III and type VI secretion systems, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The global rise of extended-spectrum β-lactamase (ESBL) and plasmid-borne cephalosporinase (pAmpC) producing Enterobacterales is … al transmission based on comparisons of ESBL/pAmpC-Ec sequence types, resistance genes, and plasmid replicons. However, these findings were challenged by the introduction of more discriminating comparison methods such as whole-genome sequencing, which revealed a largely compartmentalized circulation of ESBL/pAmpC-Ec in HICs. Similar studies in low- and mid …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Intensive pig farming is a critical component of food security and economic activity in South Africa; however, it als … tified 24 genes, including toxins and adhesion factors. Mobile genetic elements included 24 plasmid replicons, 43 prophages, 19 insertion sequence families, and 7 class 1 integrons. The E. coli isolates belonged to a diverse range of sequence types, demonstrating significant genetic variability. Further phylogenomic analysis revealed eight major clades, wi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To analyze the phenotypic and genomic characteristics of a non-typhoidal Salmonella bile isolate from a patient with chronic diar … in the parC gene was detected in the quinolone resistance-determining region (QRDR). Three plasmid replicons (IncHI2/IncHI2A, IncR, IncN) and three insertion MGEs were predicted. Forty-two virulence genes were predicted, of which 25 were secretion and transporter genes, and ten were fimbrial adherence genes. Only one invasive protein-regulated gene(inv) w …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Antimicrobial resistant Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) includes uropathogenic E. coli (UPEC), the causative … different serotypes and 12 different sequence types being detected in this study. Twenty different replicons were also found, IncF1B being the most frequently detected. Different ExPEC virulent genes and virulence associated genes (VAGs) for iron acquisition, toxin production, invasion and other virulence determinants were detected.
CONCLUSIONS: Our resu …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes is a foodborne pathogen that poses threat to food safety and public health. Generally, the rates of resistance to cli … y of acquired MDR-carrying plasmids increased from 2017 to 2022, with an increased prevalence among replicons including rep26_2_repA, rep26_4_repA, and rep26_1_pli0070/rep32_1_pli0023. Importantly, compared to the dominant hypovirulent CC9, which contained premature stop codons in the internalin gene inlA associated with adhesion and invasion, the newly em …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Increasing antimicrobial resistance (AMR) is a global threat and wild migratory birds may act as mediators of resistant bacteria … abling hybrid assembly and determination of the genomic location of bla genes. Results: A rare multireplicon IncN+IncR was recovered from one isolate carrying bla CTX-M-1 in addition to aadA2b, lnu(F), and qnrS1. Moreover, rarely detected IncY plasmids in two isolates were found to harbor multiple resistance genes in addition to the human-associated bla CT …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli ST131 is a globally dispersed extraintestinal pathogenic E. coli lineage contributing significantly to hospital and communi … at the the ST131 population in Australia carries diverse antimicrobial resistance genes and plasmid replicons and indicate cross-species movement of ST131 strains across diverse reservoirs.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Napoli (S. Napoli) is among the top serovars causing human infections in Italy, alth … analysis and draft genome characterization in terms of Multi Locus Sequence Typing (MLST), plasmid replicons, Salmonella Pathogenicity Islands (SPIs), antimicrobial resistance genes (ARGs), phages, biocide and metal-tolerance genes confirm the high genetic variability of S. Napoli, also revealing a within-serovar phylogenetic structure more complex than p …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ralstonia picketti, Ralstonia mannitolilytica, and Ralstonia insidiosa have recently been regarded as emerging pathogens of infe … uencing using a HiSeq X10 Sequencer. Antimicrobial resistance genes, virulence factors, and plasmid replicons were identified from assembled genomes. A real-time RT-PCR experiment and a cloning experiment were conducted to explore the related class D β-lactamase-encoding genes.
RESULTS: Both patients recovered under therapy with antibiotics. Isolates were …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования