We used an oligonucleotide probe specific for a polymorphic sequence in the HLA-DQ beta gene to investigate the role of DQ polymorphism in genetic susceptibility to Felty's syndrome (FS) and rheumatoid arthritis (RA). The sequence of this gene was identified from a complementary DNA library derived from an RA patient's B lymphoblastoid cell line. With this probe, we studied the prevalence of the specific DQ beta allele in DR4 positive FS patients, RA patients, and normal control subjects. Significantly more FS patients (17 of 25) showed hybridization with this oligonucleotide probe, compared w
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A repetitive sequence element was cloned from the primary etiological agent causing bovine leptospirosis in North America, Leptospira interrogans serovar hardjo type hardjo-bovis. This element was used to design a sensitive diagnostic probe which distinguishes hardjo-bovis from other pathogenic leptospires which commonly infect domestic animals in North America and discriminates between hardjo-bovis and the reference strain for serovar hardjo, hardjoprajitno. By using this probe, it was possible to identify infected cattle shedding hardjo-bovis in their urine. This is the first practical demon
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human 8-oxoG DNA glycosylase 1 (hOGG1) is one of the important members of DNA glycosylase for Base excision repair (BER), the abnormal activity of which can lead to the failure of BER and the appearance of various diseases, such as breast cancer, bladder cancer, Parkinson's disease and lung cancer. Therefore, it is important to detect the activity of hOGG1. However, traditional detection methods suffer from time consuming, complicated operation, high false positive results and low sensitivity. Thus, it remains a challenge to develop simple and sensitive hOGG1 analysis strategies to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Double-stranded (ds) oligonucleotide probes composed of quencher-dye sequence pairs outperform analogous single-stranded (ss) probes due to their superior target sequence specificity without any prerequisite target labeling. Optimizing sequence combinations for dsprobe design requires promoting a fast, accurate response to a specific target sequence while minimizing spontaneous dsprobe dissociation events. Here, flow cytometry is used to rapidly interrogate the stability and selective responsiveness of 20 candidate LNA and DNA dsprobes to a 24 base-long segment of severe acute respiratory synd
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study explored state-related tendencies in DNA methylation in people with anorexia nervosa.
METHODS: We measured genome-wide DNA methylation in 75 women with active anorexia nervosa (active), 31 women showing stable remission of anorexia nervosa (remitted) and 41 women with no eating disorder (NED). We also obtained post-intervention methylation data from 52 of the women from the active group.
RESULTS: Comparisons between members of the active and NED groups showed 58 differentially methylated sites (Q < 0.01) that corresponded to genes relevant to metabolic and nutritional
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Thalassemia is a dangerous hematolytic genetic disease. In south China, ∼24% Chinese carry alpha-thalassemia or beta-thalassemia gene mutations. Given the fact that the invasive sampling procedures can only be performed by professionals in experienced centers, it may increase the risk of miscarriage or infection. Thus, most people are worried about the invasive operation. As such, a noninvasive and accurate prenatal diagnosis is needed for appropriate genetic counseling for families with high risks. Here we sought to develop capture probes and their companion analysis methods for the non
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A plethora of options to detect mutations in tumor-derived DNA currently exist but each suffers limitations in analytical sensitivity, cost, or scalability. Droplet digital PCR (ddPCR) is an appealing technology for detecting the presence of specific mutations based on a priori knowledge and can be applied to tumor biopsies, including formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) tissues. More recently, ddPCR has gained popularity in its utility in quantifying circulating tumor DNA.
METHODS: We have developed a suite of novel ddPCR assays for detecting recurrent mutations that are preva
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To evaluate the association of oral Treponema (T.) spp. with severity of canine periodontitis, subgingival plaque samples of dogs of various breeds undergoing surgery were investigated. A wide range of oral Treponema spp. was analysed by a molecular and culture-independent approach applying DNA-DNA dot blot hybridization analysis and fluorescence in situ hybridization using Treponema specific oligonucleotide probes specific for phylogenetic groups I-VII of oral treponemes as well as probes specific for T. socranskii and T. denticola. To assess the periodontal status of affected dogs clinical p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Growth arrest and DNA damage inducible gene 153 (gadd153) is expressed at very low levels in growing cells but is markedly induced in response to cellular stresses, including glucose deprivation, exposure to genotoxic agents, and other growth-arresting situations. Forced expression of GADD153 can induce cell cycle arrest and/or apoptosis in many types of cells. Recently, we reported that GADD153 was induced in vascular smooth muscle cells (VSMCs) in neointimal lesions of balloon-injured carotid arteries. To investigate the underlying molecular mechanisms of gadd153 gene expression in VSMCs, we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transcriptional activities of genes require intermediary regulators (nuclear factors) that bind to specific segments of nuclear DNA. A method to localize in situ the distribution of these factors using nonradioactive oligonucleotides in paraffin wax-embedded tissues is described. The distribution of two nuclear factors, activated protein-1 (AP-1) and nuclear factor-kappaB (NF-kappaB), was studied in two experimental models of immune complex glomerulonephritis in rats and atherosclerosis in rabbits.
METHODS: Sections were fixed with 0.2% paraformaldehyde and were digested with peps
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chancroid is a sexually transmitted genital ulcer disease caused by Haemophilus ducreyi. Previously, we developed diagnostic DNA probes for H. ducreyi (L. M. Parsons, M. Shayegani, A. L. Waring, and L. H. Bopp, J. Clin. Microbiol. 27:1441-1445, 1989). In the present study, DNA sequencing of one of the diagnostic probes revealed two adjacent open reading frames (ORFs). These H. ducreyi ORFs and the encoded proteins show significant homology with the groE genes and GroES and GroEL heat shock proteins from several bacterial pathogens and with conserved eukaryotic 60-kDa heat shock proteins. The f…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied the mechanism of POMC gene expression in human nonpituitary tumors that is responsible for the ectopic ACTH syndrome. All tumors … ing at 3.0 kilobases upstream from the usual (pituitary) cap site was obtained, and single-stranded DNA probes were used for S1 mapping studies. They showed several upstream start sites of transcription located at -369, -217, and -108. Analysis of the human genomic sequence showed TATA and GC box-like motifs preceding the -369 and -217 sites and a GC-rich re …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA sequence analysis as well as genomic blotting experiments using cloned soybean actin DNA sequences as probes show that large sequence heterogeneity exists among members of the soybean actin multigene family. This heterogeneity suggested that the members of this family might be diverged in function and/or regulation. Five of the six soybean actin gene family members examined are shown to be significantly more diverged from one another than members of other known actin gene families. This high level of divergence was utilized in the preparation of actin gene-specific probes in the analysis o
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
B19 parvovirus is the etiologic agent of fifth disease and transient aplastic crisis. In natural infections, B19 antigen and DNA have been detected in sera early in the course of aplastic crisis and only rarely in fifth disease. We have found B19 DNA in circulating cells of infected patients by DNA dot blot with a virus-specific probe: in four of four sickle cell patients with aplastic crisis, in one asymptomatic sibling, and in one normal adult with fifth disease. Only two of the sera showed B19 DNA. High-molecular weight intermediate forms were detected by Southern analysis of DNA extracted
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A DNA aptazyme consists of an aptamer domain and a DNAzyme module, in which the DNAzyme activity can be regulated by the aptamer-target interaction. The complex of G-quadruplex (GQ) and hemin is a peroxidase-mimicking DNAzyme and has become increasingly popular as a reporter system for biosensing applications. The development of GQ-based aptazymes is of high interest as they can be used as label-free biosensors for the real-time detection of pathogens. Herein, we rationally designed ca. 200 GQ-based aptazyme candidates and evaluated the suitability of 14 aptamers targeting quinine, Protein A,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Largemouth bass virus (LMBV) is one of the most devastating viral pathogens in farmed Largemouth bass. Aptamers are novel molecule probes and have been widely applied in the field of efficient therapeutic and diagnostic agents development. LMBV-infected fathead minnow cells (LMBV-FHM) served as target cells in this study, and three DNA aptamers (LBVA1, LBVA2, and LBVA3) were generated against target cells by SELEX technology. The selected aptamers could specifically bind to LMBV-FHM cells, with rather high calculated dissociation constants (Kd) of 890.09, 517.22, and 249.31 nM for aptamers LBV
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we designed a set of SARS-CoV-2 enrichment probes to increase the capacity for sequence-based virus detection and obtain the comprehensive genome sequence at the same time. This universal SARS-CoV-2 enrichment probe set contains 502 120 nt single-stranded DNA biotin-labeled probes designed based on all available SARS-CoV-2 viral sequences and it can be used to enrich for SARS-CoV-2 sequences without prior knowledge of type or subtype. Following the CDC health and safety guidelines, marked enrichment was demonstrated in a virus strain sample from cell culture, three nasopharyngea
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: The CYP3A4*22 allele was recently reported to be associated with reduced CYP3A4 activity. We investigated the impact of this allele on the metabolism of the CYP3A-phenotyping probes, midazolam (MDZ) and erythromycin.
PATIENTS & METHODS: Genomic DNA from 108 cancer patients receiving intravenous MDZ and 45 undergoing the erythromycin breath test was analyzed for CYP3A4*22 (rs35599367 C>T) and CYP3A5*3.
RESULTS: The MDZ metabolic ratio (1´-OH-MDZ:MDZ) was 20.7% (95% CI: -36.2 to -6.2) lower for CYP3A4*22 carriers compared with CYP3A4*1/*1 patients (p = 0.01). Combining CYP3A4*22 and CYP3A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
FISH is one of the most sensitive molecular methods to detect genetic abnormalities with DNA probes. When cytogenetic studies are normal or insufficient, FISH may detect cryptic rearrangements, rare or slowly proliferative abnormal populations in non-mitotic cells. We cytogenetically evaluated 70 childhood ALL - 67.1% were found to have an abnormal karyotype. The 23 patients (32.9%) with a normal karyotype were analyzed by FISH applying two probes; TEL/AML1 and MYB which detect cryptic rearrangements of t(12;21)(p13;q22) and deletion of (6q) respectively, associated with a good prognosis. Out …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a young girl with microphthalmia, conductive deafness, aortic isthmus stenosis, laryngomalacia, and laryngeal stenosis carrying a de novo supernumerary neocentromeric derivative chromosome 13. For the precise identification and characterization of the eu- and heterochromatic content of the marker chromosome, straightforward molecular cytogenetic analyses were performed, such as chromosome microdissection, FISH with different probes (e.g. wcp, alphoid centromeric probes, BAC), centromere-specific multicolor FISH (cenM-FISH), and multicolor banding (MCB). The analyses demonstrated that
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования