BACKGROUND: Nasal swabs and saliva samples are being considered alternatives to nasopharyngeal swabs (NPSs) for detecting severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2 (SARS-CoV-2); however, few studies have compared the usefulness of nasal swabs, NPSs, and saliva samples for detecting SARS-CoV-2 and other respiratory virus infections. We compared the positivity rates and concentrations of viruses detected in nasal swabs, NPSs, and saliva samples using cycle threshold (Ct) values from real-time PCR tests for respiratory viruses.
METHODS: In total, 236 samples (48 five-rub and 10 10-rub nasa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nucleic acid-based assays provide an opportunity to screen for genetically encoded diseases like spinal muscular atrophy (SMA), before the onset of symptoms. Nowadays, such assays could be easily utilized as high-throughputs in SMA to detect a homozygous deletion of exon 7 of the survival motor neuron 1 gene (SMN1) that is responsible for >95% of SMA patients.
METHODS: We developed a new line method (NLM) as a direct real time PCR test procedure without nucleic acid extraction in dried blood spots (DBS) to screen for homozygous deletion of exon 7 of the SMN1 gene. Performance of t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vaginal colonization with lactobacilli has been linked to the health of the lower urinary tract in women. There is growing evidence that the bladder has its microbiome related closely to the vagina. In this study, we compared the three common vaginal Lactobacillus species (L. jensenii, L. iners and L. crispatus) in vaginal and urine samples to identify factors that influence urinary detection and the quantity of Lactobacillus. We used quantitative real-time PCR (qPCR) assays to measure the concentration of Lactobacillus jensenii, L. iners and L. crispatus in paired vaginal swabs and clean-catc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As untreated visceral leishmaniasis (VL) is fatal, reliable diagnostics are pivotal for accurate treatment allocation. The current diagnostic algorithm for VL in Ethiopia, which is based on the rK39 rapid diagnostic test and microscopy of tissue smears, lacks sensitivity. This probably leads to missed cases and patients not receiving treatment.
METHODOLOGY: We conducted a retrospective study on stored microscopically negative spleen and bone marrow smears from suspected VL patients collected at the Leishmaniasis Research and Treatment Center (LRTC) in Gondar, northern Ethiopia bet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human Cytomegalovirus virus (HCMV) is a worldwide virus that causes no serious symptoms in most adults. However, HCMV infection during pregnancy, it may lead to a series of serious complications, such as hearing loss, mental retardation, visual impairment, microcephaly and developmental retardation.
AIM: The aim of this study was to develop a simple, low dependence on equipment and accurate method for HCMV detection based on the recombinase polymerase amplification (RPA) and lateral flow chromatography strip (LFS) reading.
METHODS: In order to meet the feasibility of HCMV early s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diagnosis of infected individuals with Mycoplasma genitalium (MG) is often performed by real-time PCR or transcription-mediated amplification (TMA). A limitation of the MG-TMA assay is the relatively short time span of 24 h in which the collected urine is required to be transferred into a Urine Specimen Transport Tube, according to the manufacturer's guidelines. If not transferred within 24 h, the manufacturer's claimed sensitivity cannot be guaranteed anymore, and samples may instead be tested with an in-house validated real-time PCR, despite its recognized lower sensitivity. This
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ectromelia virus (ECTV) is the causative agent of mousepox in mice. In the past century, ECTV was a serious threat to laboratory mouse colonies worldwide. Recombinase polymerase amplification (RPA), which is widely used in virus detection, is an isothermal amplification method.
RESULTS: In this study, a probe-based RPA detection method was established for rapid and sensitive detection of ECTV.Primers were designed for the highly conserved region of the crmD gene, the main core protein of recessive poxvirus, and standard plasmids were constructed. The lowest detection limit of the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periprosthetic joint infection (PJI) can be diagnosed to characterize the microorganisms constituting a biofilm, which is an essential procedure for proper treatment. The gold standard method for detecting and identifying the causative microorganism is culture of microorganisms from patients-derived sample.; however, this method takes a long time and has low sensitivity. To compensate for these limitations, identification methods based on real-time PCR (RT-PCR) have been widely used. However, RT-PCR also has limitations, including low sensitivity and the requirement of a standard curve for qua
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: HLA-B*38:02 is closely related to carbimazole/methimazole-induced agranulocytosis. This study aimed to develop and validate a rapid and economical method for HLA-B*38:02 genotyping. Methods: A single-tube multiplex real-time PCR detection system comprising amplification refractory mutation system primers and TaqMan probes was established for HLA-B*38:02 genotyping. Sequence-based typing was applied to validate the accuracy of the assay. Results: The accuracy of the assay was 100% for HLA-B*38:02 genotyping. The detection limit of the new method was 0.05 ng DNA. The positive rate of HL
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid and accurate diagnosis of infections is fundamental to containment of disease. Several monkeypox virus (MPV) real-time diagnostic assays have been recommended by the CDC; however, the specificity of the primers and probes in these assays for the ongoing MPV outbreak has not been investigated. We analyzed the primer and probe sequences present in the CDC recommended MPV generic real-time PCR assay by aligning those sequences against 1730 MPV complete genomes reported in 2022 worldwide. Sequence mismatches were found in 99.08% and 97.46% of genomes for the MPV generic forward and reverse p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While Mpox virus (MPXV) diagnostics were performed in specialized laboratories only, the global emergence of Mpox cases in 2022 revealed the need for a more readily available diagnostic. Automated random-access platforms with fast nucleic acid extraction and PCR have become established in many laboratories, providing faster and more accessible testing. In this study, we adapted a previously published generic MPXV-PCR as a lab-developed test (LDT) on a NeuMoDx Molecular System and isolated MPXV clones from patient materials. To reduce the handling of infectious material, we evaluated a viral ly
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Varicella-zoster virus (VZV) infects more than 90% of the population worldwide and has a high incidence of postherpetic neuralgia in elderly patients, seriously affecting their quality of life. Combined with clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) system, we develop a quantum dot nanobeads (QDNBs) labeled lateral flow assay for VZV detection. Our assay allows the identification of more than 5 copies of VZV genomic DNA in each reaction. The entire process, from sample preparation to obtaining the results, takes less than an hour. In 86 clinical vesicles samples, the t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chlamydiaceae are a group of gram-negative intracellular bacteria which can infect a wide variety of hosts. Some chlamydial agents are capable of crossing the host barrier and though they are potentially a risk to very different species. They also pose a zoonotic risk for human and different chlamydial agents are linked to several medical maladies.
OBJECTIVES: In this study, the presence of chlamydial agents in different commercial poultry flocks in Iran was investigated.
METHODS: Swab and tissue samples were collected from 435 birds in 24 different commercial poultry flocks. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes is a ubiquitous bacterium that causes a foodborne illness, listeriosis. Most strains can be classified into major clonal complexes (CCs) that account for the majority of outbreaks and sporadic cases in Europe. In addition to the 20 CCs known to account for the majority of human and animal clinical cases, 10 CCs are frequently reported in food production, thereby posing a serious challenge for the agrifood industry. Therefore, there is a need for a rapid and reliable method to identify these 30 major CCs. The high-throughput real-time PCR assay presented here provides acc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Balanced vaginal microbiota and, as a continuum, cervical canal microbiota help prevent reproductive disorders, including recurrent miscarriage (RM). In a significant proportion of couples with RM, routine diagnostic workup cannot find any manageable cause, leading to a requirement for new diagnostic tools. In the present study, we determined the quantitative composition of the microbiota of the vagina and cervical canal, assessed by real-time polymerase chain reaction, in women with RM. It also evaluated their derangements related to the pathogenesis of RM, and thus the suitability of this te…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The presence of the SARS-CoV-2 in the peritoneal fluid is a matter of debate in the COVID-19 literature. The study aimed to report the prevalence of SARS-CoV-2 in the peritoneal fluid of patients with nasopharyngeal swab tested positive for SARS-CoV-2 undergoing emergency surgery and review the literature.
METHODS: The present study was conducted between March 2020 and June 2021. Diagnosis of SARS-CoV-2 positivity was confirmed by preoperative real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR).
RESULTS: Eighteen patients with positive nasopharyngeal swabs were operat
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbonic anhydrase 9 (CA9) is a marker for decreased O2 concentration and acidosis, associated with poor prognosis in cancerous patients. The current study suggested that the changes in CA9 gene expression level might be used as a predictive marker to assess early prognosis at the time of detection of de novo leukemia, and then monitor tumor progress during treatment. This study highlights the level of CA9 gene expression in leukemic patients. A total of 44 cases (acute myeloid leukaemia (AML) group: 23 cases; acute lymphoid leukaemia (ALL) group: 13 cases; control group: 8 healthy volunteers)
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plasmodium blood-stage infections can be identified by assaying for protein products expressed by the parasites. While the binary result of an antigen test is sufficient for a clinical result, greater nuance can be gathered for malaria infection status based on quantitative and sensitive detection of Plasmodium antigens and machine learning analytical approaches.
METHODS: Three independent malaria studies performed in Angola and Haiti enrolled persons at health facilities and collected a blood sample. Presence and parasite density of P. falciparum infection was determined by micro
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Universal spinal muscular atrophy (SMA) newborn screening was implemented in California on June 24, 2020.
OBJECTIVE: We describe California's experience with the first 18 months of SMA newborn screening, including our assay methodology, timeliness of screening and follow-up milestones, and clinical and epidemiological outcomes observed.
METHODS: Dried blood spots are screened for SMA using multiplex real time polymerase chain reaction (RT-PCR) to detect deletions of exon 7 in the survival of motor neuron 1 (SMN1) gene. Short-term follow-up data is collected from clinical staff vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma pneumoniae (Mp) is a common cause of respiratory infections in school-age children. In the present study, a recombinase polymerase amplification (RPA) assay combined with lateral flow dipstick (LFD) was developed for diagnosis of Mp. Specific primers and a probe were designed for the Mp p1 gene. The optimal reaction conditions of the RPA-LFD assay were 37 °C and 25 min. The minimal detection limit of the RPA assay was 10 DNA molecules. The RPA method had no cross-reaction with the other 14 common pathogens tested. The practicability of the assay for detecting Mp in clinical samples
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования