Alboaggregin-B (AL-B) (Peng et al., Biochemistry (1991) 30, 11529-11536) was highly purified from the snake venom of Trimeresurus albolabris and characterized structurally and functionally, comparing with botrocetin, another snake venom protein recently characterized (Usami et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1993) 90, 928-932). Both the venom proteins are a heterodimer and show a high degree of sequence homology to each other and also to C-type lectins. Botrocetin specifically binds to von Willebrand factor (vWF), whereas AL-B binds to platelet glycoprotein (GP) Ib without affecting the bindi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Venomous function is investigated in relation to innate immune function in two cases selected from scorpion venom and serpent venom. In the first case, structural analysis of scorpion toxins and defensins reveals a close interrelation between both functions (toxic and innate immune system function). In the second case, structural and functional studies of natural inhibitors of toxic snake venom phospholipases A2 reveal homology with components of the innate immune system, leading to a similar conclusion. Although there is a clear functional distinction between neurotoxins, which act by targeti
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
erm(A) subclass erm(TR), a common macrolide resistance determinant in Streptococcus pyogenes but quite rare in Streptococcus pneumoniae, was found in a clinical S. pneumoniae isolate (AP200) from Italy. In this isolate, erm(TR) was found included in a genetic element approximately 56 kb in size that did not appear to be conjugative but could be transferred by transformation. An erm(TR)-containing DNA fragment of approximately 10 kb was sequenced and 12 open reading frames (ORFs) were identified. Upstream of erm(TR), a regulatory protein of the TetR family and the two components of an efflux pu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prokaryotic insertion sequence (IS) elements behave like parasites in terms of their ability to invade and proliferate in microbial gene pools and like symbionts when they coevolve with their bacterial hosts. Here we investigated the evolutionary history of IS605 and IS607 of Helicobacter pylori, a genetically diverse gastric pathogen. These elements contain unrelated transposase genes (orfA) and also a homolog of the Salmonella virulence gene gipA (orfB). A total of 488 East Asian, Indian, Peruvian, and Spanish isolates were screened, and 18 and 14% of them harbored IS605 and IS607, respectiv
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Southern blot analysis of genomic DNAs of several fungi that produce polyketide compounds with the 6-methylsalicylic acid synthase (MSAS) gene of Penicillium patulum as a probe indicated the presence of an MSAS-homologous gene in the (+)-geodin-producing strain IMI 16,043 of Aspergillus terreus. The gene, designated atX was cloned from an A. terreus genomic DNA library and 7588 bp of the gene together with its flanking regions were sequenced to reveal the presence of a 5.5 kb open reading frame coding for a protein of 1800 amino acids with 190 kDa molecular mass. The presence of a short (70 bp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: COVID-19 is an infectious disease declared as a global pandemic caused by SARS-CoV-2 virus. Genomic changes in the receptor binding domain (RBD) region of SARS-CoV-2 led to an increased, infectivity in humans through interaction with the angiotensin-converting enzyme2 (ACE2) receptor. Simultaneously, the genetic variants in ACE2 provide an opportunity for SARS-CoV-2 infection and severity. We demonstrate the binding efficiencies of RBDs of SARS-CoV-2 strain with ACE2 variants of the human host.
METHODOLOGY: A Total of 615 SARS-CoV-2 genomes were retrieved from repository. Eighteen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spexin (SPX), a highly conserved neuropeptide, is known to have diverse functions and has been implicated/associated with pathological conditions, including obesity, diabetes, anorexia nervosa, and anxiety/mood disorders. Although most of the studies on SPX involved the mouse model, the solution structure of mouse SPX, structural aspects for SPX binding with its receptors GalR2/3, and its cellular expression/distribution in mouse tissues are largely unknown. Using CD and NMR spectroscopies, the solution structure of mouse SPX was shown to be in the form of a helical peptide with a random coil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis is considered the second most important tropical parasitic disease, with severe socioeconomic consequences for millions of people worldwide. Schistosoma mansoni , one of the causative agents of human schistosomiasis, is unable to synthesize purine nucleotides de novo, which makes the enzymes of the purine salvage pathway important targets for antischistosomal drug development. In the present work, we describe the development of a pharmacophore model for ligands of S. mansoni purine nucleoside phosphorylase (SmPNP) as well as a pharmacophore-based virtual screening approach, whi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mammalian Shc (Src homology and collagen) proteins comprise a family of four phosphotyrosine adaptor molecules which exhibit varied spatiotemporal expression and signaling functions. ShcD is the most recently discovered homologue and it is highly expressed in the developing central nervous system (CNS) and adult brain. Presently however, its localization within specific cell types of mature neural structures has yet to be characterized.
RESULTS: In the current study, we examine the expression profile of ShcD in the adult rat CNS using immunohistochemistry, and compare with those o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klotho (KL) family proteins share one or two glycoside hydrolase (GH) motifs homologous to GH family 1. However, the biological significance of GH motifs in KL family proteins remains elusive. We describe here that KL-related protein (KLrP), which is composed of a single GH motif, is a cytosolic β-glucocerebrosidase (GCase, EC 3.2.1.145). We detected a neutral conduritol B epoxide (CBE)-insensitive glucosylceramide (GlcCer)-degrading activity in the cytosol fractions of human fibroblasts, rat brains, and zebrafish embryos. KL family proteins emerged as a potent candidate for the neutral GCase
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent decades, bacterial cell biology has seen great advances, and numerous model systems have been developed to study a wide variety of cellular processes, including cell division, motility, assembly of macromolecular structures, and biogenesis of cell polarity. Considerable attention has been given to these model organisms, which include Escherichia coli, Bacillus subtilis, Caulobacter crescentus, and Myxococcus xanthus. Studies of these processes in the pathogenic bacterium Mycoplasma pneumoniae and its close relatives have also been carried out on a smaller scale, but this work is ofte
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ERCC1-XPF is a heterodimeric, structure-specific endonuclease that cleaves single-stranded/double-stranded DNA junctions and has roles in nucleotide excision repair (NER), interstrand crosslink (ICL) repair, homologous recombination, and possibly other pathways. In NER, ERCC1-XPF is recruited to DNA lesions by interaction with XPA and incises the DNA 5' to the lesion. We studied the role of the four C-terminal DNA binding domains in mediating NER activity and cleavage of model substrates. We found that mutations in the helix-hairpin-helix domain of ERCC1 and the nuclease domain of XPF abolishe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The yellow fever (YF) 17D vaccine is a live attenuated virus. Three-dimensional (3D) homology modeling of the E protein structure from YF 17D virus and its comparison with that from tick-borne encephalitis virus revealed that it is possible to accommodate inserts of different sizes and amino acid compositions in the flavivirus E protein fg loop. This is consistent with the 3D structures of both the dimeric and trimeric forms in which the fg loop lies exposed to solvents. We demonstrate here that YF 17D viruses bearing foreign humoral (17D/8) and T-cell (17D/13) epitopes, which vary in sequence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human gastric pathogen Helicobacter pylori is naturally competent for genetic transformation. The H. pylori comB gene duster encodes the VirB4-homologous ATPase ComB4 and the structural proteins ComB7-ComB10, which share significant sequence identity to the Agrobacterium tumefaciens virB-encoded type IV secretion system. To study the topology of the ComB7-10 proteins, we applied TnMax transposon mutagenesis by generating fusions of ComB proteins with mature beta-lactamase (BlaM) or alkaline phosphatase (PhoA). Our data show that the putative lipoprotein ComB7 is secreted and is found membr
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Long-read sequencing is increasingly used to uncover structural variants in the human genome, both functionally neutral and deleterious. Structural variants occur more frequently in regions with a high homology or repetitive segments, and one rearrangement may predispose to additional events. Bartter syndrome type 3 (BS 3) is a monogenic tubulopathy caused by deleterious variants in the chloride channel gene CLCNKB, a high proportion of these being large gene deletions. Multiplex ligation-dependent probe amplification, the current diagnostic gold standard for this type of mutation,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thyroid peroxidase (TPO) is a dimeric membrane-bound enzyme of thyroid follicular cells, responsible for thyroid hormone biosynthesis. TPO is also a common target antigen in autoimmune thyroid disease (AITD). With two active sites, TPO is an unusual enzyme, and thus there is much interest in understanding its structure and role in AITD. Homology modeling has shown TPO to be composed of different structural modules, as well as a propeptide sequence. During the course of studies to obtain homogeneous preparations of recombinant TPO for structural studies, we investigated the role of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human chorionic gonadotropin (hCG) is a placental hormone that stimulates secretion of the pregnancy-sustaining steroid progesterone. It and other glycoprotein hormones are disulfide-rich heterodimers that share a common alpha chain and distinctive beta chains specific to their particular G protein-linked receptors. We determined the structure of partially deglycosylated hCG at 2.6 A resolution from multiwavelength anomalous diffraction (MAD) measurements of a selenomethionyl hCG crystal. We have also begun three- and four-dimensional structural studies on the biologically active hormone and h
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leishmania parasites are deposited in the host through sand fly bites along with sand fly saliva. Therefore, salivary proteins are promising vaccine candidates for controlling leishmaniasis. Herein, two immunogenic salivary proteins, PpSP15 from Phlebotomus papatasi and PsSP9 from Phlebotomus sergenti, were selected as vaccine candidates to be delivered by live Leishmania tarentolae as vector. The stepwise in silico protocol advantaged in this study for multi-protein design in L. tarentolae is then described in detail.
METHODS: All possible combinations of two salivary proteins, P
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ramu stunt virus (RmSV), a member of the genus Mechlorovirus within the family Phenuiviridae, was previously described as a six-segmented RNA virus infecting sugarcane. In this study, we re-examined type material and additional isolates using high-throughput sequencing and RT-PCR validation, revealing that RmSV possesses a nine-segmented genome, making it the largest reported in the Phenuiviridae. This expanded architecture includes duplicated RNA segments (RNA 2a and RNA 2b) encoding nucleocapsid-like proteins and two novel segments (RNA 7 and RNA 8). Comparative analysis showed that RNA 2a a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to provide a preliminary discussion of the molecular basis of FV deficiency caused by compound heterozygous mutations in two Chinese families.
METHODS: Relative coagulation index was measured by the one-stage clotting method and the FV:Ag was measured by ELISA. All exons and flanking regions of the F5 gene were amplified by PCR and directly sequenced. ClustalX-2.1-win was used to analyze the conservation of mutations. The online software was used to predict the pathogenicity of mutations. PyMOL was used to analyze the variation in the spatial structure of the FV pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования