β-catenin is a key signal transducer in the canonical WNT pathway and is negatively regulated by ubiquitin-dependent proteolysis. Through screening of various deubiquitinating enzymes (DUBs), we identified ubiquitin specific protease 4 (USP4) as a candidate for β-catenin-specific DUB. The effects of USP4 overexpression or knockdown suggested that USP4 positively controls the stability of β-catenin and enhances β-catenin-regulated transcription. Domain mapping results revealed that the C-terminal catalytic domain is responsible for β-catenin binding and nuclear transport. Examination of colon c…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus cereus G9241 was isolated from a welder suffering from an anthrax-like inhalation illness. B. cereus G9241 encodes two megaplasmids, pBCXO1 and pBC210, which are analogous to the toxin- and capsule-encoding virulence plasmids of Bacillus anthracis. Protein modeling predicted that the pBC210 LF homologue contained an ADP-ribosyltransferase (ADPr) domain. This putative bacterial ADP-ribosyltransferase domain was denoted CerADPr. Iterative modeling showed that CerADPr possessed several conserved ADP-ribosyltransferase features, including an α-3 helix, an ADP-ribosyltransferase turn-turn
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diacylglycerol kinase (DGK) phosphorylates diacylglycerol (DAG) to produce phosphatidic acid (PA) and plays an important role in signal transduction by modulating the balance between these signalling lipids. To date, 10 mammalian DGK isozymes have been identified, and these isozymes are subdivided into five groups according to their structural features. The type II DGKs, consisting of δ1, δ2, η1, η2 and κ isoforms, possess a pleckstrin homology (PH) domain at their N-termini in addition to the separate catalytic region. Moreover, DGKs δ1, δ2 and η2 have a sterile α motif domain at their C-term
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Pasteurella multocida adenylate cyclase gene has been cloned and expressed in Escherichia coli. The primary structure of the protein (838 amino acids) deduced from the corresponding nucleotide sequence was compared with that of E. coli. The two enzymes have similar molecular sizes and, based on sequence conservation at the protein level, are likely to be organized in two functional domains: the amino-terminal catalytic domain and the carboxy-terminal regulatory domain. It was shown that P. multocida adenylate cyclase synthesizes increased levels of cyclic AMP in E. coli strains deficient i…
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
P450 BM3 is a natural fusion protein with a P450 domain fused to its necessary redox partner and capable of binding a range of fatty acids at high catalytic rates. The flexibility of the active site and catalytic efficiency have led to extensive research aimed at modifying substrate and product profiles for its utilization as a biocatalyst. The introduction of a double mutation (DM) at the base of the active site (A82F/F87V) allows the binding of a broad range of structurally diverse small molecules, including pharmaceutical drugs. Herein, we describe screening with an FDA-approved drug compou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is a disease characterized by genomic instability and aberrant DNA repair. Poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) represents a well- … l hits for interaction with PARP-1. These hits were studied using molecular docking with the PARP-1 catalytic domain (PDB ID: 7KK4). The most stable and compact complexes were further explored by 500 ns molecular dynamics (MD) simulations and various dynamic properties (RMSD, RMSF, Rg, SASA, MolSA, hydrogen bonds, PCA, DCCM). The key finding of this study is that …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developmental mechanisms regulating gene expression and the stable acquisition of cell fate direct cytodifferentiation during organogenesis. … sh dnmt1. Both lesions are predicted to eliminate dnmt1 function; one is a missense mutation in the catalytic domain and the other is a nonsense mutation that eliminates the catalytic domain. In zebrafish dnmt1 mutants, the pancreas and liver form normally, but begin to degenerate after 84 h post fertilization (hpf). Acinar cells are nearly abolished through apopt …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemotherapy-induced myelosuppression (CIM) significantly impairs hematopoiesis. Proanthocyanidin A1 (1) from peanut skin is a JAK2 activato … irectly bound JAK2 and displayed preferential affinity for the JH2 pseudokinase domain over the JH1 catalytic domain, indicating a potential JH2-mediated activation mechanism. In primary BMHSCs, 32 activated the JAK2/STAT3 pathway and alleviated carboplatin-induced damage. Consistently, oral administration of 32 at 50 mg/kg activated JAK2/STAT3 signaling in vivo a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enhancer of zeste homolog 2 (EZH2) is a methyltransferase that tri-methylates histone H3K27 as the catalytic subunit of the polycomb repressive complex 2. However, inhibition of EZH2 methyltransferase showed only variable anti-cancer efficacy, suggesting that this approach is insufficient. Here, we demonstrate a methyltransferase-independent mechanism of EZH2 wherein EZH2 interacts with inosine monophosphate dehydrogenase 2 (IMPDH2) in the cytoplasm to promote guanosine-5'-triphosphate (GTP) synthesis. Mass spectrometry identified methyltransferase-independent interactions between the EED-bind
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The heterodimeric Rab3GAP complex is a guanine nucleotide exchange factor (GEF) for the Rab18 GTPase that regulates lipid droplet metabolism, ER-to-Golgi trafficking, secretion, and autophagy. Why both subunits of Rab3GAP are required for Rab18 GEF activity and the molecular basis of how Rab3GAP engages and activates its cognate substrate are unknown. Here we show that human Rab3GAP is conformationally flexible and potentially autoinhibited by the C-terminal domain of its Rab3GAP2 subunit. Our high-resolution structure of the catalytic core of Rab3GAP, determined by cryo-EM, shows that the Rab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The acquisition of iron is critical for the survival and the virulence of numerous infectious pathogens, and most bacteria acquire ferrous iron (Fe2+) by utilizing the ferrous iron transport (Feo) system. FeoB is the main component of this system, and its function is regulated by the soluble cytosolic domain, termed NFeoB. We have recently begun to define the structure and the mechanism of the Feo system from the bacterium Vibrio cholerae, the causative agent of the disease cholera. However, major structural gaps in our understanding of the nucleotide-promiscuous V. cholerae NFeoB still exist.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
mTOR plays a crucial role in PI3K/AKT/mTOR signaling. We hypothesized that mTOR activation mechanisms driving oncogenesis can advise effective therapeutic designs. To test this, we combined cancer genomic analysis with extensive molecular dynamics simulations of mTOR oncogenic variants. We observed that conformational changes within mTOR kinase domain are associated with multiple mutational activation events. The mutations disturb the α-packing formed by the kαAL, kα3, kα9, kα9b, and kα10 helices in the kinase domain creating cryptic pocket. Its opening correlates with opening of the catalytic
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
JAK inhibitors impact multiple cytokine pathways simultaneously, enabling high efficacy in treating complex diseases such as cancers and immune-mediated disorders. However, their broad reach also poses safety concerns, which have fuelled a demand for increasingly selective JAK inhibitors. Deucravacitinib, a first-in-class allosteric TYK2 inhibitor, represents a remarkable advancement in the field. Rather than competing at kinase domain catalytic sites as classical JAK1-3 inhibitors, deucravacitinib targets the regulatory pseudokinase domain of TYK2. It strikingly mirrors the functional effect
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanisms utilized by different flaviviruses to evade antiviral functions of interferons are varied and incompletely understood. Using virological approaches, biochemical assays, and mass spectrometry analyses, we report here that the NS5 protein of tick-borne encephalitis virus (TBEV) and Louping Ill virus (LIV), two related tick-borne flaviviruses, antagonize JAK-STAT signaling through interactions with the tyrosine kinase 2 (TYK2). Co-immunoprecipitation (co-IP) experiments, yeast gap-repair assays, computational protein-protein docking and functional studies identify a stretch of 10 r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global influence of male infertility is increasing in recent decades. Proper understanding of genetics, anatomy, physiology and the intricat … sirtuin family comprises seven members (SIRT1-SIRT7), and they all possess a conserved NAD+ binding catalytic domain, termed the sirtuin core domain which is imperative for their activity. Sirtuins exert a pivotal role in cellular homeostasis, energy metabolism, apoptosis, age-related disorders and male reproductive system. However, their exact role in male reprod …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the use of pneumococcal conjugate vaccines, the number of infections related to Streptococcus pneumoniae continues to be alarming. Herein, we identified, characterized the MSlys endolysin encoded in the phage MS1. We further tested its antimicrobial efficacy against planktonic and biofilm cells, assessing the culturability of cells and biofilm structure by scanning electron microscopy, and confocal laser scanning microscopy. The modular MSlys endolysin consists of an amidase catalytic domain and a choline-binding domain. MSlys is active against isolates of children with otitis media, a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protozoans of the genus Cryptosporidium are the causative agent of the gastrointestinal disease, cryptosporidiosis, which can be fatal in immunocompromised individuals. Cryptosporidium hominis (C. hominis) bifunctional thymidylate synthase-dihydrofolate reductase (TS-DHFR) is an essential enzyme in the folate biosynthesis pathway and a molecular target for inhibitor design. Previous studies have demonstrated the importance of the ChTS-DHFR linker region "crossover helix" to the enzymatic activity and stability of the ChDHFR domain. We conducted a virtual screen of a novel non-active site pocke
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA binding motif protein 10 (RBM10) is a regulator of alternative splicing in apoptosis and inflammation. We discovered a splicing-independent function of RBM10 critical for the regulation of heart failure (HF). RBM10 is enriched in the heart and associates with Star-PAP (TUT1) to control the expression and 3' end processing of cardiac mRNAs. The RBM10 RRM2 domain binds the Star-PAP catalytic domain, which directs Star-PAP activity toward polyadenylation. RBM10 binds the pre-mRNA UTR, assembles the Star-PAP complex, and guides this complex specifically to mRNAs encoding anti-hypertrophy regul…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aminoacylation is the process of attaching amino acids to their cognate tRNA, and thus is essential for the translation of mRNA into protein … * mutation is novel and causes truncation of the QARS protein, leading to a deletion of part of the catalytic domain and the entire anticodon-binding domain. Transient expression of the p.Lys496* mutant in neuroblastoma 2A cells revealed diminished and aberrantly aggregated expression, indicating the loss-of-function nature of this mutant. Together with the previo …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diphtheria toxin (DT) binds to a specific cell surface receptor, gets internalized, and causes cytotoxicity through its catalytic domain. The toxicity of DT is used in several therapeutic molecules. Here, we have exploited the receptor-binding ability of DT to increase cellular uptake of curcumin, a hydrophobic molecule with low bioavailability and cellular uptake. We have expressed only the receptor-binding domain of DT (RDT) in Escherichia coli. Purified RDT binds to the receptor with an affinity equivalent to that of full-length DT. It also binds to curcumin forming a curcumin-RDT complex, …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования