Megakaryocytic blast crisis occurs extremely rarely, accounting for <3% of cases of chronic myelogenous leukemia in blastic transformation. In chronic myeloid leukemia, a variant Philadelphia translocation is reported in 2-10% of cases. We report an unusual case of megakaryocytic blast crisis with the Philadelphia variant rearrangement t(9;22;22) and a constitutional translocation t(3;7). The breakpoint in the 22q13 region was involved in this translocation. The chromosome region 22q13 harbors MKL1 gene, which is engaged in a specific translocation associated with acute megakaryoblastic leukem
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
4p-syndrome, or Wolf-Hirschhorn syndrome, is associated with a deletion of chromosome 4p16.3 and involves multiple malformations that result in delayed growth and development and also facial dysmorphism. We report a case of Wolf-Hirschhorn syndrome in a female infant with a 4p deletion, for which the breakpoint was detected at p14. This patient had bilateral renal hypoplasia resulting from the oligohydramnios sequence (Potter syndrome), including characteristic facial abnormalities, deformed limbs, and pulmonary hypoplasia. Patent ductus arteriosus, ascites, and bilateral renal hypoplasia were
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have identified a novel gene, Translin, encoding a protein which specifically binds to consensus sequences at breakpoint junctions of chromosomal translocations in many cases of lymphoid malignancies. The encoded protein, Translin, is a previously undescribed type with no significant similarity to known proteins. In the native form, Translin polypeptides form a multimeric structure which is responsible for its DNA binding activity. Nuclear localization of Translin is limited to lymphoid cell lines, raising the intriguing possibility that nuclear transport of Translin is regulated in a physi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have used the human-sperm/hamster-egg system to compare the frequencies of structural and numerical chromosomal aberrations in 909 sperm karyotypes from four normal healthy men. The frequency of structural aberrations was 1.3, 4.8, 9.0, and 10.4% respectively in the four donors. Certain specific breakpoints were seen twice or even three times in three of the donors. The incidence of aneuploidy was 1.3, 1.4, 1.4, and 1.9%. In three donors the frequencies of structural aberrations were significantly higher in sperm than in lymphocytes from the same man. X-to-Y ratios did not differ significan
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NLRP7 is a major gene responsible for recurrent hydatidiform moles. Here, we report 11 novel NLRP7 protein truncating variants, of which five deletions of more than 1-kb. We analyzed the transcriptional consequences of four variants. We demonstrate that one large homozygous deletion removes NLRP7 transcription start site and results in the complete absence of its transcripts in a patient in good health besides her reproductive problem. This observation strengthens existing data on the requirement of NLRP7 only for female reproduction. We show that two other variants affecting the splice accept
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Somatically-acquired translocations may serve as important markers for assessing the cause and nature of diseases like cancer. Algorithms to locate translocations may use next-generation sequencing (NGS) platform data. However, paired-end strategies do not accurately predict precise translocation breakpoints, and "split-read" methods may lose sensitivity if a translocation boundary is not captured by many sequenced reads. To address these challenges, we have developed "Bellerophon", a method that uses discordant read pairs to identify potential translocations, and subsequently uses
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Branchio-oto-renal (BOR) syndrome is an autosomal dominantly inherited developmental disorder, which is characterized by anomalies of the ears, the branchial arches and the kidneys. It is caused by mutations in the genes EYA1,SIX1 and SIX5. Genomic rearrangements of chromosome 8 affecting the EYA1 gene have also been described. Owing to this fact, methods for the identification of abnormal copy numbers such as multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) have been introduced as routine laboratory techniques for molecular diagnostics of BOR syndrome. The advantages of these technique
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal rearrangements affecting the genes encoding complement factor H and the factor H related proteins have been described in aHUS patients. To date such disorders have not been described in other aHUS associated genes. We describe here a heterozygous 875,324bp deletion encompassing the gene (CFI) encoding complement factor I and ten other genes. The index case presented with aHUS and did not recover renal function. No abnormalities were detected on Sanger sequencing of CFI but a low factor I level led to a multiplex ligation-dependent probe amplification assay being undertaken. This sh
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytogenetic abnormalities of chromosome 12p involving the TEL/ETV6 gene are observed in a variety of hematopoietic neoplasms including acute leukemias, myelodysplastic syndromes, and myeloproliferative disorders. Karyotypic aberrations, including rearrangements, deletions, and amplifications of chromosome 12p, have been documented in B-cell non-Hodgkin lymphoma; however, rearrangements targeting TEL have rarely been reported. Here we describe a diffuse large B-cell lymphoma that had a complex karyotype including t(9;12)(q22;p13), which was confirmed by fluorescence in situ hybridization to rep
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Philadelphia chromosome, a chromosomal abnormality that encodes BCR-ABL1, is the defining lesion of chronic myelogenous leukaemia (CML) and a subset of acute lymphoblastic leukaemia (ALL). To define oncogenic lesions that cooperate with BCR-ABL1 to induce ALL, we performed a genome-wide analysis of diagnostic leukaemia samples from 304 individuals with ALL, including 43 BCR-ABL1 B-progenitor ALLs and 23 CML cases. IKZF1 (encoding the transcription factor Ikaros) was deleted in 83.7% of BCR-ABL1 ALL, but not in chronic-phase CML. Deletion of IKZF1 was also identified as an acquired lesion a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal deletions at 11q21-23 have recently been reported to be common aberrations in mantle cell lymphoma (MCL). To characterize the structure of the deletion, we studied 41 cases of MCL by fluorescence in situ hybridization using a YAC contig, which spans the region at 11q22.1-23.3. 17 MCLs were studied using a set of 20 yeast artificial chromosomes (YACs) in a contig, and nine of these cases showed deletion of 11q22-23. The deletion spanned several megabases in all but one case, where only YAC 755b11 at 11q23.1, covering approximately a 1.6 Mb of DNA, was deleted. Analysis of additional
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dysplastic nevus is considered to be a precursor lesion of melanoma, representing one of the first steps in the progressive transformation from normal melanocyte to melanoma. Various risk degrees of developing cutaneous melanoma in patients with dysplastic nevi have been advanced, based on the presence of dysplastic nevi or melanoma or both in members of the patient's family. We report on the cytogenetic study of three nevi in a young patient with a family history of melanoma. Each nevus showed a simple clonal chromosome change. The t(6;15)(q13;q21) translocation found in one of them seems
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytogenetic analysis, fluorescent in situ hybridisation (FISH), and molecular amplification have been used to characterise the transfer of Yp fragments to Xp22.3 in six XX males. PCR amplification of the genes SRY, RPS4Y, ZFY, AMELY, KALY, and DAZ and of several other markers along the Y chromosome short and long arms indicated the presence of two different breakpoints in the Y fragment. However, the clinical features were very similar in five of the cases, showing a male phenotype with small testes, testicular atrophy, and azoospermia. All these patients have normal intelligence and a stature
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia-telangiectasia (A-T) is inherited as an monogenetic autosomal recessive disease. Ataxia appears around 1 year of age and progresses until the patient becomes wheelchair-bound, usually by age 10. This progress correlates with deterioration of Purkinje cells in the cerebellum. Sinopulmonary infections are common in patients from some countries but not others. One-third of the patients develop a neoplasm, usually lymphoid, sometime during their shortened lives. Conventional doses of radiation therapy for such cancers are contraindicated since A-T patients are hypersensitive to ionizing rad
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infant acute lymphoblastic leukemia (ALL) has never occurred in families except for the ∼100% concordant cases in monozygous twins attributed to twin-to-twin metastases. We report the first kindred with infant ALL in non-twin siblings. The siblings were diagnosed with MLL-rearranged (MLL-R) ALL 26 months apart. The second affected sibling had an unaffected dichorionic monozygous co-twin. Both had fatal outcomes.
PROCEDURES: Translocations were characterized by karyotype, FISH, multiplex FISH, and MLL breakpoint cluster region (bcr) Southern blot analysis. Breakpoint junctions and
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАTwin StudyПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most chromosomal aberrations revealed by chromosomal microarray testing (CMA) are simple; however, very complex chromosomal structural rearrangements can also be found. Although the mechanism of structural rearrangements has been gradually revealed, not all mechanisms have been elucidated. We analyzed the breakpoint-junctions (BJs) of two or more clustered copy number variations (CNVs) in the same chromosome arms to understand their conformation and the mechanism of complex structural rearrangements. Combining CMA with long-read whole-genome sequencing (WGS) analysis, we successfully determine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal aberrations including structural variations (SVs) are a major cause of human genetic diseases. Their detection in clinical routine still relies on standard cytogenetics. Drawbacks of these tests are a very low resolution (karyotyping) and the inability to detect balanced SVs or indicate the genomic localization and orientation of duplicated segments or insertions (copy number variant [CNV] microarrays). Here, we investigated the ability of optical genome mapping (OGM) to detect known constitutional chromosomal aberrations. Ultra-high-molecular-weight DNA was isolated from 85 blood
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper describes a female infant with microphthalmia with linear skin defects syndrome (MLS) and monosomy for the Xp22 region. Her clinical features included right microphthalmia and sclerocornea, left corneal opacity, linear red rash and scar-like skin lesion on the nose and cheeks, and absence of the corpus callosum. Cytogenetic studies revealed a 45,X[18]/46,X,r(X)(p22q21) [24]/46,X,del(X)(p22)[58] karyotype. Fluorescence in situ hybridization analysis showed that the ring X chromosome was positive for DXZ1 and XIST and negative for the Xp and Xq telomeric regions, whereas the deleted X
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell lines (U-266, U-1957, U-1996 and U-2030) established from 4 patients with multiple myeloma (MM) were analyzed cytogenetically. The cell lines represent different stages in B-cell differentiation as evidenced by ultrastructural and functional characteristics. The karyotypic pattern in 3 newly established myeloma lines was studied after a few months in culture and compared to the old myeloma cell line U-266, which was examined after 6, 7 and 8 years of continuous cultivation. Frequency of progressive numerical and structural aberrations during long-term cultivation and their correlation wit
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The birth and death of genes is central to adaptive evolution, yet the underlying genome dynamics remain elusive. The availability of closely related complete genome sequences helps to follow changes in gene contents and clarify their relationship to overall genome organization. Helicobacter pylori, bacteria in our stomach, are known for their extreme genome plasticity through mutation and recombination and will make a good target for such an analysis. In comparing their complete genome sequences, we found that gain and loss of genes (loci) for outer membrane proteins, which mediate host inter
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.