Population-scale models of microalgal growth represent the culture as average biomass and do not explicitly describe discrete cell-cycle events such as commitment, size variation and daughter-cell number. This limitation is relevant for Chlorella vulgaris, which divides by multiple fission and produces a variable number of autospores according to its physiological state. This study proposed a hybrid continuous-discrete single-cell model integrating photophysiology, internal nitrogen and phosphorus quotas, chlorophyll dynamics, the functional state of photosystem II, reactive oxygen species, vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In molecular dynamics (MD) simulations, enforcing holonomic constraints on specific interatomic distances is crucial to extend the integration time step while maintaining numerical stability. While double-precision arithmetic has traditionally been used to ensure numerical accuracy, there is a growing demand for single- and mixed-precision calculations as GPU-accelerated MD simulations become increasingly widespread. In this study, we present improvements to the constraint solvers through an analytical treatment for bonds involving a single hydrogen atom ( X H 1 groups). For more complex gro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An integrated computational strategy was used to identify potential inhibitors of the NAD (+)-arginine ADP-ribosyl transferase of cholera toxin. The target protein structure was obtained from the UniProt database and validated using PROCHECK. The potential binding pockets were predicted using DeepSite. A total of 50 flavonoids were screened using structure based virtual screening (VS), of which Kaempferol (-9.1 kcal/mol) and Taxifolin (-8.9 kcal/mol) were identified as potential inhibitors. Molecular interaction studies indicated that kaempferol had a substantially larger interaction network (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Histone lactylation links lactate metabolism to chromatin regulation, but whether lactylation-program-associated transcriptional patterns delineate recurrent pan-cancer tumor states remains unclear.
METHODS: We integrated mRNA, lncRNA, and miRNA profiles from 9712 TCGA tumors across 33 cancer types with GTEx references, six GEO cohorts, IMvigor210, and an institutional clear-cell renal cell carcinoma (ccRCC) cohort used for exploratory DIA-NN proteomic corroboration. Random-effects co-expression meta-analysis, multi-omics consensus clustering, regulon inference, immune deconvoluti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic cancer (PC) is known to be a highly fatal malignancy, and elucidating new molecular mechanisms is of great importance. In this study, we investigated NECTIN4 (PVRL4), which is associated with poor prognosis, via bioinformatics approach. We used following tools and datasets: For differential gene expression analysis, TCGA TARGET GTEx study on UCSC Xena, GSE183795, GSE71729 and GSE196009 GEO datasets; for associations with clinicopathological and promoter methylation features, UALCAN; for correlations with overall survival (OS), disease-free survival (DFS) gene chip database, and for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral submucous fibrosis (OSF) is a chronic potentially malignant disorder that can progress to oral squamous cell carcinoma (OSCC). Although dysregulated non-coding RNAs have been implicated in oral carcinogenesis, the competing endogenous RNA (ceRNA)-mediated regulatory mechanisms underlying OSF-to-OSCC progression remain poorly understood. This study aimed to identify candidate regulatory molecules and construct a putative lncRNA-miRNA-mRNA network associated with malignant transformation.
METHODS: Publicly available microarray datasets (GSE117973 and GSE125866) were analyzed to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer transcriptomics faces a fundamental challenge: conventional gene selection methods capture statistical variance but fail to decode the intrinsic geometric architecture of high-dimensional single-cell RNA sequencing data, leaving critical cancer-specific signals obscured by noise and biological heterogeneity. We present a topology-guided framework that harnesses persistent homology to extract structurally invariant, cancer-associated gene signatures from scRNA-seq data - moving beyond gene-level statistics toward shape-aware biological discovery. The framework integrates highly variable
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) progression involves complex gene regulatory interactions, yet conventional analyses often overlook genes that, while not canonical drivers, may contribute to network-level instability. In this study, we propose a dynamic computational framework that integrates time-series co-expression networks with an autoregressive neural network and local network entropy (ARNN-LNE) to quantify perturbation-induced changes in gene regulatory stability. Rather than relying on static correlation patterns, this framework evaluates how in silico perturbations influence network entropy to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiple sclerosis (MS) is a chronic, autoimmune, central nervous system disorder associated with demyelination and neuroinflammation. Current treatments decrease the risk of relapse, but are not always effective in preventing disease progression. Traditional Chinese medicine (TCM) has been known for multi-target activities, and Radix Bupleuri (RB) could be used in immune and inflammation system.
METHODS: A systems pharmacology approach was employed to screen the bioactive components of Radix Bupleuri based on pharmacokinetic parameters. Multiple sclerosis-related gene sets were o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer represents the second most prevalent malignancy among women in India and is etiologically linked to persistent infection with high-risk human papillomavirus (HPV) strains. Mesua ferrea Linn, a medicinal tree species distributed across the Eastern Himalayan region, Eastern Indian states, and the Western Ghats, has demonstrated anticancer potential in several preclinical investigations; however, its mechanistic basis in cervical cancer remains insufficiently elucidated. In this study, a network pharmacology-based workflow was employed to identify the phytochemicals of Mesua ferre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sphingosine-1-phosphate receptor 1 (S1PR1), a member of the G protein-coupled receptor (GPCR) family, is a crucial therapeutic target for various diseases. Activation of S1PR1 has been recognized as an effective therapeutic strategy for multiple sclerosis (MS), inflammatory bowel disease (IBD), and psoriasis. Natural products (NPs) serve as a rich source of bioactive compounds for drug discovery. Here, we aimed to discover novel S1PR1 agonists from NPs via multi-level virtual screening (VS). Using a validated HipHop pharmacophore model, we screened a database containing 54,642 NPs, followed by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite major advances in oncology, many chemotherapeutic agents still cause severe side effects that reduce quality of life, motivating new approaches for early detection and targeted elimination of cancer cells. Luminescent transition metal complexes are promising biomolecular probes as their photo-physical properties are dependent on the surrounding environment. This makes it possible to differentiate between different environments and as a result, allows for identification of abnormalities in DNA. However, reliable computational protocols to predict optical properties of transition metal i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) remains difficult to subtype using single omics layers. We conducted an exploratory investigation integrating reverse-phase protein array (RPPA) and DNA methylation data from the cancer genome atlas (TCGA)- pancreatic adenocarcinoma (PAAD) to assess the feasibility of multi-omics subtyping, alongside a supervised machine learning analysis of a small gene expression omnibus (GEO) transcriptomic cohort (n = 26) to identify candidate diagnostic genes. RPPA-based K-means clustering suggested a weak, possible two-subtype structure (silhouette ≈ 0.16) that rem
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α- and β-Amyrins are biologically important pentacyclic triterpenoids that occur at low levels in natural sources, making their isolation difficult. In this study, a simple and cost-effective semisynthetic route was developed to obtain α- and β-amyrins from ursolic acid and oleanolic acid in three steps, and the products were characterized by NMR, FT-IR, and HRMS. The compounds were evaluated against 32 therapeutically relevant targets using molecular docking, MM-GBSA, and molecular dynamics simulations. Estrogen receptor α (ERα) and androgen receptor (AR) were identified as the most promising
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucoepidermoid carcinoma (MEC), the most prevalent malignant salivary gland cancer, remains incompletely characterized at the molecular level. An integrated analytical pipeline was employed, combining differential expression analysis, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), resampling-based stability selection, machine learning, and cross-platform validation to identify robust diagnostic biomarkers for MEC. Two public microarray datasets (GSE169753 and GSE262344) were harmonized to form a discovery cohort of 49 samples (39 MEC and 10 normal salivary gland tissues) comprising 19,5
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ovarian cancer remains one of the most lethal gynaecological malignancies due to its late diagnosis, and resistance to conventional therapies. Traditional Chinese Medicine (TCM) is increasingly explored for its potential in cancer treatment. This study investigates the anti-tumor effects of a Chinese herbal extract on an ovarian cancer cell line in vitro.
METHODS: The ovarian cancer cell lines OVCAR-3 and SK-OV-3 treated with varying concentrations of the Chinese herbal extract (Astragalus radix) at different course of time. Cell viability using the MTT assay, and apoptosis was ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric carcinoma remains a major health burden with poor response to standard chemotherapy and a median overall survival of approximately one year. Glucocorticoid receptors (GRs) play a dual role in cancer by modulating inflammation, immune responses, and tumor progression, yet their prognostic relevance in gastric cancer remains unclear. To identify robust prognostic markers, we explored the role of glucocorticoid receptor-related genes in disease progression and immune modulation. Gene expression and clinical data of 448 patients from TCGA were used as the training cohort, while GSE54129 (n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seventeen electronic states of the dication VH2+ were characterized by the SA-CASSCF/icMRCI methodology using very extended basis sets; 11 were described for the first time. Potential energy curves were constructed and the associated spectroscopic parameters evaluated. Triplet and quintet states correlating with the V2+ + H channel are thermodynamic stable. For states dissociating into the channel V+ + H+, avoided crossings at large distances give rise to thermodynamic metastability but do not affect the characterization of the bound region. Configuration state functions with the 3σ orbital /d
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Various electronically excited states and the feasibility of direct laser cooling of SH, SeH, and TeH are investigated using the highly accurate ab initio and dynamical methods. For the detailed calculations of the seven low-lying Λ-S states of SH, we utilized the internally contracted multireference configuration interaction approach, considering the spin-orbit coupling (SOC) effects. Our calculated spectroscopic constants are in very good agreement with the available experimental results. It is found that, from SH to TeH, the crossing points among the A2Σ+ and three electronically excited st
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) is a dangerous form of leukemia, which disturbs the bone marrow and irregular White Blood Cells (WBC) for the persons of all age groups. Early diagnosis of leukemia is necessary to provide appropriate care and cure the patients. Still, the detection of ALL from Peripheral Blood Smear (PBS) images is complicated due to the size and shape of the cells. This variability creates more difficulty for the segmentation and classification of Leukemia. To solve these issues, the Deep Kronecker Wide Residual Network (DKWRN) is developed for classifying Leukemia. The blo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.