Non-typhoidal Salmonella infections represent a substantial burden of illness in humans, and the increasing prevalence of antimicrobial resistance among these infections is a growing concern. Using a combination of Salmonella isolate short-read whole-genome sequence data from select human cases, raccoons, livestock and environmental sources, and an epidemiological framework, our objective was to determine if there was evidence for potential transmission of Salmonella and associated antimicrobial resistance determinants between these different sources in the Grand River watershed in Ontario, Ca
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over the last two decades, there have been three deadly human outbreaks of coronaviruses (CoVs) caused by SARS-CoV, MERS-CoV, and SARS-CoV-2, which has caused the current COVID-19 global pandemic. All three deadly CoVs originated from bats and transmitted to humans via various intermediate animal reservoirs. It remains highly possible that other global COVID pandemics will emerge in the coming years caused by yet another spillover of a bat-derived SARS-like coronavirus (SL-CoV) into humans. Determining the Ag and the human B cells, CD4+ and CD8+ T cell epitope landscapes that are conserved amo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The material properties of bone are the sum of the complex and interrelated anabolic and catabolic processes that modulate formation and turnover. The 2q33-37 region of the human genome contains quantitative trait loci important in determining the broadband ultrasound attenuation (an index of trabecular microarchitecture, bone elasticity, and susceptibility to fracture) of the calcaneus, but no genes of significance to bone metabolism have been identified in this domain. Secreted phosphoprotein-24 kd (SPP24 or SPP2) is a novel and relatively poorly characterized growth hormone-regulated gene t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is the most prevalent form of squamous cell carcinomas of the head and neck (SCCHN), accounting for over 90 % of all oral cavity malignancies (approximately 275,000 new cases are worldwide diagnosed annually). Early-stage oral squamous cell carcinoma (T1 and T2) has a 5-year survival rate of up to 80 %. Survival rates decrease to 20-30 % at later stages (T3-T4). Each year, there are between 275,000 and 300,000 new cases of OSCC, and over 150,000 deaths worldwide. OSCC are usually non-hereditary tumors, although familial epidemiology has been rece
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Patient-specific human leukocyte antigen (HLA) genomic loss (HLA loss) is one of the reputed mechanisms of leukemia immune escape and relapse after haploidentical hematopoietic stem cell transplant (HSCT). However, clinical characteristics and prognosis of this distinct relapse type in the setting of haploidentical HSCT based on antithymocyte globulin (ATG) T-cell-replete conditioning are still unknown, especially for patients with lymphoid leukemia.
OBJECTIVE: To identify the incidence of and patient characteristics associated with HLA loss at hematologic cancer relapse after ATG
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The entire H5N1 highly pathogenic avian influenza viral genomes were identified in the frozen autopsy specimens: the trachea, lung, colon, and intestinal feces from a patient who died of the disease in 2006. Phylogenetic analysis of the viral genomes showed that these viruses belonged to clade 1 and were the reassortants generated from the reassortment of the viruses within the same clade. The sequencing data from the autopsy specimens revealed at least 8 quasispecies of the H5N1 viruses across all 4 specimen types. These sequences were compared to those derived from the virus isolates grown i
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The large genome of human cytomegalovirus (HCMV) is transcribed by RNA polymerase II (Pol II). However, it is not known how closely this betaherpesvirus follows host transcriptional paradigms. We applied PRO-Seq and PRO-Cap methods to profile and quantify transcription initiation and productive elongation across the host and virus genomes in late infection. A major similarity between host transcription and viral transcription is that treatment of cells with the P-TEFb inhibitor flavopiridol preempts virtually all productive elongation, which otherwise covers most of the HCMV genome. The deep,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wastewater antimicrobial resistance (AMR) surveillance is limited in many low- and middle-income countries where wastewater infrastructure is absent or inadequate. Surface water may provide an alternative for AMR surveillance in such settings. We investigated the resistome, virulome, and phylogenetic relationships of ESBL-producing Escherichia coli (ESBL-Ec) from surface water (SW), healthy residents (HR), and a clinical facility (CL) to determine whether SW isolates reflect human-associated AMR. During an eight-month longitudinal study in South Africa, 95 ESBL-Ec isolates (SW = 32, HR = 32, C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Giardia duodenalis, a major cause of waterborne infection, infects a wide range of mammalian hosts and is subdivided into eight genetically well-defined assemblages named A through H. However, fragmented genomes and a lack of comparative analysis within and between the assemblages render unclear the molecular mechanisms controlling host specificity and differential disease outcomes. To address this, we generated a near-complete de novo genome of AI assemblage using the Oxford Nanopore platform by sequencing the Be-2 genome. We generated 148,144 long-reads with quality scores of > 7. The final
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report complete genome sequences of two Leptospira isolates, Leptospira borgpetersenii strain HP364 and Leptospira weilii strain SC295. The genome sizes of L. borgpetersenii strain HP364 and L. weilii strain SC295 were 3,874,738 bp and 4,063,712 bp, respectively. Both genomes have been deposited in NCBI GenBank.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood genomic profiling has been applied to disorders of the blood and various organ systems including brain to elucidate disease mechanisms and identify surrogate disease markers. Since most studies have not examined specific cell types, we performed a preliminary genomic survey of major blood cell types from normal individuals using microarrays. CD4+ T cells, CD8+ T cells, CD19+ B cells, CD56+ natural killer cells, and CD14+ monocytes were negatively selected using the RosetteSep antibody cocktail, while polymorphonuclear leukocytes were separated with density gradient media. Genes different
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Familial hyperaldosteronism type II (FH-II) is characterized by inheritance of primary aldosteronism (PAL) but, unlike FH-I, is not glucocorticoid remediable and not associated with the hybrid CYP11B1/CYP11B2 gene mutation. Analysis of two pedigrees previously demonstrated linkage of FH-II with a locus at chromosome 7p22. We sought to determine whether mutations in the exons or intron/exon boundaries in PRKAR1B (encoding protein kinase A regulatory subunit R1-beta), which resides within the linked locus, are associated with FH-II.
METHODS: Primers enabling sequencing of all exons a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biogeographic partitioning of the genome is typical of the gastric pathogen Helicobacter pylori. Such population-specific evolution could serve as a model for understanding host-pathogen interaction and the impact of genetic drift and recombination on insular populations. With a total of 320 isolates from six geographic regions (Japan, India, England, Spain, Ireland, Africa, and Peru) analyzed by enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC)-based genotyping, we examined genetic affinities among various H. pylori populations in the world. Several strain-specific and region-specific di
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gamma-aminobutyric acid (GABA) receptors are the major inhibitory neurotransmitter receptors in the brain and the site of action of a number of important pharmacological agents including barbiturates, benzodiazepines, and ethanol. The gamma 1 and gamma 2 subunits have been shown to be important in mediating responses to benzodiazepines, and a splicing variant of the gamma 2 subunit, gamma 2L, has been shown to be necessary for ethanol actions on the receptor, raising the possibility that the gamma 2 gene may be involved in human genetic predisposition to the development of alcoholism. We h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human microtubule-associated protein Tau (τ) is abundant in the axons of neurons where it stabilizes microtubule bundles; abnormally hyperphosphorylated τ is a hallmark of Alzheimer's disease (AD) and related tauopathies. The hyperphosphorylation events can be recognized by phosphotyrosine-recognition domain SH2 (Src homology 2) to elicit downstream τ signaling in AD pathology. In this study, a comprehensive binary interaction map (CBIM) of all the 6 τ phosphotyrosine sites with 120 SH2 domains in the human genome was systematically created at structural level using computational analyses and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV) can cause self-limiting acute and chronic hepatitis infections, particularly in immunocompromised individuals. In developing countries, HEV is mainly transmitted via drinking contaminated water, whereas zoonotic transmission dominates the route of infection in developed countries, including Japan. Pigs are an important reservoir for HEV infection. Wild boars, which share the same genus and species as domestic pigs, are also an HEV reservoir. During our nationwide study of HEV infection in wild boar populations in Japan, a genotype 6 (HEV-6) strain, wbJHG_23, was isolate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long-term exposure to halobenzoquinones (HBQs) can induce genomic damages and abnormal epigenetic modifications. High-performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (HPLC-MS/MS) has shown unique advantages in identification and sensitive analysis of these structurally modified DNA lesions. Prior to MS analysis, genomic DNA needs to be fully digested into mono-nucleosides. Here, we prepared Supernuclease (SN)-, snake venom phosphodiesterase (SVP)- and calf intestinal alkaline phosphatase (CIP)- individually immobilized magnetic nanoparticles (MNPs), and combined them according to ce
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic treatment of sick dairy cattle is critical for the sustainability of this production system which is vital for food security and societal prosperity in many low and middle-income countries. Given the increasingly high levels of antibiotic resistance worldwide and the challenge this presents for the treatment of bacterial infections, the rational use of antibiotics in humans and animals has been emphatically recommended in the spirit of a "One Health" approach. The aim of this study was to characterize antimicrobial resistance (AMR) genes and their frequencies from whole genome seque
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To characterize one OXA-232-producing wzi93-KL112-O1 carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) co-harboring chromosomal bla CTX-M-15 and one rmpA2-associated virulence plasmid.
METHODS: Minimum inhibitory concentrations (MICs) were measured via broth microdilution method. Conjugation, chemical transformation, string test and Galleria mellonella infection model experiments were also conducted. Whole-genome sequencing (WGS) was performed on the Illumina and Nanopore platforms. Antimicrobial resistance determinants were identified using ABRicate program with ResFinder databas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT.—: Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) alterations occur in several solid tumors, including urothelial carcinoma. Although HER2-targeted therapies, such as trastuzumab deruxtecan, have shown promising results in HER2-positive bladder cancer, optimal immunohistochemistry (IHC) scoring criteria for urothelial carcinoma remain unclear.
OBJECTIVE.—: To compare American Society of Clinical Oncology (ASCO) and College of American Pathologists (CAP) HER2 IHC scoring criteria for breast and upper gastrointestinal (GI) cancers in urothelial carcinoma and to correlate HER2 expressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования