Osteoarthritis is a prevalent and severe disease. Involvement of the trapeziometacarpal joint is common and can lead to both pain and disability. Genetics are known to affect the risk of osteoarthritis, but it remains unclear how genetics affect disease trajectories. In this study, we investigated whether the genetic associations of trapeziometacarpal osteoarthritis (rhizarthrosis) vary with the need for surgical treatment. The study was conducted as a case-control genome-wide association study using individuals from the Copenhagen Hospital Biobank pain and degenerative musculoskeletal disease…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Nephrotic syndrome, a debilitating manifestation of kidney disease, often arises from diverse glomerular disorders and is accompanied by notable comorbidities. Despite indications of an immunological etiology, the precise role of immune cells in its pathogenesis remains unclear. This study aimed to elucidate the causal relationships between circulating immune cell phenotypes and nephrotic syndrome using a rigorous bidirectional Mendelian randomization approach.
METHODS: We conducted a bidirectional Mendelian randomization analysis leveraging public genome-wide association studies (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Numerous observational studies have suggested a correlation between sarcopenia and depression, but the nature of this relationship requires further investigation.
METHODS: This study employed bidirectional Mendelian randomization to explore this connection. Data from genome-wide association studies were used, encompassing measures of sarcopenia and mental factors, including depression and emotional states. The initial analysis concentrated on the impact of depression on sarcopenia, and then it examined the reverse relationship. The same methodology was applied to emotional data fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disorders associated with the immune system burden multiple organs, although the shared biology exists across the diseases. Preceding family-based studies reveal that immune diseases are heritable to varying degrees, providing the basis for immunogenomics. The recent cost reduction in genetic analysis intensively promotes biobank-scale studies and the development of frameworks for statistical genetics. The accumulating multi-layer omics data, including genome-wide association studies (GWAS) and RNA-sequencing at single-cell resolution, enable us to dissect the genetic backgrounds of immune-rel
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A link between rheumatoid arthritis (RA) and periodontitis (PD) has been established. However, their causal relationship remains unclear and the effect of different serotypes of RA on the PD development has not been investigated. This study aims to elucidate the causal association between PD and different serotypes of RA using Mendelian randomization (MR).
METHODS: A bidirectional two-sample MR analysis was performed using available large-scale genome-wide association studies statistics. The inverse-variance weighted (IVW) or multiplicative random-effects IVW was used to determine
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Increases in the availability of genetic data and advances in the tools and methods for their analyses have enabled well-powered genetic association studies that have significantly enhanced our understanding of the genetic factors underlying both rare and common valve diseases. Valvular heart diseases, such as congenital valve malformations and degenerative valve lesions, increase the risk of heart failure, arrhythmias, and sudden death. In this review, we provide an updated overview of our current understanding of the genetic mechanisms underlying valvular heart diseases. W
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Trichotillomania (TTM) and excoriation disorder (ED) are impairing obsessive-compulsive related disorders that are common in the general population and for which there are no clear first-line medications, highlighting the need to better understand the underlying biology of these disorders to inform treatments. Given the importance of genetics in obsessive-compulsive disorder (OCD), evaluating genetic factors underlying TTM and ED may advance knowledge about the pathophysiology of these body-focused repetitive behaviors.
AIM: In this systematic review, we summarize the available ev
Систематический обзорСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related hearing loss (ARHL) is a major health concern among the elderly population. It is hoped that increasing our understanding of its underlying pathophysiological processes will lead to the development of novel therapies. Recent genome-wide association studies (GWASs) discovered a few dozen genetic variants in association with elevated risk for ARHL. Integrated analysis of GWAS results and transcriptomics data is a powerful approach for elucidating specific cell types that are involved in disease pathogenesis. Intriguingly, recent studies that applied such bioinformatics approaches to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The gut microbiota may be involved in neuropathic pain. However, the causal association between gut microbiota and neuropathic pain remains unclear. Whether immune cells and inflammatory factors mediate the pathway from gut microbiota to neuropathic pain has not been elucidated.
METHODS: We obtained the summary data of 412 gut microbiota, 731 immune cells, 91 inflammatory factors, and five types of neuropathic pain (drug-induced neuropathy, postherpetic neuralgia, sciatica, trigeminal neuralgia, and unspecified neuralgia) from large-scale genome-wide association study (GWAS) datas…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Migraine is a complex neurovascular disease with a range of severity and symptoms, yet mostly studied as one phenotype in genome-wide association studies (GWAS). Here we combine large GWAS datasets from six European populations to study the main migraine subtypes, migraine with aura (MA) and migraine without aura (MO). We identified four new MA-associated variants (in PRRT2, PALMD, ABO and LRRK2) and classified 13 MO-associated variants. Rare variants with large effects highlight three genes. A rare frameshift variant in brain-expressed PRRT2 confers large risk of MA and epilepsy, but not MO.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Psoriasis is a chronic inflammatory skin disease affecting approximately 60 million people worldwide. Genome-wide association studies (GWAS) have allowed identification of novel therapeutic targets in psoriasis including tyrosine kinase 2 (TYK2) where an exonic variant within the gene increases the risk of developing psoriasis.
AREAS COVERED: This review discusses the role of TYK2 in psoriasis pathogenesis, how that relates to genetic variants and recently published ground-breaking clinical trials of novel TYK2 inhibitors. Keyword searches of PubMed were made until January 2023,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWAS) have dissected numerous genetic factors underlying refractive errors (RE) such as myopia. Despite significant insights into understanding the genetic architecture of RE, few studies have validated and explored the functional role of candidate genes within these loci. To functionally follow-up on GWAS and characterize the potential role of candidate genes on the development of RE, we prioritized nine genes (TJP2, PDE11A, SHISA6, LAMA2, LRRC4C, KCNQ5, GNB3, RBFOX1, and GRIA4) based on biological and statistical evidence; and used CRISPR/cas9 to generate kno
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: While numerous studies have highlighted an increased prevalence of depression in individuals with narcolepsy, their conclusions are often clouded by potential confounding factors, leaving the causal relationship uncertain. This study posits that narcolepsy might heighten the risk of depression and employs a two-sample Mendelian randomization analysis to investigate this hypothesis.
METHODS: Summary statistics were obtained from genome-wide association studies databases and performed a two-sample MR analysis. The inverse-variance weighted method was employed as the primary approach
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWASes) aim to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with a given phenotype. A common approach for the analysis of GWAS is single marker analysis (SMA) based on linear mixed models (LMMs). However, LMM-based SMA usually yields a large number of false discoveries and cannot be directly applied to non-Gaussian phenotypes such as count data.
RESULTS: We present a novel Bayesian method to find SNPs associated with non-Gaussian phenotypes. To that end, we use generalized linear mixed models (GLMMs) and, thus, call our method Bayesia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Common genetic variants across individuals modulate the cellular response to pathogens and are implicated in diverse immune pathologies, yet how they dynamically alter the response upon infection is not well understood. Here, we triggered antiviral responses in human fibroblasts from 68 healthy donors, and profiled tens of thousands of cells using single-cell RNA-sequencing. We developed GASPACHO (GAuSsian Processes for Association mapping leveraging Cell HeterOgeneity), a statistical approach designed to identify nonlinear dynamic genetic effects across transcriptional trajectories of cells.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The occurrence of gout is closely related to metabolism, but there is still a lack of evidence on the causal role of metabolites in promoting or preventing gout.
METHODS: We applied a two-sample Mendelian randomization (MR) analysis to assess the association between 486 serum metabolites and gout using genome-wide association study statistics. The inverse variance weighting method was used to generate the main results, while sensitivity analyses using MR-Egger, weighted median, Cochran's Q test, Egger intercept test, and leave-one-out analysis, were performed to assess the stabili…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies identified several disease-causing mutations in neurodegenerative diseases, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS). However, the contribution of genetic variants to pathway disturbances and their cell type-specific variations, especially in glia, is poorly understood. We integrated ALS GWAS-linked gene networks with human astrocyte-specific multi-omics datasets to elucidate pathognomonic signatures. It predicts that KIF5A, a motor protein kinesin-1 heavy-chain isoform, previously detected only in neurons, can also potentiate disease pathways in astrocytes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Left ventricular regional wall thickness (LVRWT) is an independent predictor of morbidity and mortality in cardiovascular diseases (CVDs). To identify specific genetic influences on individual LVRWT, we established a novel deep learning algorithm to calculate 12 LVRWTs accurately in 42,194 individuals from the UK Biobank with cardiac magnetic resonance (CMR) imaging. Genome-wide association studies of CMR-derived 12 LVRWTs identified 72 significant genetic loci associated with at least one LVRWT phenotype (P < 5 × 10-8), which were revealed to actively participate in heart development and cont
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Primary progressive aphasia (PPA) is a neurodegenerative syndrome of progressive language decline. PPA has 3 main … een of 41 SNPs of left-handedness were associated with structural asymmetry of the cerebral cortex. Genome-wide association study summary statistics were obtained from publicly available databases for semantic (308 cases/616 controls) and agrammatic PPA (269 cases/538 controls). The logopenic PPA (324 cases/3,444 controls) was approximated by proxy through the rubric of clinic …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine fibroid is one of the most prevalent benign tumors in women, with high socioeconomic costs. Although genome-wide association studies (GWAS) have identified several loci associated with uterine fibroid risks, they could not successfully interpret the biological effects of genomic variants at the gene expression levels. To prioritize uterine fibroid susceptibility genes that are biologically interpretable, we conducted a transcriptome-wide association study (TWAS) by integrating GWAS data of uterine fibroid and expression quantitative loci data. We identified nine significant TWAS genes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.