The American cockroach, Periplaneta americana, is a cosmopolitan insect notorious for thriving among humans undeterred by attempts to eliminate it. The traits that contribute to its ubiquity as an opportunistic pest, such as long lifespan, expansive neurosensory capacity, and nutritional flexibility, also make P. americana an excellent invertebrate model organism with a long history in neuroscience and physiological research. Current genetic resources available for P. americana highlight its large, complex genome and richly diverse transcriptional capabilities, but fall short of producing a co
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural variants are critical to genetic diversity and disease, yet their detection remains challenging with conventional cytogenetic techniques, including karyotyping, fluorescence in situ hybridization, and chromosome microarray analysis. These methods often lack the resolution and sensitivity needed for comprehensive characterization of chromosomal aberrations. To address these limitations, we implemented genomic proximity mapping (GPM), a genome-wide chromosome conformation capture technology, in a clinical setting. Here, we applied GPM to a cohort of 123 individuals with constitutional
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pigs are recognised as crucial intermediate hosts for the emergence of influenza viruses of pandemic potential. As the largest pork-producing nation, China hosts a complex ecosystem of swine influenza viruses (SIVs). We aimed to investigate the evolutionary processes, spatiotemporal dynamics, and biological characteristics of SIVs in China.
METHODS: From Jan 15, 2016, to Dec 22, 2020, we collected nasal swabs from pigs at eight abattoirs and 16 swine farms in the Guangdong, Henan, and Shandong provinces of China, as part of SIV surveillance. SIVs were detected with RT-PCR. Positiv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sanguinoderma infundibulare is a newly discovered species of Ganodermataceae known to have high medicinal and ecological values. In this study, the whole-genome sequencing and comparative genomic analyses were conducted to further understand Ganodermataceae's genomic structural and functional characteristics. Using the Illumina NovaSeq and PacBio Sequel platforms, 88 scaffolds were assembled to obtain a 48.99-Mb high-quality genome of S. infundibulare. A total of 14,146 protein-coding genes were annotated in the whole genome, with 98.6% of complete benchmarking universal single-copy orthologs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic structural variants (SVs) play a pivotal role in driving the evolution of hematologic malignancies, particularly in leukemia, in which genetic abnormalities are crucial features. Detecting SVs is essential for achieving precise diagnosis and prognosis in these cases. Karyotyping, often complemented by fluorescence in situ hybridization and/or chromosomal microarray analysis, provides standard diagnostic outcomes for various types of SVs in front-line testing for leukemia. Recently, optical genome mapping (OGM) has emerged as a promising technique due to its ability to detect all SVs id
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Arsenic trioxide (ATO) is a promising anticancer drug for hematological malignancy. Given the dramatic efficacy of acute promyelocytic leukemia (APL), ATO has been utilized in other types of cancers, including solid tumors. Unfortunately, the results were not comparable with the effects on APL, and the resistance mechanism has not been clarified yet. This study intends to identify relevant genes and pathways affecting ATO drug sensitivity through genome-wide CRISPR-Cas9 knockdown screening to provide a panoramic view for further study of ATO targets and improved clinical outcomes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Listeria monocytogenes is a foodborne bacterium that could persist in food and food processing environments for a long time. Understanding the population structure and genomic characterization of foodborne L. monocytogenes is essential for the prevention and control of listeriosis.
METHODS: A total of 322 foodborne L. monocytogenes isolates from 13 geographical locations and four food sources in China between 2000 and 2018 were selected for whole-genome sequencing.
RESULTS: In silico subtyping divided the 322 isolates into five serogroups, 35 sequence types (STs), 26 clonal com
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glanders is a highly contagious and life-threatening zoonotic disease caused by Burkholderia mallei (B. mallei). Without an effective vaccine or treatment, early diagnosis has been regarded as the most effective method to prevent glanders transmission. Currently, the diagnosis of glanders is heavily reliant on serological tests. However, given that markedly different host immune responses can be elicited by genetically different strains of the same bacterial species, infection by B. mallei, whose genome is unstable and plastic, may result in various immune responses. This variability can make
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural anomalies of the central nervous system (CNS) are one of the most common fetal anomalies found during prenatal imaging. However, the genomic architecture of prenatal imaging phenotypes has not yet been systematically studied in a large cohort. Patients diagnosed with fetal CNS anomalies were identified from medical records and images. Fetal samples were subjected to low-pass and deep whole-genome sequencing (WGS) for aneuploid, copy number variation (CNV), single-nucleotide variant (SNV, including insertions/deletions (indels)), and small CNV identification. The clinical significanc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conventional avian genome editing is mediated by isolation, culture, and genome editing of primordial germ cells (PGCs); screening and propagating the genome-edited PGCs; and transplantation of the PGCs into recipient embryos. The PGC-mediated procedures, however, are technically difficult, and therefore, the conventional method has previously been utilized only in chickens. Here, we generated germline mosaic founder chicken and duck lines without the PGC-mediated procedures by injecting an adenovirus containing the CRISPR-Cas9 system into avian blastoderms. Genome-edited chicken and duck offs
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome instability is a hallmark of most human cancers and is exacerbated following replication stress. However, the effects that drugs/xenobiotics have in promoting genome instability including chromosomal structural rearrangements in normal cells are not currently assessed in the genetic toxicology battery. Here, we show that drug-induced replication stress leads to increased genome instability in vitro using proliferating primary human cells as well as in vivo in rat bone marrow (BM) and duodenum (DD). p53-binding protein 1 (53BP1, biomarker of DNA damage repair) nuclear bodies were increas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammation, an old medical problem, is being recognized as an active, well orchestrated biological process. When dysregulated, chronic inflammation may ensue, leading to tissue-dependent diseases. Depending upon the ligand and cellular context, aryl hydrocarbon receptor (AHR) may accelerate or attenuate inflammation and subsequent resolution. Three examples are discussed in which AHR modulates inflammation by a mixture of genomic and non-genomic signaling pathways: (i) AHR-agonistic bacterial virulence factors are leading to both microbial defense and resolution of inflammatory responses. (i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SUMMARY: Genome detective is a web-based, user-friendly software application to quickly and accurately assemble all known virus genomes from next-generation sequencing datasets. This application allows the identification of phylogenetic clusters and genotypes from assembled genomes in FASTA format. Since its release in 2019, we have produced a number of typing tools for emergent viruses that have caused large outbreaks, such as Zika and Yellow Fever Virus in Brazil. Here, we present the Genome Detective Coronavirus Typing Tool that can accurately identify the novel severe acute respiratory syn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Viral infections are considered the most frequent cause of myocarditis and dilated cardiomyopathy (DCM).
MATERIAL AND METHODS: We investigated the changes in viral presence and the impact of viral genome persistence in the myocardium on echocardiographic parameters, functional status and some laboratory parameters in a 6-month follow-up. Fifty-four patients with recent onset DCM, left ventricular ejection fraction < 40% and biopsy-proven myocarditis (> 14 mononuclear leukocytes/mm2 and/or > 7 T-lymphocytes/mm2) were enrolled. Polymerase chain reaction (PCR) was performed to dete
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism spectrum disorder (ASD) is a neurodevelopmental disorder with considerable clinical and genetic heterogeneity. In this study, we identified all classes of genomic variants from whole-genome sequencing (WGS) dataset of 32 Chinese trios with ASD, including de novo mutations, inherited variants, copy number variants (CNVs) and genomic structural variants. A higher mutation rate (Poisson test, P < 2.2 × 10-16) in exonic (1.37 × 10-8) and 3'-UTR regions (1.42 × 10-8) was revealed in comparison with that of whole genome (1.05 × 10-8). Using an integrated model, we identified 87 potentially ri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Human Genome Project (HGP) was initiated in 1990 and completed in 2003. It aimed to sequence the whole human genome. Although it represented an advance in understanding the human genome and its complexity, many questions remained unanswered. Other projects were launched in order to unravel the mysteries of our genome, including the ENCyclopedia of DNA Elements (ENCODE). This review aims to analyze the evolution of scientific knowledge related to both the HGP and ENCODE projects. Data were retrieved from scientific articles published in 1990-2014, a period comprising the development and the
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmodium knowlesi is a newly described zoonosis that causes malaria in the human population that can be severe and fatal. The study of P. knowlesi parasites from human clinical isolates is relatively new and, in order to obtain maximum information from patient sample collections, we explored the possibility of generating P. knowlesi genome sequences from archived clinical isolates. Our patient sample collection consisted of frozen whole blood samples that contained excessive human DNA contamination and, in that form, were not suitable for parasite genome sequencing. We developed a method to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A marine-derived actinobacteria Streptomyces sp. M10 was identified as a prolific antifungal compounds producer and shared a 99.02 % 16S ribosomal RNA (rRNA) sequence similarity with that of Streptomyces marokkonensis Ap1(T), which can produce polyene macrolides. To further evaluate its biosynthetic potential, the 7,207,169 bp Streptomyces sp. M10 linear chromosome was sequenced and mined for identifiable secondary metabolite-associated gene clusters. A total of 20 secondary metabolite-associated gene clusters were deduced, including three polyketide synthases (PKSs), four non-ribosomal peptid
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pneumoniae is a nasopharyngeal commensal that occasionally invades normally sterile sites to cause bloodstream infection and meningitis. Although the pneumococcal population structure and evolutionary genetics are well defined, it is not clear whether pneumococci that cause meningitis are genetically distinct from those that do not. Here, we used whole-genome sequencing of 140 isolates of S. pneumoniae recovered from bloodstream infection (n = 70) and meningitis (n = 70) to compare their genetic contents. By fitting a double-exponential decaying-function model, we show that these
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shigellosis or bacillary dysentery is endemic worldwide and is a significant cause of death in children less than five years of age in developing countries. There are no licensed Shigella vaccines and glycoconjugates are among the leading candidate vaccines against shigellosis today. We used whole genome sequence analysis (WGA) to find out whether immunization, with an investigational Shigella sonnei glycoconjugate, could induce selective pressure leading to changes in the genome of S. sonnei. An outbreak of culture-proven S. sonnei shigellosis which occurred immediately after vaccination in o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования