Urban soils accumulating multiple pollutants act as critical reservoirs for antibiotic resistance genes (ARGs) and pathogens, yet their vertical migration in industrial soils remains poorly understood. Here, we investigated antibiotics, ARGs, and pathogenic hosts in soil profiles (0-310 cm) from Shanghai's Taopu Industrial Park (China) using ultra-performance liquid chromatography tandem mass spectrometry and metagenomic sequencing. Nineteen antibiotics (0.7-113.6 ng g⁻¹) decreased exponentially with depth, influenced by polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs). Among 1183 ARG subtypes, 437 per
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Up to now, only a few scattered studies have provided some evidence for the relationship between gut microbiota and community-acquired pneumonia (CAP), and the mechanisms by which gut microbiota contributes to the occurrence and development of CAP via the gut-lung axis require further investigation. In this study, fecal and serum samples from CAP patients and healthy controls were analyzed using 16S rRNA gene sequencing and enzyme-linked immunosorbent assay. The results showed that compared with healthy controls, alpha-diversity of gut microbiota in CAP patients was significantly reduced, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BLCA) exhibits considerable heterogeneity, and research into its tumor microenvironment and prognostic biomarkers remains insufficient. This study aims to identify key prognostic genes and immune microenvironment factors to enhance clinical assessment. Primary tumor (PT) and lymph node metastasis (LNM) samples were obtained from patients with BLCA, and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was conducted to analyze cellular composition and functional variations. Prognostic genes were identified based on integrated bulk transcriptomic data, leading to the development of a risk m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sulfonamide antibiotics have become pervasive contaminants in karst systems, where low carbon and rapid infiltration hinder natural attenuation, leading to persistent groundwater pollution and elevated antibiotic resistance risks. Although root exudates shape soil microbial metabolism and resistance, their role at the karst soil-carbonate rock interface remains unclear. This study demonstrates that artificial root exudates (ARE) significantly boost sulfamethazine (SMZ) removal at the soil-carbonate rock interface, achieving up to 92.0 % (35.1 % higher than control). Analyses of 16S rRNA gene s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspergillus flavus is a clinically and agriculturally important saprotrophic fungus responsible for severe human infections and extensive crop losses. Here, we analyze genomic data from 300 (117 clinical and 183 environmental) A. flavus isolates from 13 countries, including 82 clinical isolates sequenced in this study, to examine population and pan-genome structure and their relationship to pathogenicity. We use single nucleotide polymorphisms to build a phylogeny, analyze admixture, and perform discriminant analysis of principal components. We identify five A. flavus populations, including a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nematode Nematodirus oiratianus is associated with major economic losses in the livestock industry, as it is a common gastrointestinal parasites of cattle, sheep, and other ruminants. These parasites primarily obtain nutrients by consuming the blood of their host. This study aimed to investigate changes in the intestinal microbiota of lambs infected with N. oiratianus before and after infection, using 16S rDNA sequencing technology. We aimed to reveal the impact of N. oiratianus infection on lamb intestinal microecology and to provide scientific evidence for the prevention and control of r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine tuberculosis susceptibility and pathogenesis are influenced by host immunity, which may be modulated by the host microbiota. While intestinal microbiota composition affects pulmonary diseases in humans, its role in bovine tuberculosis remains unclear. This study explores the intestinal microbiota of cattle and its association with tuberculosis to better understand disease pathophysiology. A case-control study was conducted using small intestine content samples from cattle with and without tuberculosis, slaughtered in Rio Grande do Sul, Brazil. DNA extraction, 16S rRNA (V4) sequencing, a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nontuberculous mycobacteria (NTM) are increasingly recognized as important opportunistic pathogens, particularly in immunocompromised individuals. We discovered a newly identified NTM, initially misidentified as Mycobacterium paraffinicum, isolated from a 42-year-old female with an eight-year history of persistent pulmonary infection. The pathogen shares high molecular similarities with Mycobacterium paraffinicum, Mycobacterium nebraskense, and Mycobacterium scrofulaceum, exhibiting atypical acid-fast properties and slow growth. Phylogenetic analysis and pairwise comparisons based on digital D
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NPs have become a concerning global environmental problem. Dietary exposure to NPs can cause microbial dysbiosis. However, the risks of NPs to animals, particularly poultry species such as chickens, remain poorly understood. In this study, chickens were continuously exposed to 100 nm NPs via dietary inclusion from 18 weeks of age for 120 days to evaluate the effects of NPs on intestinal health. We found that NPs accumulated in chicken intestinal tissues, leading to adverse alterations in the intestinal mucosal structure, such as villus atrophy and goblet cell depletion, and significantly alter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) not only affects cognition and neuropathology, but several other facets capable of negatively impacting quality of life and potentially driving impairments, including altered gut microbiome (GMB) composition and metabolism. Aged (20 + mo) female TgF344-AD and wildtype rats were cognitively characterized on several tasks incorporating several cognitive domains, including task acquisition, object recognition memory, anxiety-like behaviors, and spatial navigation. Additionally, metabolic phenotyping, GMB sequencing throughout the intestinal tract (duodenum, jejunum, ileum
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite widespread industrial use, the environmental safety of hydroquinone (HQ), a benzene compound from plants used in processes like cosmetics, remains uncertain. This study evaluated the ecotoxicological impact of HQ on soil and river environments, utilizing non-target indicator organisms from diverse trophic levels: Daphnia magna, Aliivibrio fischeri, Allium cepa, and Eisenia fetida. For a more environmentally realistic assessment, microbial communities from a river and untreated soil underwent 16S rRNA gene sequencing, with growth and changes in community-level physiological profiling as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Captivity is an important and efficient technique for rescuing endangered species. However, it induces infertility, and the underlying mechanism remains obscure. This study used the plateau pika (Ochotona curzoniae) as a model to integrate physiological, metagenomic, metabolomic, and transcriptome analyses and explore whether dysbiosis of the gut microbiota induced by artificial food exacerbates infertility in captive wild animals. Results revealed that captivity significantly decreased testosterone levels and the testicle weight/body weight ratio. RNA sequencing revealed abnormal gene express
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lung macrophages play a crucial role in health and disease. Sexual dimorphism significantly impacts the phenotype and function of tissue-resident macrophages. The primary mechanisms responsible for sexually dimorphic outcomes in bronchopulmonary dysplasia (BPD) remain unidentified. We tested the hypothesis that biological sex plays a crucial role in the transcriptional state of alveolar macrophages, using neonatal murine hyperoxia-induced lung injury as a relevant model for human BPD. The effects of neonatal hyperoxia exposure (95 % FiO2, PND1-5: saccular stage) on the lung myeloid cells a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenylate cyclase 3 (ADCY3) is a transmembrane protein predominantly expressed in the primary cilia of neurons. It plays a vital role in converting ATP to cAMP, a secondary messenger that regulates various downstream signaling pathways such as carbohydrates and lipids metabolism. Homozygous loss-of-function variants in the ADCY3 gene lead to severe early-onset obesity and insulin resistance whereas gain-of-function variants protect against obesity. To describe a novel pathogenic ADCY3 variant implicated in early-onset obesity and functionally characterize this variant via in vitro and in silic
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hirschsprung-associated enterocolitis (HAEC) stands as most common and serious complication of Hirschsprung's disease. Variations in the microbiota composition may account for the differences observed between HAEC and healthy individuals, offering crucial insights into the disease's pathogenesis. Here, we performed a study to changes in the gut microbiome using 16sRNA amplicon sequencing in a cohort of HAEC patients ( n = 16) and healthy controls ( n = 14). Our result revealed a significant disparity in beta diversity between the two groups. Following correction for false discovery rate, a r
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antiviral drugs are used globally as treatment and prophylaxis for long-term and acute viral infections. Even though antivirals also have been shown to have off-target effects on bacterial growth, the potential contributions of antivirals to antimicrobial resistance remains unknown. Herein we explored the ability of different classes of antiviral drugs to induce antimicrobial resistance. Our results establish the previously unrecognized capacity of antivirals to broadly alter the phenotypic antimicrobial resistance profiles of both gram-negative and gram-positive bacteria Escherichia coli and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore the role of gut microbiota in Graves' disease (GD) and Hashimoto's thyroiditis (HT). Seventy fecal samples were collected, including 27 patients with GD, 27 with HT, and 16 samples from healthy volunteers. Chemiluminescence was used to detect thyroid function and autoantibodies (FT3, FT4, TSH, TRAb, TGAb, and TPOAb); thyroid ultrasound and 16S sequencing were used to analyze the bacteria in fecal samples; KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) and COG (Clusters of Orthologous Groups) were used to analyze the functional prediction and pathogenesis. The overall structure of gu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia is a debilitating mental disorder and often has a prodromal period, referred to as clinical high risk (CHR) for psychosis, prior to the first episode. The etiology and pathogenesis of schizophrenia remain unclear. Despite the human gut microbiome being associated with schizophrenia, the role of the oral microbiome, which is a vital player in the mouth-body connection, is not well understood. To address this, we performed 16S rRNA gene sequencing to investigate the salivary microbiome in 85 patients with drug-naïve first-episode schizophrenia (FES), 43 individuals at CHR, and 80 h
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is now well established that the Gram-negative bacterium, Helicobacter pylori, causes gastritis in humans. In recent years, it has become apparent that the so-called non-pylori Helicobacters, normally infecting pigs, cats, and dogs, may also be involved in human pathology via zoonotic transmission. Indeed, more than 30 species of non-pylori Helicobacters have been identified thus far. One such organism is Helicobacter canadensis, an emerging pathogen whose genome sequence was published in 2009. Given our long-standing interest in the biosynthesis of N-formylated sugars found in the O-antige
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: USA300 produces Panton-Valentin leucocidin (PVL) and is known as a predominant community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strain in the United States, but it was extremely rare in Japan. We report here an outbreak of USA300 in people with HIV (PWH) in Tokyo, Japan.
METHODS: We analyzed the cases of PVL-MRSA infection between 2010 and 2020 and screened for nasal colonization of PVL-MRSA in PWH who visited an HIV/AIDS referral hospital from December 2019 to March 2020. Whole-genome sequencing-based single nucleotide polymorphism (SNP) analysis was perfor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования