Microsatellite instability (MSI) has gained increasing attention as a promising biomarker for cancer immunotherapy in diverse cancer types. As a result of DNA mismatch repair (MMR) deficiency, MSI tumors show a hypermutator phenotype. Based on this feature, many computational methods have been developed to predict MSI with DNA sequencing data or mRNA expression data. Using the methylation data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) program, we developed MethylMSI, a support vector machine (SVM) model based tool for MSI classification in three cancer cohorts (colorectal, stomach and endometrial ca
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer remains a major global health challenge, underscoring the need to identify novel and effective therapeutic targets. In this study, we constructed a high-confidence cancer protein-protein interaction network and selected the largest connected component, comprising 2564 cancer-associated proteins linked by 20,747 interactions. We then evaluated 11 centrality measures to quantify the node importance. Using the TOPSIS multi-criteria decision-making approach, we ranked 2564 cancer-associated genes and identified the top 1 % (26 genes) as high-priority candidates. Drug-target mapping showed t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometriosis is an inflammatory disease, involving immune cell infiltration and production of inflammatory mediators. Ferroptosis has recently been recognized as a mode of controlled cell death and the iron overload and peroxidative environment prevailing in the ectopic endometrium facilitates the occurrence of ferroptosis. In the current investigation, gene expression data was obtained from the dataset GSE7305.The variation in infiltration of immune cells amongst the samples with endometriosis and normal tissue was analysed using the CIBERSORTx tool which revealed higher infiltration of T ce
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Designing new anticancer agents requires understanding how ligands affect target protein dynamics. AXL kinase has recently emerged as a promising therapeutic target in cancer therapy. In this study, we performed comprehensive comparative analyses of two ligand-bound AXL kinase complexes (PDB IDs: 5U6B and 7DXL) using molecular dynamics simulations, contact mapping, residue-level flexibility analysis, binding free energy calculations, free energy surface (FES) exploration, and ligand unbinding studies. Results showed that both ligands stabilized the core region via hydrophobic and van der Waals
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gout, a prevalent form of inflammatory arthritis, affects individuals of all ages and is increasing worldwide. It is closely associated with hyperuricemia, a condition caused by excessive uric acid production. Xanthine oxidase (XO) inhibitors play a key role in managing hyperuricemia, making the discovery of new and effective inhibitors a priority in drug development. In this study, computational methods were employed to screen natural compounds for their potential to inhibit XO. A total of 4947 compounds derived from 71 Vietnamese medicinal herbs were subjected to molecular docking simulation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Testicular cancer continues to rise in incidence globally, and conventional chemotherapy is often associated with severe side effects that significantly impact patient's quality of life. Identifying safer alternative therapies is becoming crucial day by day which leads to focus on naturally available phytocompounds with high bioactivity. Over the period of time, Nigella sativa (N. sativa) has garnered attention due to the presence of its rich bioactive compounds with antioxidant and anticancer properties, providing potential therapeutic benefits with minimal side effects. Since we used a netwo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontal disease, or periodontitis, is a chronic inflammatory condition affecting the tissues supporting teeth, with epigenetic mechanisms such as DNA methylation, histone modifications, and RNA molecules playing a crucial role in its progression. Histone deacetylase (HDAC) inhibitors have shown potential in treating inflammatory diseases by modulating gene expression to suppress inflammation and promote tissue regeneration. Machine learning models, particularly Kolmogorov-Arnold Networks (KANs), provide an advanced solution for predicting drug-gene associations, offering superior accuracy,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hetero coalescences of the Cu147 and Ag147 clusters at room temperature and 1300 K have been simulated by molecular dynamics approaches within embedded atom method framework, and then the structural transformation of alloying clusters formed after the coalescence is investigated during heating and cooling. The activation energy is used to describe the potential barriers that need to be overcome to carry out the merger, the potential energy characterizes the structural transition the free energy difference reflects the driving force for the coalescence of the clusters. The simulation result
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACE-1 is a prime therapeutic target for treatment of Alzheimer disease as it cleaves the β-site of APP leading to formation of amyloid plaques. A dataset of 229 benzo-fused heterocyclic compounds reported as BACE-1 inhibitors was utilized to develop various QSAR models (regression and classification) utilizing Monte Carlo algorithm. The dataset was randomly split into different sets for generation of models. The IIC and CCC were calculated to increase the predictive ability of generated models. Among various models, split-1 of Model-1 demonstrated the highest robustness and predictive accurac
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of single-cell multi-omics sequencing technologies provides new insights into cell heterogeneity. Cell clustering is a crucial step in the analysis of multi-omics data. However, existing methods often overlook variations in data quality across omics, leading to unreliable feature representations. To address this issue, we propose scUCAF, an uncertainty-aware network for multi-omics clustering. Specifically, to mitigate the impact of noise on cell feature extraction, we introduce a variational autoencoder with a negative binomial distribution. After extracting each omics feature
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholangiocarcinoma (CCA) is an aggressive bile duct malignancy with a poor prognosis and limited treatment options. Recent studies highlight the role of metabolic and signalling pathways in tumour progression and resistance, including neurotransmitter-related pathways like gamma-aminobutyric acid (GABA). Key GABA-associated genes, such as Solute Carrier Family 6 Member 12 (SLC6A12), a GABA transporter and Glutamate Decarboxylase 1 (GAD1) involved in GABA synthesis, are implicated in cancer but remain poorly understood in CCA. This study aims to identify novel long non-coding RNAs (lncRNAs) spe
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The search for anticancer therapies remains imperative, as many existing treatments are hindered by drug resistance, limited efficacy, and undesirable side effects. This study explores the anticancer potential of four 4-heteroarylidenamino-4,5-dihydro-1H-1,2,4-triazol-5-one derivatives using molecular docking and molecular dynamics simulations. These compounds were evaluated against crucial cancer-related proteins, including kinases, histone demethylases, and metabolic regulators. Binding affinity analysis revealed that some derivatives exhibited comparable or superior docking scores to commer
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advancements of next-generation sequencing, publicly available pharmacogenomic datasets from cancer cell lines provide a handle for developing predictive models of drug responses and identifying associated biomarkers. However, many currently available predictive models are often just used as black boxes, lacking meaningful biological interpretations. In this study, we made use of open-source drug response data from cancer cell lines, in conjunction with KEGG pathway information, to develop sparse neural networks, K-net, enabling the prediction of drug response in EGFR signaling pathwa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vaccines stimulate cells of the adaptive immune system, generating a protective and lasting memory, and are the main public health strategy to protect the world population from emerging pathogens such as the SARS-CoV-2 virus, responsible for millions of deaths in the recent COVID-19 pandemic. Several in-silico algorithms have facilitated the selection of antigens as vaccine candidates; however, their predictive capacity remains limited and it is necessary to continue training them, using information obtained in immunological assays. In this work, the SARS-CoV-2 proteome was sampled using a ser
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) remains one of the most aggressive and treatment-resistant subtypes of breast malignancies, defined by the absence of hormone receptors and HER2 amplification. This study introduces an integrated computer-aided drug design (CADD) framework that combines Monte Carlo-optimized QSAR modeling, molecular docking, and in silico pharmacokinetic assessment to identify dual c-Met/β-tubulin inhibitors with potential anti-TNBC activity. Robust conformation-independent QSAR models were developed using SMILES- and graph-based descriptors, achieving high internal consist
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports the synthesis and assessment of a series of imide derivatives of phthalic anhydride (phthalimides) for their potential antimicrobial activities. Phthalic acid was first converted into phthalic anhydride using acetic anhydride, which was then reacted with various L-amino acids to obtain phthalimides in high yields. Compounds HUPB, HUPC, HUPF, and HUPH exhibited promising antimicrobial activity, with HUPF and HUPH being the most potent. HUPF exhibited significant antimicrobial activity, showing inhibition zones of 24 mm versus Staphylococcus aureus (at 2000 µg/mL), 17 mm versu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic cancer (PanCa) is a devastating disease with very low survival rate. Ferroptosis and cuproptosis, regulated forms of cell death, resulting from the accumulation of iron and copper ions, respectively are gaining increasing attention for their roles in tumor development. These non-apoptotic cell death forms would be worth to explore in the context of PanCa, as it is a difficult disease to treat and often become resistant to apoptosis inducing conventional therapeutic modes. So, targeting the transcription factors (TFs) regulating both these cell death pathways are critical for pancrea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Nano-biomaterials facilitate targeted drug delivery and serve as radio-sensitizers, reducing therapeutic doses and side effects while enhancing efficacy. This meta-analysis aims to investigate the impact of bismuth-based nanoparticles on enhancing radiosensitivity, specifically by evaluating the dose enhancement factor (DEF) in radiotherapy.
MATERIALS AND METHODS: This systematic review and meta-analysis evaluated the radiosensitizing effect of bismuth-based nanoparticles. PubMed, Web of Science, and Scopus were searched for eligible studies. The cumulative dose enhancement fact
СтатьяСистематический обзорМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecules with potent anti-leishmanial activity play a crucial role in identifying treatments for leishmaniasis and aiding in the design of novel drugs to combat the disease, ultimately protecting individuals and populations. Various methods have been employed to represent molecular structures and predict effective anti-leishmanial molecules. However, each method faces challenges and limitations that must be addressed to optimize the drug discovery and design process. Recently, machine learning approaches have gained significant importance in overcoming the limitations of traditional methods a
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Psoriasis is a common clinical skin inflammatory disease. Haitang-Xiaoyin Mixture (HXM) represents a traditional Chinese medicine formulation utilized clinically for the management of psoriasis, which can reduce the psoriasis area and severity index (PASI) score, IL-23 and IL-23 levels in patients with psoriasis. However, the main active components and specific targets of HXM in the treatment of psoriasis and the relevant mechanisms of action are not clear. Therefore, in the study we aimed to elucidate the mechanistic basis of HXM's therapeutic action in psoriasis treatment through
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования