BACKGROUND: Pancreatic cancer is a highly aggressive tumor with a poor prognosis due to challenging early diagnosis and limited treatment options. CHEK1, a crucial cell cycle regulator, is important in tumor development, but its role in pancreatic cancer remains under-researched in terms of expression, function, and regulation.
OBJECTIVE: To study the effect of CHEK1 on proliferation, migration and cell cycle of pancreatic cancer, and to construct a prognostic prediction model to investigate the effect of CHEK1 on the prognosis of pancreatic cancer.
METHODS: We conducted a systematic investi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) is the fifth most common type worldwide, representing a public health problem. Among the genes related to this tumorigenesis, the family of matrix metalloproteinases (MMPs), essential regulators of the extracellular matrix (ECM), stand out for their involvement in the development and progression of GC. Therefore, we aimed to evaluate MMP gene expression variation, its relationship with clinicopathological factors and its transcriptome-wide associations. To this end, RNAseq, correlation network, and biological pathway enrichment analyses were performed on tumor samples from
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is characterized by extreme molecular heterogeneity and poor prognosis. Understanding its multiomics molecular heterogeneity may facilitate precise classification and individualized treatment.
METHODS: Transcriptomic and proteomic profiles from 140 PDAC patients were integrated using Similarity Network Fusion (SNF) to identify robust molecular subtypes. Sparse partial least-squares discriminant analysis (sPLS-DA), differential expression analysis, and network-based functional enrichment were employed to characterize subtype-specific features
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Pancreatic ductal adenocarcinoma is a highly aggressive malignancy characterized by a fibroblast-rich tumor microenvironment. Cancer-associated fibroblasts closely interact with tumor cells and play a pivotal role in cancer pathogenesis. Single-cell analyses have identified distinct cancer-associated fibroblast subsets that exert either tumor-promoting or tumor-suppressive effects in pancreatic ductal adenocarcinoma. Senescent cancer-associated fibroblasts have recently been linked to poor prognosis through their senescence-associated secretory phenotype. However, the dynami
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is a major health concern and understanding its molecular characteristics is crucial for improving its diagnosis and treatment. Here, we present a comprehensive analysis utilizing RNA-sequencing (RNA-seq) data and clinical information from Korean patients with CRC. Differential gene expression analysis identified significant changes in gene expression between tumor and normal tissues. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) revealed dysregulated pathways associated with tumor progression. Furthermore, using CMScaller, we successfully stratified CRC tissues into distinct mol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The majority of colorectal cancers (CRC) exhibit low tumor mutational burden and an "immune-cold" microenvironment, with immune evasion initiating as early as the precancerous stage. This characteristic significantly limits the clinical efficacy of immunotherapy. Therefore, this study aimed to identify key targets and mechanisms underlying immune evasion in CRC through integrated multi-omics analysis. Transcriptomic analysis identified 1341 differentially expressed immune evasion-related genes (IERGs), with 674 up-regulated and 647 down-regulated. Among these, 11 core transcription factors (TF
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Cisplatin resistance remains a major obstacle in advanced gastric cancer (GC). This study aimed to identify key molecular determinants of cisplatin resistance, with a focus on interferon-stimulated genes (ISGs), and to systematically investigate the functional role of interferon-stimulated gene 15 (ISG15) in mediating chemoresistance.
MATERIALS AND METHODS: Candidate genes associated with cisplatin resistance were first identified through transcriptomic profiling of gastric cancer tissues. An integrative machine learning framework was applied to prioritize these genes: least a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung adenocarcinoma (LUAD) is a prevalent and aggressive form of lung cancer, characterized by late-stage diagnosis, high metastatic potential, and recurrence. Epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations are commonly observed in LUAD. However, other key genes associated with EGFR mutations in LUAD remain to be clarified. Therefore, this study aims to identify key genes associated with EGFR mutations in LUAD and explore their potential mechanisms.
METHODS: The Cancer Genome Atlas (TCGA)-LUAD and LUAD sequencing datasets were utilized to compare survival outcomes between EGFR-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: The difference in molecular characteristics of Triple negative breast cancer (TNBC) aids in distinguishing between its four prominent subtypes- basal-like 1, basal-like 2, mesenchymal, and luminal androgen receptor. This study presents the first integrative framework that combines explainable AI with machine learning approaches to classify TNBC subtypes. Unlike conventional models, our approach offers interpretability while enabling biomarker prioritization by identifying key hub genes that drive subtype-specific predictions.
METHODS: In the experiment 783 cases (BL1
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Inositol metabolism, a crucial regulatory mechanism in cellular signaling, plays a pivotal role in colorectal cancer (CRC) tumorigenesis and progression. While multiple inositol-metabolizing enzymes have been implicated in CRC development, a systematic characterization of inositol metabolism-associated gene signatures and molecular subtyping based on these regulators remains unexplored. METHODS: Transcriptomic profiles and clinical data of CRC patients were obtained from TCGA and GEO databases. Integrated transcriptomic analysis enabled the stratification of CRC into distinct inosi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive subtype lacking effective targeted therapies. Although immune checkpoint inhibitors such as pembrolizumab have improved clinical outcomes in a subset of patients, limited response rates and durability highlight the need for alternative strategies. Tumor-infiltrating lymphocyte (TIL)-based adoptive cell therapy represents a promising approach; however, the absence of reliable biomarkers for TIL functionality remains a major obstacle. In this study, we isolated TILs and autologous tumor cells from nine TNBC patients and classified TILs as rea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current breast cancer biomarkers rely predominantly on protein-coding transcriptomes, leaving the regulatory information encoded by enhancer RNAs (eRNAs) largely unexploited. Here, we profiled eRNA expression across 1073 The Cancer Genome Atlas Breast Cancer (TCGA-BRCA) samples integrated with The Cancer eRNA Atlas annotations, using GTEx healthy breast tissue (n = 179) as a curated normal reference. For prognostic stratification, least absolute shrinkage and selection operator (LASSO)-Cox regression identified a 10-eRNA signature that stratified patients into high- and low-risk groups in both
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Osteosarcoma is a heterogeneous and aggressive primary bone malignancy that affects both canines and humans. Standardized treatment regimens prescribed to both species do not address the complexity of the disease and thus have resulted in stagnant patient outcomes for more than 30 years.
EXPERIMENTAL DESIGN: In this study, we present the first multiomic dataset created from a large outcome-linked biobank of canine osteosarcoma treatment-naïve primary tumors, utilizing a computational framework designed to interrogate each dataset individually and to compare and integrate findings.
R
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ewing's sarcoma (ES) is a malignant osseous neoplasm characterized by a dismal prognosis, particularly in its metastatic variant. The significance of disulfidptosis-a newly identified cell death mechanism induced by cystine metabolic imbalance and mitochondrial dysfunction-has yet to be investigated in ES. Thus, the aim of this study was to assess the prognostic significance of disulfidptosis-related genes (DRGs) in this disease.
METHODS: We analyzed four GEO datasets to examine nine DRGs through differential expression, co-expression networks, and functional enrichment analyses.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer (OC) is characterised by high malignancy. Tumour immune microenvironment (TME) may serve as a breakthrough for therapy. Chemokines are responsible for the recruitment of diverse immune cells in TME. We identify the association between chemokines and T and NK cells. This study was conducted to screen the chemokine derived from T and NK cells in OC single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) dataset was acquired from the GEO database. Total 64 genes were collected. The intersection of marker genes of T and NK cells and chemokine-related genes was considered as key chemokine-related gen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate identification of which patients with early (T1) colon cancer (CC) have lymph node metastases (LNM) is a major challenge. Current strategies have limited accuracy, resulting in overtreatment of > 80% of patients. Whilst gene expression profiles (GEPs) have shown promise in identifying patients with LNM in early studies, these have not become a routine part of clinical practice. A limitation of these GEPs is that they are generic and so agnostic of other factors that could influence gene expression, such as tumour location and mismatch repair (MMR) status. In a retrospective translatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to explore how the tumour microenvironment influences the aggressiveness, malignancy, and recurrence of ameloblastoma. By employing a spatial omics approach, we will examine the characteristics of the invasive front of ameloblastoma.
METHODS: We systematically characterised the cellular heterogeneity of ameloblastoma using spatial transcriptomic sequencing combined with integrated omics analysis of clinical tumour specimens. Additionally, we independently validated the spatial expression patterns and levels of FN1 and MMP9 in ameloblastoma through immunohistochemist
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare but highly aggressive malignancy, and alternative splicing (AS) serves as a key post-transcriptional regulatory mechanism involved in its malignant progression. A prominent feature of ACC is metabolic reprogramming, which is closely associated with poor prognosis. However, the mechanism by which AS mediates metabolic abnormalities to promote ACC invasion and metastasis remains unclear.
METHODS: We identified three splicing subtypes based on metabolism-related splicing events, which were derived by correlating metabolic flux sc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-translational modifications (PTMs) are pivotal in tumor biology, yet their role in papillary thyroid cancer (PTC) remains unclear. We integrated bulk and single-cell transcriptomes with clinical data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO) databases to analyze 17 PTMs and construct a prognostic model using 12 machine learning algorithms for predicting the thyroid cancer-free interval (TCFi). Enrichment analysis, single-cell analysis, and immune-related analysis were performed to elucidate the biological role of PTMs. Therapeutic responses of PTC patients were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with colorectal cancer have few molecularly guided treatment options. Cancers with exceptional treatment response are valuable models for discovery of molecular response mechanisms and might reveal new predictive biomarkers to guide treatment selection. However, the rarity of events is a clinical challenge. We performed integrated high-throughput drug sensitivity testing (n = 620 drugs) and molecular analyses of 103 colorectal cancer cell lines to build an in vitro foundation for exceptional treatment responses and their molecular markers. Exceptional responses were scored by a two-wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования