This study investigated the potential genetic mechanisms which underlie adipose tissue mitochondrial dysfunction in Type 2 diabetes (T2D), by systematically identifying nuclear-encoded mitochondrial genes (NEMGs) among the genes regulated by T2D-associated genetic loci. The target genes of these 'disease loci' were identified by mapping genetic loci associated with both disease and gene expression levels (expression quantitative trait loci, eQTL) using high resolution genetic maps, with independent estimates co-locating to within a small genetic distance. These co-locating signals were defined…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cognitive reserve (CR) refers to differences in the adaptability of cognitive processes that modify the impact of Alzheimer's di … porating external resources including expression quantitative trait methylation (eQTM), methylation quantitative trait loci (mQTL) databases, AD genome-wide association study summary statistics, and blood-brain DNAm correlations. A methylation score was constructed and evaluated in linear mixed-effects models of longitudinal memory in 88 participants with follow-up infor …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Periprosthetic osteolysis resulting in aseptic loosening is a leading cause of THA revision. Individuals vary in their susceptibility to osteolysis and heritable factors may contribute to this variation. However, the overall contribution that such variation makes to osteolysis risk is unknown.
QUESTIONS/PURPOSES: We conducted two genome-wide association studies to (1) identify genetic risk loci associated with susceptibility to osteolysis; and (2) identify genetic risk loci associated with time to prosthesis revision for osteolysis.
METHODS: The Norway cohort comprised 2624 patie
СтатьяМетаанализМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late-onset Alzheimer's disease (LOAD) is the most common cause of late-onset dementia in western societies. Despite remarkable achievements … x disorder with both genetic and environmental components. Multiple genes with small effects each ("quantitative trait loci"[QTLs]) are likely to contribute to the quantitative traits associated with the disease, such as memory performance, amyloid/tau pathology, or hippocampal atrophy. The motivation for identifying the genetics of LOAD is clear. Not only could it shed …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Honey bees are exposed to a number of damaging pathogens and parasites. The most destructive among them, affecting mainly the brood, is Varr … ill be employed in following experiments to analyse individualized DNA samples in order to identify quantitative trait loci (QTL) involved in the control of the investigated trait and to evaluate and possibly confirm QTL found in other studies. However, this assay is not just suitable to study Varroa tolerance, it is as well applicable to analyse any other trait in honey …
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the genetic basis of common disease and disease-related quantitative traits will aid in the development of diagnostics and therapeutics. The processs of gene discovery can be sped up by rapid and effective integration of well-defined mouse genome and phenome data resources. We describe here an in silico gene-discovery strategy through genome-wide association (GWA) scans in inbred mice with a wide range of genetic variation. We identified 937 quantitative trait loci (QTLs) from a survey of 173 mouse phenotypes, which include models of human disease (atherosclerosis, cardiovascular…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Renal cell carcinoma (RCC) is the most common type of kidney cancer, but its genetic architecture has not been fully characterized, particul … cus at 12p13.33. Leveraging genome-wide association study (GWAS) data and cross-ancestry expression quantitative trait loci (eQTLs) mapping from 266 kidney tissues, we refine the identification of putative causal variants and genes implicated in RCC. These findings are substantiated through CRISPR-based screenings and multiplexed single-cell perturbations. Additionally, …
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Over 90 regions of the genome have been associated with lung function to date, many of which have also been implicated in chroni … ntronic SNPs ( SEC24C, CASC17 and UQCC1) and two intergenic SNPs near to LY86 and FGF10. Expression quantitative trait loci analyses found evidence for regulation of gene expression at three signals and implicated several genes, including TYRO3 and PLAU. Conclusions: Further interrogation of these loci could provide greater understanding of the determinants of lung funct …
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundAlzheimer's disease (AD) is a neurodegenerative disorder resulting from a complex interplay of multiple factors. Recent hypotheses suggest a potential role of selenium and selenoproteins in AD pathogenesis. However, the causality relationship between them remains to be elucidated.ObjectiveThis study investigates the causal link between selenoproteins and AD risk.MethodsWe analyzed the data by leveraging genome-wide association studies from European cohorts (90,338 AD patients and 1,036,225 controls) and expression quantitative trait loci (eQTLs) from eQTLGen (31,684 individuals) and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mapping enhancers and their target genes in specific cell types is crucial for understanding gene regulation and human disease genetics. How … element-gene pairs. We benchmark scE2G models against CRISPR perturbations, fine-mapped expression quantitative trait loci and genome-wide association study variant-gene associations and demonstrate state-of-the-art performance at prediction tasks across several cell types and categories of perturbations. We apply scE2G to build maps of enhancer-gene regulatory interact …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lipid accumulation product index (LAP) is a robust marker of lipid burden. However, its genetic architecture and causal relevance to pancreatitis remain poorly characterized. We performed a genome-wide association study (GWAS) of LAP in 388,213 European from UK Biobank, followed by colocalization, transcriptome-wide association studies (TWAS), LD score regression and Mendelian randomization for causal relationships. Polygenic risk scores (PRS) were constructed and tested against chronic pancreatitis (CP), hypertriglyceridemic acute pancreatitis (HTG-AP), and acute pancreatitis (AP) using r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physical inactivity contributes to type 2 diabetes (T2D), but the molecular links between exercise and metabolic improvement remain incompletely understood. We meta-analyzed genome-wide association studies of vigorous physical activity and T2D (combined n ≈ 1.95 million) and integrated eQTL/sQTL maps with single-cell and spatial transcriptomic datasets to connect genetic risk with tissues, cell types, and regulatory programs. Tissue and cell-type enrichment, colocalization, and network analyses were performed. Computational findings were further examined in male 10-week-old C57BL/6J mice with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptome- and proteome-wide association studies (TWAS/PWAS) have proven successful in prioritizing genes and proteins whose genetically regulated expression modulates disease risk, but they ignore potential co-expression and interaction effects. To address this limitation, we introduce the co-expression-wide association study (COWAS) method, which can identify pairs of genes or proteins whose genetically regulated co-expression is associated with complex traits. COWAS first trains models to predict expression and co-expression from genetic variation, and then tests for association between
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians2025eng
OBJECTIVE: The objective of this study was to identify a novel gene and its potential mechanisms associated with susceptibility to gestational diabetes mellitus (GDM) through an integrative approach.
METHODS: We analyzed data from genome-wide association studies (GWAS) of GDM in the FinnGen R11 dataset (16,802 GDM cases and 237,816 controls) and Genotype Tissue Expression v8 expression quantitative trait locus data. We used summary-data-based Mendelian randomization to determine associations between transcript levels and phenotypes, transcriptome-wide association studies to provide insights i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Systemic lupus erythematosus (SLE) is a complex and incurable autoimmune disease, so several drug remission for SLE symptoms have been developed and used at present. However, treatment varies by patient and disease activity, and existing medications for SLE were far from satisfactory. Novel drug targets to be found for SLE therapy are still needed.
METHODS: Mendelian randomization (MR), an observational study way, was performed to explore potential drug targets for SLE using protein quantitative trait loci (pQTL) from recently published genome-wide association studies (GWAS) of ce…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chlamydia trachomatis (Ct) is a bacterium that causes chlamydia, the most diagnosed bacterial sexually transmitted infection (STI) in the world. In the U.S., chlamydia is most prevalent among non-Hispanic African American (AA) individuals, implying substantial racial disparity. Despite prevention and control efforts, reinfection is common, suggesting that some individuals have insufficient protective immunity to Ct. To better understand the genetically mediated risks of chlamydia reinfection, we sought to identify genetic loci associated with reinfection using a Genome-Wide Associa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) has increased exponentially over the past three decades, in parallel with the global rise in obesity and type 2 diabetes. It is currently the most common cause of liver-related morbidity and mortality. Although obesity has been identified as a key factor in the increased prevalence of MASLD, individual differences in susceptibility are significantly influenced by genetic factors. PNPLA3 I148M (rs738409 C>G) is the variant with the greatest impact on the risk of developing progressive MASLD and likely other forms
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Evidence from increasing observational studies indicates that systemic inflammation plays a role in pregnancy-related adverse events. However, the causal associations between them are largely unclear. To investigate the potential causal effects of genetically regulated concentrations of inflammatory cytokines on the risk of adverse pregnancy outcomes, we performed a Mendelian randomization (MR) analysis.
METHODS: The cis-protein quantitative trait loci for the 47 inflammatory cytokines derived from the latest genome-wide association studies (GWASs) consisting of 31,112 European in…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Functional genes within genomic loci associated with systemic lupus erythematosus (SLE), as identified by genome-wide association studies, exhibit cell-specific characteristics. This study delves into the impact of genetic variants within SLE loci on gene expression in different types of immune cells, unraveling the complex interplay between genetics and immunopathogenesis. Through the integration of genetic association and single-cell transcriptomic sequencing data, we identified potential cell-specific susceptibility genes for SLE across diverse immune cell subsets. The single-cell eQTL anal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ankylosing spondylitis (AS) is a complex condition with a significant genetic component. This study explored circulating proteins as potential genetic drug targets or biomarkers to prevent AS, addressing the need for innovative and safe treatments.
METHODS: We analyzed extensive data from protein quantitative trait loci (pQTLs) with up to 1,949 instrumental variables (IVs) and selected the top single-nucleotide polymorphism (SNP) associated with AS risk. Utilizing a two-sample Mendelian randomization (MR) approach, we assessed the causal relationships between identified proteins a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.