The 3'X tail is a functionally essential 98-nt sequence located at the 3'-end of the hepatitis C virus (HCV) RNA genome. The domain contains two absolutely conserved dimer linkage sequence (DLS) and k nucleotide segments involved in viral RNA dimerization and in a distal base-pairing interaction with stem-loop 5BSL3.2, respectively. We have previously shown that domain 3'X forms an elongated structure comprising two coaxially stacked SL1' and SL2' stem-loops. This conformation favors RNA dimerization by exposing a palindromic DLS segment in an apical loop, but buries in the upper stem of hairp
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The association of Epstein-Barr virus (EBV) with Burkitt's lymphoma (BL) is variable in different geographic regions. In developing countries, the association of EBV with BL is regarded to be of an endemic-type in equatorial Africa (> 95%) and sporadic-type in the developed countries (15-30%). The purpose of this study is to assess the frequency of EBV infection in BL, in Iran. The study also aims to compare Ribonucleic acid (RNA) in situ hybridization (RISH), the standard diagnostic method, with the polymerase chain reaction (PCR)-based method for diagnosing BL.
MATERIALS AND MET
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many inherited diseases are associated with changed splicing patterns, and alternative splicing influences several biological processes as well as the replication of certain viral pathogens. For this reason, there is a broad interest in modulating individual splicing events for therapeutic purposes. Based on the small nuclear RNA (snRNA) U7, we have developed expression vectors for short antisense RNAs that accumulate in the cell nucleus where splicing occurs and that can very specifically modulate the splicing of individual exons. More specifically, in the context of the fatal neuromuscular d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: The hepatic expression of bile acid transporters is altered in experimental cholestasis and it is unclear whether regulation exists in human cholestatic diseases. We investigated the expression of genes involved in bile acid detoxification, basolateral export and nuclear factor regulation in untreated primary biliary cirrhosis (PBC).
METHODS: Liver tissues were obtained from patients with early-stage and late-stage PBC. The hepatic expression levels of messenger RNAs were determined by the real-time reverse transcription polymerase chain reaction.
RESULTS: The hepatic expres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nuclear pore complex protein Nup88 is overexpressed in tumor cells. Immunohistochemical studies have shown that this overexpression is linked to higher aggressiveness of colorectal carcinoma and to enhanced metastatic potential of melanoma cells. However, the antibodies so far developed against Nup88 have the drawback of recognizing a number of other, up to now unspecified antigens besides Nup88. For this reason, we devised the present study on Nup88 expression at the mRNA level. RNA was extracted from fresh tumor tissue corresponding to 122 breast cancer patients. Nup88 mRNA expression wa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: Gastric cancer (GC) has high morbidity and mortality due to inefficient early screening. Therefore, we are searching for more sensitive and specific diagnostic markers for GC. tRNA-derived small RNAs are novel non-coding small RNAs with good abundance and stable presence in body fluids, which may play multiple biological regulatory roles. In this study, we aimed to find a potential biomarker with high accuracy in tRNA-derived small RNAs that can help diagnose GC. Methods: tRF-27-FDXXE6XRK45 was screened as a target molecule by high-throughput sequencing in three pairs of GC tissues.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circular RNAs (circRNAs) play a critical regulatory role in cancer progression. However, the underlying mechanisms of circRNAs in hepatocellular carcinoma (HCC) metastasis remain mostly unknown.
METHODS: Has_circ_0003998 (circ0003998) was identified by RNAs sequencing in HCC patients with /without portal vein tumor thrombus (PVTT) metastasis. The expression level of circ0003998 was further detected by in situ hybridization on tissues microarray (ISH-TMA) and qRT-PCR in 25 HCC patients with PVTT metastasis. Moreover, the 25 HCC patients with PVTT metastasis and 50 HCC patients with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
M6A is the most prevalent modification among epigenetics. M6A occurs on different sites of RNA and exerts important functions in specific circumstances, such as mRNA splicing, stability, nuclear export, translation or damage response. Different aspects of the concrete machinery of m6A modification have been studied, including its writing, erasing and reading capabilities. The molecular and biological functions of the m6A modification and enzymes, as well as their functions in different cancers have been substantially published. The present review summarizes these findings and provides clear de
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuronal intranuclear inclusions (NIIs) are the pathological hallmark of polyglutamine (polyQ) diseases. We previously found that the RNA-binding protein FUS/TLS is the major component of nuclear polyQ aggregates of a cellular model of Huntington disease. In this study, we revealed that FUS/TLS binds to NIIs in the human brains from patients with spinocerebellar ataxia type 1, 2, 3, and dentatorubral-pallidoluysian atrophy. Recent reports have revealed that mutations in FUS/TLS gene are responsible for familial amyotrophic lateral sclerosis 6 (ALS6). Our results indicated that changing FUS/TLS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effects of single administration of delta9-THC on the induction of arylhydrocarbon hydroxylase activity by phenobarbital and 3-methyl cholanthrene were determined. delta9-THC completely suppressed the induction by phenobarbital and reduced the 3-methylcholanthrene induction from 455% to 177% of control. delta9-THC had no effect on phenobarbital induction when both drugs were administered daily for 2 days and mice killed on the third day. Arylhydrocarbon hydroxylase was not the only enzyme effected as delta9-THC also inhibited the induction of aminopyrine demethylase by phenobarbital. These
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of patients with systemic lupus erythematosus revealed the close association of the disease with measles--or a related virus. High titres of antibodies to measles virus were found in patients that correlated with the course of the disease. Immunofluorescence tests revealed measles virus or a related antigen in lupus-affected tissues. Inclusion bodies consisting of paramyxovirus-like ribonucleoprotein structures were regularly detected in both affected tissues and leukocytes. Molecular hybridization of measles virus RNA with DNA from the affected tissues showed that DNA transcripts of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The upstream regulators that initiate early transcriptional responses to intestinal stress remain poorly defined. Here, we used germ-free wild-type, Lao1-knockout (LAO1KO), and Lao1/Il4i1 double-knockout (DKO) mice to determine how two l-amino acid oxidases shape acute transcriptional responses to dextran sulfate sodium (DSS). RNA-sequencing performed 24 h after DSS exposure revealed that Lao1 accounted for 80.1% of DSS-induced transcriptional changes, while Il4i1 contributed an additional 14.7%, collectively accounting for 94.8% of the total response. Pathway analysis revealed that Lao1 was r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundHypopharyngeal cancer is increasingly emerging as a disease that threatens global health, with poor prognosis and survival rates. However, clinical strategies and effective therapies remain limited.MethodsThe inhibitory effect of liensinine on tumor cells was detected through cell cycle, colony formation, and apoptosis assays. Changes in the expression levels of relevant proteins were detected and enrichment analysis of signaling pathways was performed through in vitro and RNA sequencing experiments. The transcription levels of relevant genes were further verified using reverse trans
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interactions between nervous system and adipose tissue are involved in the regulation of adipocyte browning. However, whether microglial activation participates in the regulation of cold exposure-induced sympathetic innervation and adipocyte browning is unclear. Here, we demonstrate that RNA m6A demethylase ALKBH5 in the microglia nucleus of hypothalamus (PVH) region inhibits cold exposure-induced adipocyte browning in the subcutaneous white adipose tissue (sWAT) of male mice. The single nuclear-RNA sequencing, brain slice electrophysiological assay and pathological analyses show that microgli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To elucidate the functional role of MCF2L antisense RNA1 (MCF2L-AS1) in colorectal cancer (CRC) progression and its potential molecular mechanism. METHODS: The expression of MCF2L-AS1/MCF2L in CRC cell lines was detected by qRT-PCR. The biological function of MCF2L-AS1 was investigated in vitro and in vivo (colony formation, CCK8, Apoptosis assays, wound healing and transwell assays, and mouse xenograft models). Mechanistic investigations involved bioinformatics analysis followed by experimental validation using Fluorescence in situ hybridization, RNA pull-down, and RNA immunoprecipit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stimulation of the innate immune system by foreign RNA elicits a potent interferon response and can trigger cell death. The mechanisms by which cells balance a robust response with cell-intrinsic lethality are still being uncovered. Here, using genome-wide CRISPR-Cas9 genetic screens with triphosphorylated RNA stimulation, we discover that promyelocytic leukaemia (PML) nuclear body-localized speckled protein 110 (SP110) is a potent inhibitor of type 1 interferon-driven cell death. Death suppression by SP110 counteracts a toxic activity of SP100, a major constituent of PML bodies. Loss of SP110
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human Nap1 (hNap1) is a histone chaperone involved in chromatin dynamics and has been shown to interact with the HIV-1 regulatory protein Rev, which is essential for nuclear export of viral RNA. Despite the functional significance of this interaction, its structural basis has remained elusive. Here, we present the X-ray crystal structure of hNap1 and the cryo-electron microscopy structure of the core domain of hNap1-Rev complex. The structure reveals that hNap1 binds Rev dimers via its acidic concave surface, engaging the Rev arginine-rich motif and oligomerization domain, and stabilizes Rev a
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital Dyserythropoietic Anaemia type I (CDA-I) is a rare inherited disorder of erythropoiesis, in which erythroid cells display a unique nuclear phenotype referred to as 'spongy' heterochromatin. The molecular basis of CDA-I remains unknown, with most cases of CDA-I caused by mutations in CDAN1, encoding Codanin-1, or CDIN1, encoding for Codanin-1-interacting nuclease 1 (CDIN1). To date, very little is known about the function of CDA-I disease proteins and the mechanism by which their associated mutations cause disease. Here, we demonstrate that endogenous CDIN1 interacts with Codanin-1,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Macrophages are essential for both, to clear pathogens and preserve tissue homeostasis, yet the molecular regulators of this equilibrium remain incompletely defined. Here, we identify SAILR (survival associated immune-regulatory RNA), a primate-specific long noncoding RNA (lncRNA), as a critical modulator of macrophage viability under infection conditions. SAILR is induced during monocyte-to-macrophage differentiation, but rapidly downregulated upon bacterial challenge in a nuclear factor kappa B (NF-κB) dependent manner. In both naïve and immune-activated macrophages, SAILR dampens the expres
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic cancer (PC) is a highly malignant and lethal tumor in gastrointestinal tract. Lactate accumulation is a classical feature of metabolic reprogramming in cancers. Lactate-derived lysine lactylation (Kla) is identified as a new type of post-translational modifications (PTMs), which is confirmed to be involved in multiple biological processes. However, the cancer-specific regulation of protein Kla in PC requires further elucidation. Here, we report a range of dysregulated Kla sites specifically related to RNA splicing in human pancreatic cancer, leading to the observation that the Kla a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования