BACKGROUND: HIV genetic diversity has increased over time, with recombinant forms becoming more prevalent and complicating subtype classification and surveillance, particularly in low-and-middle income countries (LMICs). Accurate subtyping is critical for surveillance, vaccine design, and cure strategies, but its reliability depends on methodological choices - the genomic region sequenced, laboratory methods employed, and the subtyping tools used. This study evaluates how these methodologies influence reported recombinant form prevalence across regions.
METHODS: This systematic review include
СтатьяСистематический обзорМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective To create a recombinant rabies virus overexpressing IL-33 and to clarify the effect of IL-33 overexpression on the phenotypic characteristics of recombinant virus in vitro. Methods The IL-33 gene was obtained and amplified from the brain of a highly virulent strain of rabies infected mouse. It was then inserted between the G and L genes of the parental virus LBNSE genome by reversing genetic manipulation and rescuing a recombinant virus overexpressing IL-33. BSR cells or mouse NA cells were infected with recombinant rabies virus (rLBNSE-IL33) and the parental strain LBNSE. Sequencing
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epigenetic methyltransferases Ezh1 or Ezh2 each interact with two structural proteins (Eed and Suz12) to form Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2). Inhibition of Ezh2 stimulates osteoblast differentiation and bone formation, but Ezh2 conditional knockout (cKO) mice have variable skeletal phenotypes. Ezh1 null mice are phenotypically normal. Here, we show that combined homozygous ablation of both Ezh1 and Ezh2 alleles results in a pronounced bone phenotype, suggesting genetic redundancy between Ezh1 and Ezh2. Transient loss of Eed, Suz12 or Ezh2 by siRNA depletion or treatment with distinct
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) remains a major cause of economic losses in the global swine industry, and the emergence of recombinant strains further complicates control efforts, particularly where modified-live vaccines (MLVs) are used. In March 2024, a commercial farrow-to-finish farm in Okinawa Prefecture, Japan, experienced a PRRS outbreak characterized by increased rates of preterm farrowing and stillbirths despite routine vaccination with a PRRS MLV. PRRSV isolated from an aborting sow, designated KU-OKN3, was subjected to whole-genome sequencing. Genomic an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phage-derived bacteriocins, also referred to as tailocins, are structures encoded by bacterial genomes and deployed into the extracellular environment to kill sensitive cells. Tailocins display great potential as agricultural antimicrobials due to their durability, efficiency, and specificity of killing with prophylactic application demonstrated to prevent infection by multiple phytopathogens. Previous reports suggest that tailocins of Pseudomonas syringae interact with sugar moieties in the lipopolysaccharide (LPS) to target sensitive cells. However, it remains unclear how genetic and genomic
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian infectious bronchitis virus (IBV) is a major pathogen impacting the global poultry industry. The QX genotype (GI-19 lineage) of IBV has rapidly spread worldwide and is now the dominant genotype in Asia and Europe. In this study, three QX-type field strains (JS/773, JS/774, and SD/783) were isolated from diseased chicken flocks in eastern China, which had been vaccinated with IBV live attenuated vaccines (H120 or QXL87) between December 2024 and January 2025. Notably, the JS/773 strain showed an H536P mutation at the S protein cleavage site, marking the first identification of a PRRRR cle
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lineage tracing is a fundamental tool in developmental biology and cancer research, providing critical insights into cell fate decisions, tissue homeostasis and tumor initiation. The mammary gland is a highly dynamic organ with a complex cellular hierarchy, making it an ideal system for lineage-tracing studies. Classic approaches, such as tamoxifen-inducible CreER/loxP recombination, have significantly advanced our understanding of mammary epithelial cell (MEC) differentiation, homeostasis, and transformation. However, these methods have limitations, including potential effects of tamoxifen on
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: GATA6, a transcription factor expressed in cholangiocytes, has been implicated in the response to liver injury. In biliary atresia, a disease characterized by extrahepatic bile duct obstruction, liver expression of GATA6 increases with pathological bile duct expansion and decreases after successful Kasai portoenterostomy. The aim of this study was to garner genetic evidence that GATA6 is involved in ductular formation/expansion.
METHODS: The murine Gata6 gene was conditionally deleted using Alb-cre, a transgene expressed in hepatoblasts (the precursors of hepatocytes and cholangio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complete sequence of a reovirus, strain NP03 associated with necrotic focus formation in the liver and spleen of Muscovy ducklings in Fujian Province, China in 2009, was determined and compared with sequences of other waterfowl and chicken-origin avian reoviruses (ARVs). Sequencing of the complete genomes of strain NP03 showed that they consisted of 23,418 bp and were divided into 10 segments, ranging from 1191 bp (S4) to 3959 bp (L1) in length, and all segments contained conserved sequences in the 5' non-coding region (GCUUUU) and 3' non-coding region (UCAUC). Pairwise sequence comparison
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ancestral genetic exchange between members of many important bacterial pathogen groups has resulted in phylogenetic relationships better described as networks than as bifurcating trees. In certain cases, these reticulated phylogenies have resulted in phenotypic and molecular overlap that challenges the construction of practical approaches for species identification in the clinical microbiology laboratory. Burkholderia cepacia complex (Bcc), a betaproteobacteria species group responsible for significant morbidity in persons with cystic fibrosis and chronic granulomatous disease, represents one
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has shown once again that coronavirus (CoV) in animals are potential sources for epidemics in humans. Porcine deltacoronavirus (PDCoV) is an emerging enteropathogen of swine with a worldwide distribution. Here, we implemented and described an approach to analyze the epidemiology of PDCoV following its emergence in the pig population. We performed an integrated analysis of full genome sequence data from 21 newly sequenced viruses, along with comprehensive epidemiological surveillance data collected globally over the l
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus A9 (CVA9) is an enterically transmitted enterovirus and one of the most pathogenic type among human enteroviruses. CVA9 isolates use a distinctive RGD (Arg-Gly-Asp) motif within VP1 capsid protein that defines its ability to bind to integrin receptor(s) for cellular entry. To investigate CVA9 evolution and pathogenicity, genetic relationships and recombination events were analyzed between 54 novel clinical isolates of CVA9, as well as 21 previously published full length CVA9 sequences from GenBank. Samples were investigated by partial sequencing of the novel VP1 and 3Dpol genes,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Promoter-based genetic recombination (via, e.g., Cre-lox) is most useful when all cells of interest express a particular gene. The discovery that the actin-binding protein advillin is expressed in all somatic sensory neurons has been exploited repeatedly to drive DNA recombination therein, yet specificity of expression has not been well demonstrated. Here, we characterize advillin expression amongst sensory neurons and in several other neural and non-neural tissues. We first validate an advillin antibody against advillin knock-out tissue, advillin promoter-driven EGFP, and advillin mRNA expres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pneumoniae is a leading cause of pneumonia, meningitis, septicemia, and middle ear infections. The incidence of S. pneumoniae isolates that are not susceptible to penicillin has risen worldwide and may be above 20% in some countries. Beta-lactam antibiotic resistance in pneumococci is associated with significant sequence polymorphism in penicillin-binding proteins (PBPs). Commensal streptococci, especially S. mitis and S. oralis, have been identified as putative donors of mutated gene fragments. However, no studies have compared sequences of the involved pbp genes in large collec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borrelia burgdorferi sensu lato (B. burgdorferi s.l.), the group of bacterial species represented by Lyme disease pathogens, has one of the most complex and variable genomic architectures among prokaryotes. Showing frequent recombination within and limited gene flow among geographic populations, the B. burgdorferi s.l. genomes provide an excellent window into the processes of bacterial evolution at both within- and between-population levels. Comparative analyses of B. burgdorferi s.l. genomes revealed a highly dynamic plasmid composition but a conservative gene repertoire. Gene duplication and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal inversions impact genetic variation and facilitate speciation in part by reducing recombination in heterokaryotypes. We generated multiple whole-genome shotgun sequences of the parapatric species pair Drosophila pseudoobscura and Drosophila persimilis and their sympatric outgroup (Drosophila miranda) and compared the average pairwise differences for neutral sites within, just outside and far outside of the three large inversions. Divergence between D. pseudoobscura and D. persimilis is high inside the inversions and in the suppressed recombination regions extending 2.5 Mb outside o
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CTX-M-15 now appears to be the dominant extended-spectrum β-lactamase worldwide, and a number of different factors may contribute to this success. These include associations between bla(CTX-M-15) and particular plasmids (IncF) and/or strains, such as Escherichia coli ST131, as well as the genetic contexts in which this gene is found. We previously identified bla(CTX-M-15) as the dominant ESBL gene in the western Sydney area, Australia, and found that it was carried mainly on IncF or IncI1 plasmids. Here, we have mapped the multiresistance regions of the 11 conjugative plasmids with one or more
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multi-Locus Sequence Typing (MLST) has emerged as a leading molecular typing method owing to its high ability to discriminate among bacterial isolates, the relative ease with which data acquisition and analysis can be standardized, and the high portability of the resulting sequence data. While MLST has been successfully applied to the study of the population structure for a number of different bacterial species, it has also provided compelling evidence for high rates of recombination in some species. We have analyzed a set of Campylobacter jejuni strains using MLST and Comparative
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome sequences are available for many bacterial strains, but there has been little progress in using these data to understand the molecular basis of pathogen emergence and differences in strain virulence. Serotype M3 strains of group A Streptococcus (GAS) are a common cause of severe invasive infections with unusually high rates of morbidity and mortality. To gain insight into the molecular basis of this high-virulence phenotype, we sequenced the genome of strain MGAS315, an organism isolated from a patient with streptococcal toxic shock syndrome. The genome is composed of 1,900,521 bp, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two closely related genes, EXO1 and DIN 7, in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae have been found to be sequence homologs of the exo1 gene from the fission yeast Schizosaccharomyces pombe . The proteins encoded by these genes belong to the Rad2/XPG and Rad27/FEN-1 families, which are structure-specific nucleases functioning in DNA repair. An XPG nuclease deficiency in humans is one cause of xeroderma pigmentosum and those afflicted display a hypersensitivity to UV light. Deletion of the RAD2 gene in S. cerevisiae also causes UV hypersensitivity, due to a defect in nucleotide excision re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования