Monitoring and strategic response to variants in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) represent a considerable challenge in the current pandemic and for future viral outbreaks. Mutations/deletions of the virion's prefusion Spike protein may have significant impact on vaccines and therapeutics that utilize this key structural protein in their mitigation strategies. In this study, we have demonstrated how dominant energetic landscape mappings ("glue points") based on ab inito all-atom force fields coupled with phylogenetic sequence alignment information can identify key r
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modification of voltage-gated Na+ channel (NaV ) function by intracellular Ca2+ has been a topic of much controversy. Early studies relied on measuring NaV function in the absence or presence of intracellular Ca2+ , and generated seemingly disparate results. Subsequent investigations revealed the mechanism(s) of Ca2+ -driven NaV modulation are complex and involve multiple accessory proteins. The Ca2+ -sensing protein calmodulin (CaM) has a central role in tuning NaV function to [Ca2+ ]i , but the mechanism has been obscured by other proteins (such as fibroblast growth factors (FGF) or CaM-depe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The most highly connected proteins in protein-protein interactions networks are called hubs; they generally connect signalling pathways. In Saccharomyces cerevisiae, Knr4 constitutes a connecting node between the two main signal transmission pathways involved in cell wall maintenance upon stress: the cell wall integrity and the calcium-calcineurin pathway. Knr4 is required to enable the cells to resist many cell wall-affecting stresses, and KNR4 gene deletion is synthetic lethal with the simultaneous deletion of numerous other genes involved in morphogenesis and cell wall biogenesis. Knr4 has
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The circular dichroism spectra of leghemoglobin a from the root nodules of soybean have been compared with those for sperm whale myoglobin in the fat- and near-ultraviolet and the Soret and visible regions of the spectrum. Circular dichroism spectra in the far-ultraviolet show that the leghemoglobins all have a high alpha-helix content (soybean leghemoglobin a, 55%) regardless of the nature of bound ligands and oxidation or spin state of the heme iron. The known sequence homologies with mammalian hemoglobins may therefore be reflected in conformational homologies as suggested by the x-ray stud
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scorpion toxins are important physiological probes for characterizing ion channels. Molecular databases have limited functional annotation of scorpion toxins. Their function can be inferred by searching for conserved motifs in sequence signature databases that are derived statistically but are not necessarily biologically relevant. Mutation studies provide biological information on residues and positions important for structure-function relationship but are not normally used for extraction of binding motifs. 3D structure analyses also aid in the extraction of peptide motifs in which non-contig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatitis E virus (HEV) is one of the leading causes of acute and chronic hepatitis among humans across the globe and is linked to severe diseases in immunocompromised individuals and pregnant women. Despite its substantial global burden, only one vaccine is licensed (in China and Pakistan), limiting its global accessibility. Furthermore, no globally approved mRNA vaccine against HEV is currently available, highlighting the need to develop strategies for alternative vaccines.
METHODS: In this study, the amino acid sequences of ORF2 capsid proteins representative of HEV genotypes 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porins are integral proteins of the outer membranes of gram-negative bacteria. In membranes, they exist as homotrimers and the L2 loops contribute to their stability. Comparison of OmpC porins of the Yersinia pseudotuberculosis complex with other enterobacterial porins demonstrated L2 loop length diversity, which is caused by varying numbers of dipeptide/tripeptide repeats. The OmpC porins are highly homologous to each other, and they can be subdivided into five isoforms based on their L2 loop structure. Optical spectroscopy and SDS-PAGE experiments revealed that particularities of the L2 loop
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Kyasanur forest disease virus (KFDV) remains a significant public health challenge due to the limitations of existing vaccines, creating a critical need for effective antiviral treatments. KFDV is a tick-borne virus responsible for 400-500 new cases annually, with a mortality rate of 3-5%. The nonstructural protein 1 (NS1), which plays crucial roles in host cell interactions, immune evasion, and viral replication, represents a promising target for antiviral drug development.
OBJECTIVE: This study aims to identify potential antiviral compounds that inhibit the activity of KFDV NS1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kalliklectin is a unique fish-specific lectin that demonstrates sequence similarity to mammalian plasma kallikrein and coagulation factor XI, which are not lectins but proteases. Reported fish kalliklectins and these mammalian proteases comprise four characteristic "apple domains" (APDs). Bioinformatics analysis revealed that Siluriformes species possess anomalous kalliklectins comprising 6 to 16 APDs. Complementary DNA cloning showed that the full-length nucleotide sequence of Ictalurus punctatus consists of 2240 bp that encode 720 amino acid residues to produce a mature protein with a putati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defects in the human ALS2 gene, which encodes the 1,657-amino-acid residue protein alsin, are linked to several related motor neuron diseases. We created a structural model for the N-terminal 690-residue region of alsin through comparative modelling based on regulator of chromosome condensation 1 (RCC1). We propose that this alsin region contains seven RCC1-like repeats in a seven-bladed beta-propeller structure. The propeller is formed by a double clasp arrangement containing two segments (residues 1-218 and residues 525-690). The 306-residue insert region, predicted to lie within blade 5 and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) poses a significant threat to global healthcare, requiring novel therapeutic strategies. Prophages, latent phage genomes integrated into bacterial chromosomes, are important resources for antimicrobial development due to their genomic stability and genetic engineering potential.
METHODS: In this study, we performed genomewide sequencing on 329 MRSA isolates to predict prophage sequences, followed by analyses of these prophages-including examinations of virulence genes, antibiotic resistance genes, homologous proteins of pathogen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
G protein-coupled receptor kinase 5 (GRK5) has emerged as a potential drug development target against heart failure and cancer. A close homolog, GRK6 represents a therapeutic target for multiple myeloma. We have rationally designed a series of highly selective, potent, noncovalent, and drug-like GRK5 inhibitors. Several inhibitors exhibited low nanomolar GRK5 inhibition and high selectivity over GRK2, and, surprisingly, some were selective for GRK6. We determined high-resolution X-ray crystal structures of several inhibitors in complex with GRK5, which provide molecular insights into the ligan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PTHrP (parathyroid hormone related protein) is an important mediator of malignancy-related tumor progression and hypercalcemia that shares considerable homology and functionality with parathyroid hormone. In this chapter, we review what has been elucidated to date regarding PTHrP's role in malignancies. Starting with a review of calcium metabolism and regulation, we then summarize the discovery and structure of PTHrP and development of sensitive immunoassays for specific measurement. Subsequently, we explore its role in tumor progression, with emphasis on the primary tumor as well as skeletal
СтатьяОбзорПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this paper, we describe the structure and temporal expression pattern of the Drosophila melanogaster genes l(2)not and l(2)rot located at locus 59F5 vis à vis the tumor suppressor gene l(2)tid described previously and exhibiting a gene within gene configuration. The l(2)not protein coding region, 1530 nt, is divided into two exons by an intron, 2645 nt, harboring the genes l(2)rot, co-transcribed from the same DNA strand, and l(2)tid, co-transcribed from the opposite DNA strand, located vis à vis. To determine proteins encoded by the genes described in this study polyclonal rabbit antibodie
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Loss-of-function mutations in interferon regulatory factor-6 (IRF6) are responsible for about 70% of cases of Van Der Woude Syndrome (VWS), an autosomal dominant developmental disorder characterized by pits and/or sinuses of the lower lip and cleft lip, cleft palate, or both.
METHODS: We collected a Chinese Han VWS pedigree, performed sequencing and screening for the causal gene mutant. Initially, species conservation analysis and homology protein modeling were used to predict the potential pathogenicity of mutations. To test whether a VWS family-derived mutant variant of IRF6 ret
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Superoxide dismutases (SODs) are metalloproteins that are responsible for the dismutation of superoxide anion radicals. SODs are consequently protective against oxidative damage to cellular components. Among other protective mechanisms, the filarial parasite Onchocerca volvulus has a well developed defense system to scavenge toxic free radicals using SODs during migration and sojourning of the microfilariae and adult worms in the human body. O. volvulus is responsible for the neglected disease onchocerciasis or `river blindness'. In the present study, an extracellular Cu/Zn-SOD from O. volvulu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution of voltage-gated calcium channel (Cav) in eukaryotes is an area of interest for biologists worldwide. The CLAN CL0030 and its family Ion_Trans 2 PF 07885 have been known to be present in prokaryotes, but the origin of these ion channels in Acanthamoeba spp. is yet to be determined. We inferred the origin of primitive forms of two-pore channels like proteins, human-like Cav 1.1 of L-type, and Cav subunit alpha-2/delta-1 in Acanthamoeba spp. early during evolution. By in-depth investigation into genomics, transcriptomics, use of bioinformatics tools and experimentations done with d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass vaccination campaigns are essential to control the ongoing novel severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-Cov-2) pandemic. The Covishield vaccine consists of the replication-deficient simian adenovirus vector ChAdOx1, which contains the full-length structural spike protein of SARS-CoV-2. Occasionally, it can lead to cutaneous reactions that contribute to fear of vaccination, hesitancy, and incomplete vaccination schedules. We report a case of facial angioedema following the first dose of Covishield in a 63-year-old woman with no previous history of allergies or hypersensitivi
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemokines are a superfamily of homologous heparin-binding proteins, first described for their role in recruiting leukocytes to sites of inflammation. Chemokines have since been recognized as key factors mediating both physiological and pathological neovascularization in such diverse clinical settings as malignancy, wound repair, chronic fibroproliferative disorders, myocardial ischemia, and atherosclerosis. Members of the CXC chemokine family, structurally defined as containing the ELR amino acid motif, are potent inducers of angiogenesis, whereas another subset of the CXC chemokines inhibits
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования