INTRODUCTION: Hepatocellular carcinoma (HCC) is the ultimate result of long-term chronic hepatitis B. Molecular interactions among parenchymal, non-parenchymal, and immune cells in the liver tumor microenvironment (TME) influence the progression of the disease by sharing molecules such as protein, nucleic acids (DNA, coding and non-coding RNAs), lipids, and others through extracellular vesicles (EVs). This study has examined the influence of Hepatitis B virus (HBV) on the enrichment of proteins in the HCC cell-derived EVs and vice versa.
METHODS: EVs were isolated from conditioned media of st
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Epstein-Barr virus (EBV)-positive Burkitt lymphoma (BL) affects children in sub-Saharan Africa, but diagnosis via tissue biopsy is challenging. We explored a liquid biopsy approach using targeted next-generation sequencing to detect the MYC-immunoglobulin (MYC-Ig) translocation and EBV DNA, assessing its potential for minimally invasive BL diagnosis.
MATERIALS AND METHODS: The panel included targets for the characteristic MYC-Ig translocation, mutations in intron 1 of MYC, mutations in exon 2 of MYC, and three EBV genes: EBV-encoded RNA (EBER)1, EBER2, and EBV nuclear antigen 2. It w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Serial monitoring of dd-cfDNA and change from baseline can provide meaningful information beyond absolute thresholds. We describe dd-cfDNA trajectories from the baseline before and after acute rejection (AR) and de novo donor-specific antibodies (dnDSA) detection in kidney transplant recipients (KTRs).
METHODS: We included KTR from 02/2019 to 03/2022 with serial dd-cfDNA. The primary analysis compared the time-varying change in dd-cfDNA from baseline in KTR first AR on biopsy [AR] to patients with no-AR on biopsy [no-AR].
RESULTS: 151 KTR were analyzed (AR = 56 KTR, no-AR = 95 KT
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The combination of abiraterone acetate and prednisone (AA/P) is used to treat metastatic prostate cancer, but molecular predictors of treatment response are not well elucidated. We evaluated plasma circulating tumor DNA- (ctDNA-) based copy number alterations (CNAs) to determine treatment-related predictive and prognostic biomarkers for metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC).
METHODS: Serial plasma specimens were prospectively collected from 88 chemotherapy-naive mCRPC patients before and after 12 weeks of AA/P treatment. Sequencing-based CNA analyses were perform
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To study the detection limits of chromosomal microaberrations in non-invasive prenatal testing with aim for five target microdeletion syndromes, including DiGeorge, Prader-Willi/Angelman, 1p36, Cri-Du-Chat, and Wolf-Hirschhorn syndromes. We used known cases of pathogenic deletions from ISCA database to specifically define regions critical for the target syndromes. Our approach to detect microdeletions, from whole genome sequencing data, is based on sample normalization and read counting for individual bins. We performed both an in-silico study using artificially created data sets and a laborat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective The objective of this study was to assess the relationship between first trimester cell-free total and fetal DNA in maternal plasma and the subsequent development of preeclampsia. Study Design Nested case-control study of patients enrolled in the Combined Antioxidant and Preeclampsia Prediction Studies prediction study of 175 women who did and 175 women who did not develop preeclampsia. The predictive values of cell-free total and fetal DNA and the subsequent development of preeclampsia were measured using receiver operating characteristic curves. Results Cell-free total DNA was high
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 4977-bp deletion is the most common deletion among more than 90 large-scale deletions of human mitochondrial DNA (mtDNA) that are associated with aging and mitochondrial myopathies. The reason why the frequency of occurrence of this common deletion is so high in aged and myopathic human tissues is not clear. Since several studies proved that unusual DNA structures play very important roles in a number of recombination events, we hypothesized that some kind of unusual DNA structure may flank the breakpoints of the 4977-bp mtDNA deletion. We used two-dimensional (2-D) gel electrophoresis to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Extracellular vesicles (EVs) are considered as a new class of resources for potential biomarkers. We analyzed expression of specific mRNA and miRNA in EVs derived from ovarian cancer ascites and the ideal controls, peritoneal fluids from benign patients for potential early detection and prognostic biomarkers.
METHODS: Fluids were collected from subjects with benign cysts or endometrioma (n = 10), or low/high grade serous ovarian carcinoma (n = 8). EV particles were captured using primarily ExoComplete filterplate or ultracentrifugation and analyzed by nanoparticle tracking analysi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Expanded non-invasive prenatal testing (NIPT) utilizing cell-free DNA (cfDNA) in maternal blood enables the detection of common trisomies as well as rare autosomal trisomies and large deletions and duplications within the genome of the placenta and, therefore, the fetus. Given that cfDNA predominantly originates from trophoblastic cells, expanded NIPT also holds the potential to reveal confined placental mosaicism (CPM). CPM has been associated with placental dysfunction, which can result in reduced levels of the circulating placental biomarkers routinely tested as part of first-
Протокол клинического исследованияСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Donor derived cell-free DNA (dd-cfDNA) has become a useful biomarker for monitoring of kidney transplant rejection, however utilization after rejection is not well established. We conducted a retrospective cohort study of 64 kidney transplant recipients (KTRs) with biopsy-proven rejection and concomitant dd-cfDNA monitoring. The primary outcome was to examine the relationship between changes in dd-cfDNA and allograft function after rejection. Secondary outcomes included the effect of a ≥61% dd-cfDNA reduction on eGFR and proteinuria, and impact of persistently elevated dd-cfDNA. The percent ch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a growing global health challenge. Conventional diagnostic tools have limited sensitivity and specificity for early-stage disease. In this context, long non-coding RNAs (lncRNAs) have emerged as promising biomarkers for T2DM risk. However, studies exploring their predictive value remain limited. This study aimed to evaluate the potential of circulating lncRNAs in T2DM development and to assess their interaction with dietary interventions.
METHODS: The study included 462 non-diabetic participants from the CORDIOPREV study, followed for 5 years und
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Examination of maternal plasma cell-free DNA (cfDNA) for noninvasive prenatal testing for fetal trisomy is a highly effective method for pregnant women at high risk. This can be also applied to fetal gender determination in female carriers of severe X-linked disease. Polymerase chain reaction (PCR) analysis is a relatively simpler and less expensive method of detecting Y chromosome-specific repeats (Y-specific PCR; YSP), but is limited by the risk of false-negative results. To address this, we have developed a combined strategy incorporating YSP and an estimation of the fetal DNA fraction. Mul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell free DNA (cfDNA) is detectable at low concentrations in the plasma of healthy subjects and at high concentrations in disorders characterized by a high rate of necrotic events, such as tumors and vasculitis, leading to the release of necrotic DNA into the surrounding tissue and the bloodstream. Although cfDNA may act as a danger signal by binding to DNA sensors, triggering inflammation and immune responses, elevated cfDNA concentrations instead may exert immunoregulatory activities. Here, we show that exogenously administered cfDNA mediates immunoregulatory functions in vivo, in particular
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The optimal systemic treatment for pulmonary large-cell neuroendocrine carcinoma (LCNEC) is still under debate. Previous studies showed that LCNEC with different genomic characteristics might respond differently to different chemotherapy regimens. In this study, we sought to investigate genomic subtyping using cell-free DNA (cfDNA) analysis in advanced LCNEC and assess its potential prognostic and predictive value.
EXPERIMENTAL DESIGN: Tumor DNA and cfDNA from 63 patients with LCNEC were analyzed by target-captured sequencing. Survival and response analyses were applied to 54 patient
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovirus specific sequences located in the 5' NTR are used to amplify viral RNA by PCR. General primers were selected for the amplification of cardioviruses, including encephalomyocarditis virus (EMCV), mengovirus and Theiler's murine encephalomyelitis virus (TMEV. Additionally, ECHO virus type 22, an atypical enterovirus, could also be detected with the general cardiovirus primers. An internal encephalomyocarditis virus specific probe and a general cardiovirus probe are used to discriminate EMCV from other cardioviruses. The sensitivity of the PCR was determined at 10 pfu after hybridizati
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kinesins are tubulin molecular motors whose function is to transport organelles within cells. Very little is known about the regulation of expression of these proteins. We have characterized the gene product of one differentially spliced mRNA of the human light chain kinesin and cloned its promoter region. A full-length kinesin cDNA was translated in vitro in a cell-free system, producing a 70-kDa protein. Using this cDNA as a probe, we isolated and sequenced the promoter, first exon, and part of the first intron of this gene from a genomic lambda EMBL3 human placental DNA library. The whole g
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Analysis of tumoral RNA from bone marrow (BM) biopsy is essential for diagnosing childhood B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL), risk stratification, and monitoring, by detecting fusions and gene expression patterns. However, frequent BM biopsies are invasive and traumatic for patients. Small extracellular vesicles (sEVs) circulating in blood contain a variety of biomolecules, including RNA, that may contribute to cancer progression, offering a promising source of non-invasive biomarkers from liquid biopsies. While most EV studies have focused on small RNAs like microRNAs (miRNAs), the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A number of human cell lines derived from well-differentiated, myxoid/round cell, or pleomorphic liposarcoma have been described. To our knowledge, however, no human cell line established from dedifferentiated liposarcoma has been reported. In this study, we established a new human cell line, FU-DDLS-1, which originated from a dedifferentiated liposarcoma arising in the retroperitoneum of a 61-year-old man. This cell line was characterized by immunocytochemistry, conventional banding analysis, fluorescence in situ hybridization with chromosome painting probe, and comparative genomic hybridizat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Patients affected by end-stage renal disease (ESRD) experience an excess of morbidity and mortality due to cardiovascular disease (CVD), which cannot be fully explained by the classical CVD risk factors. Among emerging CVD risk factors, oxidative stress is currently being given emphasis.
METHODS: We achieved a consensus on key points relating to oxidative stress in ESRD patients.
RESULTS: ESRD patients are subjected to enhanced oxidative stress, as a result of reduced anti-oxidant systems (vitamin C and selenium deficiency, reduced intracellular levels of vitamin E, reduced act
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Appendiceal cancer (AC) is a rare malignancy that often presents at advanced stages with significant histological variability influencing clinical outcomes. Precise genomic profiling is essential for accurate diagnosis and personalized patient management. This study interrogated DNA from appendiceal tumor tissue, buffy coat cells, and the cell-free DNA component of plasma using a 523-gene panel for comprehensive genomic profiling (CGP) to identify cancer-related genetic mutations in tumor and blood, evaluate tumor mutation burden, and determine genetic markers associated with histo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования