Salmon aquaculture was one of the major growing and exporting industries in Chile. Its development was accompanied by an increasing and excessive use of large amounts of antimicrobials, such as quinolones, tetracyclines and florfenicol. The examination of the sanitary conditions in the industry as part of a more general investigation into the uncontrolled and extensive dissemination of the ISA virus epizootic in 2008, found numerous and wide-ranging shortcomings and limitations in management of preventive fish health. There was a growing industrial use of large amounts of antimicrobials as an
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonellosis, caused by non-typhoidal Salmonella, is a common foodborne gastrointestinal infection. Third-generation cephalosporins are recommended as the first-line treatment for Salmonella infections. Our study aimed to investigate the molecular epidemiology, antimicrobial resistance, and the transmission of extended-spectrum β-lactamases (ESBL) genes in 96 clinical Salmonella isolates collected between 2020 and 2022 at a tertiary hospital in Shenzhen, China. We performed antimicrobial susceptibility testing and whole-genome sequencing to identify serotypes, multilocus sequence typing, anti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multidrug-resistant plasmids carrying replication genes have been widely present in various strains of Klebsiella pneumoniae. RepA and repB1 were found in plasmids belong to the IncFIB, but their detailed structural and genomic characterization was not reported yet. This is the first study that delivers structural and functional insights of repA- and repB1-carrying IncFIB plasmids.
METHODS: Klebsiella pneumoniae strains A1705, 911021, and 1642 were isolated from the human urine samples and bronchoalveolar fluids collected from different hospitals of China. Antibacterial susceptibi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The virulence regulator ToxR initiates and coordinates gene expression needed by Vibrio cholerae to colonize the small intestine and cause disease. Despite its prominence in V. cholerae virulence, our understanding of the direct ToxR regulon is limited to four genes: toxT, ompT, ompU and ctxA. Here, we determine ToxR's genome-wide DNA-binding profile and demonstrate that ToxR is a global regulator of both progenitor genome-encoded genes and horizontally acquired islands that encode V. cholerae's major virulence factors and define pandemic lineages. We show that ToxR shares more than a third of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pneumoniae expressing serogroup 6 capsules frequently causes pneumococcal infections and the evolutionary origins of the serogroup 6 strains have been extensively studied. However, these studies were performed when serogroup 6 had only two known members (serotypes 6A and 6B) and before the two new members (serotypes 6C and 6D) expressing wciN(β) were found. We have therefore reinvestigated the evolutionary origins of serogroup 6 by examining the profiles of the capsule gene loci and the multilocus sequence types (MLSTs) of many serogroup 6 isolates from several continents. We con
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carbapenem-Resistant Enterobacterales (CRE) has been categorized as pathogens of critical priority by World Health organization (WHO) as they pose significant threat to global public health. Carbapenemase production considered as the principal resistance mechanism against carbapenems and with the recent surge and expansion of carbapenemases and its variants among clinically significant bacteria in India, the present study reports expansion blaOXA-78 and blaOXA-58 of in CRE of clinical origin.
METHODS: Bacterial isolates were collected from a tertiary referral hospital and identifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The contribution of non-coding RNAs, such as microRNAs (miRNAs) in regulating physiological and pathological states has been intensively elucidated during last 15 years. The discovery of circulating miRNAs (cir-miRNAs) in variety of body fluids, is, however a recent focus of interest in understanding pathophysiological states of their originating cells/organs. Yet another stimulating debate that takes miRNAs to the next level is their presence in exosomes, and this is truly interesting area of research. Exosomes are cell-derived extracellular vesicles, and are naturally equipped biological veh
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical pathogens, especially Gram-negative bacteria developing resistance to third-generation cephalosporins, are making clinical outcomes more complicated and serious. This study was undertaken to evaluate the distribution of CTX-M-type extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) in Tamil Nadu, India. For this study, clinical samples were collected from five different hospitals located in Tamil Nadu and the ESBL-producing Gram-negative isolates were characterized. MIC was performed using cefotaxime and ceftazidime. The bla ESBL-producing genes were screened using multiplex PCR for the genes, CTX
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Coxiella bacteria were identified from various tick species across the world. Q fever is a zoonotic disease caused by the bacteria Coxiella burnetii that most commonly infects a variety of mammals. Non-mammalian hosts, such as birds, have also been reported to be infected with the pathogenic form of "Candidatus Coxiella avium". This research increases the list of tick species that have been found with Coxiella-like bacteria in Thailand.
METHODS: A total of 69 ticks were collected from 27 domestic fowl (Gallus gallus domesticus), 2 jungle fowl (Gallus gallus) and 3 Siamese fireback
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferromanganese nodule deposits represent unique deep-sea habitats characterized by metal-rich environments. However, the composition and ecological functions of viral communities inhabiting the regions remain poorly understood. Here, we investigated the composition, distribution patterns, and potential ecological roles of viral community in both sediments and nodules from ferromanganese nodule deposits. Our results indicated that viral community distribution was influenced by sediment depth, habitat type, and microbial community. Furthermore, viruses may enhance the environmental adaptability
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pesticide contamination in water bodies is an emerging driver of antimicrobial resistance (AMR), posing severe environmental and public health risks. Due to excessive agricultural use, pesticides routinely end up in water bodies due to leaching, improper disposal, and agricultural runoff. Pesticides act as selective pressures, promoting resistant microbial strains by providing evolutionary pressure for the strains to thrive. Pesticides facilitate the dissemination of resistance genes through several mechanisms; horizontal gene transfer, bio-film formation, and co-selection with heavy metals. P
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Considering the increasing reports of Salmonella enterica strains resistant to quinolones, antimicrobials frequently employed as therapeutic agents globally, our goal was to investigate the occurrence of plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) determinants in S. enterica recovered from natural surface waters in Paraíba state, Brazil. Water samples (n = 230) were collected monthly in triplicate using modified Moore swabs from 29 sampling sites belonging to 10 large dams. After conventional microbial isolation, representative isolates (n = 938) were submitted to whole genome sequencing, ass
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli (E. coli) are widespread in China, with occurrences documented in humans, animals, and the environment. The dissemination of ESBL-producing E. coli is likely facilitated by the widespread use of antibiotics in human and animal agriculture, the presence of antibiotic-resistant bacteria (ARBs) in animal feces, and close human-animal interactions. Plasmids, particularly those belonging to incompatibility (Inc) group, such as IncF, IncI, and IncH families, play a vital role in facilitating the horizontal gene transfer of ESBL genes ac
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Overexpression of efflux pumps represents a key mechanism of resistance in bacteria. Soil bacteria such as Streptomyces harbour a vast array of efflux genes that are transcriptionally silent under laboratory conditions. However, dissemination of many of these genes into clinical pathogens via horizontal gene transfer results in conferring resistance to multiple drugs. In this study, we have identified the role of a MFS transporter, SCO3366 from Streptomyces coelicolor, in governing multidrug resistance. Overexpression and knockout studies revealed that SCO3366 provides resistance to several st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Considering the extensive evolutionary history of Mycobacterium tuberculosis, anti-Tuberculosis (TB) drug therapy exerts a recent selective pressure. However, in a microorganism devoid of horizontal gene transfer and with a strictly clonal populational structure such as M. tuberculosis the usual, but not sole, path to overcome drug susceptibility is through de novo mutations on a relatively strict set of genes. The possible allelic diversity that can be associated with drug resistance through several mechanisms such as target alteration or target overexpression, will dictate how these genes ca
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The whole genome sequencing and annotation of Clostridium perfringens strains revealed several genes coding for proteins of unknown function with no significant similarities to genes in other organisms. Our previous studies clearly demonstrated that hypothetical proteins CPF_2500, CPF_1441, CPF_0876, CPF_0093, CPF_2002, CPF_2314, CPF_1179, CPF_1132, CPF_2853, CPF_0552, CPF_2032, CPF_0438, CPF_1440, CPF_2918, CPF_0656, and CPF_2364 are genuine proteins of C. perfringens expressed in high abundance. This study explored the putative role of these hypothetical proteins using bioinformatic tools an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since mid-1991, New Zealand has experienced an epidemic of meningococcal disease. The epidemic has been caused by serogroup B meningococci expressing PorA type P1.7-2,4, belonging to the ST-41/ST-44 complex, lineage III. Most B:P1.7-2,4 meningococci express type 4 PorB (87.0%), although case isolates with porB other than type 4 have been identified throughout the duration of the epidemic. To assess the genetic relatedness of case isolates with an alternative porB gene, multilocus restriction typing validated against multilocus sequence typing was used. This determined that B:P1.7-2,4 meningoco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria exhibit extensive genetic heterogeneity within species. In many cases, these differences account for virulence properties unique to specific strains. Several such loci have been discovered in the genome of the type b serotype of Haemophilus influenzae, a human pathogen able to cause meningitis, pneumonia, and septicemia. Here we report application of a PCR-based scanning procedure to compare the genome of a virulent type b (Hib) strain with that of the laboratory-passaged Rd KW20 strain for which a complete genome sequence is available. We have identified seven DNA segments or H. infl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A strain of Klebsiella pneumoniae resistant to cefoxitin and oxyimino-cephalosporins, but susceptible to cefepime, was isolated from an adult patient hospitalised in Taichung, Taiwan. Isoelectric focusing revealed three beta-lactamases with isoelectric points of 5.4, 8.2 and 7.9, respectively. Following PCR with plasmid DNA templates and gene sequencing, these enzymes were shown to correspond to TEM-1, SHV-5 and a novel DHA-1-like enzyme (designated DHA-3). The bla genes for TEM-1 and SHV-5 were transferable, but the bla(DHA-3) gene was non-self-transferable in conjugation experiments. All thr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Listeria monocytogenes is a food-borne pathogen that causes infections with a high-mortality rate and has served as an invaluable model for intracellular parasitism. Here, we report complete genome sequences for two L. monocytogenes strains belonging to serotype 4a (L99) and 4b (CLIP80459), and transcriptomes of representative strains from lineages I, II, and III, thereby permitting in-depth comparison of genome- and transcriptome -based data from three lineages of L. monocytogenes. Lineage III, represented by the 4a L99 genome is known to contain strains less virulent for humans.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.