The misfolding of the protein α-synuclein (αS) has been implicated in the molecular chain of events leading to Parkinson disease. Physiologically, αS undergoes a transition from a random coil to helical conformation upon encountering synaptic vesicle membranes. On analogous small unilamellar vesicles (SUVs), the conformation of αS is dominated by a single elongated αS helix. However, alternative broken helix states have been postulated, mandating experimental clarification. Here, the upper limit for the free energy difference between elongated and broken helix conformations on SUVs resembling
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yellow fever virus (YFV) encodes two envelope proteins, pre-membrane (prM) and envelope (E), that accumulate in the endoplasmic reticulum (ER). The C termini of prM and E form two antiparallel transmembrane alpha-helices that contain ER-retention signals. To understand further the ER retention of the prME heterodimer, we characterized the subcellular localization of chimeric proteins made of a reporter protein fused to the transmembrane segments of YFV envelope proteins. We showed that at least three of the transmembrane segments of the prME heterodimer are ER-retention signals. Interestingly,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the gene encoding alpha-skeletal-muscle actin, ACTA1, cause congenital myopathies of various phenotypes that have been studied since their discovery in 1999. Although much is now known about the clinical aspects of myopathies resulting from over 60 different ACTA1 mutations, we have very little evidence for how mutations alter the behavior of the actin protein and thus lead to disease. We used a combination of biochemical and cell biological analysis to classify 19 myopathy mutants and found a range of defects in the actin. Using in vitro expression systems, we probed actin foldin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural Tet repressor (TetR) variants are alpha-helical proteins bearing a large loop between helices 8 and 9, which is variable in sequence and length. We have deleted this loop consisting of 14 amino acid residues in TetR(D) and rebuilt it stepwise with up to 42 alanine residues. All except the mutant with the longest alanine loop show wild-type repression, but none is inducible with tetracycline. This demonstrates the importance of the alpha8-alpha9 loop and its amino acid sequence for induction. The induction efficiencies increase with loop length, when the more tightly binding inducer anh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parathyroid hormone-related protein (PTHrP) is expressed in a wide variety of cells where it acts as an autocrine and/or paracrine factor involved in regulation of cellular growth, differentiation, and embryonic development. It may also play a physiological endocrine role in calcium transport across the placenta or during lactation. The N-terminal portion, PTHrP-(1-34), retains all the calciotropic parathyroid hormone-like activity and is a lead structure for the design of novel, bone anabolic agents for the treatment of bone disorders such as osteoporosis. To characterize the putative bioacti
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human dopamine transporter (hDAT) participates in dopamine homeostasis by clearing dopamine from the extracellular space using secondary active transport. Dysregulation of hDAT has been reported to be associated with different neuropsychiatric disorders. Dopamine transporter deficiency syndrome (DTDS) is a complex disease caused by defects in dopamine uptake within the synaptic cleft and patients manifest parkinsonian features. The extracellular loops are crucial for DAT activity and defects in these regions disturb dopamine transport. In the present study, a 3.5-year-old female in a consa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid diseases, including neurodegenerative diseases such as Alzheimer's and Parkinson's, are linked to a poorly understood progression of protein misfolding and aggregation events that culminate in tissue-selective deposition and human pathology. Elucidation of the mechanistic details of protein aggregation and the structural features of the aggregates is critical for a comprehensive understanding of the mechanisms of protein oligomerization and fibrillization. Vibrational spectroscopies, such as Fourier transform infrared (FTIR) and Raman, are powerful tools that are sensitive to the secon
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this research, we present a preliminary computational study of four Dermaseptin-related peptides from the skin exudate of the gliding tree frog Agalychnis spurrelli. Experimentally, the amino acid sequence of these peptides was elucidated through molecular cloning and tandem mass spectrometry and synthetic peptides were assayed against E. coli, S. aureus, and C. albicans to determine their antimicrobial properties. With the sequences on hand, a computational study of the structures was carried out, obtaining their physicochemical properties, secondary structure, and their similarity to othe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Changes in the structure of tropomyosin (TM) altered the texture profiles of eel balls and the inhibitory activity of the angiotensin-converting enzyme (ACE). The secondary and tertiary structure of TM was determined after high hydrostatic pressure (HHP) treatment. The correlation between the spatial structure of TM and the texture profiles of eel balls was developed and discussed. The β-sheet was converted to a β-turn and a random coil when treated at HHP (200-400 MPa), meanwhile the α-helix unfolded and was converted into a β-sheet, β-turn and a random coil with treatment at 500 and 600 MPa.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Voltage-gated sodium (NaV) channels are essential for the transmission of pain signals in humans making them prime targets for the development of new analgesics. Spider venoms are a rich source of peptide modulators useful to study ion channel structure and function. Here we describe β/δ-TRTX-Pre1a, a 35-residue tarantula peptide that selectively interacts with neuronal NaV channels inhibiting peak current of hNaV1.1, rNaV1.2, hNaV1.6, and hNaV1.7 while concurrently inhibiting fast inactivation of hNaV1.1 and rNaV1.3. The DII and DIV S3-S4 loops of NaV channel voltage sensors are important for
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oxidative stress is an early hallmark in neurodegenerative disorders such as Alzheimer's and Parkinson's diseases. However, the critical biochemical effector mechanisms of oxidative neurotoxicity have remained surprisingly elusive. In screening various peroxides and potential substrates of oxidation for their effect on neuronal survival, we observed that intramembrane compounds were significantly more active than aqueous or amphiphilic compounds. To better understand this result, we synthesized a series of competitive and site-specific membrane protein oxidation inhibitors termed aminoacyllipi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CssII is a β-scorpion peptide that modifies preferentially sodium currents of the voltage-dependent Na(+) channel (Nav) sub-type 1.6. Previously, we have found that the C-terminal amidation of CssII increases its affinity for Nav, which opens at more negative potentials in the presence of CssII. Although C-terminal amidation in vitro conditions is possible, five CssII peptide toxin variants with C-terminal residues modified were heterologously expressed (rN66S, rN66H, rN66R, r[T64R/N66S] and r[T64R/N66R], in which r stands for recombinant, the capital letters to the amino acid residues and the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disruption of the cellular membrane by the amyloidogenic peptide IAPP (or amylin) has been implicated in beta-cell death during type 2 diabetes. While the structure of the mostly inert fibrillar form of IAPP has been investigated, the structural details of the highly toxic prefibrillar membrane-bound states of IAPP have been elusive. A recent study showed that a fragment of IAPP (residues 1-19) induces membrane disruption to a similar extent as the full-length peptide. However, unlike the full-length IAPP peptide, IAPP(1-19) is conformationally stable in an alpha-helical conformation when boun
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two alpha-helical antimicrobial peptides (BMAP-27 and -28) and four synthetic analogs were compared for in vitro and in vivo antimicrobial efficacy. All peptides proved active in vitro at micromolar concentrations against a range of clinical isolates, including antibiotic-resistant strains. BMAP-27 and two analogs were more effective towards Gram-negative, and BMAP-28 towards Gram-positive organisms. In addition, BMAP-28 provided some protection in vitro against human herpes simplex virus type 1 (HSV-1). The parent peptides and mBMAP-28 analog protected mice from lethal i.p. infections in an a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A detailed kinetic analysis of metal encapsulation by a de novo-designed protein is described. The kinetic mechanism of Hg(II) encapsulation in the three-stranded coiled coil formed by the peptide CH(3)CO-G LKALEEK CKALEEK LKALEEK G-NH(2) (Baby L9C) is derived by global analysis. The mechanism involves rapid initial collapse of two peptides by Hg(II) forming Hg(Baby L9C(-H))(2) with a linear thiolato Hg(II) bound to the cysteine sulfur atoms. Here, Baby L9C(-H) denotes Baby L9C with the cysteine thiol deprotonated. Addition of the third peptide, forming the three-stranded coiled coil, is the r
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycogen storage disease type 1b is caused by a deficiency in a glucose 6-phosphate transporter (G6PT) that translocates glucose 6-phosphate from the cytoplasm to the endoplasmic reticulum lumen where the active site of glucose 6-phosphatase is situated. Using amino- and carboxyl-terminal tagged G6PT, we demonstrate that proteolytic digestion of intact microsomes resulted in the cleavage of both tags, indicating that both termini of G6PT face the cytoplasm. This is consistent with ten and twelve transmembrane domain models for G6PT predicted by hydropathy analyses. A region of G6PT correspondi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The extent to which side-chains at the surface of globular proteins adopt well-defined conformations is a matter of some controversy and, in turn, the idea that specific interactions amongst them might make a significant contribution to defining tertiary structures would be generally seen as questionable. In at least some cases, however, there is evidence for organisation of the surface to form discrete, tightly packed clusters. In this paper we examine the role of such clusters in accommodating large, hydrophobic residues on the exterior of protein structures. Taking poplar plastocyanin as a
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The change of conformation of protein kinase C interacting with the surface of a mercury electrode directly from a solution or through a lipid monolayer was inferred from the number of cystine residues exposed and reduced on the electrode and from their reduction potentials. Soluble protein kinase C was estimated to have 5-6 disulfide bonds which could potentially react with the mercury electrode. Two major reduction peaks of cystine at different microenvironments within the protein molecule adsorbed to a mercury surface. They were observed in a.c. polarograms and cyclic voltamograms at two di
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For night blindness, a detailed structural exploration of the interactions among G-protein receptor rhodopsin, transducin and arrestin was performed. Rhodopsin is responsible for dim light vision while a point mutation (G90→D90) results in an adverse change in its photo-transduction. The validated 3D models of the three proteins were utilized, and upon mutation and interactions, rhodopsin attained higher stability (evaluated through thermodynamic energy calculations, electrostatic surface potential and solvent accessible area), thereby participating strongly with transducin. Conformational swi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования