Computational studies are pivotal in drug development, particularly for screening potential lead compounds. In this study, a library of 37 compounds derived from Withaniasomnifera was meticulously prepared and analyzed. The evaluation process involved applying Lipinski's Rule, followed by ADMET predictions to assess factors that directly influence the pharmacological properties of a drug. The pharmacokinetics and pharmacodynamics of these compounds were thoroughly compared, with aspirin serving as the standard reference drug.Among 37 compounds, Withasomniferol C was found to be the most effect
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given the rising incidence of prostate cancer (PCa), there is an increasing demand for cost-effective and reliable methods for early detection using the prostate-specific antigen (PSA) biomarker. PCa remains a leading cause of mortality among individuals with prostates aged 55-80 years. Molecularly Imprinted Polymers (MIPs) represent a promising solution due to their selectivity, sensitivity, and stability for PSA detection. However, the synthesis of MIPs for protein targets presents significant challenges, particularly in the rational selection of functional monomers and cross-linkers. This s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physics-based methods such as protein-ligand binding free energy calculations have been increasingly adopted in early-stage drug discovery to prioritize promising compounds for synthesis. However, the accuracy of these methods is highly dependent on the details of the calculation and choices made while preparing the ligands and protein ahead of running calculations. During ligand preparation, researchers typically assign partial atomic charges to each ligand atom using a specific ligand conformation for charge assignment, often the input conformer. While it is a well-known problem that partial
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate molecular representation learning is critical for accelerating property prediction in drug discovery. Here, we propose the Dual-branch Molecular Property Encapsulation (DMPE) framework. Its core component, the Refined Interactive Graph Attention Framework (RIGAF), captures both intramolecular topology and intermolecular structural similarity within the broader chemical space. Subsequently, a Kolmogorov-Arnold Network (KAN)-based Embedding and Fusion (KAEF) module uses spline-based transformations to integrate these graph features with complementary molecular fingerprints, enhancing mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The drug discovery process remains slow, costly, and prone to high failure rates, with inefficiencies in lead compound identification and biological activity prediction representing significant contributing factors. Traditional QSAR models, which often focus on specific compound families and smaller datasets, struggle to meet the large-scale data requirements for deep learning models. This study proposes an innovative molecular screening and clustering method that addresses the limitations of traditional QSAR models and screening approaches. By introducing the concept of molecular scaffolds an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) poses a growing global threat, with antibiotic-resistant infections becoming a leading cause of death worldwide. The present study explores natural cyanobacterial compounds as possible inhibitors of Escherichia coli DNA gyrase B (GyrB) which is a verified antibacterial target that is not present in higher eukaryotes. Because of the urgent need for novel antibacterial drugs, we identified nine drug-like candidates using lipinski's rule of five and ADMET profiling. Molecular docking revealed that Biselyngbyaside B and Smenamide A exhibited greater binding affinitie
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibition of the hERG (human ether-a-go-go-related gene) channel by drug molecules can lead to severe cardiac toxicity, resulting in the withdrawal of many approved drugs from the market or halting their development in later stages. These findings highlight the pressing need to evaluate hERG blockade during drug development. We propose a novel framework for feature extraction and aggregation optimization (FEAOF), which primarily consists of a feature extraction module and an aggregation optimization module. The model integrates diverse ligand representations, including molecular fingerprints,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herein we report the in silico discovery of 13 novel micromolar potent inhibitors of the SARS-CoV-2 NSP13 helicase validated in cellular antiviral and biophysical ThermoFluor assays. The compounds, discovered using a novel fragment-based pharmacophore virtual screening workflow named FragmentScout, enable the advancement of novel antiviral agents. FragmentScout uses publicly accessible structural data of the SARS-CoV-2 NSP13 helicase, which was previously generated at the Diamond LightSource by XChem high-throughput crystallographic fragment screening. The workflow generates a joint pharmacoph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using first principles methodology, we show that molecular NaBr and MgO nanoclusters are efficient ecofriendly and transition metal free catalysts for the carbonylation of aziridines to β-lactams. Multi-step mechanisms are proposed, where the activation energies of the rate-determining step are strongly lowered compared to gas phase reaction, exhibiting, however, a unique step. Also, these reactions are viewed to be favored thermodynamically in the presence of these catalysts and also in solvents, in particular in methanol. We suggest thus the use of NaBr and MgO nanoclusters for these reactio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB) remains a significant global health threat, claiming millions of lives annually despite being preventable. The emergence of drug-resistant strains, including extensively drug-resistant TB (XDR-TB) and multidrug-resistant TB (MDR-TB), severely limits conventional treatment options. Furthermore, commonly used TB medications like isoniazid (INH) and rifampicin (RIF) are associated with adverse side effects. Consequently, researchers increasingly explore natural products as potential sources for novel anti-TB therapeutics. This study investigated the inhibitory potential of 103 f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer is one of the most common malignancies in men worldwide and is driven in large part by aberrant androgen receptor (AR) signaling. Upon sufficient androgenic concentration, the AR undergoes conformational changes and translocates to the nucleus, where it promotes the transcription of genes essential for tumor growth and progression. In this study, we performed a structure-based virtual screening of 34 phytochemicals from Euphorbia resinifera against the crystal structure of the AR ligand-binding domain (PDB ID: 1E3G). This screening identified two leading compounds, Resiniferato
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The thiadiazole scaffold has gained prominence in modern drug discovery due to its remarkable structural adaptability. Its unique framework enables interactions with a wide spectrum of biological targets, making it a valuable pharmacophore for therapeutic development. Reflecting its growing clinical importance, efficient synthetic access to thiadiazole derivatives has become a focal point for medicinal chemists seeking to exploit its multifunctional activity. In our study, we synthesized a streamlined and high-throughput synthetic protocol to generate a novel library of imidazole linked thiadi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aromatic nucleophilic substitution (SNAr) is a widely employed synthetic method for modifying thiophene derivatives. Herein, we computationally investigate the reaction mechanism of 2-methoxy-3-X-5-nitrothiophenes with pyrrolidine (where X = NO2, CN, SO2CH3, COCH3, CO2CH3, CONH2 or H). This SNAr reaction follows a stepwise pathway: initially, pyrrolidine adds to the C2 position of the 2-methoxy thiophene partner. Then, the release of methanol is triggered by a proton transfer from the newly formed ammonium intermediate to the methoxy group. With excess pyrrolidine, this proton transfer is cata
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Landiolol is a beta-blocker used in the treatment of Sepsis. However, how this drug influences key genes and pathways involved in disease remains unknown. This study aimed to explore potential biomarkers involved in the mechanism of Landiolol's action in sepsis.
METHODS: Two microarray datasets from the Gene Expression Omnibus database were downloaded. Differentially expressed genes (DEGs) were identified. Then, Landiolol-associated genes (lnd-DEGs) were screened using weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), followed by enrichment analysis and protein-protein interactio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is a disease rooted in genomic alterations and has long stood as one of the most formidable foes for humanity since its inception. A patient's survival often hinges on the specific genomic mutations present and the corresponding immune system response. As each genomic alteration has its deleterious damage, identification of potential drivers of cancer progression may risk yielding false positives without a mutation-specific approach. To advance our understanding of tumor biology, there is a need for a systematic computational framework that combines both bulk RNA-seq and single-cell RNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomedical Image Segmentation applications have witnessed mushroom growth in the last two decades. Current state-of-the-art approaches face challenges when dealing with instance imbalances in datasets. Various functions, such as Blob Loss, Lesion-wise Loss, and Dice Loss limitations, were addressed by Instance-wise loss and Center-of-Instance loss (ICI). ICI is the result of Instance loss, and the center of instance loss suffers from highly unregulated labels and outputs, resulting in low accuracy of aforementioned loss functions. We introduce a novel dual-coefficient regularization approach f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study uses density functional theory (DFT) calculations at the M06-2X/6-311 + G(d,p) level to explore the potential of main group non-metals (X = O, N, S, P) to form hypervalent ylides (RmX+-YRn -2 -). Substituent effects (R = alkoxy, alkyl, phenyl, H, NH2, NMe2, halogens) on the stability of these ylides and their neutral counterparts (Rm- 1X-YRn -1) are analyzed across various X → Y bonding scenarios. Fluorine-substituted ylides (e.g., NhO/F, ShO/F, ShS/F, PhO/F) and PhO/OMe exhibited the highest stability compared to their neutral forms. Bond length and Wiberg bond order analyses revea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effects of replacing individual contributions to an empirical energy function are assessed for halogenated benzenes (X-Bz, X = H, F, Cl, Br) and chlorinated phenols (Cl-PhOH). Introducing electrostatic models based on minimal distributed charges (MDCM) instead of usual atom-centered point charges (PCs) to realistically describe features such as σ-holes yields overestimated hydration free energies unless the van der Waals parameters are reparametrized. Scaling van der Waals ranges by 10% to 20% for three Cl-PhOH and most X-Bz yield results within experimental error bars, which is encouragin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Density functional theory (DFT) is a treatment widely employed for exploring the electronic structure of atoms, molecules, solids, and complex systems. Despite its efficiency and popularity, the accuracy of DFT results is highly dependent on the choice of exchange-correlation (XC) functionals. This study evaluates several XC functionals for calculating atomization energies in 13-atom homo- and heteronuclear alkali metal clusters (X13 and YX12, with X, Y = Li, Na, K, Rb, and Cs), comparing these results with reference data obtained from fixed-node Diffusion Monte Carlo (DMC) simulations. Our fi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The understanding of the interaction mechanism between ligands and receptors depends on the performance of the descriptors. In this study, the electrophilic and nucleophilic interactions of diarylpyrazole-benzenesulfonamide derivatives active on human carbonic anhydrase in 3D space were analyzed using different types of Local Reactivity Descriptors (LRDs). Three different classes of descriptors used in the Molecular Conformer Electron Topology (MCET) method: (1) Atomic charge, (2) Frontier Molecular Orbital (FMO) and (3) Fukui and Klopman indices. To assess the effect of changing LRD types on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования