We investigated mechanisms of the false-positive test results on rapid-antigen detection test (RADT) for group A Streptococcal (GAS) pharyngitis. Most RADT false-positives (76%) were associated with polymerase chain reaction-positive GAS results, suggesting that RADT specificity could be considered close to 100%. Finding that 61% of GAS culture-negative but RADT-positive cases were positive on both GAS polymerase chain reaction and Staphylococcus aureus testing, we posit bacterial inhibition as causative.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chlamydia trachomatis is the most common bacterial etiology of sexually transmitted infection.
AIM: A pilot study was designed using PCR for amplification and detection of a specific 517 bp sequence of the common endogenous plasmid of C. trachomatis from clinical swab specimens obtained from symptomatic female patients attending STD clinics of AIIMS and Regional STD Teaching, Training & Research Center, Safdarjang Hospital, New Delhi.
METHODS: 97 patients were recruited in the study, and endocervical swabs were collected following standard procedures. The samples were analyzed by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: This study investigated the levels of prepatent S. haematobium infection in water samples collected from Schistosomiasis haematobium transmission namely: International Institute of Tropical Agriculture (IITA) river and Eleyele river in Oyo state, Oyan dam and Shokori river in Ogun state, Badagry Lagoon and Lagoon (University of Lagos, Lagos state).
METHODOLOGY: Polymerase chain reaction (PCR) assay amplifying the Dra I repeated sequence of S. haematobium cercariae from the water samples was used. Samples of cercariae obtained from a laboratory population of Bulinus globosus and Bu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Planning for appropriate preventive measures against Chlamydia trachomatis, a common cause of sexually transmitted disease, requires knowledge of prevalence of infection so that interventions can be targeted in a cost-effective manner. This study was performed on 178 male patients presenting with urethritis in the Mashhad province to determine the prevalence of chlamydial infection in Northeast Iran. A cotton swab and first voided urine specimen were collected according to standard procedures. Polymerase chain reaction (PCR) tests were used for the detection of C. trachomatis in the specimens …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two turkey flocks (male and female) and the environment of their house were investigated for the presence of thermophilic Campylobacter. Sample DNA was extracted directly from fecal material and environmental samples. Bacterial identification was done using a modified Campylobacter species specific multiplex PCR. The times needed for colonization and prevalence in male and female turkeys were determined independently. All environmental samples collected before restocking were negative in the PCR analysis, showing a good hygiene and biosecurity system. The first positive PCR results were obtain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: BCR-ABL kinase domain (KD) mutation is the major mechanism contributing to suboptimal response to tyrosine kinase inhibitors (TKI) in BCR-ABL-positive chronic myeloid leukemia (CML) patients. T315I mutation, as one of the most frequent KD mutations, has been shown to be strongly associated with TKI resistance and subsequent therapeutic failure. A simple and sensitive method is thus required to detect T315I mutation at the earliest stage.
METHODS: A single-tube allele specific-polymerase chain reaction (AS-PCR) method was developed to detect T315I mutation in a mixture of normal an…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We tested 513 stool samples from patients in Sydney, Australia for Blastocystis by using five diagnostic techniques: microscopy of a permanently stained smear using a modified iron-hematoxylin stain, two xenic culture systems (a modified Boeck and Drbohlav's medium and tryptone, yeast extract, glucose, methionine-9 medium), and two published conventional polymerase chain reaction methods specific for the small subunit ribosomal DNA. Ninety-eight (19%) samples were positive for Blastocystis in one or more of the diagnostic techniques. The PCR 2 method was the most sensitive at detecting Blastoc…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Because infected dogs are widely considered to be the main domestic reservoir for Leishmania infantum (syn Leishmania chagasi) parasites in Brazil, the diagnosis of canine visceral leishmaniasis (CVL) must be made both accurately and promptly. The present study attempted to standardize a conventional polymerase chain reaction (cPCR) protocol for the detection of L. infantum DNA in canine spleen samples. Quantitative PCR (qPCR) technique was used to confirm the presence of Leishmania DNA in the canine spleen fragments. A comparison was made between the efficacies of these molecular diagnostic t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We hypothesized that Leishmania kDNA may be present in urine of patients with cutaneous leishmaniasis (CL). Urine samples and standard diagnostic specimens were collected from patients with skin lesions. kDNA polymerase chain reaction (PCR) was performed on samples from patients and 10 healthy volunteers from non-endemic areas. Eighty-six of 108 patients were diagnosed with CL and 18 (21%) had detectable Leishmania Viannia kDNA in the urine. Sensitivity and specificity were 20.9% (95% confidence interval [CI] 12.3-29.5%) and 100%. Six of 8 patients with mucocutaneous involvement had detectable…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The diagnosis of pneumocystis pneumonia (PCP) in non-human immunodeficiency virus (HIV)-infected immunocompromised patients is notoriously difficult. The recent advent of polymerase chain reaction (PCR)-based detection systems, based on the identification of single fungal genes, has markedly improved diagnostic accuracy in this ominous disease. In an attempt to further improve diagnostic yield, the authors used a PCR-based detection system for Pneumocystis jirovecii, based on targeting 3 distinct genes.
METHODS: During the 4-year period (January 2005 to January 2009), all consec…
Клиническое исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumocystis jirovecii pneumonia (PCP) is one of the most common and fatal infections in non-AIDS immunocompromised patients, which is difficult to diagnose by traditional morphologic methods. This study evaluated polymerase chain reaction (PCR) assays of Pneumocystis jirovecii mitochondrial large subunits ribosomal RNA in sputum and bronchioalveolar lavage fluid (BALF) for diagnosing PCP.
METHODS: Sputum and BALF specimens from two groups were collected: one group (PCP group) included 20 patients definitely diagnosed of PCP by Gomori methenamine silver (GMS) stains of BALF; the o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The aim of this study is to evaluate the role of real-time polymerase chain reaction (PCR) and conventional bacterial culture methods in the detection of Pseudomonas aeruginosa in contact lens-induced severe, partially treated corneal ulcers referred to a tertiary center.
METHODS: The study duration was 6 months. All patients with contact lens-related corneal ulcer, requiring admission during the study period were recruited. Samples from corneal scrapings were simultaneously sent at the time of admission for PCR and culture testing. An in-house real-time PCR was developed to detect t…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus epidermidis is a significant pathogen in neonatal sepsis and other nosocomial infections. For further investigations of the colonisation patterns and invasive pathways, typing methods that are applicable on large populations of bacterial isolates are warranted. In the present study, a genotyping method based on polymerase chain reaction (PCR) for the repeat regions of four genes (sdrG, sdrF, aap and sesE) that encode for bacterial surface proteins was developed and applied to a sample of well-characterised neonatal blood isolates of S. epidermidis (n = 49). The PCR products were…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human enterovirus 71 (HEV71) and coxsackievirus A16 (CVA16) are two major aetiological agents of hand, foot and mouth disease (HFMD) in children. Recently there have been several large outbreaks of HFMD in Vietnam and the Asia-Pacific region. In this study, a multiplex RT-PCR assay was developed in order to detect simultaneously HEV71, CVA16 and other human enteroviruses. Enterovirus detection was performed with a mixture of three pairs of oligonucleotide primers: one pair of published primers for amplifying all known enterovirus genomes and two new primer pairs specific for detection of the V
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Credible vector-borne disease surveillance programs, especially in developing countries with limited resources, must include diagnostic tests that are efficient, inexpensive and simple and safe to administer while maintaining high levels of sensitivity and specificity. Since immunohistochemistry (IHC) includes most of these features, its sensitivity, specificity, predictive positive value (PPV) and predictive negative value (PNV) for West Nile virus (WNv) screening were compared to those of the gold standard, RT-PCR testing of kidney tissue in dead birds.
METHODOLOGY: IHC and RT
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeriosis is a severe infection that mainly affects pregnant women, neonates, and immuno-compromised adults. The commercially available semi-automated repetitive-sequence-based polymerase chain reaction assay system, DiversiLab, has been successfully used for subtyping several species of bacteria. In this article we compare the DiversiLab System with macrorestriction analysis by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), which is currently the gold standard for molecular subtyping of Listeria monocytogenes. We used a panel of 116 human and food L. monocytogenes isolates for the comparative eva…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmania (Viannia) guyanensis was for many years the only species commonly identified in French Guiana, but precise species identifications were quite rare. We describe a new restriction fragment length polymorphism-polymerase chain reaction technique using a 615-bp fragment of the RNA polymerase II gene and 2 restriction enzymes, TspRI and HgaI. Seven reference strains (Leishmania (Leishmania) amazonensis, Leishmania (Viannia) lainsoni, Leishmania (Viannia) braziliensis, L. (V.) guyanensis, Leishmania (Viannia) naiffi, Leishmania (Leishmania) major, Leishmania (Leishmania) infantum) and 112…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dermatophytes are the main cause of onychomycoses, but various nondermatophyte filamentous fungi are often isolated from abnormal nails. The correct identification of the aetiological agent of nail infections is necessary in order to recommend appropriate treatment.
OBJECTIVE: To evaluate a rapid polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay based on 28S rDNA for fungal identification in nails on a large number of samples in comparison with cultures.
METHODS: Infectious fungi were analysed using PCR-RFLP in 410 nail samples in which fungal el…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine if Mycobacterium tuberculosis can be detected in corneas of donors who have active tuberculosis (TB) disease using polymerase chain reaction (PCR) or culture.
DESIGN: This is a prospective cross-sectional study.
PARTICIPANTS: 25 corneas (12 from TB-negative donors and 13 from TB-positive donors) from the Sta. Lucia International Eye Bank were submitted to the TB Research Laboratory, Medical Research Laboratory, Department of Medicine, UP-PGH, for diagnostic evaluation.
INTERVENTION: Corneas were evaluated using PCR test for M tuberculosis. Acid-fast bacilli smear and…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To clarify the usefulness of multiplex reverse transcription polymerase chain reaction (mRT-PCR) in diagnosing acute leukemia, mRT-PCR detecting 28 different translocations was performed on bone marrow aspirates of 156 patients with acute leukemia, and the results were compared with conventional chromosomal karyotypes. About 113 of 156 patients had acute myeloid leukemia (AML), and 36 had acute lymphoid leukemia (ALL) with patients' ages ranging from 1 to 84 (median: 34.5). Concordance rate between karyotyping and mRT-PCR was 50% (51% in AML and 44% in ALL). Karyotype revealed chromosomal abno…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования