The Dmrt gene family is characterized by a conserved DM domain, and is crucial to sex determination and sexual differentiation. Dmrt1 is pivotal in testis formation and function by interacting with genes crucial for Sertoli cell differentiation, such as Sox9. Across 128 vertebrate species, Dmrt1 exhibits sexually dimorphic expression, prior to gonadal sex differentiation, implicating its role in master regulation of sex determination. Dmrt1 emerges as a master sex-determining gene in one fish, frog, chicken, and turtle, with candidacy in 12 other vertebrate species. Recent studies suggest epig
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: The association between Wilson disease and various ATP7B mutations is well-established; however, the molecular mechanism underlying the functional consequence of these mutations, particularly the splicing mutations, remains unclear. This study focused on the ATP7B c.1543+1G>C variant, to reveal a universal pathogenic mechanism of the ATP7B mutants with altered N-terminus.
METHODS: The splicing assay and RNA pull-down were performed to explore the mechanism of the aberrant splicing. The ATP7B knockout HuH-7 cell line and Atp7b-/- mice were created, and the functional consequ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA binding motif 20 (RBM20) regulates pre-mRNA splicing of over thirty genes, among which titin is a major target. With RBM20 expression, titin expresses a larger isoform at fetal stage to a smaller isoform at adult resulting from alternative splicing, while, without RBM20, titin expresses exclusively a larger isoform throughout all ages. In addition to splicing regulation, it is unknown whether RBM20 also regulates gene expression. In this study, we employed Rbm20 knockout rats to investigate gene expression profile using Affymetrix expression array. We compared wild type to Rbm20 knockout a…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many genes increase coding capacity by alternate exon usage. The gene encoding the insect nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) α6 subunit, target of the bio-insecticide spinosad, is one example of this and expands protein diversity via alternative splicing of mutually exclusive exons. Here, we show that spinosad resistance in the tomato leaf miner, Tuta absoluta is associated with aberrant regulation of splicing of Taα6 resulting in a novel form of insecticide resistance mediated by exon skipping. Sequencing of the α6 subunit cDNA from spinosad selected and unselected strains of T. absolut
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinocerebellar ataxia type 31 (SCA31) is an adult-onset autosomal-dominant neurodegenerative disorder showing progressive cerebellar ataxia mainly affecting Purkinje cells. The SCA31 critical region was tracked down to a 900 kb interval in chromosome 16q22.1, where the disease shows a strong founder effect. By performing comprehensive Southern blot analysis and BAC- and fosmid-based sequencing, we isolated two genetic changes segregating with SCA31. One was a single-nucleotide change in an intron of the thymidine kinase 2 gene (TK2). However, this did not appear to affect splicing or expressi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE/HYPOTHESIS: Otosclerotic bone is supposed to show unique CD46 expression pattern because otosclerosis is an organ-specific disease with viral etiology.
STUDY DESIGN: Otosclerosis is a complex bone remodeling disorder of the human otic capsule, which is associated with persisting measles virus infection. The general cellular receptor of measles virus is the CD46, which has 14-known splicing isoforms.
METHODS: Nucleic acid was extracted from ankylotic stapes footplates (N = 99) removed during stapedectomies. Consecutive histological, CD46 specific immunohistologic analysis, and multi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the GPR143 gene cause X-linked ocular albinism type 1 (OA1), a disease that severely impairs vision. We recently generated induced pluripotent stem cells (iPSCs) from skin fibroblasts of an OA1 patient carrying a point mutation in intron 7 of GPR143. This mutation activates a new splice site causing the incorporation of a pseudoexon. In this study, we present a high-performance CRISPR-Cas ribonucleoprotein strategy to permanently correct the GPR143 mutation in these patient-derived iPSCs. Interestingly, the two single-guide RNAs available for SpCas9 did not allow the cleavage of t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our patient was a 52-year-old man who was diagnosed with signet ring cell gastric adenocarcinoma. An extensive family history of gastric cancer raised suspicion for hereditary diffuse gastric cancer. Sequencing of the patient's CDH1 gene revealed a novel point mutation in a strictly conserved splice site within intron 6, c.833-2 A > G. This mutation was predicted to result in loss of function due to defective RNA splicing. To characterize the pathogenic mechanism of this mutation, we amplified the patient's CDH1 gene products by reverse transcriptase polymerase chain reaction. Primers flanking…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6 -methyladenosine (m6 A) is the most prevalent modification in mRNA and engages in multiple biological processes. Previous studies indicated that m6 A methyltransferase METTL3 ('writer') and demethylase FTO ('eraser') play critical roles in heart-related disease. However, in the heart, the function of m6 A 'reader', such as YTH (YT521-B homology) domain-containing proteins remains unclear. Here, we report that the defect in YTHDC1 but not other YTH family members contributes to dilated cardiomyopathy (DCM) in mice. Cardiac-specific conditional Ythdc1 knockout led to obvious left ventricular
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary spastic paraplegias (HSPs) are a group of heterogeneous neurodegenerative disorders, which are often presented with overlapping phenotypes such as progressive paraparesis and spasticity. To assist the diagnosis of HSP subtypes, next-generation sequencing is often used to provide supporting evidence. In this study, we report the case of two probands from the same family with HSP symptoms, including bilateral lower limb weakness, unsteady gait, cognitive decline, dysarthria, and slurring of speech since the age of 14. Subsequent whole-genome sequencing revealed that the patients are c
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total synthesis of the natural product 6-deoxypladienolide D (1) has been achieved. Two noteworthy attributes of the synthesis are (1) a late-stage allylic oxidation which proceeds with full chemo-, regio-, and diastereoselectivity and (2) the development of a scalable and cost-effective synthetic route to support drug discovery efforts. 6-Deoxypladienolide D (1) demonstrates potent growth inhibition in a mutant SF3B1 cancer cell line, high binding affinity to the SF3b complex, and inhibition of pre-mRNA splicing.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In most cells, Malat1 long noncoding RNA localizes to the nucleus where it affects splicing and chromatin function. In mouse neurons, Malat1 is exported to the cytoplasm where it is translated to generate the M1 micropeptide. Here, we characterize an internal ribosome entry site (IRES) required for M1 translation that is sufficient to induce cap-independent expression of a downstream open reading frame. In vivo chemical probing and structural modeling defined a three-stem-loop RNA secondary structure that encompasses the active IRES segment and coincides with a mouse B1 SINE (short intersperse
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary ciliary dyskinesia (PCD, OMIM 244400) is a rare genetic disorder that affects motile cilia and is characterised by impaired mucociliary clearance of the airway epithelium, which results in chronic upper and lower airway infections. While short-read next-generation sequencing technology has been used for the genetic testing of PCD, its effectiveness is limited in identifying variants in the HYDIN gene because of the nearly identical pseudogene HYDIN2 As we confirmed that the HYDIN2 gene was not expressed in airway cells, we obtained nasal mucosa biopsy specimens for total RNA sequencing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Технология RNA-посланника (mRNA) революционизирует фармацевтическую промышленность благодаря ее более высокому уровню безопасности, производственным возможностям и потенциальному применению в отношении ранее не поддающихся лекарственным препаратам целей лечения. Помимо линейной МРНК, такой, как обычная МРНК, самовычисляющаяся МРНК и транспоминирующая МРНК, в качестве многообещающего кандидата появился циркуляр МРНК. Циркулярная RNA (Circular RNA) — класс однострунной RNA с кавалентно закрытой структурой петли, которая обеспечивает повышенную стабильность по сравнению с линейной RNA за счет соп
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Alternative splicing generates multiple RNA isoforms from a single gene, enriching genetic diversity and impacting gene function. Effective visualization of these isoforms and their expression patterns is crucial but challenging due to limitations in existing tools. Traditional genome browsers lack programmability, while other tools offer limited customization, produce static plots, or cannot simultaneously display structures and expression levels. RNApysoforms was developed to address these gaps by providing a Python-based package that enables concurrent visualization of RNA isofo
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Functional analysis of factors involved in transcription and RNA processing is difficult in vivo because of the importance of these processes to maintain cell viability. The ability to perform conditional knockouts and to generate stable transfectants in DT40 cells has facilitated the study of general transcription factors such as TATA binding proteins, essential splicing factors such as ASF/SF2 and crucial polyadenylation factors such as CstF64, as well as a number of more specific regulators of gene expression. The complexity of transcriptional regulation and the coupled mechanisms of RNA pr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Current therapies have succeeded in controlling AIDS pandemic. However, there is a continuing need for new drugs, in particular those acting through new and as yet unexplored mechanisms of action to achieve HIV infection cure. We took advantage of the unique feature of proviral genome to require both activation and inhibition of splicing of viral transcripts to develop molecules capable of achieving long lasting effect on viral replication in humanized mouse models through inhibition of Rev-mediated viral RNA biogenesis.
RESULTS: Current HIV therapies reduce viral load during trea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast carcinoma amplified sequence 2 (BCAS2), a core component of the hPrP19 complex, plays crucial roles in various physiological and pathological processes. However, whether BCAS2 has functions other than being a key RNA-splicing regulator within the nucleus remains unknown. Here, we show that BCAS2 is essential for primitive hematopoiesis in zebrafish and mouse embryos. The activation of Wnt/β-catenin signaling, which is required for hematopoietic progenitor differentiation, is significantly decreased upon depletion of bcas2 in zebrafish embryos and mouse embryonic fibroblasts. Interesting
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in the cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5) gene are associated with CDKL5 deficiency disorder (CDD), a severe X-linked developmental and epileptic encephalopathy. Deletions affecting the 5' untranslated region (UTR) of CDKL5, which involve the noncoding exon 1 and/or alternatively spliced first exons (exons 1a-e), are uncommonly reported. We describe genetic and phenotypic characteristics for 15 individuals with CDKL5 partial gene deletions affecting the 5' UTR. All individuals presented characteristic features of CDD, including medically refractory infantile-onset epile
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is a hematological malignancy with high metabolic heterogeneity. N6-methyladenosine (m6A) modification plays an important role in metabolism through regulating circular RNAs (circRNAs). However, the underlying mechanism is not yet fully understood in CLL. Herein, an m6A scoring system and an m6A-related circRNA prognostic signature are established, and circTET2 as a potential prognostic biomarker for CLL is identified. The level of m6A modification is found to affect the transport of circTET2 out of the nucleus. By interacting with the RNA-binding protein (RB
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования