Mantle cell lymphoma (MCL) is an aggressive, highly proliferative B-cell non-Hodgkin lymphoma, characterized by the specific t(11;14)(q13;q32) translocation. It is well established that this translocation alone is not sufficient to promote MCL development, but that additional genetic changes are essential for malignant transformation. We have identified such additional tumorigenic triggers in MCL tumors, by applying genome-wide array-based comparative genomic hybridization with an 800-kilobase (kb) resolution. This strategy, combined with a newly developed statistical approach, enabled us to c…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Breast cancer is thought to develop from noninvasive precursor lesions, although the earliest steps of neoplastic transformation are still undefined. Usual ductal hyperplasia (UDH) is considered to represent a benign proliferation of ductal epithelial cells, whereas atypical ductal hyperplasia (ADH) may represent the first clonal neoplastic expansion of these cells. The aim of this study was to examine genetic alterations in UDH and ADH and to determine the relationship between these lesions in the same breast biopsy.
EXPERIMENTAL DESIGN: Comparative genomic hybridization analysis wa…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Undifferentiated embryonal sarcoma (UES) is the third most common hepatic malignancy in children. Previous reports have described a broad range of complex cytogenetic abnormalities in individual cases of hepatic UES. Herein we report the cytogenetic findings of six cases of hepatic UES at our institution analyzed by conventional cytogenetic methods and comparative genomic hybridization (CGH). The CGH demonstrated several chromosomal gains and deletions in each case, but there was no specific abnormality seen in every case. Patterns of chromosomal changes included gains of chromosome 1q (four c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Schwannomas occur sporadically or in association with neurofibromatosis 2 (NF2), an autosomal dominant disorder, which predispos … vestigated DNA copy number changes in 25 schwannomas (12 NF2 and 13 sporadic schwannomas) using the comparative genomic hybridization (CGH) technique. Some chromosomal regions were further studied by LOH or FISH analysis.
FINDINGS: CGH detected genomic abnormalities in 15 of 25 schwannomas (60%). The most common alteration was loss on 22q, found in 32% (8/25) of schwannomas. No c …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
More than 50% of spontaneous abortions (SAs) have abnormal chromosomes; the most common abnormalities are trisomy, sex chromosome monosomy, and polyploidy. Conventional cytogenetic analysis of SAs depends on tissue culturing and is associated with a significant tissue culture failure rate and contamination by maternally derived cells. Comparative genomic hybridization (CGH), in combination with flow cytometry (FCM), can detect numerical and unbalanced structural chromosomal abnormalities associated with SAs while avoiding the technical problems associated with tissue culture. Routine cytogenet…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental and occupational mutagens such as chemical agents are suspected to be involved in cancer development. However, a direct link b … 12 patients with occupational histories of solvents and TRI exposure were histologically analyzed. Comparative Genomic Hybridization (CGH) was used to screen for genomic alterations along all chromosomal arms. Tumor DNA was analyzed for mutations of the von Hippel-Lindau gene (VHL) on 3p25.5 by PCR and sequencing analyses. The histological analysis revealed 9 clear cell (75%), 2 …
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma is the leading cause of death among cutaneous neoplasms. Best outcome relies on early detection and accurate pathologic diagnosis. … ing a more definitive diagnosis. In recent years, DNA-based molecular ancillary tests, specifically comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization, have been developed to help guide the diagnosis of ambiguous melanocytic proliferations. This study will present an updated overview of these two major ancillary tests, which are currently being used in clinic …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The comparative genomic hybridization (CGH) technique was initially used for detection of chromosomal imbalances in tumor cells. CGH can also be used as a supplementary method to karyotypic analysis in clinical cytogenetic cases. In order to evaluate CGH usefulness in prenatal and postnatal analysis of whole chromosome and segmental aneusomies, we investigated 13 clinical samples from blood, cultured chorionic villi, cultured amniotic fluids and uncultured amniotic fluids. These specimens, initially analyzed by conventional cytogenetics, included 5p monosomy, 9p duplication, add 6p, unbalanced…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic alteration in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) was studied in two cell line pairs (HN30-HN31 and HN4-HN12) using conventional C-banding, multiplex fluorescence in situ hybridization (M-FISH), and array comparative genomic hybridization (array CGH). HN30 and HN4 were derived from primary lesions in the pharynx and base of tongue, respectively, and HN31 and HN12 were derived from lymph-node metastatic lesions belonging to the same patients. Gain of chromosome 1, 7, and 11 were shared in almost all cell lines. Hierarchical clustering revealed that HN31 was closely related to …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Compelling evidence indicates that Shigella species, the etiologic agents of bacillary dysentery, as well as enteroinvasive Escherichia coli, are derived from multiple origins of Escherichia coli and form a single pathovar. To further understand the genome diversity and virulence evolution of Shigella, comparative genomic hybridization microarray analysis was employed to compare the gene content of E. coli K-12 with those of 43 Shigella strains from all lineages.
RESULTS: For the 43 strains subjected to CGH microarray analyses, the common backbone of the Shigella genome was estima…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Array-based comparative genomic hybridization (aCGH) is a new technique for detecting submicroscopic deletions and duplications, and can overcome many of the limitations associated with classic cytogenetic analysis. However, its clinical use in spontaneous abortion needs comprehensive evaluation. We used aCGH to investigate chromosomal imbalances in 100 spontaneous abortions and compared the results with G-banding karyotyping and fluorescence in situ hybridization (FISH). Inconsistent results were verified by quantitative fluorescence PCR.
RESULTS: Abnormalities were detected in 6…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital diaphragmatic hernia (CDH) has an incidence of 1 in 3,000 births and a high mortality rate (33%-58%). Multifactorial inheritance, … ients and from four previously published patients with CDH and a 15q deletion. By using array-based comparative genomic hybridization and fluorescent in situ hybridization to determine the boundaries of the deletions and by including data from two individuals with terminal 15q deletions but without CDH, we were able to exclude a substantial portion of the telomeric region from the …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analyzed quantitative chromosome 14 abnormalities in 124 meningiomas by interphase fluorescence in situ hybridization (iFISH) and confirmed the nature of abnormalities by comparative genomic hybridization (CGH). We correlated the abnormalities with clinical, histopathologic, and prognostic factors. Of 124 cases, 50 (40.3%) showed loss (14.5%) or gain (25.8%) of the 14q32 chromosome region by iFISH. Most corresponded to numeric abnormalities: monosomy (12.9%), trisomy (1.6%), or tetrasomy (24.2%); in only 2 cases (1.6%), chromosome 14 loss did not involve the whole chromosome and was restric…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD10 is one of the hallmarks of germinal center B-cells where follicular lymphomas (FL) originate. It has not been clearly established, however, whether CD10(+) diffuse B-cell lymphomas (DLBCL) are genetically similar to FL. We therefore examined 19 CD10(+) DLBCL and 40 FL by means of comparative genomic hybridization (CGH) and tissue-fluorescence in situ hybridization (T-FISH). Chromosomal imbalance was more frequently detected in CD10(+) DLBCLs (19/19) than in FLs (24/40). Significant differences were found in eight frequently imbalanced regions, namely those with gains of chromosomes 7q and…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although a number of malignant fibrous histiocytoma (MFH) cell lines have been reported, their characterization at a molecular cytogenetic level has not been fully established. In this study, we established a new human cell line, designated as FU-MFH-1, from a storiform-pleomorphic MFH arising in the retroperitoneum of a 61-year-old woman, and applied comparative genomic hybridization (CGH) and fluorescence in situ hybridization (FISH) with chromosome painting probes for the characterization of chromosome alterations. FU-MFH-1 cells were spindle, round, or polygonal in shape with oval nuclei, …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spontaneous abortion occurs in 8-20% of recognized pregnancies and usually takes place in the first trimester (7-11 weeks). There are many causes of pregnancy loss, but the most important (about 75%) is the presence of chromosomal aberrations. We present the results of oligonucleotide array application in a cohort of 62 miscarriage cases. The inclusion criteria for the study were the loss after 8th week of pregnancy and the appearance of recurrent miscarriages. DNA was extracted from trophoblast or fetal skin fibroblasts. In the 62 tested materials from recurrent miscarriages, the detection ra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to determine the suitability of the comparative genomic hybridization to microarray (aCGH) technique for prenatal diagnosis, but also to assess the frequency of chromosomal aberrations that may lead to fetal malformations but are not included in the diagnostic report. We present the results of the aCGH in a cohort of 7400 prenatal cases, indicated for invasive testing due to ultrasound abnormalities, high-risk for serum screening, thickened nuchal translucency, family history of genetic abnormalities or congenital abnormalities, and advanced maternal age (AMA). The ov…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Copy number variations have been found in patients with neural tube abnormalities. In this study, we performed genome-wide screening using high-resolution array-based comparative genomic hybridization in three children with tethered spinal cord syndrome and two healthy parents. Of eight copy number variations, four were non-polymorphic. These non-polymorphic copy number variations were associated with Angelman and Prader-Willi syndromes, and microcephaly. Gene function enrichment analysis revealed that COX8C, a gene associated with metabolic disorders of the nervous system, was located in the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Renal cell carcinoma occurs at higher frequency in acquired cystic renal disease than in the general population. We have analyzed 4 tumors obtained from the kidneys of 2 patients with acquired cystic renal disease, including 2 conventional renal cell carcinomas and 2 acquired cystic renal disease-associated tumors, for genetic alterations. DNA changes were established by applying the 44K Agilent Oligonucleotide Array-Based CGH (Agilent Technologies, Waldbronn, Germany), and mutation of VHL gene was detected by direct sequencing of the tumor genome. DNA losses and mutation of the VHL gene, whic
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular cytogenetic techniques enabled us to clarify numerical and structural alterations previously detected by conventional cytogenetic techniques in 37 patients who had myelodysplastic syndromes with complex karyotypes. Using high-resolution comparative genomic hybridization (HR-CGH), we found the most recurrent alterations to be deletion of 5q (70%), 18q (35%), 7q (32%), 11q (30%), and 20q (24%), gain of 11q (35%) and 8q (24%), and trisomy of chromosome 8 (19%). Furthermore, in 35% of the patients, 20 amplifications were identified. These amplifications were shown by FISH to involve some…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования