Drawbacks of conditional gene deletion in mice include the need for extensive breeding and, often, a lack of cell type-specificity. CRISPR interference (CRISPRi) is an alternative approach for loss-of-function studies that inhibits expression by guiding a transcriptional repressor to the transcription start-site of target genes. However, there has been limited exploration of CRISPRi in mice. We tested the effectiveness of a single CRISPRi transgene broadly expressing a single guide RNA and a catalytically dead Cas9 fused to the KRAB repressor domain to suppress a well-characterized target gene
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prime editing (PE) enables precise and versatile genome editing without requiring double-stranded DNA breaks. Here we describe the systematic optimization of PE systems to efficiently correct human cystic fibrosis (CF) transmembrane conductance regulator (CFTR) F508del, a three-nucleotide deletion that is the predominant cause of CF. By combining six efficiency optimizations for PE-engineered PE guide RNAs, the PEmax architecture, the transient expression of a dominant-negative mismatch repair protein, strategic silent edits, PE6 variants and proximal 'dead' single-guide RNAs-we increased corr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetically modified pigs play a critical role in mimicking human diseases, xenotransplantation, and the development of pigs resistant to viral diseases. The use of programmable endonucleases, including the CRISPR/Cas9 system, has revolutionized the generation of genetically modified pigs. This study evaluates the efficiency of electroporation of oocytes prior to fertilization in generating edited gene embryos for different models. For single gene editing, phospholipase C zeta (PLC ζ) and fused in sarcoma (FUS) genes were used, and the concentration of sgRNA and Cas9 complexes was optimized. T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in microRNA-96 (MIR96) cause autosomal dominant deafness-50 (DFNA50), a form of delayed-onset hearing loss. Genome editing has shown efficacy in hearing recovery through intervention in neonatal mice, yet editing in the adult inner ear is necessary for clinical applications, which has not been done. Here, we developed a genome editing therapy for the MIR96 mutation 14C>A by screening different CRISPR systems and optimizing Cas9 expression and the sgRNA scaffold for efficient and specific mutation editing. AAV delivery of the KKH variant of Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9-KKH) and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibroblast growth factor receptor 4 (FGFR4) has a role in many biological processes, including lipid metabolism, tissue repair, and vertebrate development. In recent years, FGFR4 overexpression and activating mutations have been associated with numerous adult and pediatric cancers. As such, FGFR4 presents an opportunity for therapeutic targeting which is being pursued in clinical trials. To understand the role of FGFR4 signaling in disease and development, we generated and characterized three alleles of fgfr4 knockout zebrafish strains using CRISPR/Cas9. To generate fgfr4 knockout crispants, w
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adeno-associated virus (AAV)-mediated clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) editing holds promise to restore missing dystrophin in Duchenne muscular dystrophy (DMD). Intramuscular coinjection of CRISPR-associated protein 9 (Cas9) and guide RNA (gRNA) vectors resulted in robust dystrophin restoration in short-term studies in the mdx mouse model of DMD. Intriguingly, this strategy failed to yield efficient dystrophin rescue in muscle in a long-term (18-month) systemic injection study. In-depth analyses revealed a selective loss of the gRNA vector after long-term syst
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diploid genome of the fungal pathogen Candida albicans is highly heterozygous, with most allele pairs diverging at either the coding or regulatory level. When faced with selection pressure like antifungal exposure, this hidden genetic diversity can provide a reservoir of adaptive mutations through loss of heterozygosity (LOH) events. Validating the potential phenotypic impact of LOH events observed in clinical or experimentally evolved strains can be difficult due to the challenge of precisely targeting one allele over the other. Here, we show that a CRISPR-Cas9 system can be used to overc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To review the clinical and translational implications of off-target activity associated with clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-based approaches in nontuberculous mycobacteria (NTM) and discuss current strategies aimed at specificity and safety.
MATERIALS AND METHODS: The relevant published literature on the application of CRISPR-Cas systems, including Cas9, Cas12a and CRISPR interference (CRISPRi), in NTM research was reviewed. Particular attention was given to off-target mechanisms, mycobacteria-specific genomic challenges, computational predictio
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas systems protect bacteria from viral nucleic acids. The Cas9 enzyme cleaves bacteriophage DNA preventing viral genes from being expressed in the bacterial host. In this work, the Cas9 protein is repurposed to function as an intracellular mammalian defense mechanism that protects human cells from cytomegaloviral DNA. The A549 lung adenocarcinoma cell line was genetically modified to express a doxycycline-inducible Cas9, and a guide RNA targeting a luciferase reporter plasmid. This investigation revealed a robust inducible Cas9 system that successfully reduced the expression of the luc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance is a major global health concern that requires innovative therapeutic strategies. This study aimed to address this challenge by designing Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-associated protein (CRISPR-Cas)-based plasmid systems for potential genome editing applications in multidrug-resistant (MDR) Klebsiella pneumoniae clinical isolates. Minimum inhibitory concentrations (MICs) of imipenem, meropenem, and ertapenem were determined according to European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing guidelines. All isolates (n = 5) were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Achieving pancreatic-targeted delivery marks a breakthrough in treating pancreatic diseases, yet precise delivery remains challenging1. Here we identify an explicit and universal principle for pancreatic-selective delivery and propose a pancreatic-targeted lipid nanoparticle (AH-LNP) for mRNA delivery. AH-LNP exhibits size enlargement after assembly with proteins, facilitating capsule-filter-mediated pancreas-selective accumulation and receptor-mediated endocytosis, thereby boosting the pancreatic-targeted ability. Benefiting from this, AH-LNP enables precise and efficient genome editing in th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predictable control of gene expression is essential for building genetic circuits and improving metabolic pathways, but conventional promoter libraries often behave unpredictably when genes are combined. Here we develop CRISPR-Activated Promoter-based Orthogonal expression (CAPO), a quantitative platform for controlling multiple genes in yeast. CAPO uses synthetic CRISPR-activated promoters that remain silent until matching guide RNAs recruit dCas9-VPR. We tune each gene by varying guide RNA abundance with defined T7 promoters, while keeping regulatory channels orthogonal. CAPO reaches express
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Posterior capsule opacification (PCO) is the most common postoperative complication of cataract surgery. Transforming growth factor-β (TGF-β) is related to epithelial-mesenchymal transition (EMT) of lens epithelial cells (LECs) that is proven to induce PCO formation in clinical and experimental studies. In this study, CRISPR sequences targeting exon of TGF-βRII were knocked out with lentiviral transfection in LECs. Rabbits' PCO model was established and recombinant adeno-associated virus (AAV) for transferring the gRNA of TGF βRII were intravitreally injected. SgRNA inhibited TGF-βRII expressi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenems have been considered to be the preferred antibiotics against Acinetobacter baumannii thus far. However, carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii (CRAB) has gradually escalated worldwide, and it frequently causes respiratory and bloodstream infections. Its resistance may lead to high mortality. Thus, there is an urgent need to develop antibacterial drugs. In our research, the pH-sensitive sgRNA-I/L@ZS nanosystem delivered imipenem and better released it in infected tissues to synergistically damage bacteria with nanoparticles. Gene editing of the CRISPR-Cas9 nanosystem amplified
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recombinant adenoviruses have broad applications for gene delivery and expression. Furthermore, the adenovirus packaging system facilitates the expression of RNA-guided CRISPR/Cas9 nuclease complexes. In this study, we developed a novel system, named AdBlue, for the construction of recombinant adenoviruses using an enzymatic assembly strategy. This system could significantly reduce the time and labor required to generate adenoviral vectors. When applied to CRISPR/Cas9 design, it simplifies the preparation of recombinant adenoviruses carrying nuclease complexes and can induce high levels of sit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Erythropoietin (EPO) stimulates erythroid differentiation and maturation. Though the transcriptional regulation of EPO has been well studied, the molecular determinants of EPO secretion remain unknown. Here, we generated a HEK293T reporter cell line that provides a quantifiable and selectable readout of intracellular EPO levels and performed a genome-scale CRISPR screen that identified SURF4 as an important mediator of EPO secretion. Targeting SURF4 with multiple independent single guide RNAs (sgRNAs) resulted in intracellular accumulation and extracellular depletion of EPO. Both of these phen
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cochliomyia hominivorax and Lucilia cuprina are major pests of livestock. Their larvae infest warm-blooded vertebrates and feed on host's tissues, resulting in severe industry losses. As they are serious pests, considerable effort has been made to develop genomic resources and functional tools aiming to improve their management and control. Here, we report a significant addition to the pool of genome manipulation tools through the establishment of efficient CRISPR/Cas9 protocols for the generation of directed and inheritable modifications in the genome of these flies. Site-directed mutations w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida albicans, an opportunistic fungal pathogen, causes severe infections in immunocompromised individuals. Limited classes and overuse of current antifungals have led to the rapid emergence of antifungal resistance. Thus, there is an urgent need to understand fungal pathogen genetics to develop new antifungal strategies. Genetic manipulation of C. albicans is encumbered by its diploid chromosomes requiring editing both alleles to elucidate gene function. Although the recent development of CRISPR-Cas systems has facilitated genome editing in C. albicans, large-scale and multiplexed function
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precise, site-specific insertion of large gene sequences holds great promise for the treatment of diverse genetic disorders. Although prime editing using paired guide RNAs (pegRNAs) can mediate targeted integration, insertion efficiency drops sharply for payloads exceeding 300 base pairs1-3. Here we present a rationally designed quadruple pegRNA strategy (QuadPE) for efficient and programmable insertion of large DNA fragments. Through screening different designs, we identified that combinations of two genome-targeting pegRNAs in a PAM-out or PAM-in orientation, when paired with two donor-targe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study explores a novel therapeutic approach for spinal bulbar muscular atrophy (SBMA), a neurodegenerative disorder caused by a mutation in the Androgen Receptor (AR) gene. The aim is to investigate the potential of CRISPR-Cas9 technology in targeting the mutant AR gene to inhibit its production. The objectives include assessing the accuracy and efficacy of CRISPR-Cas9 guided RNAs in silencing the mutant gene and evaluating the feasibility of this approach as a treatment for SBMA. Computational and in-silico approaches are used to evaluate the feasibility of using CRISPR-Cas9 technology f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования