The purpose of this study was to expand our knowledge of small RNAs, which are known to function within protein complexes to modulate the transcriptional output of the cell. Here we describe two previously unrecognized, small RNAs, termed pY RNA1-s1 and pY RNA1-s2 (processed Y RNA1-stem -1 and -2), thereby expanding the list of known small RNAs. pY RNA1-s1 and pY RNA1-s2 were discovered by RNA sequencing and found to be 20-fold more abundant in the retina than in 14 other rat tissues. Retinal expression of pY RNAs is highly conserved, including expression in the human retina, and occurs in all
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proximal spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive neuromuscular disorder caused by deletion or mutation of SMN1 (survival motor neuron 1). SMN exon 7 splicing is regulated by a number of exonic and intronic regulatory sequences and the trans-factors that bind them. Variants located in or near these regulated regions should be evaluated to determine their effect on splicing. We identified the rare variant c.863G>T (r.835_*3del, p.Gly279Glufs*5) in exon 7 of SMN1 in three patients affected with type I or type II SMA. Most of the SMN1 transcripts exhibited complete loss of exon 7 i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human nuclear and mitochondrial genomes co-exist within each cell. While the mitochondrial genome encodes for a limited number of proteins, transfer RNAs, and ribosomal RNAs, the vast majority of mitochondrial proteins are encoded in the nuclear genome. Of the multitude of mitochondrial disorders known to date, only a fifth are maternally inherited. The recent characterization of the mitochondrial proteome therefore serves as an important step toward delineating the nosology of a large spectrum of phenotypically heterogeneous diseases. Following the identification of the first nuclear gene
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Myositis is a heterogeneous family of autoimmune muscle diseases. As myositis autoantibodies recognize intracellular proteins, their role in disease pathogenesis has been unclear. This study aimed to determine whether myositis autoantibodies reach their autoantigen targets within muscle cells and disrupt the normal function of these proteins.
METHODS: Confocal immunofluorescence microscopy was used to localize antibodies and other proteins of interest in myositis muscle biopsies. Bulk RNA sequencing was used to study the transcriptomic profiles of 668 samples from patients with my
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of circular RNAs (circRNAs) in glucose metabolism in pancreatic duct adenocarcinoma (PDAC) remains elusive. Through RNA sequencing of cells cultured under conditions of glucose deprivation, we identified hsa_circ_0007590. Sanger sequencing and RNase R and Act D treatments were performed to confirm the circular RNA features of hsa_circ_0007590. RNA in situ hybridization (RNA-ISH) and quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) were used to estimate hsa_circ_0007590 expression in PDAC clinical specimens and cell lines. hsa_circ_0007590 expression was higher in PDAC patients and clo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In primary chicken embryo cells infected with fowl plague virus addition of actinomycin D at defined times during the infection cycle has different consequences on viral replication. If actinomycin D is added immediately after infection with a concentration, which inhibits viral RNA synthesis only partially, it interferes with the nucleo-cytoplasmic transport of all viral RNA species (mRNA and vRNA) so far tested. If actinomycin D is present during infection (adsorption, penetration and uncoating) no viral RNA is synthesized, and the nucleocapsid of the infecting virus does not reach the nucle
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The syncytiotrophoblast (STB) is a multinucleated cell layer that forms the outer surface of human chorionic villi. Its unusual structure, with billions of nuclei in a single cell, makes it difficult to resolve using conventional single-cell methods. To better understand STB differentiation, we performed single-nucleus and single-cell RNA sequencing on placental tissue and trophoblast organoids (TOs). Single-nucleus RNA-seq was essential for capturing STB populations, revealing three nuclear subtypes: a juvenile subtype co-expressing CTB and STB markers, one enriched in oxygen sensing genes, a
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The term "mitochondrial diseases" encompasses a heterogeneous group of disorders in which a primary mitochondrial dysfunction is suspected or proven by morphologic, genetic, or biochemical criteria. Clinically, these progressive disorders usually affect muscle, either alone (mitochondrial myopathies) or in combination with other systems, most often brain (encephalomyopathies). Mitochondria are unique among intracellular organelles in that mitochondrial proteins are encoded by two genomes, nuclear DNA (nDNA) and mitochondrial DNA (mtDNA). The vast majority of mitochondrial proteins are encoded
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA binding protein dysfunction is a pathogenic feature of multiple neurological diseases, including multiple sclerosis (MS). Neurodegeneration (the loss of, or damage to neurons and axons) is the primary driver of disease progression in MS. Herein, we utilized a novel, neuron-specific model of neurodegeneration by transducing primary mouse neurons with mutant forms of the RNA binding protein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 (hnRNP A1) identified from MS patients, including one within the M9-nuclear localization sequence of hnRNP A1 (A1(P275S)) and a second in the prion-like domain o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repeat expansion in C9orf72 causes amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal lobar degeneration. Expanded sense and antisense repeat RNA transcripts in C9orf72 are translated into five dipeptide-repeat proteins (DPRs) in an AUG-independent manner. We previously identified the heterogeneous ribonucleoprotein (hnRNP) A3 as an interactor of the sense repeat RNA that reduces its translation into DPRs. Furthermore, we found that hnRNPA3 is depleted from the nucleus and partially mislocalized to cytoplasmic poly-GA inclusions in C9orf72 patients, suggesting that poly-GA sequesters hnRNPA3 wit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) ranks among the most prevalent malignancies affecting the male population worldwide, and metastatic PCa (mPCa) carries a poor prognosis. Circular RNAs (circRNAs), a distinct class of RNAs, have been implicated in the progression of various tumors. However, their specific biological functions and underlying mechanisms in PCa, particularly in mPCa, remain largely undefined. In this study, we identified a novel circRNA derived from the back-splicing of exons 20-21 of the Dopey Family Member 2 (DOPEY2) gene. This circRNA, which we named circDOPEY2, was highly expressed in PCa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is caused by homozygous deletions/mutations of SMN1 gene. All SMA patients carry a nearly identical SMN2 gene. A nucleotide change in SMN2 results in exon 7 exclusion in the majority of SMN2 mRNA, thus producing low level of SMN protein. Extracellular pH change has been shown to modulate alternative splicing of several pre-mRNAs. In this study, we showed that extracellular pH change can also modulate SMN2 exon 7 splicing in SMA cells. Low extracellular pH enhances SMN2 exon 7 skipping, whereas high extracellular pH promotes its inclusion. Low extracellular pH also
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis caused by Japanese encephalitis virus (JEV) infection leads to the central nervous system disorder in human and swine. Viruses utilize the host protein synthesis mechanisms to efficiently translate their RNAs. Herein, we demonstrated that the host transcription factor SOX10 downregulated an RNA-binding protein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H (HNRNPH1) during JEV infection. We further showed that JEV replication was promoted when HNRNPH1 inhibited RIG-I/MDA5 signal pathway to decrease interferon (IFN) expression. Remarkably, the multifunctional enzyme NS3 of JEV
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular diseases remain the leading cause of morbidity and mortality worldwide; however, effective clinical therapies that achieve myocardial regeneration are still lacking, underscoring the urgent need for novel therapeutic strategies. In this study, we identified an RNA-binding protein Ptbp1, a key component of RNA metabolism, as a critical regulator of cardiomyocyte proliferation via the formation of biomolecular condensates. We found that Ptbp1 exhibits granule-like structures in cardiomyocyte nuclei during fetal to early postnatal stages. These Ptbp1 foci are phase-separated liquid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetic nephropathy (DN) is one of the most common microvascular complications of diabetes mellitus, without suitable therapies, ultimately leading to end-stage renal disease. Podocyte loss serves as an initial insult during DN progression, yet the endogenous protective mechanisms remain elusive. Our single-nucleus RNA sequencing data revealed a large group of differentially expressed lncRNAs in renal tissues of DN. In this study, we found that Gm13561 was a podocyte-specific lncRNA predominantly localized in the nucleus and significantly downregulated in both DN mouse renal tissues and high-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repair of double strand breaks (DSBs) by RNA-binding proteins (RBPs) is vital for ensuring genome integrity. DSB repair is accompanied by local transcriptional repression in the vicinity of transcriptionally active genes, but the mechanism by which RBPs regulate transcriptional regulation is unclear. Here, we demonstrated that RBP hnRNPA2B1 functions as a RNA polymerase-associated factor that stabilizes the transcription complex under physiological conditions. Following a DSB, hnRNPA2B1 is released from damaged chromatin, reducing the efficiency of RNAPII complex assembly, leading to local tra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral genomes are enriched with G-quadruplexes (G4s), non-canonical structures formed in DNA or RNA upon assembly of four guanine stretches into stacked quartets. Because of their critical roles, G4s are potential antiviral targets, yet their function remains largely unknown. Here, we characterize the formation and functions of a conserved G4 within the polymerase coding region of orthoflaviviruses of the Flaviviridae family. Using yellow fever virus, we determine that this G4 promotes viral replication and suppresses host stress responses via interactions with hnRNPH1, a host nuclear protein
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is a neurodegenerative disease caused by the absence of a functional copy of the Survival of Motor Neuron 1 gene (SMN1). The nearly identical paralog, SMN2, cannot compensate for the loss of SMN1 because exon 7 is aberrantly skipped from most SMN2 transcripts, a process mediated by synergistic activities of Src-associated during mitosis, 68 kDa (Sam68/KHDRBS1) and heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) A1. This results in the production of a truncated, nonfunctional protein that is rapidly degraded. Here, we present several crystal structures of Sam68 RNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor-derived extracellular vesicles (EVs) play critical roles in premetastatic niche (PMN) formation. Here, we demonstrated that EVs from highly metastatic osteosarcoma cell lines preferentially localized to lung fibroblasts and induce inflammatory PMN formation. High-throughput profiling of EVs-derived long noncoding RNAs (lncRNAs) identified lncOSLMT as a candidate enriched in EVs and markedly upregulated in patient tumors and serum, with elevated levels correlating with poor prognosis. Mechanistically, in EVs, lncOSLMT directly bound the RNA-binding protein hnRNPA2B1. Following internaliza
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetes is one of the most common and fastest-growing diseases worldwide, and diabetic atherosclerotic calcification is a frequent and fatal complication, the underlying mechanisms of which remain unclear. In this study, we investigated the mechanism by which HNRNPC regulates diabetic vascular calcification.
METHODS: We retrieved datasets GSE211722, GSE84012, and GSE74755 from the GEO database and performed probe-to-gene name conversion. Based on expression profile data and aortic transcriptomic data from diabetic and non-diabetic mice, RNA m6A methylation-related regulatory gene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования