BACKGROUND: Although microbiological bacterial culture is currently considered the gold standard for diagnosis of septic arthritis, many studies have documented substantial false-negative and false-positive rates. The objective of this study was to determine whether real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction can be used to detect bacterial messenger RNA (mRNA) in synovial fluid as a way to distinguish live and dead bacteria as an indicator of active infection.
METHODS: Synovial fluid samples were obtained from twelve consecutive patients who presented with knee pai…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVE: Ulcerative colitis (UC) is a disease of unknown aetiology in which exacerbations are sometimes linked to intestinal colonization by toxin-producing Clostridium difficile. We undertook this study to detect and quantitatively assess C. difficile in the stool of patients with UC using real time polymerase chain reaction (RT-PCR), and to compare it with healthy individuals.
METHODS: A total of 37 consecutive patients with UC (26 male, mean age 41.3 yr) and 36 healthy adult volunteers (20 male, mean age 36.4), none of whom had received antibiotics within two months prior to…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diagnosing Neisseria gonorrheae using nucleic acid amplification tests (NAATs) might increase the sensitivity, compared to cultivation. However, using NAATs has also been problematic mainly due to the close genetic relationships between different Neisseria species, resulting in false positive diagnoses. This study was conducted to clinically validate a previously published real-time polymerase chain reaction (PCR) method targeting the porA pseudogene in N. gonorrheae in comparison to culture techniques.
METHODS: In total, 360 samples, urethra (n = 109), rectum (n = 84), pharynx (n…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The outcome of microbiological diagnostics may depend on the sampling technique. It was the aim of the present study to compare two widely used sampling techniques for subgingival bacteria using quantitative real-time polymerase chain reaction.
METHODS: Twenty patients with chronic periodontitis were randomized into two groups. In group A, samples were taken first with a paper point and then with a curet at the same site (single-rooted teeth with probing depth >5 mm) before scaling and root planing and after 10 weeks. The sampling sequence was reversed in group B. The analysis ena…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: H. pylori is a well recognized pathogenic factor of chronic gastritis and class I carcinogen. Specimens are collected on gastroscopy performed due to clinical symptoms suggesting upper alimentary tract organic disease for pathomorphological examinations and for the estimation of the presence of H. pylori infection in urease test, histological examination in Giemsa staining method or in a culture. The aim of the project was to compare the detection of H. pylori in gastric mucosa in children by conventional method and polymerase chain reaction technique (PCR).
MATERIAL AND METHODS: …
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: With the advent of new antifungal agents, the identification of a causative pathogen is crucial to guide the antifungal treatment of invasive mold infection. However, tissue cultures often fail to grow a fungal pathogen in cases of suspected mold infection.
METHODS: In a prospective multicenter study, we compared the results of histopathological analysis, culture, and 2 seminested polymerase chain reaction assays identifying Aspergillus species and Zygomycetes as causative agents of invasive mold infections using respiratory tract biopsy samples obtained from 56 immunocompromised …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A direct-PCR assay was developed for the rapid detection of Taylorella equigenitalis, a Gram-negative bacterium responsible for contagious equine metritis (CEM) in Equidae. The bacteria may be detected in equine genital swabs without need for a preliminary step of DNA extraction or bacterial isolation. Specificity was determined with 125 isolates of T. equigenitalis, 24 isolates of Taylorella asinigenitalis, five commensal bacteria of the genital tract and a facultative intracellular pathogen of foals found in large concentration in soil. Our PCR is specific and amplified a 413-bp 16S ribosoma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RV Armored RNA constructed in the laboratory was shown to be resistant to RNase and DNase digestion. It could remain stable at 4 degrees C for at least 60 days, and was much more stable than RV strain TR23 [corrected] in normal human plasma. Therefore it could be used as stable, well-characterized positive control and standard for quantitative RT-PCR assay.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Previous studies using flow cytometry have shown that CD34+ cell trafficking is increased in patients with chronic idiopathic myelofibrosis. Few data exist on physiologic CD34 + cell trafficking and the quantification of very low cell ranges requires reliable and sensitive measurement techniques. The aim of this study was to establish a quantitative polymerase chain reaction (PCR) technique for studying CD34+ cell trafficking in physiologic conditions, and in patients with myeloproliferative diseases.
DESIGN AND METHODS: CD34+ cell trafficking was measured in 56 con…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 44 year-old woman was diagnosed as having chronic renal failure due to rapidly progressive glomerulonephritis (RPGN) from one year earlier … of 116 mEq/l. Both the CSF culture for Mycobacterium (M.) tuberculosis and the conventional single polymerase chain reaction (PCR) for M. tuberculosis DNA in CSF were negative results on admission. In contrast, nested PCR of preserved CSF samples obtained at admission demonstrated positive results. We diagnosed her conditions as tuberculous meningitis (TBM) and administer …
Клинический случайАннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated a two-step semi-nested polymerase chain reaction (PCR)-based approach for the specific detection of Ancylostoma duodenale DNA in human faeces. The test was used to determine to what extent this species of hookworm is present in the regions of Bolgatanga and Garu of northern Ghana. Initially, the sensitivity and specificity of the PCR were tested using a range of well-defined control samples. Subsequently, a total of 378 human faecal DNA samples from Bolgatanga and Garu were subjected to the PCR. The results were compared with those obtained using a previously established PCR for t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A polymerase chain reaction (PCR) protocol for the rapid detection of meningococcal DNA in cerebrospinal fluid (CSF) was developed and optimized. A set of primers based on Neisseria surface protein A (nspA) gene sequence was designed to amplify a 481-bp product specific for N. meningitidis. We tested 85 N. meningitidis strains obtained from patients with meningococcal meningitis and 112 CSF samples from patients with suspected meningococcal meningitis. No amplification of the nspA gene was observed from other Neisseriaceae species (except from N. gonorrhoeae) and from other bacteria frequently…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anew human leukocyte antigen (HLA) class I allele, HLA-A*0252, has been found during routine typing of samples for the Australian Bone Marrow Donor Registry. A*0252 differs from A*020101 at four codon positions, with all the new polymorphisms resulting in an amino acid change. The amino acids involved are located in the antigen-binding region of the HLA protein.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of infected and infective black flies was estimated by pool screen polymerase chain reaction (PCR) amplification in the three river basins in Ecuador endemic for onchocerciasis. Mass distribution of ivermectin (Mectizan) resulted in dramatic declines in the prevalence of infected and infective flies. In the Rio Santiago river basin, no infections were detected, suggesting that transmission had ceased. The ratio of infected to infective flies in Simulium exiguum was 10-fold lower than the corresponding ratio for Simulium quadrivittatum, suggesting that S. exiguum is a more-compet…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mouse monoclonal antibodies (mAbs) were produced against an Indian isolate of egg drop syndrome (EDS) virus and characterized. Four hybridom … F8 mAbs as capture antibody and polyclonal chicken serum against EDS virus as detection antibody. A polymerase chain reaction (PCR) was used to detect the EDS viral genome. Following experimental infection of oestrogen-treated chickens with EDS virus, cloacal swabs, oviduct, uterus and spleen were collected at different days post-infection and used in both AC-ELISA and PCR …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PCR assay has been shown to be a promising option for the diagnosis of brucellosis. However, few studies have been performed with field samples in order to evaluate the assay as a diagnostic tool. In this study, routine use of a species-specific PCR assay previously developed for the identification of Brucella cultures was assessed for the detection of Brucella DNA directly from the stomach contents of aborted sheep fetuses. The assay is based on the insertion sequence IS711 in the Brucella chromosome. In the study, during 3 successive lambing seasons (1998-1999, 1999-2000 and 2000-2001) 126 a
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A nested polymerase chain reaction (PCR) assay for the diagnosis of human visceral leishmaniasis (VL) due to Leishmania infantum infection was developed using primers selected from the parasite's genomic deoxyribonucleic acid (DNA). The assay, which is based on the use of leucocytes separated from blood samples by Ficoll-Paque centrifugation, was compared with culture in vitro. Blood samples were collected from 17 patients in Spain with a history of clinical VL, 15 of whom were also infected with human immunodeficiency virus (HIV) (13 samples during the VL episode and 31 samples during post-tr…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transfusion and apheresis science : official journal of the World Apheresis Association : official journal of the European Society for Haemapheresis2002eng
Real-time PCR methods for the detection of RHD and the C, c, and E allele of RHCE were applied for the prediction of fetal Rh phenotype using maternal plasma. In one of 36 samples investigated the DNA extraction failed. When we tested the remaining 35 samples for Rh antigens which were absent on the mother's red cells, the fetal D-status was correctly determined in 26 of 27 cases (1 false negative). Fetal C was tested correctly in 23 samples, c was true positive in the only c-negative woman and the fetal E-status was correctly determined in 35 cases. In conclusion real-time PCR of maternal pla
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection with hepatitis C virus (HCV) is a matter of great concern because of its potentially grave consequences. Instead of relying on the conventional anti-HCV antibody test to detect HCV infection after needlestick incidents, we used the polymerase chain reaction (PCR) to achieve earlier detection, to manage a patient more effectively, and to exclude possible infection more quickly. Fourteen incidents were studied in which the source patients were positive for both the anti-HCV antibody and HCV RNA, and the exposed subjects were negative for anti-HCV antibody at the time of the incidents. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.