OBJECTIVES: Several genome-wide association studies (GWAS) of bone mineral density (BMD) have successfully identified multiple susceptibility genes, yet isolated susceptibility genes are often difficult to interpret biologically. The aim of this study was to unravel the genetic background of BMD at pathway level, by integrating BMD GWAS data with genome-wide expression quantitative trait loci (eQTLs) and methylation quantitative trait loci (meQTLs) data METHOD: We employed the GWAS datasets of BMD from the Genetic Factors for Osteoporosis Consortium (GEFOS), analysing patients' BMD. The areas …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immunopathology contributes to the high mortality of tuberculous meningitis, but the biological pathways involved are mostly unk … the same centre. Genome-wide single nucleotide polymorphism typing was used to identify tryptophan quantitative trait loci, which were used for survival analysis in a third cohort of 285 patients.
FINDINGS: Concentrations of 250 (70%) of 351 metabolites detected in CSF were higher in patients with tuberculous meningitis than in controls, especially in those who died du …
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The use of molecular genetic technologies for broodstock management and selective breeding of aquaculture species is becoming increasingly more common with the continued development of genome tools and reagents. Several laboratories have produced genetic maps for rainbow trout to aid in the identification of loci affecting phenotypes of interest. These maps have resulted in the identification of many quantitative/qualitative trait loci affecting phenotypic variation in traits associated with albinism, disease resistance, temperature tolerance, sex determination, embryonic developme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Differential expression analysis of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data is central for characterizing how experimental factors affec … gulatory networks, 1.2 million peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) to map cell-type-specific quantitative trait loci (QTLs), and the 50-million-cell CELLxGENE Discover corpus to compare arbitrary cell groups. In all cases, Memento identified more significant and reproducible differences in mean expression compared with existing methods. It also identified differen …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: There are currently no US Food and Drug Administration-approved treatments for vascular dementia (VaD). Genome-wide approaches have successfully identified druggable targets and treatments for various disorders. In this study, we performed druggable genome-wide two-sample Mendelian randomization (2SMR) analysis to identify possible treatment targets for VaD.
METHODS: 2SMR analyses were used to estimate the causal effects of druggable gene expression on VaD risk. The exposure variables were significant cis-expression quantitative trait loci (eQTLs) and cis-protein quantitative trai…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
KEY POINTS: The cross-species integration of mouse kidney multi-omics and human genome-wide association study identified 46 cross-species ur … a tissues with and without stones. Colocalization analysis between urolithiasis GWAS and expression quantitative trait loci data of human renal tubules and glomeruli suggested shared signals at the GLUD1 , UMOD , SLC34A1 , TCEA3 , and H1-0 regions. Mendelian randomization analysis using the same renal expression quantitative trait loci datasets further supported these fi …
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identifying effective pharmacological interventions to prevent the progressive enlargement and rupture of aortic aneurysms (AAs) … nd multivariable MR analyses. Utilizing genetic instrumental variables, we retrieved cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) data for potential targets of metformin from the Expression Quantitative Trait Loci Genetics Consortium (eQTLGen) Consortium and Genotype-Tissue Expression (GTEx) project. Colocalization analysis was employed to ascertain the probability …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
At a time when complex diseases affect globally 280 million people and claim 14 million lives every year, there is an urgent need to rapidly … al cell carcinoma; CD, Crohn disease; COPD, chronic obstructive pulmonary disease; eQTL, expression quantitative trait loci; HCC, hepatocellular carcinoma; HNSCC, head and neck squamous cell carcinoma; GTEx, genotype-tissue expression; GWAS, genome-wide association studies; LAP, LC3-associated phagocytosis; LC3-II, phosphatidylethanolamine conjugated form of LC3; LD, lin …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), which drove the 2019 coronavirus disease (COVID-19) pandemic, continues to eng … VID-19. Significant loci associated with COVID-19 were examined within the framework of methylation quantitative trait loci (mQTL), which are located near the gene-of-orig (cis-mQTL) and expression quantitative trait loci (eQTL), which are located near the gene-of-origin (cis-eQTL), enabling analysis to assess mediators between genetic variants and COVID-19 status. Our a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
KEY POINTS: Genetic variant rs477155 near cytidine deaminase identified IgA nephropathy patients with enhanced glucocorticoid response. rs47 … t of 211 high-risk patients receiving glucocorticoid monotherapy. Functional annotation, expression quantitative trait loci mapping, regulatory analyses, and dual-luciferase reporter assays elucidated the biologic relevance of candidate loci.
RESULTS: Genome-wide analysis identified three loci with suggestive genotype-by-treatment interaction ( P < 5.00×10 -6 ), of whic …
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study identified and validated stable genetic loci associated with MSM tolerance, predicted the underlying candidate genes, and provided marker-assisted selection tools for improving wheat herbicide tolerance. Mesosulfuron-methyl (MSM) is one of the few herbicides conferring high efficacy in eliminating poaceae weeds. Improper application, however, can result in phytotoxicity and yield reduction in wheat. Cultivating herbicide-tolerant wheat varieties is therefore of significant agricultural importance, though the genetic basis of this tolerance remains poorly understood. This study perfo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The gut–eye axis (GEA) has been proposed as a framework for understanding comorbidity between gastrointestinal and ocular diseases. This study aimed to investigate their shared genetic architecture, pleiotropy, and putative biological pathways potentially influenced by environmental exposures and gut microbiota. METHODS: This study integrated large-scale genome-wide association study summary data on five gastrointestinal and eight ocular diseases to assess genetic correlations and genetic overlap. Pleiotropic variants were identified, followed by functional and tissue-specific anal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Major depressive disorder (MDD) is a prevalent psychiatric disorder, and its pathophysiology is related to immune dysregulation. The use of genetic evidence to identify molecular targets of specific immune cell types will provide new directions for the development of precision immunotherapy. We integrated single-cell cis-eQTL data for 14 immune cell subtypes from the OneK1K cohort with MDD GWAS summary statistics. We assessed the causal effect of genetically predicted immune cell-specific gene expression on depression using single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization (scTWMR), follo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Body mass index (BMI) is associated with multisystem disease risk, but the immune cell-specific regulatory contexts underlying BMI-related genetic associations with disease outcomes remain unclear.
METHODS: We applied a cell-stratified Mendelian randomization framework integrating European-ancestry BMI GWAS data, GWAS datasets for 33 disease outcomes across five disease systems, single-cell cis-eQTL data from 28 peripheral blood immune cell types, and dynamic CD4+ T cell eQTL data. SuSiE-based colocalization was used to identify BMI-associated loci sharing causal variants with immune-ce
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic fatigue is a debilitating symptom linked to mitochondrial dysfunction which lacks comprehensive genetic insights. This study aims to investigate mitochondrial-related genes associated with chronic fatigue and explores therapeutic targets. We conducted summary-data-based Mendelian randomization (SMR) and Bayesian colocalization analyses using blood eQTL data (n = 31,684) and fatigue GWAS data (n = 449,019). Mitochondrial-related genes were sourced from MitoCarta3.0. Two-sample Mendelian randomization (TSMR) analysis and gene expression detection in rat models of fatigue were employed to
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although targeted therapy significantly improves the prognosis of gastric cancer patients, the availability of cancer targeted drugs in clinical practice is still limited. In order to identify potential therapeutic targets for gastric cancer, Mendelian randomization (MR) analysis based on aggregated data was conducted. Specifically, cis eQTL data were obtained from the whole blood and gastric cohorts of GTEx Consortium V8 as exposure variables. Obtain cancer summary statistical data representing outcome variables from the FinnGen database. Using co localization analysis to evaluate whether com
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vascular dementia (VaD) is a prevalent age-related neurocognitive disorder characterized by progressive cognitive impairment and a lack of disease-modifying therapies. Although age-related brain endothelial dysfunction has been implicated as a central contributor to the pathogenesis of VaD, the molecular mechanisms underlying this process remain incompletely elucidated.
METHODS: We employed an integrative analytical framework combining Mendelian randomization (MR) and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq). MR analysis was performed using plasma protein quantitative trait loci (pQ…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cerebral palsy (CP) is a complex neurological disorder characterized by motor and postural impairments, often stemming from prenatal or perinatal brain injury. Despite extensive research, the precise genetic mechanisms underlying CP remain elusive.Here, we employed genome-wide Summary-data based MR (SMR) and Mendelian randomization (MR) analysis to investigate the potential causal role of genes within the complement system in neuronal development and plasticity (CSNDP) pathway in CP pathogenesis. Leveraging summary-level data from large-scale GWAS and quantitative trait locus (QTL) studies, we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction is linked to age-related macular degeneration (AMD), but its mechanisms and related molecular networks remain unclear. We explored the association between mitochondrial-related genes and AMD by integrating multiomic data. We acquired summary-level data on mitochondrial-related protein abundance, gene expression, and gene methylation from quantitative trait locus studies. Genetic associations with AMD were sourced from the International Age-related Macular Degeneration Genomics Consortium (discovery), FinnGen (replication), and UK Biobank (replication) studies. We used
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evidence for adaptation of human skin color to regional ultraviolet radiation suggests shared and distinct genetic variants across populations. However, skin color evolution and genetics in East Asians are understudied. We quantified skin color in 48,433 East Asians using image analysis and identified associated genetic variants and potential causal genes for skin color as well as their polygenic interplay with sun exposure. This genome-wide association study (GWAS) identified 12 known and 11 previously unreported loci and SNP-based heritability was 23-24%. Potential causal genes were determin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования