Epigenetic inheritance relies on the precise recycling of parental histones during DNA replication. The N-terminal region of Pol1, the catalytic subunit of DNA polymerase α, has previously been implicated in chaperoning parental histone recycling. In this study, we identify a single amino acid mutation in the C-terminal region of Saccharomyces cerevisiae Pol1 (pol1-F1396S) that destabilizes the protein and disrupts the transfer of parental histones to the lagging strand during DNA replication. As a primary consequence, pol1-F1396S cells exhibit decreased chromatin stability. Furthermore, we de…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein homeostasis is essential for maintaining normal cellular function. However, protein homeostasis efficiency declines with age, leading to the accumulation of aberrant protein structures associated with neurodegenerative diseases such as Parkinson's disease (PD). PD is characterized by the aggregation of alpha-synuclein (αSyn) into cytoplasmic inclusions. This process is accompanied by elevated phosphorylation at serine 129 (S129). The accumulation of αSyn into aggregates and their propagation disrupts key proteostasis pathways, including the ubiquitin-proteasome system (UPS) or autophag
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The contribution of the ribonuclease activities of the RNA exosome to transcription has remained unclear. We have investigated the role of DIS3, one of the catalytic subunits of the RNA exosome, in transcription by RNA polymerase II (RNAPII). Rapid depletion of DIS3 reduces RNA synthesis and induces RNAPII elongation defects that are exacerbated by UV irradiation, a treatment that generates transcription-blocking DNA lesions and promotes RNAPII backtracking. DIS3 itself redistributes following UV irradiation, mirroring RNAPII dynamics, which suggests that DIS3 acts in concert with the transcri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genotoxic stress is frequently accompanied by alterations in cellular redox homeostasis; however, the mechanisms linking redox regulation to the DNA damage response (DDR) remain incompletely understood. Here, we investigated the early redox response to DNA damage induced by methyl methanesulfonate (MMS) in Saccharomyces cerevisiae, focusing on cysteine oxidative post-translational modifications (PTM). We show that activation of the DNA damage response is accompanied by rapid redox changes that occur in the absence of a generalized oxidative stress response. MMS exposure promotes selective remo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Different inositol phospholipids (PIPs) distribute to distinct subcellular organelles, creating an addressing system that dictates the sites of action of PIP-binding proteins, including components of the Endosomal Sorting Complexes Required for Transport (ESCRT). The ESCRT machinery is recruited to remodel many different cellular membranes through combinatorial binding interactions made by the early-acting ESCRT-I and ESCRT-II complexes with PIPs, ubiquitin modifications, and membrane-specific adaptors. Membrane remodeling, constriction, and fission are then mediated by membrane-associated fil
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The general consensus is that the vacuolar-type H+-translocating ATPase (V-ATPase) is critical for macroautophagy/autophagy. However, there is a fundamental conundrum because follicular lymphoma-associated mutations in the V-ATPase result in lysosomal/vacuolar deacidification but elevated autophagy activity under nutrient-replete conditions and the underlying mechanisms remain unclear. Here, working in yeast, we show that V-ATPase dysfunction activates a selective autophagy flux termed "V-ATPase-dependent autophagy ". By combining transcriptomic and proteomic profiling, along with genome-wide
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing prevalence of dermatophyte resistance to terbinafine, a key drug in the treatment of dermatophytosis, represents a significant obstacle to treatment. Trichophyton rubrum is the most commonly isolated fungus in dermatophytosis. In T. rubrum, we identified TERG_07844, a gene encoding a previously uncharacterized putative protein kinase, as an ortholog of budding yeast Saccharomyces cerevisiae polyamine transport kinase 2 (Ptk2), and found that T. rubrum Ptk2 (TrPtk2) is involved in terbinafine tolerance. In both T. rubrum and S. cerevisiae, Ptk2 knockout strains were more sensitiv…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The autosomal-recessive diphthamide deficiency syndrome presents as intellectual disability with developmental abnormalities, seizures, craniofacial and additional morphological phenotypes. It is caused by reduced activity of proteins that synthesize diphthamide on human translation elongation factor 2. Diphthamide synthesis requires seven proteins (DPH1-DPH7), with clinical deficiency described for DPH1, DPH2 and DPH5. A limited set of variant alleles from syndromic patients has been functionally analyzed, but databases (gnomAD) list additional so far uncharacterized variants in human DPH1 an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Upon DNA damage, cells activate the DNA damage response (DDR) to coordinate proliferation and DNA repair. Dietary, metabolic, and environmental inputs are emerging as modulators of how DNA surveillance and repair take place. Lipids hold potential to convey these cues, although little is known about how. We observed that lipid droplet (LD) number specifically increased in response to DNA breaks. Using Saccharomyces cerevisiae and cultured human cells, we show that the selective storage of sterols into these LD concomitantly stabilizes phosphatidylinositol-4-phosphate (PI(4)P) at the Golgi, wher…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
tRNA methyltransferase 9 (Trm9)-catalysed tRNA modifications have been shown to translationally enhance the DNA damage response (DDR). Here, we show that Saccharomyces cerevisiae trm9Δ, distinct DNA repair and spindle assembly checkpoint (SAC) mutants are differentially sensitive to the aminoglycosides tobramycin, gentamicin and amikacin, indicating DDR and SAC activation might rely on translation fidelity, under aminoglycoside stress. Further, we report that the DNA damage induced by aminoglycosides in the base excision repair mutants ogg1Δ and apn1Δ is mediated by reactive oxygen species, wh…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipid droplets (LDs) are essential for cellular lipid homeostasis by storing diverse neutral lipids (NLs), such as triacylglycerol (TAG), steryl esters (SE), and retinyl esters (RE). A proper assembly of TAG-containing LDs at the ER requires Seipin, a conserved protein often mutated in lipodystrophies. Here, we show that the yeast Seipin Sei1 and its partner Ldb16 also promote the storage of other NL in LDs. Importantly, this role of Sei1/Ldb16 is evolutionarily conserved as expression of human-Seipin restored normal SE-containing LDs in yeast Seipin mutants. As in the case of TAG, the formati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natamycin is a polyene macrolide, widely employed to treat fungal keratitis and other yeast infections as well as to protect food products against fungal molds. In contrast to other polyene macrolides, such as nystatin or amphotericin B, natamycin does not form pores in yeast membranes, and its mode of action is not well understood. Here, we have employed a variety of spectroscopic methods, computational modeling, and membrane reconstitution to study the molecular interactions of natamycin underlying its antifungal activity. We find that natamycin forms aggregates in an aqueous solution with s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently developed quantitative redox proteomic studies enable the direct identification of redox-sensing cysteine residues that regulate the functional behavior of target proteins in response to changing levels of reactive oxygen species. At the molecular level, redox regulation can directly modify the active sites of enzymes, although a growing number of examples indicate the importance of an additional underlying mechanism that involves conditionally disordered proteins. These proteins alter their functional behavior by undergoing a disorder-to-order transition in response to changing redox
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Saccharomyces cerevisiae chaperone gene SSB2 belongs to the Hsp70 family. Unlike other HSP70 genes, SSB2 gene expression is reduced after heat shock. It has been reported that Ssb2p can be cross-linked to ribosome-bound nascent polypeptide chains, suggesting a potential role of SSB2 in the endoplasmic reticulum (ER) stress response. In this study, SSB2-deletion and SSB2-overexpression yeast strains were generated and applied to explore the potential mechanism by which SSB2 is involved in the tunicamycin (TM)-induced ER stress response. We demonstrate for the first time that SSB2 deficiency…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide excision repair (NER) excises a variety of environmentally derived DNA lesions. However, NER efficiencies for structurally different DNA lesions can vary by orders of magnitude; yet the origin of this variance is poorly understood. Our goal is to develop computational strategies that predict and identify the most hazardous, repair-resistant lesions from the plethora of such adducts. In the present work, we are focusing on lesion recognition by the xeroderma pigmentosum C protein complex (XPC), the first and required step for the subsequent assembly of factors needed to produce succe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mitochondrial ADP/ATP carrier is a nuclear encoded protein, which catalyzes the exchange of ATP generated in mitochondria with ADP produced in the cytosol. In humans, mutations in the major ADP/ATP carrier gene, ANT1, are involved in several degenerative mitochondrial pathologies, leading to instability of mitochondrial DNA. Recessive mutations have been associated with mitochondrial myopathy and cardiomyopathy whereas dominant mutations have been associated with autosomal dominant Progressive External Ophtalmoplegia (adPEO). Recently, two de novo dominant mutations, R80H and R235G, leadin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myo-inositol, the precursor of all inositol compounds, is essential for the viability of eukaryotes. Identifying the factors that regulate inositol homeostasis is of obvious importance to understanding cell function and the pathologies underlying neurological and metabolic resulting from perturbation of inositol metabolism. The current study identifies Mck1, a GSK3 homolog, as a novel positive regulator of inositol de novo synthesis in yeast. Mck1 was required for normal activity of myo-inositol phosphate synthase (MIPS), which catalyzes the rate-limiting step of inositol synthesis. mck1Δ cell
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DDHD domain-containing proteins, which belong to the intracellular phospholipase A1 (iPLA1) family, have been predicted to be involved in phospholipid metabolism, lipid trafficking, membrane turnover, and signaling. Defective cardiolipin (CL), phosphatidylethanolamine, and phosphatidylglycerol remodeling cause Barth syndrome and mitochondrial dysfunction. Here, we report that Yor022c is a Ddl1 (DDHD domain-containing lipase 1) that hydrolyzes CL, phosphatidylethanolamine, and phosphatidylglycerol. Ddl1 has been implicated in the remodeling of mitochondrial phospholipids and CL degradation.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To maintain proper cellular homeostasis, the magnitude of autophagy activity has to be finely tuned in response to environmental changes. Many aspects of autophagy regulation have been extensively studied: pathways integrating signals through the master regulators TORC1 and PKA lead to multiple post-translational modifications affecting the functions, protein-protein interactions, and localization of Atg proteins. The expression of several ATG genes increases sharply upon autophagy induction conditions, and defects in ATG gene expression are associated with various diseases, pointing to the im
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of macrolactam analogues of the naturally occurring resorcylic acid lactone radicicol have been synthesised from methyl orsellinate in 7 steps, involving chlorination, protection of the two phenolic groups, and hydrolysis to the benzoic acid. Formation of the dianion and quenching with a Weinreb amide results in acylation of the toluene methyl group that is followed by amide formation and ring closing metathesis to form the macrocyclic lactam. Final deprotection of the phenolic groups gives the desired macrolactams whose binding to the N-terminal domain of yeast Hsp90 was studied by i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования