The main protease (Mpro) of SARS-CoV-2 plays an essential role in the virus life cycle and is considered a key target for therapeutic development. This study explores the inhibition mechanism of SARS-CoV-2 Mpro by ebselen, an organoselenium drug that shows potent inhibitory activity. By using a combination of multiple computational methods including molecular docking, molecular dynamics simulations, and density functional theory calculations, the complete covalent inhibition process of ebselen is simulated for the first time. Two possible pathways with different bound conformations of ebselen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present work aims to comprehensively analyze the diffusion of plant metabolites from the polyethylene glycol (PEG) hydrogels for controlled release applications. For this study, a mathematical model based on free volume theory has been utilized to simulate the diffusion of low molecular weight plant metabolites. The results demonstrate that the mesh size of the crosslinked network, thereby the diffusion coefficient of the natural compound can be computed using the current framework. The proposed model has also been validated using the experimental data. The diffusion period has been observ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We develop a machine-learning method for coarse-graining condensed-phase molecular systems using anisotropic particles. The method extends currently available high-dimensional neural network potentials by addressing molecular anisotropy. We demonstrate the flexibility of the method by parametrizing single-site coarse-grained models of a rigid small molecule (benzene) and a semi-flexible organic semiconductor (sexithiophene), attaining structural accuracy close to the all-atom models for both molecules at a considerably lower computational expense. The machine-learning method of constructing th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS) is a rare imprinting disorder and overgrowth syndrome with a prevalence of 1 in 10,000 live births. It is characterized by predilection for embryonal tumor growth, especially Wilms tumor (WT), and manifestations like lateralized overgrowth/hemihypertrophy, macroglossia, macrosomia, anterior abdominal wall defects, and hyperinsulinism. Our case is a 1 year of female child who presented with abdominal swelling and limb length discrepancies. A clinical diagnosis of BWS was made based on multifocal WT and hepatomegaly and nephromegaly detected on contrast-enhanced
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The photophysical properties of two classes of porphyrins and metalloporphyrins linked to N-heterocyclic carbene (NHC) Au(I) complexes have been investigated by means of density functional theory and its time-dependent extension for their potential application in photodynamic therapy. For this purpose, the absorption spectra, the singlet-triplet energy gaps, and the spin-orbit coupling (SOC) constants have been determined. The obtained results show that all the studied compounds possess the appropriate properties to generate cytotoxic singlet molecular oxygen, and consequently, they can be emp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase enzyme (P. falciparum DHFR) is one of the vital drug targets for malaria treatment, as this protein is indispensable for nucleotide metabolic pathways. This research aimed to discover promising phthalide derivatives against both wild and mutant P. falciparum DHFR enzymes through various computational techniques. The binding affinities were investigated using molecular docking, which showed five compounds having the highest affinity scores against both enzymes compared to the reference compounds. MM-GBSA calculations displayed favourable free bindin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gaining a fundamental insight into the biomolecular recognition of posttranslationally modified histones by epigenetic reader proteins is of crucial importance to understanding the regulation of the activity of human genes. Here, we seek to establish whether trimethylthialysine, a simple trimethyllysine analogue generated through cysteine alkylation, is a good trimethyllysine mimic for studies on molecular recognition by reader proteins. Histone peptides bearing trimethylthialysine and trimethyllysine were examined for binding with five human reader proteins employing a combination of thermody
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protective action of caffeic (CA) and syringic (SA) acids on the genotoxicity exercised by snake venoms was investigated in this study. Molecular interactions between phenolic acids and the enzyme succinate dehydrogenase were also explored. In the electrophoresis assay, SA did not inhibit the genotoxicity induced by the venom. However, CA partially inhibited DNA degradation. In the comet assay, SA and CA exerted an inhibitory effect on the venom-induced fragmentation. Succinate dehydrogenase presented, in computational analyzes, favorable energies to the molecular bond to both the malonic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Research involving snake venom has gradually surpassed the simple discovery of new molecules using purification and structural characterization processes, and extended to the identification of their molecular targets and the evaluation of their therapeutic potential. Nevertheless, this only became possible due to constant progress in experimental biology and protein purification approaches.
OBJECTIVE: This review aims to discuss the main components of snake venoms that have been investigated for biotechnological purposes, and to discover how these promising biomolecules were obtai
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gas-phase metal ion-ligand complexes offer model environments to study molecular interactions that are key to many catalytic processes. Here, we present a combined experimental and computational study of M+(N2O)n [M = Cu, Ag, Au; n = 2-7] complexes. The spectra provide clear evidence for both nitrogen- and oxygen-bound ligands giving rise to a wide range of structural isomers for each complex studied. The evolution of the complex structures observed as well as spectral trends for each metal center are interpreted in terms of a molecular orbital binding picture and resulting calculated ligand b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic pancreatitis increases the risk of developing pancreatic cancer. This often presents as a mass lesion in the head of pancreas. Mass lesion in the head of pancreas can also occur secondary to an inflammatory lesion. Recognising this is crucial to avoid unnecessary surgery. This is sometimes difficult as there is an overlap in clinical presentation and conventional computed tomography (CT) abdomen findings in inflammatory and malignant mass. Advances in imaging technologies like endoscopic ultrasound in conjunction with techniques like fine needle aspiration, contrast enhancement and ela
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An all-atom force field was set up for a new class of ionic liquids (ILs), tetrabutylphosphonium amino acid, on the basis of the AMBER force field with determining parameters related to the phosphorus atom and modifying several parameters. Ab initio quantum chemical calculations were employed to obtain molecular geometries, infrared frequencies, and torsion energy profiles. Atom partial charges were obtained by using the one-conformation, two-step restraint electrostatic potential approach. Molecular dynamics simulation was carried out in the isothermal-isobaric ensemble for 14 tetrabutylphosp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the genealogical, clinical and molecular genetic findings of a new family with autosomal dominant early-onset Alzheimer's disease (FAD) discovered in Torino (Italy). Up to now, the pedigree comprises 1500 members, distributed in 8 generations. 22 patients affected with Alzheimer's disease have been identified. The clinical course of the disease was fairly uniform in all the patients. An high incidence of myoclonic jerks and epileptic seizures was found. Molecular genetic studies showed the presence of positive but nonsignificant lod scores between chromosome 21 anonymous DNA markers
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The N-methyl-D-aspartate receptor (NMDAR) plays a critical role in regulating excitatory glutamatergic neurotransmission and synaptic plasticity. However, excessive NMDAR activation can lead to increased calcium ion influx, resulting in excitotoxicity- a key contributor to neurodegenerative diseases. Although current NMDAR inhibitors exist, their clinical use is limited due to adverse effects.
METHODS: This study employed computational screening of Bacillus-derived macrolactins to identify potential NMDAR antagonists. Molecular docking simulations were performed using AMDock v1.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonlinear optical properties of molecular materials are governed by aggregation and cooperative effects in the condensed phase, requiring first-principles simulations on large molecular assemblies to achieve a realistic description of experiment. While modern electronic-structure theory implementations mitigate key computational challenges through low-memory two-electron integral engines and multifrequency response solvers, practical calculations of third-order nonlinear optical response in extended systems remain prohibitively expensive. The dominant bottleneck arises because conventional app
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A green and sustainable synthetic protocol was developed for the preparation of a previously unreported series of 2-amino-7-hydroxy-4-aryl-4H-chromene-3-carbonitrile derivatives (PPA1-PPA5) using vitamin B1 (thiamine hydrochloride) as an inexpensive and environmentally benign organocatalyst under mild aqueous ethanol conditions. The synthesized derivatives were comprehensively characterized by FTIR, 1H/13C NMR, HRMS, and elemental analyses, and subsequently evaluated for their in vitro antiplasmodial activity against the chloroquine-sensitive Plasmodium falciparum 3D7 strain together with thei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Pancreatic cancer is among the malignancies with the poorest prognosis, largely due to its aggressive nature and resistance to conventional therapies. Case Summary: This report describes the case of a 69-year-old male patient with stage IV primary lung adenocarcinoma presenting with high levels of programmed death-ligand 1 (PD-L1). Simultaneously, abdominal computed tomography (CT) showed a dilated pancreatic duct at the level of the pancreatic head and a hypodense lesion in the uncinate process involving the superior mesenteric artery. Fine-needle aspiration (FNA) of the pancreati
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The current monkeypox (MPX) outbreak, caused by the monkeypox virus (MPXV), has turned into a global concern, with over 59,000 infection cases and 23 deaths worldwide.
OBJECTIVES: Herein, we aimed to exploit robust immunoinformatics approach, targeting membrane-bound, enveloped, and extracellular proteins of MPXV to formulate a chimeric antigen. Such a strategy could similarly be applied for identifying immunodominant epitopes and designing multi-epitope vaccine ensembles in other pathogens responsible for chronic pathologies that are difficult to intervene against.
METHODS: A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The decreasing efficacy of traditional antibiotics due to increasing antimicrobial resistance represents an urgent challenge. This study presents a comprehensive in silico study of the antibacterial potential of novel fluoroisoxazolidine derivatives, complementing Chakraborty in vitro results to assess their antimicrobial efficacy. Using computational modeling, including density functional theory (DFT), ADMET analysis, and molecular docking simulations, we explore their electronic properties, biological interactions, and pharmacokinetic profiles. In particular, we provide their optimized molec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Unlimited growth of cancer cells requires an extensive nutrient supply. To meet this demand, cancer cells drastically upregulate glucose uptake and metabolism compared to normal cells. This difference has made the blocking of glycolysis a fascinating strategy to treat this malignant disease. α-enolase is not only one of the most upregulated glycolytic enzymes in cancer cells, but also associates with many cellular processes or conditions important to cancer cell survival, such as cell migration, invasion, and hypoxia. Targeting α-enolase could simultaneously disturb cancer cells in multiple wa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования