Chronic periodontitis (CP) is a multifactorial inflammatory disease. Growing evidence links dysregulated serum metabolites to CP pathogenesis, yet their causal roles in disease progression remain poorly defined. We performed bidirectional Mendelian randomization (MR) analysis to evaluate causal relationships between 486 serum metabolites and CP. Inverse-variance weighted, MR-Egger, and weighted median methods were employed to mitigate research bias. Sensitivity was evaluated via the Cochran Q test, MR-Egger, and leave-one-out analysis. Metabolic pathway analysis (based on metabolomics data) wa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis is a life-threatening syndrome characterized by a dysregulated host response to infection and profound metabolic alterations that contribute to immune dysfunction and organ failure. This Review synthesizes proteomic evidence on sepsis-associated alterations in proteins involved in metabolic pathways across circulating biofluids, immune cells, and organs. Across plasma and urine, proteomic studies identify disturbances in lipoprotein-associated pathways, redox homeostasis, mitochondrial function, and substrate metabolism, indicating that protein signatures of metabolic dysregulation are
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autoimmune encephalitis (AIE) is a rare, severe inflammatory brain disease, with its pathogenesis not yet fully elucidated. This study aimed to characterize proteomic and metabolomic alterations in the cerebrospinal fluid (CSF) of AIE patients and identify potential therapeutic targets.
METHODS: 65 consecutive AIE patients and age-matched concurrent controls were enrolled, respectively. Clinical characteristics, including blood and CSF laboratory findings, were compared between the two groups, and CSF samples were collected for multi-omics analysis. Differentially expressed protei
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oral microbiome comprises analysis of microbes within the oral cavity. Omics, molecular, and bioinformatic methods have significant functions in examining the diversity, composition, and function of the oral microbiome. Molecular techniques, especially 16S and 18S rRNA sequencing, have transformed the study of the oral microbiome. Analysis by 16S rRNA gene sequences of the oral sample creates a broad portrait of the species composition of the oral microbiome and both existing and new species of bacteria. It is instrumental in detecting bacterial pathogens at specific levels, specifically t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis is a serious public health concern, with transmission facilitated by a small number of freshwater snail intermediate host species. Infection outcomes vary greatly across the primary vector genera, Biomphalaria (for Schistosoma mansoni), Bulinus (for S. haematobium), and Oncomelania (for S. japonicum), even within species, ranging from full resistance to high compatibility. Omics methods have altered this field by correlating host genotype, baseline immunological status, and time-resolved responses to whether invading miracidia are eliminated or develop sporocysts. Evidence from
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB) remains a leading infectious killer, with growing evidence that the human microbiome-particularly in the gut and lungs-sha … al mechanisms. This narrative review synthesizes recent evidence, emphasizing the need to integrate multiomics approaches-metagenomics, metatranscriptomics, and metabolomics-and experimental validation to uncover causal links between microbiome alterations and TB pathogenesis or therapy response. We discuss potential clinical applications, including microbio …
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate survival prediction remains a central challenge in precision oncology, particularly for female patients whose sex-specific molecular characteristics are often under-modeled in prior studies. Although multi-omics integration enables a deeper exploration of prognostic biomarkers, existing methods rely on mathematically driven fusion strategies, which tend to dilute omics-specific signals and fail to capture biological regulatory hierarchies across omics layers. To address these limitations, we propose BOMIFA (Biologically informed Omics representation and Multi-omics Integration Framewo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer remains one of the most lethal and prevalent malignancies, yet the cellular composition and developmental trajectory of its tumor populations are not fully understood. In this study, we performed single-cell multiome sequencing on paired tumor and adjacent tissue samples from gastric cancer patients. By integrating single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and single-cell Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (scATAC-seq) data, we identified three primary epithelial components in gastric cancer: normal cells, metaplastic cells and cancer cells. Our analysis re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leiocassis longirostris (L. longirostris) is a significant freshwater fish species in China. Due to the decline in natural populations, its market demand is now largely met through artificial breeding. However, the complex and prolonged ovarian maturation process has rendered current artificial breeding methods limited. Additionally, the molecular mechanisms underlying ovarian development in L. longirostris remain poorly understood. In this study, we conducted RNA and protein sequencing of L. longirostris ovarian samples across five developmental stages, categorized based on histological stain
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sojae Semen Praeparatum (SSP) has a fermentation history exceeding a millennium. The inclusion of Artemisia annua and Mori Folium in the fermentation process has progressively transformed SSP into both a functional food and a medicinal product. However, the underlying mechanisms driving this transformation remain insufficiently understood. This study applied metabolomics and high-throughput technologies to systematically compare SSP fermented with (Mori Folium - Artemisia annua Fermented Soybeans, MAFS) and without (Water - Fermented Soybeans, WFS) Artemisia annua and Mori Folium. After 22 day
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut microbiota remodeling is a critical component of the domestication syndrome. However, the structural and functional consequences of domestication on gut microbiomes in ducks remain poorly understood. Understanding how domestication and associated ecological transitions influence gut microbial communities can shed light on host adaptation mechanisms. We performed integrated metagenomic and metabolomic analyses of the ileal and cecal microbiota from Mallards and Shaoxing ducks-two ecotypes of Anas platyrhynchos representing wild and domesticated lineages-to investigate microbial community st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Weaning represents a critical period during which mammals adapt to solid food and develop their immune systems. The intestine, as the primary digestive and immune organ, is central to successful weaning. Bats are the only flying mammals and undergo ontogenetic shifts in flight and diet in response to substantial energy and immune demands. However, the transcriptomic and metabolomic changes in bat intestines during the weaning transition remain unexplored. RESULTS: In this study, 24 small intestinal tissue samples were collected from Vespertilio sinensis across four developmental st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bone disorders affect more than half of the adult population worldwide who may have a poor quality of life and physical independence worldwide. Multi-omic techniques are increasingly adopted and applied to determine the molecular mechanisms of bone tissue repair, providing perspective towards personalized medical intervention. Data from genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, glycomics, and lipidomics were combined to elucidate dynamic processes in bone repair. In this narrative review, the key role of genetic and epigenetic factors in regulating injured cellular responses is highl
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rodent ischemia-reperfusion injury (IRI) and liver transplantation (LT) models play crucial roles in mimicking graft injury and immune rejection, developing therapeutic approaches, and evaluating the efficacy of treatments. The application of integrated multi-omics data and advanced omics techniques like single-cell RNA sequencing in rodent models has expanded researchers' perspectives on pathophysiological processes in LT settings. This review summarizes key molecules and pathways associated with reperfusion injury and prognosis in LT models, highlighting the potential of omics data in unders
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic autoimmune disease marked by joint inflammation and destruction. Current treatments often have side effects and resistance. Cucurbitacin E (CuE), a natural compound with anti-inflammatory properties, shows therapeutic potential but its role in RA is unclear. This study explores CuE's mechanisms in RA, focusing on M1 macrophage polarization.
METHODS: We used a multi-omics approach, integrating transcriptomics, single-cell sequencing, and network pharmacology. Key steps included immune infiltration analysis, WGCNA, machine learning-based biomar
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) arises in the colorectal tissue driven by genetic disorder or the accumulation of somatic mutations, leading to abnormal epithelial cell growth. In this study, we employed single-nucleus multi-omics analysis, including single-nucleus RNA-seq and single-nucleus ATAC-seq, on over 100,000 high-quality nuclei to investigate the molecular landscape of both primary tissue and patient-derived organoids (PDOs). Our analysis showed that normal PDOs (N-PDOs) derived from tissue adjacent to tumors replicate the cellular composition and differentiation trajectory of colorectal cryp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eggs represent an accessible and nutrient-dense source of high-quality animal protein, and decades of selective breeding have markedly elevated reproductive output in commercial laying hens. However, sustaining elevated productivity while improving eggshell integrity presents a critical challenge, as the molecular mechanisms of eggshell strength remain unclear. In this study, phenotypic assessment of eggshell strength was combined with single-cell transcriptomic profiling of the uterus from high- and low-strength groups, transcriptomic analysis of multiple tissues, and quantitative proteomic a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psoriasis is a chronic skin disease affected by genetic and autoimmunity. The traditional Chinese medicine, Compound Qingdai Capsule (CQC), has shown potential benefits in treating psoriasis in clinical settings. Despite its efficacy, the molecular mechanisms underpinning its therapeutic action remain unclear.
PURPOSE: This study aimed to unravel the molecular mechanism of Compound Qingdai Capsule for psoriasis based on the psoriasis pathogenic pathway network, integrating multi-omics analysis, systems pharmacology, machine learning modeling, and animal experimentation.
METHODS:
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tritrichomonas foetus is an anaerobic flagellated protozoan that infects multiple animal hosts, primarily cattle and cats, with occasional isolation from pigs. It causes bovine trichomonosis, a venereal disease associated with infertility, abortion, and economic losses in cattle herd. In cats, T. foetus infects the gastrointestinal tract, causing chronic diarrhea which can be difficult to treat. Despite its broad impact, the pathogen is difficult to control because it evades immune responses and persists in host tissues. Recent advances in omics technologies, including genomics, transcriptomic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования