Malaria, leishmaniasis, Chagas disease, and human African trypanosomiasis continue to cause considerable suffering and death in developing countries. Current treatment options for these parasitic protozoal diseases generally have severe side effects, may be ineffective or unavailable, and resistance is emerging. There is a constant need to discover new chemotherapeutic agents for these parasitic infections, and natural products continue to serve as a potential source. This review presents molecular docking studies of potential phytochemicals that target key protein targets in Leishmania spp.,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV type 1 (HIV-1) is characterized by its rapid genetic evolution, leading to challenges in anti-HIV therapy. However, the sequence variations in HIV-1 proteins are not randomly distributed due to a combination of functional constraints and genetic drift. In this study, we examined patterns of sequence variability for evidence of linked sequence changes (termed as coevolution or covariation) in 15 HIV-1 proteins. It shows that the percentage of charged residues in the coevolving residues is significantly higher than that in all the HIV-1 proteins. Most of the coevolving residues are spatially
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To improve energy efficiency and inhibit urease, this study developed an infrared physical field (IPF) method. This study integrates experimental approaches and computational simulations to elucidate the mechanism of urease inactivation under IPF treatment. The optimal treatment (130 °C-9 min) reduced the enzyme activity by 97.55% within the experimental range (90-130 °C, 1-9 min). Experimentally, circular dichroism showed a 25.36% increase in random coil content, and hydrophobicity assays showed a 1.23-fold increase in surface hydrophobicity. Molecular dynamics simulations predicted disruptio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein and peptide aggregation has become a prominent focus in biomedical research due to its critical role in the development of neurodegenerative diseases (NDs) and its relevance to industrial applications. Neurodegenerative disorders such as Alzheimer's disease (AD), Parkinson's disease (PD), Huntington's disease (HD), and Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) are closely associated with abnormal aggregation processes, highlighting the need for a deeper understanding of their molecular mechanisms. In recent years, a wide range of computational methods, bioinformatics tools, and curated datab
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
19F NMR parameters are versatile probes for studying metal-fluoride complexes. Quantum chemical calculations of 19F NMR chemical shifts enhance the accuracy and validity of the resonance signal assignments in complex spectra. However, the treatment of solvation effects in these calculations remains challenging. In this study, we establish a successful computational protocol using ab initio molecular dynamics simulations for the accurate prediction of 19F NMR chemical shifts in square-planar nickel-fluoride complexes. In particular, we have studied in detail the trans-[NiF(2,3,4,5-C6F4I)(PEt3)2
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a composite framework for calculating the rates of non-radiative deactivation processes, namely internal conversion (IC) and intersystem crossing (ISC), on an equal footing by explicitly computing the non-adiabatic coupling (NAC) and spin-orbit coupling (SOC) constants, respectively. The stationary-state approach uses a time-dependent generating function based on Fermi's golden rule. We validate the applicability of the framework by computing the rate of IC for azulene, obtaining comparable rates to experimental and previous theoretical results. Next, we investigate the photophysics
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmaniasis is a complex disease caused by over 20 Leishmania species that primarily affects populations with poor socioeconomic conditions. Currently available drugs for treating leishmaniasis include amphotericin B, paromomycin, and pentavalent antimonials, which have been associated with several limitations, such as low efficacy, the development of drug resistance, and high toxicity. Natural products are an interesting source of new drug candidates. The Asteraceae family includes more than 23 000 species worldwide. Secondary metabolites that can be found in species from this family have b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HYPOTHESIS: The anisotropic nature of colloidal particles results in orientation-dependent interactions that organize the particles into peculiar structures different from those formed by isotropic colloids. Particles with a hydrophilic hemisphere are expected to assemble in hydrophobic solvents due to the contribution of hydrophobic interactions as observed for molecular amphiphiles.
EXPERIMENTS: Asymmetrically decorated silica-based Janus particles are dispersed in an apolar solvent, chloroform, and their structure and dynamics are studied by light scattering and compared with computer simu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The computational modeling of molecules under high pressure is a growing research area that augments experimental high-pressure chemistry. Here, a new electronic structure method for modeling atoms and molecules under pressure, Gaussians On Surface Tesserae Simulate HYdrostatic Pressure (GOSTSHYP) approach, is introduced. In this method, a set of Gaussian potentials is distributed evenly on the van der Waals surface of the investigated chemical system, leading to a compression of the electron density and the atomic scaffold. Since no parameters other than pressure need to be specified, GOSTSHY
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cocaine abuse represents a significant health issue worldwide. Besides cardiovascular complications, psychiatric and neurologic symptoms are the most common manifestations of cocaine toxicity. In cocaine abusers brain abnormalities have been shown with computed tomography (CT), magnetic resonance imaging (MRI), positron emission tomography (PET), or single photon emission computed tomography (SPECT). The spectrum of neuropathologic alterations seen in cocaine abusers is broad. The major findings consist of vascular complications such as stroke, subarachnoid and intracerebral hemorrhages and ce
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Poisson-Boltzmann (PB) equation is widely used for modeling electrostatic effects and solvation for macromolecules. The generalized Born (GB) model has been developed to mimic PB results at substantial lower computational cost. Here, we report an analytical GB method that reproduces PB results with high accuracy. The analytical approach builds on previous work of Gallicchio and Levy (J. Comput. Chem. 2004, 25, 479), and incorporates an improvement, proposed by Grycuk (J. Chem. Phys. 2003, 119, 4817), of the Coulomb-field approximation used in most GB methods. Tested against PB results, our
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Imaging methods that visualize the structure and function of the living body are widely used in patient care and biomedical research, but their full potential has not yet been applied to the study and treatment of the severe illnesses caused by pathogens of biodefense concern. "Conventional" imaging techniques (e.g., radiography, computed tomography, ultrasound, or magnetic resonance imaging) delineate anatomic changes in tissues, whereas "molecular" methods employ magnetic resonance, positron emission tomography, single-photon emission computed tomography, or optical (fluorescence or biolumin
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A key process in the development of atherosclerotic plaques is the recruitment of monocytes into the artery wall. Using spectral photon-counting computed tomography we examine whether monocyte deposition within the artery wall of ApoE-/- mouse can be detected. Primary mouse monocytes were labelled by incubating them with 15 nm gold nanoparticles coated with 11-mercaptoundecanoic acid The monocyte uptake of the particle was confirmed by electron microscopy of the cells before injection into 6-week-old apolipoprotein E deficient (ApoE-/-) mouse that had been fed with the Western diet for 10 week
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ClC-3 chloride channels play essential roles in cervical cancer progression by regulating lysosomal acidification, cell volume homeostasis, and chemoresistance. However, no highly selective small-molecule modulators of ClC-3 have been reported to date. Motivated by the urgent clinical need to reverse ClC-3-mediated chemoresistance and the challenge of processing massive chemical libraries under limited computational hardware resources, we propose a novel AI-driven Drug Discovery (AIDD) pipeline. Here, we present an integrated virtual drug discovery framework that transitions from traditional C
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background Resistance to targeted cancer therapies, such as osimertinib in EGFR-mutant lung cancer, remains a major obstacle to effective treatment. Predicting synergistic drug combinations offers a promising strategy to overcome such resistance; however, the nonlinear and heterogeneous nature of molecular interactions makes this prediction highly challenging. This study introduces the Multimodal Molecular Drug Graph Neural Network (MMDGNN), a unified framework designed to enhance drug synergy prediction through advanced molecular representation learning. Methods MMDGNN integrates molecular fi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the preliminary role of γ-oryzanol (γ-O) against breast cancer through computational and in vitro analyses. Reference protein set (RPS) and functional enrichment set (FES) proteins were identified and subjected to network pharmacology. Pharmacogenomics analysis assessed expression profiles and survival associations. Molecular docking of γ-O with PIK3CA, AKT1, AKR1C3, ESR1, and MAPK1 was performed, followed by molecular dynamics (MD) simulation of the γ-O-PIK3CA complex. Brine shrimp lethality assay (BSLA) evaluated the effect of γ-O on nauplii survival and percentage le
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Exchange proteins directly activated by cyclic AMP (Epac) represent a promising therapeutic target for developing novel cardiotropic agents. Epac-dependent signaling regulates intracellular calcium dynamics, intercellular coupling, and the contractile function of cardiomyocytes. Preclinical studies have demonstrated the potential of Epac2 inhibitors for the treatment of cardiovascular diseases (CVDs).
METHODS: New potential Epac protein inhibitors from the series of arylsulfonylaminopyridines were designed using pharmacophore modeling, molecular docking, ADMET analysis, and mole
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding molecular recognition, crystal packing and biological processes including protein-ligand binding, protein folding, and macromolecular structure all depend on accurate modeling of noncovalent interactions. In this study, we introduce and evaluate two complementary models─empirical and physically grounded ─for computing exchange-repulsion, and dispersion energies. Once combined, these two terms form van der Waals (vdW) potentials allowing the computation of total vdW interaction energies. A set of 21 atom-type-specific vdW parameters of a buffered 7-14 potential was derived via a l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Juvenile Myelomonocytic Leukemia (JMML) is an aggressive pediatric hematological cancer categorized by aberrant activation of the RAS/MAPK pathway. It is commonly caused by gain-of-function mutations, such as E76K in the PTPN11 protein. While 5-azacitidine (5-Aza) and the MEK inhibitor PD0325901 (PD-901) are not known direct inhibitors of SHP2/PTPN11, the reported activity of 5-Aza combined with MEK inhibition in PTPN11-mutated JMML offered a biological rationale for examining their potential structural interactions with SHP2.
METHODS: This study used a computational approach th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Cysteinyl leukotrienes are components of slow-reacting substances of anaphylactic shock (SRS-A) and play a key role in asthma and inflammatory responses. Although chromone-2-carboxylic acids and substituted (aryloxy)alkanoic acids have the potential to be SRS-A antagonists, their comprehensive structure-activity relationships and pharmacokinetic characteristics remain understudied. Objective: This study integrated computational and experimental approaches, including QSAR modeling, molecular docking, ADMET analysis, molecular dynamics (MD) simulations, and antioxidant evaluation to
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования