INTRODUCTION: The COVID-19 pandemic disrupted the circulation patterns of respiratory viruses. In tropical regions like Thailand, ongoing surveillance is essential to understand the etiology of severe acute respiratory infections (SARIs) in the post-pandemic era. We investigated the etiology of SARI among hospitalized adults in the post-pandemic era.
METHODS: We conducted a retrospective analysis of respiratory samples collected from adult patients (≥18 years) who were hospitalized at a regional hospital in Chiang Mai, Thailand, between November 2023 and April 2024 due to symptoms of SARI (fe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Fluorescence microscopy and fungal culture are the primary diagnostic methods for superficial fungal infections, but they are limited by low sensitivity and long turnaround time, respectively. We determined the optimal cycle threshold (Ct) cutoff for a novel multiplex PCR assay (iFIND) using receiver operating characteristic analysis and evaluated whether a "microscopy + iFIND" combined strategy improves diagnostic performance. This prospective study enrolled 113 patients with suspected superficial mycoses. Specimens underwent fluorescence microscopy, fungal culture, and automated
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The traditional reliance on slow culture-based diagnostics often leads to delays in targeted therapy and the overuse of broad-spectrum antibiotics, aggravating the problem of antimicrobial resistance.
AIM: To compare the BioFire, FilmArray Pneumonia Panel plus (FA-PneumobioMérieux) assay with a conventional diagnostic tools, including culture and VITEK 2 (bioMérieux), to identify microorganisms in critically ill patients (severe pulmonary infection) to get the best results within a short period.
METHODS: An observational, comparative cross-sectional, hospital-based investigation
СтатьяНаблюдательное исследованиеСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The analysis of the T-cell receptor (TCR) is becoming an increasingly important tool in the study of the tumor microenvironment. Global features of the repertoire, including clonality and diversity, can give important insights into the immunological processes which drive cancer progression or regression, especially in the context of immune checkpoint inhibitors. Specific TCR sequences are increasingly being used as part of the computational or experimental antigen discovery pipeline. However, the clinical samples available from tumors frequently contain poor-quality nucleic acids, making the a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hemoglobin Bart's hydrops fetalis is the most severe form of α-thalassemia, caused by homozygous α0-thalassemia, which is highly prevalent in Southeast Asian countries. Simple and rapid identification of α0-thalassemia carrier and prenatal diagnosis of Hemoglobin Bart's hydrops is essential in the region. We have developed a multiplex RPA assay for simple detection of α0-thalassemia (SEA and THAI deletions) and tested it in carrier detection (n = 125) and prenatal diagnosis of Hb Bart's hydrops fetalis syndrome (n = 30). The sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative pre
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Distinguishing between Mycobacterium tuberculosis (MTB) and nontuberculous mycobacteria infections remains clinically challenging due to their drastically different treatment regimens, underscoring the critical need for rapid and accurate mycobacterial identification to guide effective patient management. This study aimed to develop a multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay for the detection and typing of major pathogenic mycobacteria - including MTB, Mycobacterium avium complex (MAC), Mycobacteroides chelonae - Mycobacteroides abscessus group (MCAG), and Mycobacterium kansasii - and t…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is the second most common fatal genetic disease in infancy. It is caused by deletion or intragenic pathogenic variants of the causative gene SMN1, which degenerates anterior horn motor neurons and leads to progressive myasthenia and muscle atrophy. Early treatment improves motor function and prognosis in patients with SMA, but drugs are expensive and do not cure the disease. Therefore, carrier screening seems to be the most effective way to prevent SMA birth defects. In this study, we genetically analyzed 1400 samples using multiplex ligation-dependent probe ampli
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Giardia duodenalis is a common cause of diarrheal illness in regions with limited resources. The demand for rapid and cost-effective detection and genotyping methods in large-scale epidemiological studies and clinical diagnostics is imperative. Hence, we developed a multiplex PCR-RFLP technique targeting the tpi gene of G. duodenalis. The assay successfully screened G. duodenalis positive clinical samples (6.33 %; 36/565). It was also able to categorize the isolates into assemblages A (41.66 %; 13/36) and B (58.33 %; 23/36), as well as into subassemblages: AI (13.8 %; 5/36), AII (27.77 %; 10/3
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid emergence of SARS-CoV-2 variants with high severity and transmutability adds further urgency for rapid and multiplex molecular testing to identify the variants. A nucleotide matrix-assisted laser-desorption-ionization time-of-flight mass spectrophotometry (MALDI-TOF MS)-based assay was developed (called point mutation array, PMA) to identify four major SARS-CoV-2 variants of concern (VOCs) including Alpha, Beta, Delta, and Omicron (namely PMA-ABDO) and differentiate Omicron subvariant (namely PMA-Omicron). PMA-ABDO and PMA-Omicron consist of 24 and 28 mutation sites of the spike gene
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) causes a wide range of hospital and community-acquired infections worldwide. MRSA is associated with worse clinical outcomes that can lead to multiple organ failure, septic shock, and death, making timely diagnosis of MRSA infections very crucial. In the present work, we develop a method that enables the positive enrichment of bacteria from spiked whole blood using protein coated magnetic beads, followed by their lysis, and detection by a real-time multiplex PCR directly. The assay targeted bacterial 16S rRNA, S. aureus (spa) and methicillin r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The sequence similarity between CYP21A2 gene and its inactive pseudogene CYP21A1P, and copy number variation (CNV) caused by unequal crossover, make it challenging to characterize the CYP21A2 gene through traditional methods. This study aimed to evaluate the clinical utility of the long-read sequencing (LRS) method in carrier screening and genetic diagnosis of congenital adrenal hyperplasia (CAH) by comparing the efficiency of the LRS method with the conventional multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) plus Sanger sequencing approaches in CYP21A2 analysis.
METHODS:
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. Group B Streptococcus (GBS) remains the leading cause of bacterial neonatal infections worldwide, despite the spread of recommendations on vaginal screening and antibiotic prophylaxis.Hypothesis/Gap Statement. There is a need to evaluate the potential changes in GBS epidemiology over time following the introduction of such guidelines.Aim. Our aim was to perform a descriptive analysis of the epidemiological characteristics of GBS by conducting a long-term surveillance of strains isolated between 2000 and 2018, using molecular typing methods.Methodology. A total of 121 invasive str
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spinal Muscular Dystrophy (SMA) is one of the leading causes of death in infants and young children from heritable diseases. Although no large-scale popultion-based studies have been done in Saudi Arabia, it is reported that the incidence of SMA is higher in the Saudi population partly because of the high degree of consanguineous marriages.
METHODS: The final analysis included 4198 normal volunteers aged between 18 and 25 years old, 54.7% males, and 45.3% females. Whole blood was spotted directly from finger pricks onto IsoCode StixTM and genomic DNA was isolated using one triangl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The GenMark Dx ePlex Respiratory Pathogen Panel (RP) is a multiplexed nucleic acid test for the qualitative detection of common viral and a few bacterial causes of respiratory tract infections. The ePlex RP has received FDA clearance for nasopharyngeal swab (NPS) specimens collected in viral transport media. In this study, we evaluated the performance of the ePlex RP panel in comparison to the NxTAG Respiratory Pathogen Panel (NxTAG-RPP) from Luminex in use in our laboratory, not only for NPS but also for bronchoalveolar lavage specimens (BAL). We also evaluated the impact of implementing the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The objective of this study was to evaluate the virulence of P. aeruginosa ventilator-associated pneumonia (VAP) strains (cases) in terms of biofilm production and other phenotypic and genotypic virulence factors compared to P. aeruginosa strains isolated from other infections (controls).
METHODS: Biofilm production was tested to assess biomass production and metabolic activity using crystal violet binding assay and XTT assay, respectively. Pigment production (pyocyanin and pyoverdine) was evaluated using cetrimide agar. Virulence genes were detected by conventional multiplex PCR
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To compare multiplex nucleic acid amplification tests (NAATs) that detect and differentiate herpes simplex virus (HSV) and varicella-zoster virus (VZV) with traditional virologic assays.
METHODS: The HSV ELVIS Test System (Quidel, San Diego, CA) and/or Light Diagnostics VZV direct fluorescent antibody (DFA) kit (Millipore Sigma, Billerica, MA), as well as an ARIES HSV 1&2/VZV assay (Luminex, Austin, TX) and the Solana HSV1 + 2/VZV Assay (Quidel), were performed on non-cerebrospinal fluid specimens.
RESULTS: The sensitivities/specificities for the ELVIS, Aries, and Solana assays f
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine babesiosis is caused by tick-transmitted intraerythrocytic protozoan parasites occurring worldwide. In southern Africa, babesiosis is caused by Babesia rossi and B. vogeli and is one of the most common and important infectious diseases affecting dogs. There is no reliable, rapid and sensitive method for the detection of these parasites, especially when parasitaemia is low. The aim of this study was to develop a sensitive and specific multiplex TaqMan® MGB PCR assay for the diagnosis of canine babesiosis infections occurring in southern Africa, and to discriminate between Babesia rossi a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paramushir virus belongs to Sakhalin virus genogroup within Orthonairovirus genus and is one of the poorly studied viruses with unknown pathogenicity. At the moment, only one nearly complete sequence of Paramushir virus genome, isolated in 1972, is available. Two new strains of PARV were isolated in 2015 from a sample collected at the Tyuleniy Island in the Okhotsk Sea and sequenced using a combination of high throughput sequencing and specific multiplex PCR. Both strains are closely related to the early sequenced PARV strain LEIV-1149 K. The signs of intersegment reassortment and probable rec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anomalous pulmonary venous connection (APVC) is an uncommon congenital anomaly in which pulmonary venous blood flows directly into the right side of the heart or into the systemic veins. To identify whether there is any association between 22q11 CNVs and APVC, we analyzed the clinical data of 86 APVC patients and then studied the CNVs of 22q11 in 86 sporadic APVC patients by multiplex ligation-dependent probe amplification. The results showed that two patients carried the CNVs of 22q11, one patient had the deletion of 22q11 and the other had the duplication of 22q11. The incidence was signific
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования