UNLABELLED: During assembly, double-stranded DNA viruses, including bacteriophages and herpesviruses, utilize a powerful molecular motor to package their genomic DNA into a preformed viral capsid. An integral component of the packaging motor in the Bacillus subtilis bacteriophage ϕ29 is a viral genome-encoded pentameric ring of RNA (prohead RNA [pRNA]). pRNA is a 174-base transcript comprised of two domains, domains I and II. Early studies initially isolated a 120-base form (domain I only) that retains high biological activity in vitro; hence, no function could be assigned to domain II. Here w
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytomegalovirus (CMV) infection is extremely common in patients with advanced human immunodeficiency virus infection, in whom it can produce a variety of clinical syndromes. Ganciclovir is a guanosine analogue that selectively inhibits CMV DNA polymerase when intracellularly phosphorylated to its active form. In patients with CMV retinitis, induction therapy with ganciclovir results in high rates of clinical and virologic response; maintenance therapy is required to forestall progression of disease. Clinically relevant resistance of CMV to ganciclovir has recently been reported. Decreased phos
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The linear virion form of Epstein-Barr virus (EBV) DNA has variable numbers of direct tandem 500 bp repeats at each terminus. The terminal restriction endonuclease fragments and the fused terminal fragments in the intracellular episomal form are heterogeneous in size, and vary by increments of 500 bp. The structure of the termini of EBV in carcinomas of the nasopharynx and the parotid gland was compared with the EBV termini in monoclonal and polyclonal tissues or cell lines. A single band representing the EBV joined termini was detected in each of the carcinomas and in the monoclonal lymphoid
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A highly sensitive method for the quantification of methylated DNA was developed by integrating gold nanoparticles (AuNPs) labeling with inductively coupled plasma mass spectrometry (ICP-MS), coupled with the cascade amplification of exponential isothermal amplification (EXPAR) and deoxyribozyme (DNAzyme). In this design, the target methylated DNA binds to a specific single-stranded DNA (ssDNA), forming a complex that is recognized and cleaved by the modification-dependent endonuclease FspEI. This cleavage releases a distinct X sequence, which then serves as a primer to initiate th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Based on the previous research, we found that the magnetic nanocomposite Fe3O4/rGO (reduced graphene oxide) has a good drug loading effect. Therefore, in this paper, we studied the positive role of Fe3O4/rGO as a drug carrier in the interaction between resveratrol (RES) and calf-thymus DNA (ct-DNA). The fluorescence experiment is used to evaluate by the Stern-Volmer equation, the quenching constant of RES - ct-DNA system with and without Fe3O4/rGO decreases with the increasing temperature. It was found the quenching mode of RES - ct-DNA and Fe3O4/rGO - RES - ct-DNA systems were all static quen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In radiotherapy, X-ray or heavy ion beams target tumors to cause damage to their cell DNA. This damage is mainly induced by secondary low energy electrons. In this paper, we report the DNA molecular breaks at the atomic level as a function of electron energy and types of electron interactions using of Monte Carlo simulation. The number of DNA single and double strand breaks are compared to those from experimental results based on electron energies. In recent years, DNA atomistic models were introduced but still the simulations consider energy deposition in volumes of DNA or water equivalent ma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial DNA (mtDNA) maintenance is essential for cellular homeostasis, and defects in mtDNA replication are linked to a broad spectrum of mitochondrial diseases. During replication, DNA polymerase γ (Polγ) must traverse duplex junctions and stable secondary structures, yet how the human enzyme overcomes these barriers remains incompletely understood. Here, cryo-electron microscopy structures of Polγ bound to forked DNA, G-quadruplex (G4)-containing DNA and DNA bound to mitochondrial single-stranded DNA-binding protein (mtSSB) reveal a common template-entry path along the catcher domain a
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
G-quadruplex DNA in recognized as a potential target for anti-cancer drugs. In this work, an anthraquinonecarboxamido derivative of β-cyclodextrin (AQCC) is synthesized as a novel DNA binder that further can deliver an additional molecule at the target, carrying it in the cavity of modified cyclodextrin. The binding of AQCC with ethidium bromide (EtBr), berberine (Ber), duplex calf-thymus DNA (CT-DNA), quadruplexes (G4) viz., kit22, myc22, and telo24 are studied. The compound acts as a host molecule for the encapsulation of DNA binders viz., EtBr, Ber and enhances their fluorescence due to the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The six Saccharomyces cerevisiae SLX genes were identified in a screen for factors required for the viability of cells lacking Sgs1, a member of the RecQ helicase family involved in processing stalled replisomes and in the maintenance of genome stability. The six SLX gene products form three distinct heterodimeric complexes, and all three have catalytic activity. Slx3-Slx2 (also known as Mus81-Mms4) and Slx1-Slx4 are both heterodimeric endonucleases with a marked specificity for branched replication fork-like DNA species, whereas Slx5-Slx8 is a SUMO (small ubiquitin-related modifier)-targeted
LectureПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In cancer immunotherapy, the immune system is stimulated to specifically recognize and eliminate malignant cells while minimizing harm to normal cells. One widely investigated potential immunotherapeutic agent is CpG oligonucleotides (CpG ODNs), short single-stranded DNA molecules with the ability to stimulate both innate and adaptive immune responses by binding to Toll-like receptor 9 (TLR9) within endosomal membranes. However, their short half-life in systemic circulation presents a significant challenge to achieving therapeutic efficacy. Herein, we designed and developed an acidic pH-respon
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The reaction of the HS•/S•- radical (pKa ~3.4), generated selectively from H2S by γ-irradiated N2-flushed aqueous solutions at pH 5, with purine nucleosides (dG or dA), a 10-mer double-stranded oligodeoxynucleotide (ds-ODNs), and calf thymus (ct) DNA was investigated, under various experimental conditions. Concurrent quantification of the four purine 5',8-cyclo-2'-deoxynucleosides (cPu) and two 8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxypurines (8-oxo-Pu) by LC-MS/MS analysis using isotopomeric internal standards was achieved. The formation of 8-oxo-Pu is several tens of times larger than cPu. Mechanistic sche
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA hydroxymethylation (5hmC) is known to be altered in human prostate cancer. An animal model is required to study the functional roles of the ten eleven translocation (TET) DNA dioxygenases and the 5hmC modification in prostate cancer development and progression.
METHODS: We characterized Tet expression, global genomic 5hmC, and genome-wide 5hmC patterns, and the transcriptome, in the TRansgenic Adenocarcinoma of Mouse Prostate (TRAMP) autochthonous model of prostate cancer.
RESULTS: We observed increased mRNA and protein levels of Tet1 in TRAMP samples, as compared to normal m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While generally referred to as "non-integrating" vectors, adenovirus vectors have the potential to integrate into host DNA via random, illegitimate (nonhomologous) recombination. The present study provides a quantitative assessment of the potential integration frequency of adenovirus 5 (Ad5)-based vectors following intravenous injection in mice, a common route of administration in gene therapy applications particularly for transgene expression in liver. We examined the uptake level and persistence in liver of first generation (FG) and helper-dependent (HD) Ad5 vectors containing the mouse lept
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Although breast cancer (BC) patients benefit from radiotherapy (RT), some radiosensitive (RS) patients suffer from side effects caused by ionizing radiation in healthy tissues. It is thought that RS is underlaid by a deficiency in the repair of DNA double-strand breaks (DSB). DNA repair proteins such as p53-binding protein 1 (53BP1) and phosphorylated histone H2AX (γH2AX), form DNA repair foci at the DSB locations and thus serve as DSB biomarkers. Peripheral blood lymphocytes (PBL) are commonly believed to be an appropriate cell system for RS assessment using DNA repair foci. The amou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Following exposure to radiation and chemotherapeutic agents, the epidermal growth factor receptor (EGFR) can modulate the repair of DNA double-strand breaks (DSB) by forming protein complexes that include the catalytic subunit of DNA-dependent protein kinase (DNA-PKcs). This is one of the key mechanism by which tumors become resistant to DNA-damaging therapies. Our previous studies have shown that insulin-like growth factor binding protein-3 (IGFBP-3) is a substrate for DNA-PKcs, and can transactivate EGFR. We therefore questioned whether IGFBP-3 might interact with the EGFR-DNA-PK complex tha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extrachromosomal circular DNAs (eccDNAs) are produced from all regions of the eucaryotic genome. We used inverse PCR of non-B microsatellites capable of forming hairpin, triplex, quadruplex and AT-rich structures integrated at a common ectopic chromosomal site to show that these non-B DNAs generate highly mutagenized eccDNAs by replication-dependent mechanisms. Mutagenesis occurs within the non-B DNAs and extends several kilobases bidirectionally into flanking and nonallelic DNA. Each non-B DNA exhibits a different pattern of mutagenesis, while sister clones containing the same non-B DNA also
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acid amplification, the bedrock of biotechnology and molecular diagnostics, surges in applications-especially isothermal approaches-heightening the demand for advanced and precisely engineered methods. Here, a novel approach for amplifying DNA with multiarm priming and looping optimization of nucleic acid (AMPLON) is presented. AMPLON relies on a novel polymeric material with unique set of multiarm polyethylene glycol-DNA primers for efficient DNA amplification under isothermal conditions. Each arm carries single-stranded DNA complementing the sense or antisense sequence of the target
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The airway epithelium forms the interface between the inhaled environment and the lung. The airway epithelium is dysfunctional in asthma and epigenetic mechanisms are considered a contributory factor. We hypothesised that the DNA methylation profiles of cultured primary airway epithelial cells (AECs) would differ between cells isolated from individuals with asthma (n = 17) versus those without asthma (n = 16). AECs were isolated from patients by two different isolation techniques; pronase digestion (9 non-asthmatic, 8 asthmatic) and bronchial brushings (7 non-asthmatic and 9 asthmatic). DNA me
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the amount of single-stranded DNA breaks in circulating leukocytes of primary open-angle glaucoma (POAG) patients.
METHODS: A comparative quantification of DNA breaks was performed in circulating leukocytes of POAG patients and healthy controls. The following groups of subjects were compared: (1) POAG patients having primary vascular dysregulation (PVD), (2) POAG patients without PVD, (3) healthy controls with PVD, and (4) healthy controls without PVD. The damage to DNA resulting in single-stranded breaks was assessed by means of the alkaline comet assay in which the d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A flow fluorometric analysis (using a commercial flow cytometer) of individual cationic lipoid-DNA complexes is presented. Such single lipoplex studies have the advantage of providing detailed characterization of heterogeneous ensembles of lipoplex preparations that cannot be obtained with methods that provide only population averages. Specifically, the composition (amount of lipoid and the lipoid-DNA ratio) was determined for statistically large ensembles (10 (3)-10 (4) particles) under a variety of conditions, including DNA:lipoid mixing ratio, lipoid dispersion method (extruded, vortexed),
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования