BACKGROUND: Decidualization of ectopic endometrium often leads to the extensive proliferation of local tissue and is easily misdiagnosed as malignant tumors. The study is aimed at constructing a microRNA- (miRNA-) mRNA network underlying decidualized endometriotic cyst stromal cells (ECSCs).
METHODS: All data were collected from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Firstly, the differentially expressed genes (DEGs, adj. P-Val < 0.05, | log FC | ≥1) and miRNAs (DEMs, P-Val < 0.05, ∣log FC | ≥1) were analyzed by the limma package. Secondly, we predicted the target genes (TGs) of these DE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Assessment of the clinical significance of unclassified variants (UVs) identified in BRCA1 and BRCA2 is very important for genetic counselling. The analysis of co-segregation of the variant with the disease in families is a powerful tool for the classification of these variants. Statistical methods have been described in literature but these methods are not always easy to apply in a diagnostic setting.
METHODS: We have developed an easy to use method which calculates the likelihood ratio (LR) of an UV being deleterious, with penetrance as a function of age of onset, thereby avoidi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uveal melanoma (UM) is the most common primary intraocular malignancy in adults. Up to 50% of primary UM cases will develop distant metastasis, but no effective therapies are currently available. The present study aimed to characterize the expression profile of the long noncoding RNAs (lncRNAs) and screen the potential metastasis-associated lncRNAs in UM. A genome-wide analysis of the transcriptome was performed on 11 primary UM tissues (6 metastasized and 5 nonmetastasized) through RNA sequencing. A total of 40,878 lncRNAs were detected in UM, 4,983 of which were novel candidates. We identifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 1 (NME1) is a metastasis suppressor gene, exhibiting reduced expression in metastatic cancers and the ability to suppress metastatic activity of cancer cells. We previously identified NME1-regulated genes with prognostic value in human melanoma. This study was conducted in melanoma cell lines aiming to elucidate the mechanism through which NME regulates one of these genes, aldolase C (ALDOC).
MATERIALS AND METHODS: ALDOC mRNA and protein expression was measured using qRT-PCR and immunoblot analyses. Promoter-luciferase constructs and chro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An increasing number of studies have indicated the crucial involvement of long non-coding RNAs (lncRNAs) in the onset and progression of malignancies. However, a complete understanding of the molecular mechanism underlying the effect of abnormally expressed lncRNAs on breast cancer (BC) remains elusive. This study aimed to elucidate the influence of the lncRNA small nucleolar RNA host gene 1 (SNHG1) on BC progression and its underlying mechanism. Our findings revealed a conspicuous up-regulation of SNHG1 in both BC tissues and cells. The downregulation of SNHG1 was observed to inhibit BC cell
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ERV3 (HERV-R) is a complete human endogenous retrovirus located on the long arm of chromosome 7. Long terminal repeat-envelope (env) gene spliced mRNAs of 9 and 3.5 kb are widely expressed in human tissues and cells, but gag-pol mRNAs have not been found. Furthermore, the env gp70 gene contains an open reading frame throughout its length. The highest expression of ERV3 mRNA detected so far is in placenta and the lowest in choriocarcinoma cell lines. We have previously shown that the human monoblastic cell line U-937 and some normal and neoplastic tissues also express high levels of ERV3 env me
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic cancer (PC) is one of the most lethal malignancies worldwide, characterized by late diagnosis, aggressive progression, and limited responsiveness to current therapeutic strategies. Although extensive genomic analyses have identified key driver protein-coding genes (PCGs), therapeutic approaches targeting individual genes have shown limited clinical benefit. This limitation highlights the molecular complexity of PC, where tumor progression is governed by regulatory networks that extend beyond genetic alterations. Non-coding RNAs (ncRNAs), which constitute nearly 98% of the human geno
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fat mass and obesity-associated protein (FTO), the first identified N6-methyladenosine (m6A) RNA demethylase, has become both a leading candidate target in oncology and one of its most contested, behaving as an oncogene in some malignancies and as a tumor suppressor in others. Multiple inhibitor classes, FB23 derivatives, proteolysis-targeting chimera (PROTAC) degraders, repurposed entacapone, and tumor-targeted nanomedicines, have entered preclinical development, yet the clinical proposition remains unresolved because no framework currently predicts directionality or matches strategy to p
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nucleoporin 188 (NUP188) is a vital component of the nuclear pore complex that regulates cancer progression, but its role in diagnosis, prognosis, and immunoregulation in pan-cancer remains unclear.
METHODS: A comprehensive exploration of the value of NUP188 was performed using different platforms and software, including TCGA, HPA, UALCAN, TISIDB, cBioPortal, STRING, GSCALite, cancerSEA databases, and R software. The expression of NUP188 in gastric cancer (GC) was detected by immunohistochemistry. The association between NUP188 and clinicopathologic features was explored, and the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor suppressor gene NKX3.1 and the LPL gene are located in close proximity on chromosome 8, and their deletion has been reported in multiple studies. However, the significance of LPL loss may be misinterpreted due to its co-deletion with NKX3.1, a well-established event in prostate carcinogenesis. This study investigates whether LPL deletion represents a biologically relevant event or occurs merely as a bystander to NKX3.1 loss. We analyzed 28 formalin-fixed paraffin-embedded prostate cancer samples with confirmed LPL deletion and 28 without. Immunohistochemical staining was performed, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The embryonic transcription factor TBXT (brachyury) drives chordoma, a spinal neoplasm without effective drug therapies. TBXT's regulatory network is poorly understood, and strategies to disrupt its activity for therapeutic purposes are lacking. We developed designed ankyrin repeat proteins that block TBXT-DNA binding (T-DARPins). In chordoma cells, T-DARPins reduced cell cycle progression, spheroid formation, and tumor growth in mice and induced signs of senescence and differentiation. Transcriptomic and proteomic analyses identified gene networks involved in cell cycle regulation, embryonic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial dysregulation contributes to the chemoresistance of multiple cancer types. Yet, the functions of mitochondrial dysregulation in Ovarian serous cystadenocarcinoma (OSC) remain largely unknown.
AIM: We sought to investigate the function of mitochondrial dysregulation in OSC from the bioinformatics perspective. We aimed to establish a model for prognosis prediction and chemosensitivity evaluation of the OSC patients by targeting mitochondrial dysregulation.
METHODS: Differentially expressed genes (DEGs) were screened from the Cancer Genome Atlas (TCGA)-OV dataset and t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cystic echinococcosis (CE) is a common chronic zoonotic parasitic disease infected with the Echinococcus granulosus. This study aimed to construct the competitive endogenous RNA (ceRNA) network and investigate the mechanism of mice in echinococcosis sensitization.
METHODS: The animal model of echinococcosis was established in mice, and the RNA sequencing was then performed using cysts. The differentially expressed RNAs (DERNAs: DEmRNAs, DEmiRNAs, and DElncRNAs) were screened between anaphylactic mice or non-anaphylactic mice and controls, respectively. The interactions of two DERN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Overexpression of HECT-type E3 ubiquitin ligase SMURF1 is correlated with poor prognosis in patients with various cancers, such as glioblastoma, colon cancer, and clear cell renal cell carcinoma. SMURF1 acts as a tumor promoter by ubiquitination modification and/or degradation of tumor-suppressing proteins. Combined treatment of Smurf1 knockdown with rapamycin showed collaborative antitumor effects in mice. This review described the role of HECT, WW, and C2 domains in regulating SMURF1 substrate selection. We summarized up to date SMURF1 substrates regulating different type cell signaling, thu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genitourinary cancers (GCs) include a large group of different types of tumors localizing to the kidney, bladder, prostate, testis, and penis. Despite highly divergent molecular patterns, most GCs share commonly disturbed signaling pathways that involve the activity of TGF-β (transforming growth factor beta). TGF-β is a pleiotropic cytokine that regulates key cancer-related molecular and cellular processes, including proliferation, migration, invasion, apoptosis, and chemoresistance. The understanding of the mechanisms of TGF-β actions in cancer is hindered by the "TGF-β paradox" in which earl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxia regulated genes (HRGs) formed a complex molecular interaction network (MINW), contributing to many aspects of glioblastoma (GBM) tumor biology. However, little is known about the intrinsic structures of the HRGs-MINW, mainly due to a lack of analysis tools to decipher MINWs. By introducing general hyper-geometric distribution, we obtained a statistically reliable gene set of HRGs (SR-HRGs) from several datasets. Next, MINWs were reconstructed from several independent GBM expression datasets. Algebraic topological analysis was performed to quantitatively analyze the amount of equivalenc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging short-term bioassays for chemically-induced carcinogenesis are dependent for their relevance to human risk assessment on the degree of coincidence of human and rodent tumor pathways. Since these pathways do not always converge, these new tests may have a number of unanticipated pitfalls. Models of liver and renal tumors are described. The results from Rb and p53 tumor suppressor gene transgenic animals are compared to human tumor syndromes. The question of mutagenic and epigenetic fingerprints of chemicals versus the cell-specific selection of spontaneous mutations is debated. Example
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer stem cells (CSCs) drive recurrence and drug resistance in hepatocellular carcinoma (HCC), but their origin remains controversial: are they tumour-initiating cells or late-stage dedifferentiation products? Direct human single-cell evidence linking bipotent progenitors (BPs) and CSCs has been lacking.
METHODS: We integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from 109 samples (44 patients; 410,608 cells) across five public cohorts and generated EpCAM-enriched scRNA-seq from two additional HCC patients. Single-cell somatic mutations were inferred from the transcriptomi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) is the most frequently diagnosed malignancy in women and remains a leading cause of cancer-related mortality worldwide. Among the oncogenic microRNAs, hsa-miR-21 has been consistently implicated in tumorigenesis, yet a comprehensive network-level understanding of its regulatory landscape in BC is lacking. In this study, we performed an integrative bioinformatics analysis to characterize the molecular pathways and prognostic impact of hsa-miR-21. Experimentally validated mRNA targets were retrieved from miRTarBase and used to construct a high-confidence protein-protein intera
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.