This case of encephalomyelitis in a previously healthy 21-year-old man who developed opsoclonus-myoclonus demonstrates the diagnostic utility of clinically validated metagenomic next-generation sequencing (mNGS), followed by appropriate confirmation, in complex cases of encephalitis. In this patient, an extensive diagnostic workup was negative for infectious, inflammatory, demyelinating, autoimmune, and paraneoplastic etiologies. However, clinically validated mNGS of the CSF identified human pegivirus (HPgV) as a potential causative agent. A 5-day course of IV immunoglobulins (IVIg) led to the
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To report a case of Corynebacterium striatum meningitis and conduct a comprehensive literature review to determine the clinical presentation, microbiology, and treatment approaches for these patients.
MATERIALS AND METHODS: A 75-year-old male patient presented with headache and fever; however, bacterial cultures of cerebrospinal fluid (CSF) yielded negative results. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) of CSF subsequently identified Corynebacterium striatum meningitis as the causative agent for meningitis. A systematic search was performed across various databases encompas
СтатьяКлинический случайОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The diagnosis of psittacosis is still challenging due to the high risk of underdiagnosis and misdiagnosis. Here, we reported our diagnostic experience with psittacosis in combination with central nervous system (CNS) infection and acute cerebral infarction (CI).
CASE REPORT: A 62-year-old gentleman presented to our department due to episodic vertigo for 4 hours. Pulmonary CT scan revealed high-density shadows in the right upper lobe, and brain MRI initially excluded new CI lesions. Seven days later, the patient began to show fever, with the highest temperature of 39.3°C. Pulmona
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Micronodular thymic carcinoma with lymphoid hyperplasia (MNC) is an extremely rare tumor. Fewer than 30 histologically proven examples of MNC have been described in the English literature. A 64-year-old man with a history of colon cancer presented with an anterior mediastinal mass on follow-up examination. Surgical excision was performed. Macroscopically, the mass (3.0 × 2.7 cm) was relatively well-demarcated and surrounded by fat. The cut surface was tan yellow and solid. Microscopically, it showed multiple small tumor islands composed of frankly malignant epithelial cells with pleomorphism a
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epidemiological investigations of the foodborne parasitic illness cyclosporiasis can be aided by molecular techniques that enable the identification of genetically related clusters of Cyclospora isolates. At the Centers for Disease Control and Prevention (CDC), routine Cyclospora genotyping for the purpose of informing epidemiological outbreak investigations has occurred since 2018 using clinical stool specimens from case patients diagnosed with cyclosporiasis. This approach involves targeted amplicon deep sequencing of eight genotyping markers, followed by bioinformatic processing through a c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the clinical application value of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in pathogen detection of bloodstream infection secondary to hematologic diseases in children.
METHODS: 42 children with bloodstream infections secondary to hematologic diseases admitted to the Children's Hematology and Tumor Center of the Affiliated Hospital of Guangdong Medical University from November 2021 to May 2023 were included in the study, and their clinical data, results of peripheral blood mNGS and traditional blood culture, pathogen distribution characteristics, and diagnostic effi
СтатьяНаблюдательное исследованиеАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cryptococcus neoformansis widely distributed in nature and primarily causes infections in various parts of the body through inhalation into the lungs. While C.neoformans infection predominantly occurs in immunocompromised individuals, there has been a significant increase in reports among immunocompetent hosts in recent years. Although the lungs and central nervous system constitute the most common sites of infection, cryptococcal osteomyelitis remains exceptionally rare and is typically associated with disseminated disease in immunodeficient patients. Herein, we present a rare cas
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Erythrocytes have an average lifespan of 120 days, after which they are typically removed by macrophages in the reticuloendothelial system. Hemolytic anemia can shorten erythrocyte lifespan, leading to varying clinical presentations depending on whether hemolysis occurs intravascularly or extravascularly. Among intrinsic causes of hemolysis, pyrimidine 5'-nucleotidase (P5N) deficiency is a notable condition, often presenting as nonspherocytic hemolytic anemia.
METHODS: We report a case of a 65-year-old female patient with systemic lupus erythematosus and a history of splenectomy,
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Members of the genus Trichinella are muscle-dwelling zoonotic parasites of global importance for public health, animal husbandry, and trade. Trichinella chanchalensis (T13) is the newest species in the genus, first described in the Yukon and the Northwest Territories, for which the geographical distribution remains unknown due to limitations of the gold standard test for genotyping (multiplex polymerase chain reaction [PCR]). Our primary objective was to determine whether T. chanchalensis was present in Alaska, using a new molecular method that enables the description of the preval
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus anthracis, the causative agent of anthrax, is a highly virulent zoonotic pathogen primarily affecting domesticated and wild herbivores. Human exposure to B. anthracis is primarily through contact with infected animals or contaminated animal products. In Pakistan, where livestock vaccines are largely unavailable and infected carcasses are often disposed of improperly, the risk to humans, wildlife and livestock is significant. Currently, the diagnosis of anthrax infections and outbreak tracing necessitates the isolation and culturing of B. anthracis, a process that requires BSL-3 facili
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Balamuthia mandrillaris is a rare, free-living amoeba (FLA) that causes granulomatous amoebic encephalitis, a disease with close to 90% mortality. The geographical ranges of many FLA are expanding, potentially increasing human exposure to B. mandrillaris. Here, we report a case of a 58-year-old woman with progressive neurological symptoms, ultimately diagnosed postmortem with B. mandrillaris encephalitis through plasma metagenomic next-generation sequencing (mNGS) despite negative results on both cerebrospinal fluid (CSF) mNGS and CSF PCR testing. Histologic analysis and real-time PCR (qPCR) s
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic variant testing through next-generation sequencing (NGS) is well integrated into Swiss molecular pathology laboratories and has become a standard diagnostic method for numerous indications in cancer patient care. Currently, there is a wide variation in reporting practices within our country, and as patients move between different hospitals, it is increasingly necessary to standardize NGS reports to ease their reinterpretation. Additionally, as many different stakeholders-oncologists, hematologists, geneticists, pathologists, and patients-have access to the NGS report, it needs to conta
СтатьяКлинические рекомендацииПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Newborn screening (NBS) in the United States began in the 1960s to detect inborn errors of metabolism that benefited from presymptomatic treatment compared with treatment after the development of symptoms and diagnosis. Over time, it expanded to include endocrinological disorders, hematological disorders, immunodeficiencies, and other treatable diseases such as lysosomal storage diseases (LSD), cystic fibrosis, X-linked adrenoleukodystrophy, and spinal muscular dystrophy. This expansion has been driven by new technologies (e.g., tandem mass spectrometry) and novel treatments (e.g., enzyme repl
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) is a novel technique for detecting pathogens. This retrospective study evaluated the diagnostic value of mNGS using plasma for infections in hematology patients and its impact on clinical treatment and prognosis in different subgroups of hematology patients.
METHODS: A total of 153 hematology patients with suspected infection who underwent mNGS using plasma were enrolled in the study. Their clinical histories, conventional microbiological test (CMT) results, mNGS results, treatment and prognosis were retrospectively analyzed.
RESULT
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronavirus disease 2019 (COVID-19) was considered a major public health burden worldwide. Multiple studies have shown that susceptibility to severe infections and the development of long-term symptoms is significantly influenced by viral and host factors. These findings have highlighted the potential of host genetic markers to identify high-risk individuals and develop target interventions to reduce morbimortality. Despite its importance, genetic host factors remain largely understudied in Latin-American populations. Using a case-control design and a custom next-generation sequencing (NGS) pa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Distinguishing between sporadic and germline/mosaic NF2-related schwannomatosis is important to ensure that patients have appropriate long-term care. With this report, we describe a unique case of a patient with 4 ipsilateral schwannomas and identify a combination of sequencing modalities that can accurately diagnose mosaic NF2-related schwannomatosis.
METHODS: We present a 32-year-old woman with a familial history of vestibular schwannoma in her father and right-sided schwannomas involving the apical and basal turns of cochlea, lateral semicircular canal, and internal auditory ca
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As part of a sea turtle health monitoring program on the central east coast of Queensland, Australia, stranded and sick green sea turtles (Chelonia mydas) were subjected to necropsy and histopathology. A subset of these turtles had myocarditis of varying severity, which could not be attributed to parasitism by spirorchid flukes or bacterial infections. We, therefore, undertook an investigation to determine whether virus infections might be part of the pathogenesis. Deep sequencing revealed abundant DNA virus contigs in the heart tissue, of which CRESS and circoviruses appeared to be the most c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malassezia restricta, a lipophilic and lipodependent yeast belonging to the basidiomycetes group, is an opportunistic fungal pathogen associated with various skin diseases, including seborrheic dermatitis and dandruff. Typically, Malassezia infection in neonates manifests as fungemia or hematogenous dissemination to the bone or lungs. However, vertebral osteomyelitis caused by these fungi is rarely reported owing to non-specific clinical presentations and laboratory/imaging findings. The Pathogen Metagenomics Sequencing (PMseq) technique enables direct high-throughput sequencing of
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a zoonotic and neglected waterborne disease caused by the pathogenic helical spirochetes. Early diagnosis of leptospirosis remains challenging due to non-specific symptoms and the limited availability of rapid point-of-care diagnostic tests. Herein, we present a case where a patient suspected of having COVID-19 was diagnosed with leptospirosis using metagenomic next-generation sequencing (mNGS). This case highlights the potential of mNGS to diagnose leptospirosis in the context of the COVID-19 pandemic.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The metagenomic next-generation sequencing (mNGS) method is preferred for genotyping useful for the identification of organisms, illumination of metabolic pathways, and determination of microbiota. It can accurately obtain all the nucleic acid information in the test sample. Anthrax is one of the most important zoonotic diseases, infecting mainly herbivores and occasionally humans. The disease has four typical clinical forms, cutaneous, gastrointestinal, inhalation, and injection, all of which may result in sepsis or meningitis, with cutaneous being the most common form. Here, we report a case
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования