MET exon 14 skipping is an actionable oncogenic driver in non-small cell lung carcinoma (NSCLC); however, noncanonical splice-region variants are frequently classified as variants of unknown significance (VUS), which may result in missed therapeutic opportunities and highlight limitations in current DNA next-generation sequencing (NGS) reporting criteria. We report a patient with pulmonary sarcomatoid carcinoma harboring a noncanonical MET splice donor-proximal indel (c.3022_3028 + 13delinsA), initially interpreted as a VUS, who achieved a rapid and durable response to capmatinib. Subsequent R
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CADM2, a candidate gene for psoriasis, was identified by a genome-wide association study using microsatellites in the Japanese population (561 cases and 561 controls). Moreover, haplotype analysis included an additional 68 SNPs and indicated that a 110-kb haplotype block was detected for the protective risk haplotype of psoriasis. We also identified an initial exon of novel splicing variants in this haplotype block. A functional analysis by qRT-PCR using RNAs from the blood of 56 cases and 64 controls significantly demonstrated an inverse correlation between expression frequencies in a novel s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Large-conductance, calcium-activated potassium (Maxi-K) channels are implicated in the modulation of human uterine contractions and myometrial Ca2+ homeostasis. However, the regulatory mechanism(s) governing the expression of Maxi-K channels with decreased calcium sensitivity at parturition are unclear. The objectives of this study were to investigate mRNA expression of the Maxi-K alpha subunit, and that of its splice variants, in human non-pregnant and pregnant myometrium, prior to and after labour onset, to determine whether altered expression of these splice variants is associat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 latency is mainly characterized at transcriptional level, and little is known about post-transcriptional mechanisms and their contribution to reactivation. The viral protein Rev controls the nucleocytoplasmic export of unspliced and singly-spliced RNA that is central to proviral replication-competence and is therefore a prerequisite for efficient viral reactivation during the "shock-and-kill" cure therapy. Here we show that during infection and reactivation, unspliced HIV-1 RNA is a subject to complex and dynamic regulation by the Rev cofactor MATR3 and the MTR4 cofactor of the nuclear e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Adenovirus (Ad) replication compartments (RC) are nuclear microenvironments where the viral genome is replicated and a coordinat … s (RCf) proved to be functional, as they directed de novo synthesis of viral DNA and RNA as well as RNA splicing, activities that are associated with RC in vivo. A detailed analysis of the production of viral late mRNA from RCf at different times postinfection revealed that viral mRNA splicing occurs in RC and that the synthesis, posttranscriptional processing …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital insensitivity to pain with anhidrosis (CIPA) is a rare autosomal recessive genetic disease characterized by the lack … quencing of isolated RT-PCR products was used to characterize the effect of the mutations on NTRK1 mRNA splicing. The clinical diagnosis of CIPA was confirmed by the detection of two splice-site mutations in NTRK1, revealing that the patient was a compound heterozygote at this gene. One of these alterations, c.574+1G>A, is located at the splice donor site of i …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sertoli cells provide essential structural and nutritional support for germ cell development and play critical roles in spermatogenesis. Post-transcriptional regulation exerts important functions in Sertoli cells. Complex alternative splicing processes exist in Sertoli cells. This study focuses on splicing factor SRSF1 to investigate its function and mechanisms in Sertoli cell development. Sertoli cell-specific SRSF1 ablation from embryonic development arrests cell proliferation and increases apoptosis, thereby reducing Sertoli cell number, constricting the germ cell microenvironment, and caus
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expansion of CAG repeats in HTT exon 1 is the acknowledged driver of Huntington's disease. Alternative processing of HTT pre-mRNA generates the truncated HTT1a transcript, translated into a toxic peptide. While its dependence on CAG length is well documented, the role of adjacent sequences - particularly the Proline-Rich Domain (PRD) - remains unexplored. Using our HuntEx1-engineered mouse embryonic stem cell platform, we show that human PRD promotes HTT1a production, whereas its replacement with mouse PRD in an otherwise human exon 1 markedly reduces HTT1a levels. Mechanistically, we find tha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the gene encoding the enzyme iduronate-2-sulfatase (IDS) were reported as the cause of the X-linked recessive lysosomal disease, mucopolysaccharidosis II (MPS II). Amongst the different mutations, it emerges that nearly 10% are nucleotide substitutions causing splicing mutations. We now report the molecular characterisation of three MPS II patients with multiple aberrant transcripts due to three different point mutations. The c.418+1G>C that occurred in the invariant splice-site motif, produced only aberrantly spliced transcripts. Whilst the mutations affecting variant motifs (c.4
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) has emerged as an abundant modification throughout the transcriptome with widespread functions in protein-coding and noncoding RNAs. It affects the fates of modified RNAs, including their stability, splicing, and/or translation, and thus plays important roles in posttranscriptional regulation. To date, m6A methyltransferases have been reported to execute m6A deposition on distinct RNAs by their own or forming different complexes with additional partner proteins. In this review, we summarize the function of these m6A methyltransferases or complexes in regulating the key
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a highly lethal malignancy primarily driven by oncogenic KRAS signaling. The splicing factor serine/arginine-rich splicing factor 1 (SRSF1) plays a key oncogenic role in PDAC through reciprocal cross-interactions with KRAS signaling. However, the mechanisms regulating SRSF1 protein stability remain poorly understood. In this study, we identify the deubiquitinase USP39 as a critical regulator of SRSF1 stability. It interacts with SRSF1 in an RNA-independent manner and suppresses its ubiquitination. USP39 is upregulated in PDAC and correlate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bispecific antibodies are a growing class of therapeutics that simultaneously engage two targets. However, their complex molecular structures pose challenges for production in Chinese hamster ovary cells, the current industry standard for biologics manufacturing. Here we present a case study of three IgG-scFv format bsAbs expressed in CHO cells, in which one candidate exhibited markedly lower titers despite high sequence homology to the other two. Using multi-omics analysis (RNA sequencing, splicing prediction, codon optimization assessment, and motif screening) to investigate potential causes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although genome sequencings have recognized many cancer-associated genes in hepatocellular carcinoma (HCC), distinguishing their functional effect remains challenging. Leveraging on a genome-wide CRISPR knockout (KO) screening, we uncovered spliceosome factors as major survival essential genes in HCC and up-regulations of ferroptosis suppressors [particularly glutamate-cysteine ligase catalytic subunit (GCLC)] in lenvatinib resistance. Our KO screen in patient-derived HCC organoid showed splicing factor 3b subunit 4 (SF3B4) to be top-ranked, conferring prosurvival signal in HCC organoid and dr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital Cataracts, Facial Dysmorphism, and Neuropathy (CCFDN) syndrome is a rare autosomal recessive disorder predominantly found among Vlax Roma populations, caused by a deep intronic founder variant in the CTDP1 gene. This review synthesizes recent advances in understanding the molecular mechanisms of CTDP1 dysfunction, highlighting its central role in transcriptional regulation, RNA splicing, DNA repair, and genome integrity. The unique splicing defect caused by the founder disease-causing variant in the Roma population results in a multisystem phenotype with early-onset neuropathy, cong…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orofacial cleft (OFC) is a common human congenital anomaly. Epithelial-specific RNA splicing regulators ESRP1 and ESRP2 regulate craniofacial morphogenesis and their disruption result in OFC in zebrafish, mouse and humans. Using esrp1/2 mutant zebrafish and murine Py2T cell line models, we functionally tested the pathogenicity of human ESRP1/2 gene variants. We found that many variants predicted by in silico methods to be pathogenic were functionally benign. Esrp1 also regulates the alternative splicing of Ctnnd1 and these genes are co-expressed in the embryonic and oral epithelium. In fact, o…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present the case of a male patient who was ultimately diagnosed with Becker muscular dystrophy (BMD; MIM# 300376) after the onset of muscle weakness in his teens progressively led to significant walking difficulties in his twenties. A genetic diagnosis was pursued but initial investigation revealed no aberrations in the dystrophin gene (DMD), although immunohistochemistry and Western blot analysis suggested the diagnosis of dystrophinopathy. Eventually, after more than 10 years, an RNA analysis captured abnormal splicing where 154 nucleotides from intron 43 were inserted between exon 43 and
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enhanced expression of the cold-shock protein RNA binding motif 3 (RBM3) is highly neuroprotective both in vitro and in vivo. Whilst upstream signalling pathways leading to RBM3 expression have been described, the precise molecular mechanism of RBM3 cold induction remains elusive. To identify temperature-dependent modulators of RBM3, we performed a genome-wide CRISPR-Cas9 knockout screen using RBM3-reporter human iPSC-derived neurons. We found that RBM3 mRNA and protein levels are robustly regulated by several splicing factors, with heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 (HNRNPH1) being th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several preclinical models have been recently developed for metabolic associated fatty liver disease (MAFLD) and associated hepatocellular carcinoma (HCC) but comprehensive analysis of the regulatory and transcriptional landscapes underlying disease in these models are still missing. We investigated the regulatory and transcriptional landscape in fatty livers and liver tumours from DIAMOND mice that faithfully mimic human HCC development in the context of MAFLD. RNA-sequencing and ChIP-sequencing revealed rewiring of the Wnt/β-catenin regulatory network in DIAMOND tumours, as manifested by chr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exon skipping is an effective strategy for the treatment of many Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) mutations. Natural exon skipping observed in several DMD cases can help in identifying novel therapeutic tools. Here, we show a DMD study case where the lack of a splicing factor (Celf2a), which results in exon skipping and dystrophin rescue, is due to a maternally inherited trans-generational epigenetic silencing. We found that the study case and his mother express a repressive long non-coding RNA, DUXAP8, whose presence correlates with silencing of the Celf2a coding region. We also demonstrate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marfan syndrome is a heritable autosomal-dominant connective tissue disorder and it was typically caused by mutations in FBN1. However, the synonymous mutation was seldom recorded to be related to Marfan syndrome. Hereon, Multiplex ligation-dependent probe amplification failed to detect a copy number variant involving FBN1 but a synonymous mutation c.4773A > G (p.Gly1591Gly) was identified by NGS in exon 39. RNA was extracted from patient's aortic tissue and reverse polymerase chain reaction demonstrated the presence of a shortened mRNA transcript. Results of minigene models indicated that c.4
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования