INTRODUCTION: Atherosclerosis (AS) and acquired immune deficiency syndrome (AIDS) are associated with autophagy-related pathways. This research was intended to ascertain the interplay between AS and AIDS through autophagy-related mechanisms and to identify potential common biomarkers.
METHODS: Single-cell datasets for AS and AIDS were extracted from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) from each dataset were identified and then intersected with autophagy-related genes (ATGs). Functional enrichment and protein-protein interaction (PPI) network analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is a common inherited cardiomyopathy, and the mechanisms by which oxidative stress contributes to HCM remain unclear. This study aimed to identify HCM-associated oxidative stress genes and evaluate their significance in HCM pathogenesis through bioinformatic analysis of public datasets. GSE36961 and GSE141910 were downloaded from the Gene expression Omnibus (GEO) database, and genes associated with oxidative stress were searched in the Gene Ontology (GO) database. After differential analysis, marker genes were obtained using LASSO and SVM-RFE algorithms. DAVID
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with cirrhosis face an elevated risk of developing sepsis, leading to an escalating mortality rate. This study focuses on the link between natural killer (NK) cells, cirrhosis, and sepsis. Our goal is to identify NK cell-related genes that could serve as common diagnostic biomarkers for both conditions. The datasets pertaining to cirrhosis and sepsis were obtained from the Gene Expression Omnibus database. Initially, a single sample Gene set enrichment analysis (ssGSEA) concentrated on the NK cell gene set. Subsequently, the ssGSEA score was utilized as the phenotype data for the weig
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore the immunological underpinnings and prognostic potential of gene expression profiles in bladder cancer through comprehensive analyses of The Cancer Genome Atlas (TCGA) data. We used the TCGA data to identify differentially expressed genes (DEGs) and performed enrichment analysis to reveal the related biological pathways. Meanwhile, the least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) algorithm was adopted to develop a prognostic model. Then we evaluated the performance of the model in both TCGA and GSE13507 datasets. Furthermore, we conducted a comprehensive investigation on
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoporosis (OP) is a common metabolic bone disease characterized by decreased bone mass and increased fracture risk. Recent studies suggest that oxidative phosphorylation (OXPHOS) plays a crucial role in the pathogenesis of OP. This study aims to investigate the differential expression and potential functional roles of OXPHOS-related genes in OP.
METHODS: We downloaded gene expression data from two OP-related datasets, GSE56815 and GSE7429, using the GEOquery package. We also collected OXPHOS-related genes from the GeneCards and MsigDB databases. The limma package was used for d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pathogenic mechanism underlying Mycobacterium tuberculosis (MTB) remains elusive, posing challenges to its diagnosis and treatment. Cuproptosis is a newly identified mechanism of cell death. This study explores the role of cuproptosis-related genes (CRGs) in pulmonary tuberculosis (PTB) to uncover potential diagnostic biomarkers and therapeutic targets.
METHODS: Differentially expressed gene (DEG) analysis and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) were carried out using the GSE83456 dataset. PTB-associated DEGs were intersected with CRGs to identify PTB-related
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is a chronic hepatic disease. The incidence and prevalence of NAFLD have increased greatly in recent years, and there is still a lack of effective drugs. Autophagy plays an important role in promoting liver metabolism and maintaining liver homeostasis, and defects in autophagy levels are considered to be related to the development of NAFLD. However, the molecular mechanisms of autophagy in NAFLD still remain unknown. In this study, we identified 6 autophagy-associated hub genes using gene expression profiles obtained from the GSE48452 and GSE89632 data
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mounting evidence indicates that myocardial fibrosis (MF) is frequently intertwined with immune and metabolic disorders. This comprehensive review aims to delve deeply into the crucial role of immune-related signature genes in the pathogenesis and progression of MF. This exploration holds significant importance as understanding the underlying mechanisms of MF is essential for developing effective diagnostic and therapeutic strategies. The dataset GSE9735 about myocardial fibrosis and non-fibrosis was downloaded from GEO database. Differentially expressed genes (DEGs) were identified by 'limma'
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Preeclampsia (PE) poses significant diagnostic and therapeutic challenges. This study aims to identify novel genes for potential diagnostic and therapeutic targets, illuminating the immune mechanisms involved.
METHODS: Three GEO datasets were analyzed, merging two for training set, and using the third for external validation. Intersection analysis of differentially expressed genes (DEGs) and WGCNA highlighted candidate genes. These were further refined through LASSO, SVM-RFE, and RF algorithms to identify diagnostic hub genes. Diagnostic efficacy was assessed using ROC curves. A p
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aimed to identify novel biomarkers for preeclampsia (PE) diagnosis by integrating Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) with machine learning techniques.
PATIENTS AND METHODS: We obtained the PE dataset GSE25906 from the gene expression omnibus (GEO) database. Analysis of differentially expressed genes (DEGs) and module genes with Limma and Weighted Gene Co-expression Network analysis (WGCNA). Candidate hub genes for PE were identified using machine learning. Subsequently, we used western-blotting (WB) and real-time fluorescence quantitative (qPCR) to verify
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is a globally prevalent chronic inflammatory skin disease. This study aimed to scrutinize the hub genes related to inflammation and potential molecular mechanisms in psoriasis. Utilizing mRNA expression profiles from public datasets GSE13355, GSE78097, and GSE14905, we set up a comprehensive analysis. Initially, we selected differentially expressed genes (DEGs) from psoriasis and control samples in GSE13355, followed by calculating inflammatory indices using genomic set variation analysis (GSVA). Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) was then applied to link significan
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic ankle instability (CAI) poses challenges in sports. Textured insoles are a promising intervention for optimizing ankle muscle activity and enhancing ankle proprioceptive ability in individuals with CAI. This study investigated the effects of different types of insoles on ankle muscle activity and ankle inversion proprioception during drop-landing tasks. Thirty-two soccer players (16 CAI, 16 non-CAI) participated in the study. Electromyographic (EMG) activity of the tibialis anterior (TA), medial gastrocnemius (MG), and peroneus longus (PL) muscles was recorded during drop-landing tasks
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ankylosing spondylitis (AS) with radiographic damage is more prevalent in men than in women. IL-17, which is mainly secreted from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), plays an important role in the development of AS. Its expression is different between male and female. However, it is still unclear whether sex dimorphism of IL-17 contribute to sex differences in AS.
METHODS: GSE221786, GSE73754, GSE25101, GSE181364 and GSE205812 datasets were collected from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differential expressed genes (DEGs) were analyzed with the Gene Set Enrichm
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related hearing loss (ARHL), is a pervasive health problem worldwide. ARHL seriously affects the quality of life and reportedly leads to social isolation and dementia in the elderly. ARHL is caused by the degeneration or disorders of cochlear hair cells and auditory neurons. Numerous studies have verified that genetic factors contributed to this impairment, however, the mechanism behind remains unclear. In this study, we analyzed an mRNA expression dataset (GSE49543) from the GEO database. Differentially expressed genes (DEGs) between young control mice and presbycusis mice were analyzed u
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bedaquiline (BDQ) has shown efficacy in shortening treatment duration and enhancing treatment success rates for multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB), thereby prompting widespread adoption. However, resistance to BDQ has emerged. This study aimed to identify genetic characteristics associated with decreased susceptibility to BDQ, using a public database to aid in the detection of resistant strains. Seventy-one BDQ-resistant and 929 BDQ-susceptible isolates from the open-source CRyPTIC database were selected for analysis. Variant calling was conducted via the clockwork pipeline. Univariate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atopic dermatitis (AD) and psoriasis are among the most common chronic inflammatory skin diseases. Although AD and psoriasis are distinguished using clinical criteria, the lesions of these two diseases are sometimes highly similar, making diagnosis difficult. In addition, the mechanisms underlying these two diseases are not fully clear. Here, we aimed to identify potential genes and regulatory mechanisms in AD and psoriasis patients to aid in the diagnosis and treatment of AD and psoriasis. The GSE121212 dataset was obtained from the NCBI Gene Expression Omnibus database and weighted gene co-e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study was designed to detect possible biomarkers associated with diabetic foot ulcer (DFU) incidence in an effort to develop novel treatments for this condition. The GSE7014 and GSE29221 gene expression datasets were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database, after which differentially expressed genes (DEGs) were identified between DFU and healthy samples. These DEGs were then arranged into a protein-protein interaction (PPI) network, and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway and Gene Ontology (GO) term enrichment analyses were performed to explore
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Asthenozoospermia, one of the most common causes of male infertility, is a complicate multifactorial pathological condition that genetic factors are involved in. However, the epigenetic signature and mechanism of asthenozoospermia still remain limited. Our study aimed to confirm the key microRNAs (miRNAs) and genes in asthenozoospermia and demonstrate the underlying epigenetic regulatory mechanisms. Methods: We screened out and pooled previous studies to extracted potential differentially expressed miRNAs (DEMs). GSE22331 and a published profile dataset were integrated to identify
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The association between polymorphisms in vitamin D-binding protein (DBP) gene and the risk of multiple sclerosis (MS) and type 1 diabetes mellitus (T1DM) has been investigated in many studies, but the studies showed controversial results. The rationale for this meta-analysis was to determine whether DBP polymorphisms increases the risk of MS and T1DM by pooling data.
METHODS: Potentially relevant studies were searched using GWAS Catalog, PubMed, Embase, CNKI and WANFANG databases up to November 2019. The pooled odds ratios (ORs) and corresponding 95% confidence intervals (CIs) wer
СтатьяМетаанализСистематический обзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We aimed to identify new biomarkers in Diffuse Large B-cell Lymphoma (DLBCL) using the deep learning technique.
METHODS AND RESULTS: The multilayer perceptron (MLP) analysis was performed in the GSE10846 series, divided into discovery (n = 100) and validation (n = 414) sets. The top 25 gene-probes from a total of 54,614 were selected based on their normalized importance for outcome prediction (dead/alive). By Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) the association to unfavorable prognosis was confirmed. In the validation set, by univariate Cox regression analysis, high expression of AR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования