The alpha-subunit of the nicotinic acetylcholine receptor (alphaAChR) contains a binding site for alpha-bungarotoxin (alpha-BTX), a snake-venom-derived alpha-neurotoxin. Previous studies have established that the segment comprising residues 173-204 of alphaAChR contains the major determinant interacting with the toxin, but the precise boundaries of this determinant have not been clearly defined to date. In this study, we applied NMR dynamic filtering to determine the exact sequence constituting the major alphaAChR determinant interacting with alpha-BTX. Two overlapping synthetic peptides corre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A live attenuated virus vaccine has been recently developed to prevent Argentine hemorrhagic fever. In this paper, we report the nucleotide sequence of the glycoprotein precursor gene (GPC) of the Junin virus vaccine strain (Candid #1) and its flanking untranslated regions. The untranslated regions flanking the GPC genes of different arenaviruses are variable in length, sequence, and secondary structure. However, when this highly attenuated Junin virus strain is compared with the MC2 strain, which is of intermediate virulence, one nucleotide insertion and four nucleotide substitutions are foun
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Factor H (FH) is a plasma glycoprotein that plays a central role in regulation of the alternative pathway of complement. It is composed of 20 short complement regulator (SCR) domains. The SCR-1/5 fragment is required for decay acceleration and cofactor activity, while the SCR-16/20 fragment possesses binding sites for complement C3d and heparin. X-ray scattering and analytical ultracentrifugation showed that SCR-1/5 was monomeric, while SCR-16/20 formed dimers. The Guinier radius of gyration R(G) of 4.3 nm for SCR-1/5 and those of 4.7 nm and about 7.8 nm for monomeric and dimeric SCR-16/20, re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Familial cases of amyotrophic lateral sclerosis are most frequently caused by mutation in the superoxide dismutase-1 (SOD1) gene. We report a heterozygous I113F mutation in a patient with familial ALS characterized by early and predominant bilateral vocal cord paralysis followed by descending spinal cord paresis. Modelling of the mutant SOD1 showed an alteration of the protein secondary structure leading to impaired strength of the dimer interface. This may result in a failure of the protein folding and subsequently generation of toxic intracellular aggregates, suggesting a pathogenic role for
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Momordica charantia (Mc) seeds are widely used edible crop with high nutritional quality. The food and pharmaceutical industries use it as a natural anti-oxygenic agent. Herein, a ~52 kDa protein, which is a major part of seed proteome has been purified, biochemically characterized and structure has been determined. MALDI-ESI-MS identified peptide fragments and contig-deduced sequence suggested the protein to be homologous to 7S globulins. The crystal structure shows that protein has a bicupin fold similar to 7S globulins and the electron density for a copper and acetate ligand were observed i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The focus of this paper is on the impact of approaches used to improve protein solubility on its interfacial activity. A range of approaches are used to disperse vegetable proteins in water to stabilize emulsions. Applying physical fields like sonication while pH shifting is thought to have synergistic effects on the emulsifying activity of plant proteins. But the key structural features of proteins that are altered by modification and affect adsorbed layer formation remain unclear. This study evaluated the effects of combining pH shifting and ultrasonication on the interfacial properties of p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heat shock protein 47 (Hsp47) is an endoplasmic reticulum (ER)-resident molecular chaperone essential for correct folding of procollagen in mammalian cells. In this Review, we discuss the role and function of Hsp47 in vertebrate cells and its role in connective tissue disorders. Hsp47 binds to collagenous (Gly-Xaa-Arg) repeats within triple-helical procollagen in the ER and can prevent its local unfolding or aggregate formation, resulting in accelerating triple-helix formation of procollagen. Hsp47 pH-dependently dissociates from procollagen in the cis-Golgi or ER-Golgi intermediate compartmen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have performed the first unbiased folding simulations of the GB1 hairpin in explicit solvent, using hundreds of microsecond-long molecular dynamics simulations (total time: 0.7 ms). Our simulations are initiated from two sets of structures. Starting from an equilibrium unfolded state, we obtain single-exponential folding kinetics with rate coefficients in good agreement (T=350 K) or within an order of magnitude (T=300 K) of the experimental values. However, simulations initiated from unfolded configurations lacking secondary structure result in biexponential kinetics with an additional fast
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid is associated with a number of diseases including Alzheimer's, Huntington's, Parkinson's, and the spongiform encephalopathies. Amyloid fibrils have been formed in vitro from both disease and nondisease related proteins, but the latter requires extremes of pH, heat, or the presence of a chaotropic agent. We show, using fluorescence spectroscopy, electron microscopy, and solid-state NMR spectroscopy, that the alpha-helical type I antifreeze protein from the winter flounder forms amyloid fibrils at pH 4 and 7 upon freezing and thawing. Our results demonstrate that the freezing of some pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adaptation to persisting stimulation is required for highly sensitive detection of temporal changes of stimuli, and often involves covalent modification of receptors. Therefore, it is of vital importance to understand how a receptor and its cognate modifying enzyme(s) modulate each other through specific protein-protein interactions. In the chemotaxis of Escherichia coli, adaptation requires methylation of chemoreceptors (e.g. Tar) catalyzed by the CheR methyltransferase. CheR binds to the C-terminal NWETF sequence of a chemoreceptor that is distinct from the methylation sites. However, little
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Plasmodium falciparum relies on gametocytogenesis to transmit from humans to mosquitoes. Gametocyte development 1 (Pfgdv1) is an upstream activator and epigenetic controller of gametocytogenesis. The emergence of drug resistance is a major public health concern and this requires the development of new strategies that target the transmission of malaria. As a putative drug target, Pfgdv1 has not been characterized to identify its polymorphisms and alleles under selection and how such polymorphisms influence protein structure.
METHODS: This study characterized single-nucleotide pol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningtidis is responsible for causing meningococcal meningitis along with acute septicaemia in human beings. Functional genomics strategies proved cruciality of certain genes/proteins in Neisseria meningitidis pathogenesis. During the present studies, three important Neisseria meningitidis proteins i.e., Dead box RNA-Helicase, Polyribonucleotide nucleotidyl-transferase PNPase and Ribonuclease-III were targeted for homology modeling and protein-ligand docking studies not only to determine their three dimensional architectures but also to identify their potential novel inhibitors. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein misfolding and its deviant self-assembly to converge into amyloid fibrils is associated with the perturbation of cellular functions and thus with debilitating neurodegenerative diseases including Alzheimer's disease, Parkinson's disease, etc. A great deal of research has already been carried out to discover a potential amyloid inhibitor that can slow down, prevent, or remodel toxic amyloids. In the present study with the help of a combination of biophysical, imaging, and computational techniques, we investigated the mechanism of interaction of cholic acid (CA), a primary bile acid, wit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The plasma membrane Ca2+-ATPase (PMCA) pumps play a critical role in the maintenance of calcium (Ca2+) homeostasis, crucial for optimal neuronal function and cell survival. Loss of Ca2+ homeostasis is a key precursor in neuronal dysfunction associated with brain aging and in the pathogenesis of neurodegenerative disorders. In this article, we review evidence showing age-related changes in the PMCAs in synaptic plasma membranes (SPMs) and lipid raft microdomains isolated from rat brain. Both PMCA activity and protein levels decline progressively with increasing age. However, the loss of activit
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Changes in pH resulting in modifications of charge can dramatically alter the folding and interaction of proteins. This article probes the effects of charge and hydrophobicity on the oligomerization of macrocyclic β-sheet peptides derived from residues 11-17 of IAPP (RLANFLV). Previous studies have shown that a macrocyclic β-sheet peptide containing this IAPP sequence (peptide 1Arg) does not form oligomers in aqueous solution at low millimolar concentrations. Replacing arginine with the uncharged isostere citrulline generates a homologue (peptide 1Cit) that forms a tetramer consisting of a san
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Historically, pharmacological therapies have used mechanisms such as γ-aminobutyric acid A (GABAA) receptor potentiation to drive sleep through broad suppression of central nervous system activity. With the discovery of orexin signaling loss as the etiology underlying narcolepsy, a disorder associated with hypersomnolence, orexin antagonism emerged as an alternative approach to attenuate orexin-induced wakefulness more selectively. Dual orexin receptor antagonists (DORAs) block the activity of orexin 1 and 2 receptors to both reduce the threshold to transition into sleep and attenuate orexin-m
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 4-year-old boy presented with nonimmune hemolysis, thrombocytopenia, and acute kidney injury. Investigations for an underlying cause failed to identify a definitive cause and a putative diagnosis of complement-mediated atypical hemolytic uremic syndrome (aHUS) was made. The patient was started initially on plasma exchange and subsequently eculizumab therapy, after which his kidney function rapidly improved. While on eculizumab therapy, despite adequate complement blockade, he presented 2 more times with hemolytic anemia and thrombocytopenia, but without renal involvement. Genetic analysis di
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Mevalonate kinase deficiency, a rare autosomal recessive autoinflammatory disease, is caused by mutations in the MVK gene encoding mevalonate kinase (MK). MK catalyzes the phosphorylation of mevalonic acid to mevalonate-5-phosphate (MVAP) in the pathway of isoprenoid and sterol synthesis. The disease phenotype correlates with residual activity ranging from <0.5% for mevalonic aciduria to 1-7% for the milder hyperimmunoglobulinemia D and periodic fever syndrome (HIDS). Hence, assessment of loss-of-function requires high accuracy measurements. We describe a method using isotope dilut
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four novel peptides were isolated from the venoms of the solitary eumenine wasps Eumenes rubrofemoratus and Eumenes fraterculus. Their sequences were determined by MALDI-TOF/TOF (matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) analysis, Edman degradation and solid-phase synthesis. Two of them, eumenitin-R (LNLKGLIKKVASLLN) and eumenitin-F (LNLKGLFKKVASLLT), are highly homologous to eumenitin, an antimicrobial peptide from a solitary eumenine wasp, whereas the other two, EMP-ER (FDIMGLIKKVAGAL-NH(2)) and EMP-EF (FDVMGIIKKIAGAL-NH(2)), are similar to eumenine mastop
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A critical issue in the development of implicit solvent models is their quality in realistic simulations of non-trivial systems. In a previous study, we quantitatively compared the reaction field energies of static structures calculated with the Poisson-Boltzmann implicit solvent and the TIP3P explicit solvent and found an overall agreement, though a discrepancy was also observed in the electrostatic potentials of mean force for salt-bridging and hydrogen-bonding dimers (see J. Phys. Chem. B, 2006, 110, 18680). In this study, we are interested in how the implicit solvent performs in molecular
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.