Merkel Cell Polyomavirus (MCPyV) is the etiological agent of the majority of Merkel Cell Carcinomas (MCC). MCPyV positive MCCs harbor integrated, defective viral genomes that constitutively express viral oncogenes. Which molecular mechanisms promote viral integration, if distinct integration patterns exist, and if integration occurs preferentially at loci with specific chromatin states is unknown. We here combined short and long-read (nanopore) next-generation sequencing and present the first high-resolution analysis of integration site structure in MCC cell lines as well as primary tumor mate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current standard of care for treating HIV infection is the use of three antiretroviral drugs: a combination of two nucleoside/nucleotide reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) and a third agent from either the integrase strand transfer inhibitor (INSTI), boosted protease inhibitor (PI) or non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI) classes. In an effort to minimize the long-term adverse effects and cost of antiretroviral therapy, the use of regimens with fewer drugs in the combination has been under active investigation. To this end, the combination of dolutegravir (DTG) plus
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic low levels of survival motor neuron (SMN) protein cause spinal muscular atrophy (SMA). SMN is ubiquitously expressed, but the mechanisms underlying predominant neuron degeneration in SMA are poorly understood. We report that chronic low levels of SMN cause Senataxin (SETX)-deficiency, which results in increased RNA-DNA hybrids (R-loops) and DNA double-strand breaks (DSBs), and deficiency of DNA-activated protein kinase-catalytic subunit (DNA-PKcs), which impairs DSB repair. Consequently, DNA damage accumulates in patient cells, SMA mice neurons and patient spinal cord tissues. In divid
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome editing represents a powerful tool to treat inherited disorders. Highly specific endonucleases induce a DNA double strand break near the mutant site, which is subsequently repaired by cellular DNA repair mechanisms that involve the presence of a wild type template DNA. In vivo applications of this strategy are still rare, in part due to the absence of appropriate animal models carrying human disease mutations and knowledge of the efficient targeting of endonucleases. Here we report the generation and characterization of a new mouse model for X-linked retinitis pigmentosa (XLRP) carrying
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenoviruses are the most common vectors used in clinical trials of gene therapy. In 2017, 21.2% of clinical trials used rAds as vectors. Systemic administration of rAds results in high tropism in the liver. Interferon types α and β are the major antiviral cytokines which orchestrate the host's immune response against rAd, limiting therapeutic gene expression and preventing subsequent vector administration. siRNA is small double-strand RNAs that temporally inhibit the expression of a specific gene. The aim is to evaluate the effect of IFN-α blocking by a specific siRNA on Ad-GFP transduction a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA double-strand breaks (DSBs) are one of the most serious forms of DNA damage to the cell, causing genomic instability and ultimately carcinogenesis. In this study, we hypothesized that single nucleotide polymorphisms (SNPs) at the micro RNA (miRNA)-binding sites of DSB repair genes may influence cancer risk by dysregulating target gene expression. To test our hypothesis, we firstly performed functional prediction for common SNPs in DSB genes and found 12 potentially functional SNPs located at the miRNA-binding sites. We then investigated their associations with risk of squamous cell carcino
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As the options for systemic treatment of malignant melanoma (MM) increase, the need to develop biomarkers to identify patients who might benefit from cytotoxic chemotherapy becomes more apparent. In preclinical models, oxaliplatin has activity in cisplatin-resistant cells. In this study, we have shown that oxaliplatin forms interstrand crosslinks (ICLs) in cellular DNA and that loss of the heterodimeric structure-specific endonuclease XPF-ERCC1 causes hypersensitivity to oxaliplatin in mammalian cells. XPF deficiency resulted in late S-phase arrest and persistence of double-strand breaks follo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of UVB-induced apoptosis in the formation of squamous cell carcinoma (SCC) is recognized. We previously identified the small RhoB (Ras homolog gene family, member B) GTPase, an early response gene to cellular stress, as a critical protein controlling apoptosis of human keratinocytes after UVB exposure. Here we generated SKH1 (hairless immunocompetent mouse) mice invalidated for RhoB to evaluate its role in UVB-induced skin carcinogenesis in vivo. We show that rhob-/- mice have a lower risk of developing UVB-induced keratotic tumors and actinic keratosis that is associated with a highe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The alteration in the expression of some genes and proteins responsible for chosen DNA repair pathways in pterygium pathogenesis were studied. This study was focused on the examination of the expression of genes and RAD50 protein taking part in homologous recombination.
METHODS: Peripheral blood lymphocytes, samples of pterygium tissue, samples of conjunctiva of patients suffering from pterygium as well as peripheral blood lymphocytes and conjunctiva of patients from the control group were examined. In order to identify genes products from RNA, Ribonuclease Protection Assai method wa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The aims of the present study were to better understand the role of Ku 80, which is involved in double-strand break repair in mammalian cells in the mechanism of radiation resistance and to verify the possibility of increasing cell radiosensitivity by targeted inhibition of Ku autoantigen 80 (Ku 80).
MATERIALS AND METHODS: Western blot and electrophoretic mobility shift assay (EMSA) were performed on the human bladder carcinoma cell line RT112 (radioresistant) and on the human colorectal carcinoma cell line SW48 (radiosensitive) to assess the expression levels of DNA-dependent protei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A phenotype-driven approach led to the first understanding of precisely what the Toll-like receptors (TLR) did, when it was determined that the mammalian endotoxin (lipopolysaccharide; LPS) receptor is encoded by TLR4. The TLRs are the primary sensors of the innate immune system, and without them, small inocula of microorganisms pose a major threat to the host, growing unchecked for a long period before they are recognized. Mutations that affect innate immune sensing may account for a substantial fraction of sepsis, and a highly significant excess of mutations in TLR4 has been identified in pa
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this report we summarize evidence to support a model for the development of Graves' disease. The model suggests that Graves' disease is initiated by an insult to the thyrocyte in an individual with a normal immune system. The insult, infectious or otherwise, causes double strand DNA or RNA to enter the cytoplasm of the cell. This causes abnormal expression of major histocompatibility (MHC) class I as a dominant feature, but also aberrant expression of MHC class II, as well as changes in genes or gene products needed for the thyrocyte to become an antigen presenting cell (APC). These include
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplex genome editing of cellular therapies frequently requires multiple DNA double-strand breaks (DSBs), which can induce genotoxicity through chromosomal rearrangements and large deletions. Base editors enable targeted sequence changes with minimal DSBs and are widely used for gene disruption, but their capacity for transgene insertion has remained unexplored. Here, we have developed base editor-mediated knockin (BEKI), a non-viral platform combining transgene insertion with multiplex gene disruption using a single enzyme. BEKI repurposes the base editor's Cas9 nickase domain to generate
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) arises from abnormal expansion of CAG trinucleotide repeats within the HTT gene, leading to mutant huntingtin (mHTT) aggregation, progressive loss of striatal medium spiny neurons (MSNs), and progressive neurodegeneration. While the genetic cause is established, the mechanisms that confer selective MSN vulnerability, particularly those linked to aging, remain unclear. We employed a combination of miR-9/9*-124-driven reprogramming and MSN-specific transcription factors to generate patient-derived MSNs from fibroblasts of symptomatic HD patients (HD-MSNs), pre-symptomat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Prostate cancer (PCa) is one of the most commonly diagnosed cancers in men, with a high global incidence. The Meiotic Nuclear Division 1 (MND1) protein is essential for the repair of DNA double-strand breaks during meiosis, but its role in PCa remains poorly understood. This study aims to explore the function of MND1 in PCa progression and the mechanism involved.
METHODS: RNA-Seq data from the TCGA and GEO databases were analyzed. Kaplan-Meier (KM) method and χ2 test examined the association between MND1 expression, prognosis, and clinical parameters. PCa cell lines (22RV1 and C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antigen receptor diversity depends on the assembly of variable (V), diverse (D), and joining (J) exons in genes encoding immunoglobulins (Igs) and T cell receptors (TCRs). During V(D)J recombination, DNA double-strand breaks (DSBs) introduced by the RAG1/2 nuclease complex are repaired by the process of nonhomologous end-joining (NHEJ). We hypothesized that functional redundancies between NHEJ and the chromatin DSB response, which depends on the kinase ATM, potentially masked the activity of additional factors that regulate V(D)J recombination. We performed targeted CRISPR-Cas9 knockout screen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: There is recent in vivo discovery documenting the carcinogenic effect of bile at strongly acidic pH 3.0 in hypopharynx, while in vitro data demonstrate that weakly acidic bile (pH 5.5) has a similar oncogenic effect. Because esophageal refluxate often occurs at pH > 4.0, here we aim to determine whether weakly acidic bile is also carcinogenic in vivo.
METHODS: Using 32 wild-type mice C57B16J, we performed topical application of conjugated primary bile acids with or without unconjugated secondary bile acid, deoxycholic acid (DCA), at pH 5.5 and controls, to hypopharyngeal mucosa (H
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of Human Papillomavirus (HPV)-associated oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) is increasing rapidly in the UK. Patients with HPV-positive OPSCC generally show superior clinical responses relative to HPV-negative patients. We hypothesised that these superior responses could be associated with defective repair of DNA double strand breaks (DSB). The study aimed to determine whether defective DNA repair could be associated with sensitivity to inhibition of DNA repair using the PARP inhibitor Olaparib. Sensitivity to Olaparib, and induction and repair of DNA damage, were asse
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lemur tyrosine kinase 3 (LMTK3) is an oncogenic kinase that is involved in different types of cancer (breast, lung, gastric, colorectal) and biological processes including proliferation, invasion, migration, chromatin remodeling as well as innate and acquired endocrine resistance. However, the role of LMTK3 in response to cytotoxic chemotherapy has not been investigated thus far. Using both 2D and 3D tissue culture models, we found that overexpression of LMTK3 decreased the sensitivity of breast cancer cell lines to cytotoxic (doxorubicin) treatment. In a mouse model we showed that ectopic ove
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The patterns of emergent HIV-1 drug resistance in patients failing a single-tablet regimen consisting of elvitegravir, boosted by cobicistat, plus emtricitabine and tenofovir disoproxil fumarate (EVG/COBI/FTC/TDF) include mutations in HIV-1 reverse transcriptase (RT) and integrase (IN). The order of development of mutations at early virological failure has not been described. The aim of this study was to determine the first resistance mutations to emerge during virological failure on EVG/COBI/FTC/TDF.
PATIENTS AND METHODS: Population sequencing was conducted at the first virologic
Клиническое исследование III фазыСтатьяРандомизированное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования