The genome of Chlamydophila caviae (formerly Chlamydia psittaci, GPIC isolate) (1 173 390 nt with a plasmid of 7966 nt) was determined, representing the fourth species with a complete genome sequence from the Chlamydiaceae family of obligate intracellular bacterial pathogens. Of 1009 annotated genes, 798 were conserved in all three other completed Chlamydiaceae genomes. The C.caviae genome contains 68 genes that lack orthologs in any other completed chlamydial genomes, including tryptophan and thiamine biosynthesis determinants and a ribose-phosphate pyrophosphokinase, the product of the prsA
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DGCR6 (DiGeorge critical region) gene encodes a putative protein with sequence similarity to gonadal (gdl), a Drosophila melanogaster gene of unknown function. We mapped the DGCR6 gene to chromosome 22q11 within a low copy repeat, termed sc11.1a, and identified a second copy of the gene, DGCR6L, within the duplicate locus, termed sc11.1b. Both sc11.1 repeats are deleted in most persons with velo-cardio-facial syndrome/DiGeorge syndrome (VCFS/DGS), and they map immediately adjacent and internal to the low copy repeats, termed LCR22, that mediate the deletions associated with VCFS/DGS. We se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the molecular characterization of an ethyl methanesulfonate (EMS)-induced mutation that causes albinism and lethality at the seedling stage in Arabidopsis thaliana. We identified the mutation using a mapping-by-sequencing approach that uses Fisher's exact tests to detect changes in allele frequencies among the seedlings of an F2 mapping population, which had been pooled according to their phenotypes (wild-type or mutant). After purifying genomic DNA from the plants of both pools, the two samples were sequenced using the Illumina HiSeq 2500 next-generation sequencing platform. The bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The FEZ (fasciculation and elongation protein zeta) family designation was purposed by Bloom and Horvitz by genetic analysis of C. elegans unc-76. Similar human sequences were identified in the expressed sequence tag database as FEZ1 and FEZ2. The unc-76 function is necessary for normal axon fasciculation and is required for axon-axon interactions. Indeed, the loss of UNC-76 function results in defects in axonal transport. The human FEZ1 protein has been shown to rescue defects caused by unc-76 mutations in nematodes, indicating that both UNC-76 and FEZ1 are evolutionarily conserve
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NixA, the high-affinity cytoplasmic membrane nickel transport protein of Helicobacter pylori, imports Ni(2+) into the cell for insertion into the active site of the urease metalloenzyme, which is required for gastric colonization. NixA fractionates with the cytoplasmic membrane, and protein cross-linking studies suggest that NixA functions as a monomer. A preliminary topological model of NixA with seven transmembrane domains was previously proposed based on hydropathy, charge dispersion, and homology to other transporters. To test the proposed topology of NixA and relate critical residues to s
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Trichinellosis is a re-emerging infectious disease, caused by Trichinella spp. Cathepsin F belongs to cysteine protease that is a major virulence factor for parasitic helminths, and it may be a potential anti-helminth drug target and vaccine candidate. The aim of this study was to clone, express and identify a cathepsin F-like protease in Trichinella spiralis and to investigate its biochemical characteristics.
METHODS: The full-length cDNA encoding a putative cathepsin F-like protease in T. spiralis, TsCF1, was cloned and its biochemical characterization and expression profile wer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 1 diabetes in the NOD mouse model has been linked to >30 insulin-dependent diabetes (Idd) susceptibility loci. Idd4 on chromosome 11 consists of two subloci, Idd4.1 and Idd4.2. Using congenic analysis of alleles in NOD and NOD-resistant (NOR) mice, we previously defined Idd4.1 as an interval containing >50 genes that controlled expression of genes in the type 1 IFN pathway. In this study, we report refined mapping of Idd4.1 to a 1.1-Mb chromosomal region and provide genomic sequence analysis and mechanistic evidence supporting its role in innate immune regulation of islet-directed autoimm
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autosomal dominant hereditary spastic paraplegia (ADHSP) is mainly caused by mutations in the SPG4 gene, which encodes a new member of the AAA (adenosine triphosphatases associated with diverse cellular activities) protein family (spastin). Accumulation of genotype-phenotype correlation is important for better understanding of SPG4-linked hereditary spastic paraplegia.
OBJECTIVES: To perform a clinical and genetic study of families with ADHSP and to perform the functional analysis of the founder mutation discovered in the SPG4 gene.
DESIGN: Genetic and clinical study. Patients Fi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We are investigating induction of chicken cytochrome P450 genes by the sedative phenobarbital in chick embryo hepatocytes. The steady-state level of induced mRNA for the gene CYP2H1 is about 10-fold higher than that of a second gene, CYP2H2. Here, we show that a difference in drug-responsive enhancer activity does not underlie the differential response of these genes to phenobarbital since upstream enhancer regions are identical in these genes. The first 198 bp of CYP2H2 promoter sequence is identical to the CYP2H1 gene promoter, except that the functional HNF-3 binding site in the CYP2H1 prom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenoviruses (HAdVs) of species Human mastadenovirus B (HAdV-B) are genetically highly diverse and comprise several pathogenic types. AdVs closely related to members of HAdV-B infect African great apes and the evolutionary origin of HAdV-B has recently been determined in ancient gorillas. Genetic evidence for intra- and inter-species recombination has been obtained for AdVs of humans and captive great apes, but evidence from wild great apes is lacking. In this study, potential HAdV-B members of wild Eastern gorillas were analysed for evidence of recombination. One near-complete genome wa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Bartonella includes numerous species with varied host associations, including several that infect humans. Development of a molecular diagnostic method capable of detecting the diverse repertoire of Bartonella species while maintaining genus specificity has been a challenge. We developed a novel real-time PCR assay targeting a 301-bp region of the ssrA gene of Bartonella and demonstrated specific amplification in over 30 Bartonella species, subspecies, and strains. Subsequent analysis of ssrA sequences was sufficient to discriminate Bartonella species and provided phylogenetic data co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One hundred and twenty-four rabies viruses (RABV) were isolated from humans and eight species of mammals in Colombia during 1994-2005. To determine the genetic and reservoir-associated diversity cDNA fragments encoding 88 amino acids at the carboxyl terminus of the nucleoprotein were sequenced and used in phylogenetic analyses. Eight genetic lineages (GL) were characterized. GL1, GL2 and GL3 consisted of dog-associated antigenic variant (AV) 1 RABV, isolated in the centre-east, north and southwest of Colombia, respectively. GL1 is apparently extinct in Colombia. The GL4 were AV3, AV8 and non-d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schaaf-Yang syndrome and Prader-Willi syndrome are imprinting disorders that result from the disruption of paternally expressed genes within the 15q11-q13 region. Both conditions present with overlapping clinical features including developmental delay, hypotonia and endocrine abnormalities. Schaaf-Yang syndrome specifically results from heterozygous variants in the paternally expressed MAGEL2 gene. Because these variants are often de novo, determining that the variant is on the paternal allele is essential for a definitive diagnosis. Traditional methods, such as methylation-specific PCR, are l
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Послепереходные модификации (ПТМ) играют центральную роль в регулировании ячеек и связаны с многочисленными заболеваниями. Поиск баз данных остается стандартом для идентификации модифицированных пептидов с тандемных масс-спектр, но затрудняется комбинаторным расширением типов модификаций и участков. Последовательность действий De novo peptide является привлекательной альтернативой, однако существующие методы по-прежнему ограничиваются немодифицированными пептидами или узким набором PTM. Здесь мы закачали большой набор спектральных данных из эндогенных и синтетических пептидов из Протеоме-Тул,
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Transient S-sulfenylation of cysteine thiols mediated by reactive oxygen species plays a critical role in pathology, physiology and cell signaling. Therefore, discovery of new S-sulfenylated sites in proteins is of great importance towards understanding how protein function is regulated upon redox conditions.
RESULTS: We developed PRESS (PRotEin S-Sulfenylation) web server, a server which can effectively predict the cysteine thiols of a protein that could undergo S-sulfenylation under redox conditions. We envisage that this server will boost and facilitate the discovery of new and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia-telangiectasia is a multisystemic disease with severe neurological affectation, immunodeficiency and telangiectasia. The disorder is caused by alterations in the ATM gene, whose size and complexity make molecular diagnosis difficult. We designed a target-enrichment next-generation sequencing strategy to characterize 28 patients from several regions of Spain. This approach allowed us to identify gene variants affecting function in 54 out of the 56 alleles analyzed, although the two unresolved alleles belong to brothers. We found 28 ATM gene mutations, of which 10 have not been reported.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper studies a full nucleotide sequence of cryptic plasmid pTP33, which was isolated from the typical plague strain of the Tuvinian natural focus, Yersinia pestis I-2638. Sequencing was carried out using the 454 GS Junior platform (Roche). In analysis using the software package GS De Novo Assembler v. 2.7 (Roche) and the algorithm Newbler v. 2.7, 1855 nucleotide reads, which contained 1101246 nucleotides, were assembled to a contig of 33 978 bp. The GC content of the obtained nucleotide sequence was 50.25%. During annotation, we found 56 open reading frames. Homologs of the predicted rea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Metagenomics enables comprehensive exploration of microbial communities but is influenced by library preparation and sequencing technologies, affecting recovery of microbial genomes and proteins. Here, we benchmarked six Illumina-compatible short-read library preparation conditions in triplicate at 2 × 150 bp and 2 × 250 bp read lengths alongside PacBio HiFi long-read sequencing using a composite environmental sample of marine mangrove sediment and terrestrial palm tree soil. Longer short reads (2 × 250 bp) combined with optimal library preparation approaches improved assembly qual
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of the present study was to analyze the clinical phenotypes of a girl with oculo-facio-cardio-dental (OFCD) syndrome and to identify the potential pathogenic mutation responsible for her disease. The patient underwent detailed clinical examinations and phenotype data were collected over a follow-up period of 9 years. Mutation analysis of the candidate gene BCOR was performed with polymerase chain reaction and Sanger sequencing. BCOR of 60 unrelated normal individuals were also sequenced as a control group. Clinical phenotyping and follow-up study results indicate that this patient
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmodium falciparum is the parasite responsible for the most lethal form of malaria, an infectious disease that causes a large proportion of childhood deaths and poses a significant barrier to socioeconomic development in many countries. Although antimalarial drugs exist, the repeated emergence and spread of drug-resistant parasites limit their useful lifespan. An alternative strategy that could limit the evolution of drug-resistant parasites is to target host factors that are essential and universally required for parasite growth. Host-targeted therapeutics have been successfully applied in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования