BACKGROUND: Roberts syndrome (RBS) is a rare autosomal recessive disorder caused by variations in the ESCO2 gene; however, prenatal diagnosi … ypic characteristics of this case were strongly suspected to be associated with RBS. Finally, whole exome sequence analysis revealed the insertion of a homozygous base pair in exon 6 of the ESCO2 gene (NM_001017420.3, c.1111insA, NP_001017420.1, p.Thr371fs). Both of the couples were heterozygous carriers for this variant.
CONCLUSION: We are the first t …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TRIP4 is one of the subunits of the transcriptional coregulator ASC-1, a ribonucleoprotein complex that participates in transcriptional coactivation and RNA processing events. Recessive variants in the TRIP4 gene have been associated with spinal muscular atrophy with bone fractures as well as a severe form of congenital muscular dystrophy. Here we present the diagnostic journey of a patient with cerebellar hypoplasia and spinal muscular atrophy (PCH1) and congenital bone fractures. Initial exome sequencing analysis revealed no candidate variants. Reanalysis of the exome data by inclusion in th…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carcinoma showing thymus-like differentiation (CASTLE) is a rare tumor, especially in the parotid gland. We encountered a CASTLE of the parotid gland and analyzed its clinicopathological features, as well as the genotype using whole exome sequencing (WES). Moreover, we successfully established an organoid culture cell line from the primary tumor tissue. The patient was a 23-year-old woman who underwent superficial parotidectomy with peripheral neck dissection, followed by radiotherapy. Pathologically, the resected specimen showed atypical epithelioid nests and trabeculae with squamous differen…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Causative variants in genes of the EDA/EDAR/NF-κB pathway, such as EDA and EDARADD, have been widely identified in patients with non-syndromic tooth agenesis (NSTA). However, few cases of NSTA are due to ectodysplasin-A receptor (EDAR) variants. In this study, we investigated NSTA-associated variants in Chinese families.
METHODS: Peripheral blood samples were collected from the family members of 24 individuals with NSTA for DNA extraction. The coding region of the EDA gene of the 24 probands was amplified by PCR and sequenced to investigate new variants. Whole-exome sequencing and…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary immunodeficiency disorders (PIDs) are inborn errors of immunity (IEI) that cause immune system impairment. To date, more than 400 single-gene IEI have been well defined. The advent of next generation sequencing (NGS) technologies has improved clinical diagnosis and allowed for discovery of novel genes and variants associated with IEI. Molecular diagnosis provides clear clinical benefits for patients by altering management, enabling access to certain treatments and facilitates genetic counselling. Here we report on an 8-year experience using two different NGS technologies, namely resear
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetics of autosomal recessive intellectual disability (ARID) has mainly been studied in consanguineous families, however, founder populations may also be of interest to study intellectual disability (ID) and the contribution of ARID. Here, we used a genotype-driven approach to study the genetic landscape of ID in the founder population of Finland. A total of 39 families with syndromic and non-syndromic ID were analyzed using exome sequencing, which revealed a variant in a known ID gene in 27 families. Notably, 75% of these variants in known ID genes were de novo or suspected de novo (64%…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Degenerative lumbar spinal stenosis (DLSS) is a common lumbar disease that requires surgery. Previous studies have indicated that genetic mutations are implicated in DLSS. However, studies on specific gene mutations are scarce. Whole-exome sequencing (WES) is a valuable research tool that identifies disease-causing genes and could become an effective strategy to investigate DLSS pathogenesis.
METHODS: From January 2016 to December 2017, we recruited 50 unrelated patients with symptoms consistent with DLSS and 25 unrelated healthy controls. We conducted WES and exome data analysis …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim of this study was to explore the genetic basis of non-syndromic tooth agenesis (TA) in a Chinese family of five individuals using whole-exome sequencing (WES) analysis.
SETTINGS AND SAMPLE POPULATION: Five participants/Family-based study of a non-syndromic TA proband.
METHODS: The proband, proband's mother and grandmother displayed congenital tooth deficiency. Genomic DNA was extracted from the peripheral blood or saliva samples of the proband, her parents and her grandmother, and WES was utilized to identify the causal genetic mutation. The identified mutation was further…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Pregnancy loss ranging from spontaneous abortion (SAB) to stillbirth can result from monogenic causes of Mendelian inheritance. This study evaluated the clinical application of exome sequencing (ES) in identifying the genetic etiology for pregnancy loss.
METHODS: A cohort of 102 specimens from products of conception (POC) with normal karyotype and absence of pathogenic copy-number variants were selected for ES. Abnormality detection rate (ADR) and variants of diagnostic value correlated with SAB and stillbirth were evaluated.
RESULTS: ES detected 6 pathogenic variants, 16 likely pat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND The pathogenesis of sporadic multiple meningiomas in the patients without history of neurofibromatosis type II remains unclear. We report whole exome sequencing (WES) of 2 metachronous multiple meningiomas of the same patient. CASE REPORT A 39-year-old female had a 5-month history of headache and her magnetic resonance imaging (MRI) revealed a significantly enhanced intracranial space-occupying pathology with dura tail sign and skull invasion. She had no history of neurofibromatosis type II or other tumors. Tumor resection achieved Simpson grade I and the pathological studies reveal…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The comparison of the landscape of somatic alterations in circulating tumor cells (CTCs) versus metastases is challenging. Here, we comprehensively characterized the somatic landscape in bulk (amplified and non-amplified), spike-in breast cancer cells, CTCs, and metastases from breast cancer patients using whole-exome sequencing (WES). We determined the level of genomic concordance for somatic nucleotide variants (SNVs), copy number alterations (CNAs), and structural variants (SVs). The variant allele fractions (VAFs) of somatic variants were remarkably similar between amplified and non-amplif…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Primary CoQ deficiency occurs because of the defective biosynthesis of coenzyme Q, one of the key components of the mitochondrial electron transport chain. Patients with this disease present with a myriad of non-specific symptoms and signs, posing a diagnostic challenge. Whole-exome sequencing is vital in the diagnosis of these cases.
CASE: Three unrelated cases presenting as either encephalopathy or cardiomyopathy have been diagnosed to harbor a common pathogenic variant c.370G > A in COQ4. COQ4 encodes a key structural component for stabilizing the multienzymatic CoQ biosynthesi…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute disseminated encephalomyelitis is generally preceded by an infection, and it is usually self-limiting and non-recurrent. H … ays preceded by autoinflammatory manifestations and without evidence of infectious processes. Whole exome sequencing was performed, and although the results were not conclusive, we found variants in genes associated with both autoinflammatory (NLRP12) and neurological (POLR3A) phenotypes that could be related to the disease pathogenesis having a polygen …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alport syndrome (AS) is a rare hereditary disease that presents with chronic kidney disease and sensorineural hearing loss, and is diagnosed … microscopy and extensive thinning of the glomerular basement membrane on electron microscopy. Whole-exome analysis revealed a known COL4A4 (type IV collagen α4) mutation (c. 2510 G > C: p. Gly837Ala). Two pedigrees with the same variant have been reported previously, one as ADAS and the other as autosomal recessive AS. However, these two cases exhibited …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic alterations in familial intestinal gastric cancer (FIGC) have not been clearly understood. Aiming to explore the molecular basis and the driving mutations underlying the pathogenesis of FIGC, we performed exome sequencing of the blood samples of the members of an extended family with FIGC. The differences in mutation patterns between family members with gastric cancer and controls were analysed and the overlapped variants were screened by comparing previously published data for blood and tumours from gastric cancer patients. The overlapped genes harbouring insertions‑deletions (IND…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next generation sequencing (NGS) technologies reshape the diagnostics of rare neurological diseases. In the background of certain neurological symptoms, such as ataxia, many acquired and genetic causes may be present. Variations in a given gene can present with variable phenotypes, too. Because of this phenomenon, the conventional one gene sequencing approach often fails to identify the genetic background of a disease. Next generation sequencing panels allow to sequence 50-100 genes simultaneously, and if the disease stratification is not possible based on the clinical symptoms, whole exome se…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To determine the diagnostic yield of combined exome sequencing (ES) and autopsy in fetuses/neonates with prenatally identified structural anomalies resulting in termination of pregnancy, intrauterine, neonatal, or early infant death.
METHODS: ES was undertaken in 27 proband/parent trios following full autopsy. Candidate pathogenic variants were classified by a multidisciplinary clinical review panel using American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) guidelines.
RESULTS: A genetic diagnosis was established in ten cases (37%). Pathogenic/likely pathogenic variants were ide…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Visceral leishmaniasis (kala-azar, KA) is the most severe form of leishmaniasis, characterized by fever, weight loss, hepatosplenomegaly, and lymphadenopathy. During an outbreak of KA in Babar El Fugara (Sudan), 5.7% of cured patients displayed relapses, with familial clustering in half the cases.
METHODS: We performed whole-exome sequencing on 10 relapsing individuals and 11 controls from 5 nuclear families.
RESULTS: Rare homozygous and compound-heterozygous nonsense (c.1213C > T, rs139309795, p.Arg405*) and missense (c.701A > G, rs143439626, p.Lys234Arg) mutations of the alkylg…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.