Recent evidence suggests a genetic component to oxygen-induced retinopathy (OIR), a robust experimental model of human retinopathy of prematurity. OIR lends itself well to quantitative analysis of gene expression in rodents with well-defined genetic backgrounds. Such analysis by real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) requires the use of reference genes as internal standards for purposes of normalization. We sought to identify housekeeping genes showing stable retinal expression across different rat strains and developmental stages, that were not regulated by oxygen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: V gene segments of the T cell receptor (TCR) β chain (TRBV) are crucial for antigen recognition, yet previous studies have treated them as fixed categories and neglected repertoire-specific immune dynamics that inform functional diversity.
METHODS: We introduce ClareV, a contrastive learning framework that partitions T cell receptor repertoires into V gene-specific groups to extract data-driven embeddings capturing these dynamics. We evaluated ClareV across three TCR repertoire cohorts spanning cytomegalovirus (CMV), gastric cancer, and multi-cancer settings.
RESULTS: In the Emer
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) co-opts and interacts with an extensive array of host factors for productive infection. Herein, we develop an HBV reporter virus expressing red fluorescent protein (HBV-RFP) that is suitable for a CRISPR-based genome-wide screen for HBV host dependency factors. HepG2NTCP/Cas9 cells were transduced with a pooled lentiviral library of single-guide RNA (sgRNA) targeting 19,114 human genes, edited and infected with HBV-RFP. RFP-low cells were sorted using fluorescence-activated cell sorting. The sorted cells were expanded and underwent two additional rounds of infection and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invertebrate host–parasite associations are one of the keystones in order to understand vector-borne diseases. The study of these specific interactions provides information not only about how the vector is affected by the parasite at the gene-expression level, but might also reveal mosquito strategies for blocking the transmission of the parasites. A very well-known vector for human malaria is Anopheles gambiae. This mosquito species has been the main focus for genomics studies determining essential key genes and pathways over the course of a malaria infection. However, to-date there is an imp
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The assembly of primordial follicles in mammals represents one of the most critical processes in ovarian biology. It directly affects the number of oocytes available to a female throughout her reproductive life. Premature depletion of primordial follicles contributes to the ovarian pathology primary ovarian insufficiency (POI). To delineate the developmental trajectory and regulatory mechanisms of oocytes during the process, we performed RNA-seq on single germ cells from newborn (P0.5) ovaries. Three cell clusters were classified which corresponded to three cell states (germ cell cyst, cyst br
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-cell lymphotropic virus (HTLV-1) and bovine leukemia virus (BLV) are oncogenic deltaretroviruses, which are the cause of adult T cell leukemia/lymphoma (ATLL) and enzootic bovine leukosis (EBL), respectively. In this study, to evaluate the virus-host interactions in the manifestation of the associated malignancy, four pooled RNA samples of each host (three RNAs in each sample) were applied to RNA-seq. Differential expression analyses were conducted separately between ATLL and EBL groups, in comparison with the healthy group, to identify functional Gene Ontology (GO) terms and hub genes
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Podocyte function is tightly linked to the complex organization of its cytoskeleton and adhesion to the underlying glomerular basement membrane. Adhesion of cultured podocytes to a variety of substrates is reported to correlate with podocyte health. To identify novel genes that are important for podocyte function, we designed an in vitro genetic screen based on podocyte adhesion to plates coated with either fibronectin or soluble Fms-like tyrosine kinase-1 (sFLT1)/Fc. A genome-scale pooled RNA interference screen on immortalized human podocytes identified 77 genes that increased adhesion to fi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin D receptor (VDR) gene polymorphisms and the risks for various breast and ovarian cancers have been reported in many epidemiological studies. However, the associations between VDR gene polymorphisms and the risk for each type of cancer are unclear. The aim of this meta-analysis was to evaluate the associations between VDR gene polymorphisms and female reproductive cancers. A systematic review was performed with the PubMed Science Direct, Scopus, and Google Scholar databases up to April 2014 using the search terms "vitamin D receptor or VDR" and "variant or polymorphism or SNP" with term
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epidemiological studies have evaluated the association between Apolipoprotein E (APOE) gene ε2/ε3/ε4 polymorphism and glaucoma susceptibility. However, the published data are still inconclusive. The aim of the present study is to evaluate the impact of APOE gene ε2/ε3/ε4 polymorphism on glaucoma risk by using meta-analysis.
METHODS: A comprehensive literature search of PubMed, EMBASE, Cochrane, Elsevier Science Direct and CNKI databases was conducted to identify relevant articles, with the last report up to January 5, 2014. Pooled odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) w
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetical genomics has been suggested as a powerful approach to study the genotype-phenotype gap. However, the relatively low power of these experiments (usually related to the high cost) has hindered fulfillment of its promise, especially for loci (QTL) of moderate effects.One strategy with which to overcome the issue is to use a targeted approach. It has two clear advantages: (i) it reduces the problem to a simple comparison between different genotypic groups at the QTL and (ii) it is a good starting point from which to investigate downstream effects of the QTL. In this study, from 698 F2 bi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Characterization of anemia in horses presents a challenge, as they do not release reticulocytes into peripheral blood. Transferrin receptor (TfR) expression is highest on erythroid cells in people and rats, and measurement of a soluble serum form (sTfR) is used to quantify erythropoiesis in these species. We hypothesized that equine TfR (eTfR) expression is similar in quantity and distribution to that in these other species and thus has potential for characterization of the regenerative response in anemic horses.
OBJECTIVE: This study was conducted to clone and sequence the eTfR g
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To determine the effects of prostaglandin F(2alpha) analogues on gene expression of human ciliary muscle (HCM) and trabecular meshwork (HTM) cells.
METHODS: Cultures of HCM and HTM cells were established from five different donors treated for 9 days with 10 microg/mL of either latanoprost (free acid) or prostaglandin F(2alpha) ethanolamide and compared with control cells. The mRNA from the cells of the five individual donors was pooled and analyzed by using gene microarrays. Gene expression changes were confirmed by either real-time PCR or relative quantitative PCR.
RESULTS: Approxi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tick-borne viruses (TBVs) include the highly pathogenic viruses associated with infectious diseases in both humans and animals. The global public health concern of TBVs is closely related to geographic distribution of ticks. In Africa, a variety of TBVs have been reported by detections from ticks and high seroprevalence in humans and domestic animals. In this study, we aimed to detect TBVs from ticks in Kenya by targeting viral genes of Orthoflavivirus, Bandavirus and Orthonairovirus. Ticks were collected from cattle, camels, sheep and goats in Isiolo, Narok and Baringo counties, and viral RNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In settings of persistent (self or foreign) antigen, such as autoimmunity and chronic infection, immune responses are sustained by stem-like T cells. Although TCF1 has emerged as a key transcription factor (TF) associated with stemness, the TCF1hi population is heterogeneous, raising the question of whether TCF1 exclusively defines the stem T cell (TSC) pool. Using preclinical models of autoimmune type 1 diabetes and chronic infection, we discover that a small subset of TCF1hi T cells express the TF LEF1. LEF1+ TCF1hi T cells define a true self-renewing TSC pool. TSC give rise to LEF1- TCF1hi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inositol pyrophosphates (PP-InsPs) are nutrient messengers whose cellular levels are precisely regulated. Diphosphoinositol pentakisphosphate kinases (PPIP5Ks) generate the active signaling molecule 1,5-InsP8. PPIP5Ks harbor phosphatase domains that hydrolyze PP-InsPs. Plant and Fungi Atypical Dual Specificity Phosphatases (PFA-DSPs) and NUDIX phosphatases (NUDTs) are also involved in PP-InsP degradation. Here, we analyze the relative contributions of the three different phosphatase families to plant PP-InsP catabolism. We report the biochemical characterization of inositol pyrophosphate phosp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune hepatitis (AIH) is an immune disorder characterized by hypergammaglobulinemia, autoantibodies, and chronic active hepatitis on liver histology. However, immune cell population characteristics in AIH patients remain poorly understood. This study was designed to analyze peripheral blood mononuclear cell (PBMC) characteristics in AIH through single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and explore potential AIH-related molecular mechanisms. We generated 3690 and 3511 single-cell transcriptomes of PBMCs pooled from 4 healthy controls (HCs) and 4 AIH patients, respectively, by scRNA-seq. These
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We examined the composition and spatial correlation of sulfur and mercury pools in peatland soil profiles by measuring sulfur speciation by 1s X-ray absorption near-edge structure spectrocopy and mercury concentrations by cold vapor atomic fluorescence spectroscopy. Also investigated were the methylation/demethylation rate constants and the presence of hgcAB genes with depth. Methylmercury (MeHg) concentration and organic disulfide were spatially correlated and had a significant positive correlation (p < 0.05). This finding is consistent with these species being products of dissimilatory sulfa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulation of bile acid metabolism is normally discussed as the regulation of bile acid synthesis, which serves to compensate for intestinal loss in order to maintain a constant pool size. After a meal, bile acids start cycling in the enterohepatic circulation. Farnesoid X receptor-dependent ileal and hepatic processes lead to negative feedback inhibition of bile acid synthesis. When the intestinal bile acid flux decreases, the inhibition of synthesis is released. The degree of inhibition of synthesis and the mechanism and degree of activation are still unknown. Moreover, in humans, a biphasic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several observational studies have examined vitamin D pathway polymorphisms and their association with type 1 diabetes (T1D) susceptibility, with inconclusive results. We aimed to perform a systematic review and meta-analysis assessing associations between selected variants affecting 25-hydroxyvitamin D [25(OH)D] and T1D risk. We conducted a systematic search of Medline, Embase, Web of Science and OpenGWAS updated in April 2021. The following keywords "vitamin D" and/or "single nucleotide polymorphisms (SNPs)" and "T1D" were selected to identify relevant articles. Seven SNPs (or their proxies)
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The association between polymorphisms in vitamin D-binding protein (DBP) gene and the risk of multiple sclerosis (MS) and type 1 diabetes mellitus (T1DM) has been investigated in many studies, but the studies showed controversial results. The rationale for this meta-analysis was to determine whether DBP polymorphisms increases the risk of MS and T1DM by pooling data.
METHODS: Potentially relevant studies were searched using GWAS Catalog, PubMed, Embase, CNKI and WANFANG databases up to November 2019. The pooled odds ratios (ORs) and corresponding 95% confidence intervals (CIs) wer
СтатьяМетаанализСистематический обзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования