BACKGROUND: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) exhibits heterogeneous therapeutic outcomes owing to various tumor microenvironments (TMEs). Previous studies have classified OSCC according to its molecular characteristics; however, clinical practice is limited by technical complexity.
METHODS: A total of 33 patients from five single-cell datasets of primary OSCC were integrated for CMS classification. The correlation between CMS classification and prognosis was analyzed with integrated bulk transcriptomics. Top scoring pairs (TSPs) algorithm was used to identify the gene pair that effectively
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric adenocarcinoma is a significant global health concern. Among the myriad histologic classification methods for this cancer, the Lauren classification stands out as a pivotal tool. Nonetheless, the precision and detail of current histological staging techniques frequently face scrutiny. Utilizing high-resolution single-cell transcriptomic data, this research delves into the distinctive gene expression patterns in diffuse, intestinal, and mixed gastric cancers by deploying various machine learning algorithms. The main goal was to recognize important gene markers and establish efficient cl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is counted among the most widespread malignancies worldwide, characterised by elevated incidence and mortality rates. Conventional chemotherapy is frequently associated with severe toxic side effects and the development of drug resistance, which necessitates an urgent search for alternative therapeutic modalities. Traditional Chinese medicine (TCM), distinguished by its multi-component and multi-target synergistic actions, represents a promising prospect for the development of innovative anti-tumour therapies. Nitidine chloride (NC), a major bioactive component isolated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Glioblastomas (GBMs) are aggressive primary brain tumors characterized by immune evasion and therapeutic resistance. Here, we aimed to decipher the transcriptional landscape of disease aggressiveness in GBM by employing a multi-layered transcriptomic approach.
MATERIALS AND METHODS: We performed transcriptome-wide differential expression analysis using TCGA IDH-wildtype GBM data after stratifying the tumors based on epithelial-mesenchymal transition (EMT) signature scores. Functional and pathway enrichment analyses, STRING-based protein-protein interaction (PPI) network assist
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The differentiation status of thyroid cancer (THCA) is closely associated with prognosis; however, the underlying molecular regulatory mechanisms remain incompletely understood. This study aimed to identify hub genes associated with THCA differentiation based on progression-free interval (PFI)-related genes and to explore the underlying mechanisms. The common database datasets were integrated to identify differentially expressed genes, and univariate Cox regression analysis was performed to determine PFI-related genes. Molecular subtypes were constructed using consensus clustering based on PFI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cutaneous melanoma is an aggressive malignancy characterized by a high metastatic potential and variable response to immune checkpoint blockade (ICB). The extracellular matrix protein proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP), an extracellular matrix protein, contributes to stromal architecture and tumor-immune interactions. This study investigated whether PRELP expression drives transcriptomic remodeling, alternative splicing, interferon (IFN)-related signaling pathways to influence immunotherapy responsiveness in melanoma.
METHODS: Bulk RNA sequencing was per
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Understanding the molecular features that underlie metastatic prostate cancer (PCa) is essential to develop prognostic markers and improve treatment decisions. However, such studies are hampered by substantial intratumor and interpatient heterogeneity. METHODS: To cope with this heterogeneity, we propose a unique study design that leverages the statistical power of multifocal bulk transcriptome profiling with the resolution of a single-cell analysis to identify processes and cell types associated with regional metastatic lymph node seeding in PCa. RESULTS: Elaborate analysis of the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among adoptive immune cell therapies, cytokine-induced killer cell (CIK) therapy has demonstrated clear therapeutic relevance in multiple cancers, particularly clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). Despite being clinically successful, the molecular signatures associated with the immune-regulatory role of these CIK cells in cancers remain elusive. Considering this, we systematically identified CIK expansion-induced genes (CIK-EIGs) from their transcriptome profiles and curated the CIK-EIG-anchored transcriptome framework across bulk and single-cell ccRCC datasets. Using comprehensive bioinfo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC) shows substantial prognostic heterogeneity, motivating robust transcriptome-based risk stratification. Ferroptosis, cuproptosis and disulfidptosis are distinct stress-related cell-death programs whose gene-expression patterns may capture diverse tumour states. Using TCGA-KIRC RNA-seq data (n=533), tumour samples were randomly split 1:1 into a training set (n=267) and an independent test set (n=266); In the training cohort, lncRNAs associated with curated genes for each programmed cell death (PCD) modality were screened using EPIC-adjusted partial Spearm
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuro-immune interactions are critical in cancer, yet their molecular features in bladder cancer remain unclear. We analyzed transcriptomic data from TCGA and UCSC Xena to investigate the expression profiles and molecular subtypes of neuro-immune-related genes, and constructed a neuro-immune-related score (NAS) model. Single-cell transcriptomic data were integrated to explore the immune microenvironmental features, and functional validation was performed by knocking down SERPINE2 with shRNA in T24 cells. The results showed that six core genes (SERPINE2, NXPH4, SERPINB2, C2orf40, SERPINB12, SER
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer (BLCA) is a common urinary tract malignancy with significant global burden, yet the prognostic relevance of dietary restriction-related genes (DRRGs) in BLCA remains unclear.
METHODS: Prognostic DRRGs in BLCA were identified based on publicly available databases by differential expression analysis, univariate Cox regression analysis, Mendelian randomization (MR) analysis and LASSO regression analysis. A risk model was built and evaluated, after which a nomogram was established and assessed by using the risk score and clinical characteristics. Following this, analysi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metastasis and poor chemotherapy response have stagnated therapeutic progress in osteosarcoma (OS) for the past three decades. Defining the transition from localized to metastatic OS before overt dissemination is fundamental for improving survival. However, effective early diagnostic tools remain scarce, largely due to limited exploitation of the metastasis-associated tumor microenvironment's own record of prior environmental and stress exposures encoded in cell-intrinsic transcriptional states. Here, we employed a supervised machine learning framework with iterative resampling and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico2026eng
BACKGROUND: Endometrial cancer (EC) is a common gynecological tumor. Insulin resistance (IR) increases the risk of EC. However, the common molecular basis between the two remains unclear. This study aims to screen the common differential expression genes (DEGs) between the two diseases and construct a prognostic risk model.
METHODS: We obtained gene expression profiles and clinical information of patients with IR and EC from GEO and TCGA datasets. We performed differential analysis to discover the shared DEGs between IR and EC. Subsequently, the interactions among overlapping DEGs, along with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung adenocarcinoma (LUAD) is characterized by complex immune microenvironments that modulate disease progression and response to therapy. CD4⁺ naïve T cells are traditionally considered precursors of effector T cells, yet their functional states within LUAD remain poorly defined. We integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from LUAD tumor and distal normal tissues with bulk RNA-seq datasets (GSE159857 and TCGA-LUAD) to characterize CD4⁺ naïve T cell heterogeneity. Subclustering, trajectory analysis, cell-cell communication inference, and transcription factor network analysis wer
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Pancreatic neuroendocrine tumors (PNET) are rare malignancies of the endocrine pancreas with diverse clinical outcomes. Whereas some PNETs are indolent, others are aggressive and metastasize quickly. However, clinically relevant molecular stratification for PNET to predict outcomes and guide therapeutic decision-making is limited. Thus, there is an urgent need to understand the molecular heterogeneity of PNETs to refine prognostication and discover novel therapeutic vulnerabilities.
EXPERIMENTAL DESIGN: We performed single-nucleus RNA sequencing on untreated, resected primary, and me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pre-malignant precursor to oesophageal adenocarcinoma (OAC), Barrett's oesophagus (BO), is prevalent in 10-15% of patients with chronic gastroesophageal acid reflux. However, in most cases, the BO condition is stable to cancer promotion; i.e. less than 1% of patients develop OAC. Here, we investigate whether there are factors that can act to prevent BO patients from developing OAC. The receptor tyrosine kinase, cKIT, is expressed in Barrett's tissue, but sparingly so in either normal or OAC tissue. To investigate whether cKIT influences cellular function that might be consistent with susta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Estrogen receptor (ER)-positive breast cancer (BrCa) accounts for two-thirds of all BrCa cases worldwide. Therefore, ER-targeted endocrine therapy is the standard treatment for this disease. There has been a recent trend towards developing combination therapies using molecularly targeted drugs to improve outcomes. This study aimed to identify therapeutic targets demonstrating efficacy when combined with fulvestrant (a selective ER downregulator/degrader). We generated microRNA (miRNA) signatures from fulvestrant-treated MCF-7 cells by RNA sequencing. From the signature, we evaluated miR-374b-5
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives: Cervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma (CESC) necessitate the discovery of novel biomarkers for prognostic and therapeutic advancement. This study aims to evaluate the clinical significance of ubiquitin-conjugating enzyme E2C (UBE2C) and its association with the tumor microenvironment (TME) in CESC. Methods: We meticulously sourced CESC data from renowned repositories such as The Cancer Genome Atlas (TCGA), Genotype-Tissue Expression (GTEx), and Gene Expression Omnibus (GEO), leveraging cutting-edge techniques including single-cell RNA sequencing (scRNA-se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonsmall cell lung cancer (NSCLC) is characterized by substantial heterogeneity in driver mutation backgrounds and tumor microenvironment (TME) phenotypes, yet the transcriptional regulatory states linking genotype context to immune-stromal variation remain incompletely defined. In this study, we integrated mutation, transcriptomic, and clinical data from TCGA-LUAD/LUSC to construct a mutation-expression-matched NSCLC cohort and evaluated RUNX1 as a mutation context-associated transcriptional/regulatory state rather than as a recurrently mutated driver. Driver contexts were assessed using a pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common primary liver malignancy and remains a major cause of cancer-related mortality worldwide. Its poor clinical outcomes are largely attributed to late-stage diagnosis and the limited accuracy of currently available diagnostic and prognostic biomarkers. Therefore, identifying novel molecular markers with improved sensitivity, specificity, and therapeutic relevance is essential for enhancing early detection and guiding personalized treatment strategies.
AIMS: To identify and prioritize novel candidate HCC biomarkers with diagnostic and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования