Lawsonia intracellularis (LI), Brachyspira hyodysenteriae (Bhy), and Clostridium perfringens (Cp) are three common swine enteric pathogens widespread worldwide, leading to huge economic losses to the pig industry. LI, Bhy, and Cp are co-infected and should not be distinguished, and the detection of bacterial nucleic acids in feces allows rapid identification of whether a herd is infected with these three pathogens. In this study, we developed and optimized a TaqMan triple quantitative real-time PCR (qPCR) method for LI, Bhy, and Cp, which was validated and applied to the analysis of actual sam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feline infectious peritonitis (FIP) is a fatal disease in cats that is caused by feline coronavirus (FCoV). FCoV RT-qPCR is widely used to diagnose FIP due to its high sensitivity and ability to quantify FCoV RNA. However, its convenience is limited by the need for expensive equipment and/or processing at external laboratories. We herein developed two rapid and simple FCoV RNA detection systems: one combining conventional RT-PCR with the Single Tag Hybridization-Printed Array Strip (STH-PAS) method (the RT-PCR and STH-PAS system) and the other combining RT-RPA, an isothermal nucleic acid ampli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine immunodeficiency virus (BIV) and bovine leukemia virus (BLV) are retroviruses infecting cattle, with BLV being a known cause of enzootic bovine leukosis. In contrast, BIV is considered non-pathogenic and has been less studied, despite its relevance to animal lentiviral evolution. This study aimed to develop and validate a multiplex real-time PCR assay for simultaneous detection of BIV proviral DNA and quantification of BLV proviral load. Novel primers and probes targeting the BIV pol gene were designed. The assay demonstrated a detection limit of 10 copies per reaction with a probabilit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma contamination poses a persistent challenge in cell culture systems and the production of cell-derived biological products, including vaccines and therapeutic drugs. Current detection methods suffer from several limitations: they risk false-negative results due to incomplete species coverage, exhibit high detection limits in molecular assays, and prove time-consuming while lacking sensitivity for certain fastidious mycoplasma species that grow poorly in vitro, as outlined in pharmacopeial testing standards. To address these issues, we developed three improved detection methods-PCR, e
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A sustained outbreak of H5N1 influenza virus among wild fowl and domestic livestock has caused more than 70 zoonotic infections in humans in North America, including two deaths. The United States Centers for Disease Control and Prevention has recommended rapid H5 subtyping for all hospitalized cases with influenza A virus infection to enable prompt initiation of antiviral treatment, as well as infection prevention and implementation of public health measures to control spread. To address these needs, we developed a qualitative multiplex RT-qPCR assay to subtype H5 influenza virus in nasal, nas
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yellow fever is an infectious disease preventable by vaccination. The vaccine is composed of a live attenuated virus that, in some cases, may lead to adverse events, as neurological or viscerotropic disease. The differentiation between serious adverse vaccine events and natural infection by yellow fever virus is essential, especially in yellow fever endemic areas. Here we describe a genotyping tool to distinguish the vaccine from wild-type viruses. Experimental assays confirmed the discrimination between South American I and vaccine viruses, but in silico analyses also show its potential to be
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: An eschar is not always present in all scrub typhus patients. Furthermore, such patients may present to tertiary care hospitals after administration of doxycycline. The present study aimed to determine the usefulness of using the swab from eschar sites in the diagnosis of scrub typhus in patients who present post-doxycycline therapy.
METHODS: Blood, eschar scraping and swab samples were collected daily until patient discharge/death. Real-time SYBR green PCR targeting the groEl gene, TaqMan probe PCR targeting the 47 kDa gene and nested PCR targeting the 56 kDa gene of Orientia tsu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT.—: Quantification and detection of the t(9;22) (BCR-ABL1) translocation in chronic myelogenous leukemia and B-lymphoblastic leukemia are important for directing treatment protocols and monitoring disease relapse. However, quantification using traditional reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) is dependent on a calibration curve and is prone to laboratory-to-laboratory variation. Droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) is a novel method that allows for highly sensitive absolute quantification of transcript copy number. As such, ddPCR is a good c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We compared the sensitivity and specificity of four commercial coronavirus disease (COVID-19) diagnostic kits using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Kits I-IV approved by the State Drug Administration of China were selected, and the detection targets were ORF1ab gene and N gene. Specificity was evaluated by detecting other respiratory viruses. The sensitivity and batch effect of each kit were evaluated by testing 10-fold dilutions of RNA. Clinical application was verified by testing nasopharyngeal swab and sputum specimens from COVID-19 patients. Among the 78
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives: This study evaluated the diagnostic performance of the eazyplex® SuperBug CRE (eSBCRE) system, based on a loop-mediated isothermal amplification (LAMP), for the detection of the most common extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) and carbapenemase genes in 140 clinical isolates of Escherichia coli. Materials and Methods: ESBL (blaCTX-M-1group and blaCTX-M-9group) and carbapenemase (blaKPC, blaVIM, blaNDM, blaOXA-48, and blaOXA-181) genes were detected using the eSBCRE test and compared with the results obtained by PCR, real-time PCR, and phenotypic methods. Results: Concordant res
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: FFPE samples represent a rich pool of tissue samples for retrospective analyses of mRNA and miRNA analyses. However, the initial formalin fixation introduces a chemical modification of RNA and causes its degradation, therefore, a longer storage of tissue in formalin is predicted to render ribonucleic acids lost for isolation and subsequent analyses.
METHODS: Herein, we tested the impact of several factors on isolation of total RNA and detection with RT-qPCR from mouse liver tissue stored for over two years in formalin at room temperature.
RESULTS: The incubation of tissue in TA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine respiratory disease complex (BRDC) is one of the most significant diseases of cattle. Bacterial pathogens involved in BRDC include Mannheimia haemolytica, Mycoplasma bovis, Histophilus somni, and Pasteurella multocida. We developed and evaluated a multiplexed real-time hydrolysis probe (rtPCR) assay using block-based Peltier and rotary-based thermocycling on lung tissue, nasal swabs, and deep nasopharyngeal swabs. The rtPCR results were compared to culture or a gel-based M. bovis PCR using statistical analysis to determine optimum quantification cycle (Cq) cutoffs to maximize agreement.
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: A molecular method for a rapid detection of viable Legionella pneumophila of all serogroups in tap water samples was developed as an alternative to the reference method (ISO). Legionellae are responsible for Legionnaires' disease, a severe pneumonia in humans with high lethality.
METHODS AND RESULTS: The developed method is based on a nutritional stimulation and detection of an increase in precursor 16S rRNA as an indicator for viability. For quantification, DNA was detected by qPCR. This method was compared to the ISO method using water samples obtained from public sports facilities in
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Influenza A viruses (IAVs) have always remain a serious concern for the global economy and public health. A rapid, specific and sensitive detection method is always needed to control the influenza in its early stages by timely intervention of therapy and early clinical management.
OBJECTIVES: To develop RT-LAMP assays for detection of influenza A viruses, their further subtyping into seasonal (H1N1, H3N2) and novel pandemic H1N1 viruses and to evaluate clinical applicability of optimized RT-LAMP assays on patients' samples.
STUDY DESIGN: In this study, we optimized RT-LAMP assay
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Zika virus (ZIKV) is an arbovirus that has spread rapidly worldwide within recent times. There is accumulating evidence that associates ZIKV infections with Guillain-Barré Syndrome (GBS) and microcephaly in humans. The ZIKV is genetically diverse and can be separated into Asian and African lineages. A rapid, sensitive, and specific assay is needed for the detection of ZIKV across various pandemic regions. So far, the available primers and probes do not cover the genetic diversity and geographic distribution of all ZIKV strains. To this end, we have developed a one-step quantitative reverse
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tyrosine kinase inhibitors (TKIs) are the cornerstone of successful clinical management of patients with chronic myeloid leukemia (CML). Quantitative monitoring of the percentage of the fusion transcript BCR-ABL1 (breakpoint cluster region-c-abl oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase) BCR-ABL1IS (%BCR-ABL1IS) by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is the gold standard strategy for evaluating patient response to TKIs and classification into prognostic subgroups. However, this approach can be challenging to perform in a reproducible manner. Reverse-transcription digita
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Abnormalities in ureteric bud (UB) branching morphogenesis lead to congenital anomalies of the kidney and reduced nephron numbers associated with chronic kidney disease (CKD) and hypertension. Previous studies showed that the epithelial fibroblast growth factor receptor 2 (Fgfr2) IIIb splice variant supports ureteric morphogenesis in response to ligands from the metanephric mesenchyme during renal organogenesis. The epithelial-specific splicing regulator Esrp1 is required for expression of Fgfr2-IIIb and other epithelial-specific splice variants. Our objective was to determine whet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Analysis of extracellular vesicles (EVs) derived from plasma or cerebrospinal fluid (CSF) has emerged as a promising biomarker platform for therapeutic monitoring in glioblastoma patients. However, the contents of the various subpopulations of EVs in these clinical specimens remain poorly defined. Here we characterize the relative abundance of miRNA species in EVs derived from the serum and cerebrospinal fluid of glioblastoma patients. EVs were isolated from glioblastoma cell lines as well as the plasma and CSF of glioblastoma patients. The microvesicle subpopulation was isolated by pelleting
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virus inactivation by chemical disinfectants is an important instrument for infection control in medical settings, but the mechanisms involved are poorly understood. In this study, we systematically investigated the effects of several antiviral treatments on hepatitis C virus (HCV) particles as model for enveloped viruses. Studies were performed with authentic cell culture-derived viruses, and the influence of chemical disinfectants, heat, and UV treatment on HCV was analyzed by the determination of infectious particles in a limiting-dilution assay, by quantitative reverse transcription-PCR, b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ureaplasma parvum, which has been recognised as a coloniser in the male urethra, is detected in some men with non-gonococcal urethritis. In this study, we quantified the 16 S rRNA genes of U. parvum by a real-time polymerase chain reaction-based assay in first-voided urine from 15 symptomatic and 38 asymptomatic men who were positive only for U. parvum. We also determined the leukocyte counts by automated quantitative urine particle analysis in their first-voided urine. Positive correlations were observed between copies of the 16 S rRNA genes of U. parvum/ml and the leukocyte counts/µl in firs…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования