An extensive computer-simulation study is performed on a simple but general molecular model recently proposed (Jørgensen et al. (1991) Biochem. Biophys. Acta 1062, 277-238) to describe foreign molecules interacting with lipid bilayers. The model is a multi-state lattice model of the main bilayer transition in which the foreign molecules are assumed to intercalate at interstitial lattice positions. Specific as well as non-specific interactions between the foreign molecules and the lipid acyl chains are considered. Particular attention is paid to the fluctuating properties of the membrane and ho…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the superselective, multivalent interactions that drive immunity, infection, and biosensing requires (i) model surfaces with precisely tunable receptor density and (ii) quantitative readouts. Here, we introduce a fully automated well-plate-based platform using cell-mimicking supported lipid bilayers (SLBs) that enables both requirements with standardized, commercially available equipment. We outline the main challenges associated with integrating liquid handling with the shear and disruption-sensitive SLB system and offer practical guidelines to overcome them. The resulting versa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the past decade, advancements in CryoEM have afforded significant insight into transmembrane regions of ion channels. Portions of cytosolic amino acids have been structurally and biophysically characterized; however, understanding structural relationships and how components integrate into a functional ion channel required clarification. Here, we have calculated an all-atom model for the complete sequence of the cardiac voltage-gated calcium ion channel (CaV1.2 alpha-1C and beta-3 subunits) in a lipid bilayer with explicit salt and water. Four one-microsecond molecular dynamics (MD) simu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
General anesthetics have revolutionized medicine by facilitating invasive procedures, and have thus become essential drugs. However, detailed understanding of their molecular mechanisms remains elusive. A mechanism proposed over a century ago involving unspecified interactions with the lipid bilayer known as the unitary lipid-based hypothesis of anesthetic action, has been challenged by evidence for direct anesthetic interactions with a range of proteins, including transmembrane ion channels. Anesthetic concentrations in the membrane are high (10-100 mM), however, and there is no experimental
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A biomimetic membrane consisting of a thiolipid monolayer tethered to a mercury electrode, with a dioleoylphosphatidylcholine (DOPC) monolayer on top of it, was fabricated. The thiolipid, referred to as DPOL, consisted of an octaethyleneoxy (OEO) chain terminated at one end with a lipoic acid residue and covalently linked at the other end to two phytanyl chains. The functionality of this biomimetic membrane, referred to as a tethered bilayer lipid membrane (tBLM), was tested by incorporating gramicidin and alamethicin and verifying their ion channel activity. Advantages and drawbacks with resp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dopamine transporter (DAT) operates via facilitated diffusion, harnessing an inward Na(+) gradient to drive dopamine from the extracellular synaptic cleft to the neuron interior. The DAT is relevant to central nervous system disorders such as Parkinson disease and attention-deficit hyperactivity disorder and is the primary site of action for the abused psychostimulants cocaine and amphetamines. Crystallization of a DAT homolog, the bacterial leucine transporter LeuT, provided the first reliable 3-D DAT template. Here, the LeuT crystal structure and the DAT molecular model have been combine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies of several ICK ion-channel blockers suggest that lipid bilayer interactions play a prominent role in their actions. Structural similarities led to the hypothesis that bilayer interactions are important for the entire ICK family. We have tested this hypothesis by performing direct measurements of the free energy of bilayer partitioning (DeltaG) of several peptide blockers using our novel quenching-enhanced fluorescence titration protocol. We show that various ICK peptides demonstrate markedly different modes of interaction with large unilamellar lipid vesicles. The mechanosensiti
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Didodecyldimethylammonium bromide (DDAB) lipid bilayer-protected gold nanoparticles (AuNPs), which were stable and hydrophilic, were synthesized by in situ reduction of HAuCl(4) with NaBH(4) in an aqueous medium in the presence of DDAB. As-prepared nanoparticles were characterized by UV-vis spectra, transmission electron microscopy, dynamic light scattering analysis, and X-ray photoelectron spectroscopy. All these data supported the formation of AuNPs. Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) and differential thermal analysis/thermogravimetric analysis data revealed that DDAB existed in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Caffeine (1,3,7-trimethylxanthine) is a widely consumed psychoactive drug and neurostimulant, yet its molecular organization and permeation behavior in lipid membranes are not fully understood. We employ microseconds-long, united-atom molecular dynamics simulations to investigate caffeine interactions with a solvated DPPC (1,2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphocholine) bilayer at its fluid phase. Caffeine molecules initially aggregate in the aqueous phase to form ordered stackings, which successively permeate into the membrane. The stacked assemblies gradually dissolve, reaching a stable dispers
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug studies targeting neuronal ion channels are crucial to understand neuronal function and develop therapies for neurological diseases. Th … rode arrays (OMEAs) for ion-channel-related drug studies. This work demonstrates that the supported lipid bilayers (SLBs) derived from both neuron-like (neuroblastoma) cells and primary neurons are integrated with OMEAs for the first time. The increased expression of voltage-gated calcium (CaV) ion channels on differentiated SH-SY5Y SLBs compared to non-differe …
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV), dengue virus (DENV) and Japanese encephalitis virus (JEV) belong to the family Flaviviridae. Their viral particles … re good candidates for the development of broad-spectrum antiviral drugs that target viral envelope lipid bilayers derived from the ER membrane.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apolipoprotein L-1 (APOL1), the trypanolytic factor of human serum, can lyse several African trypanosome species including Trypanosoma bruce … of full-length recombinant APOL1 induce ideally cation-selective macroscopic conductances in planar lipid bilayers. The conductances were highly sensitive to pH: their induction required acidic pH (pH 5.3), but their magnitude could be increased 3,000-fold upon alkalinization of the milieu (pK(a) = 7.1). We show that this phenomenon can be attributed to the asso …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Voltage-dependent K(+) (Kv) channels form the basis of the excitability of nerves and muscles. KvAP is a well-characterized archeal Kv channel that has been widely used to investigate many aspects of Kv channel biochemistry, biophysics, and structure. In this study, a minimal kinetic gating model for KvAP function in two different phospholipid decane bilayers is developed. In most aspects, KvAP gating is similar to the well-studied eukaryotic Shaker Kv channel: conformational changes occur within four voltage sensors, followed by pore opening. Unlike the Shaker Kv channel, KvAP possesses an in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1. We examined the effects of cations that bind to phospholipid bilayers on the calcium requirement for exocytosis in vitro. 2. Tetracaine and trifluoperazine, two monovalent cations that bind hydrophobically to lipid bilayers, decreased the zeta-potential of lipid vesicles with a phospholipid composition similar to sea urchin plasma membranes; the decrease in the magnitude of the negative zeta-potential was consistent with the Gouy-Chapman-Stern theory. 3. Trifluoperazine and tetracaine also increased the concentration of calcium required to produce half-maximal exocytosis (Ca50) in isolated …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The thinning of lipid bilayers during their main phase transition, as the outcome of the weakening of van der Waals interactions between their hydrocarbon chains and the hydration of the polar headgroup region, displays a peak at the specific temperature (Tm). The most common technique used for Tm determination is differential scanning calorimetry (DSC), which provides the required information straightforwardly and rapidly, but it cannot provide any details on the molecular-level events that underlie the main phase transition. To uncouple the impact of hydrogen bonding and (de)protonation in t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how membrane lipids interact with small-molecule drugs is crucial for applications in anesthetics, antibacterial agents, surfactants, and biopesticides. Key questions include identifying the factors that modulate drug affinity for target membranes and elucidating the mechanisms underlying their interactions and translocations across lipid bilayers. Molecular dynamics simulations are a widely used tool to characterize these interactions at a high resolution. Given the finely tuned lipid composition of different cell types and subcellular compartments, membrane models must account …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuronal cell death induced by cell membrane damage is one of the major hallmarks of neurodegenerative diseases. Neuroinflammation precedes the loss of neurons; however, whether and how inflammation-related proteins contribute to the loss of membrane integrity remains unknown. We employed a range of biophysical tools, including high-speed atomic force microscopy, fluorescence spectroscopy, and electrochemical impedance spectroscopy, to ascertain whether the pro-inflammatory protein S100A8 induces alterations in biomimetic lipid membranes upon interaction. Our findings underscore the crucial ro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increased efforts are being made for observing proteins in their native environments. Pulsed electron-electron double resonance spectroscopy (PELDOR, also known as DEER) is a powerful tool for this purpose. Conventionally, PELDOR employs an identical spin pair, which limits the output to a single distance for monomeric samples. Here, we show that the Gd3+-trityl-nitroxide (NO) three-spin system is a versatile tool to study heterooligomeric membrane protein complexes, even within their native membrane. This allowed for an independent determination of four different distances (Gd3+-trityl, Gd3+-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We used micropipette aspiration to directly measure the area compressibility modulus, bending modulus, lysis tension, lysis strain, and area expansion of fluid phase 1-stearoyl, 2-oleoyl phosphatidylcholine (SOPC) lipid bilayers exposed to aqueous solutions of short-chain alcohols at alcohol concentrations ranging from 0.1 to 9.8 M. The order of effectiveness in decreasing mechanical properties and increasing area per molecule was butanol>propanol>ethanol>methanol, although the lysis strain was invariant to alcohol chain-length. Quantitatively, the trend in area compressibility modulus follows…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive fungal infections remain a major clinical challenge due to limited antifungal drugs, drug toxicity, and resistance. Fungal infections trigger endoplasmic reticulum (ER) stress. However, the mechanism through which this stress response affects antifungal immunity remains unclear. Here, we showed that de novo triglyceride synthesis promotes antifungal innate immune signaling and proinflammatory gene expression in macrophages. Upon fungal stimulation, triglycerides induce ER lipid bilayer stress and activate the protein kinase R (PKR)-like ER kinase (PERK) branch of the unfolded protein
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования