BACKGROUND: Rickettsia rickettsii, Rickettsia parkeri, and Rickettsia akari are the most common causes of spotted fever group rickettsioses indigenous to the United States. Infected patients characteristically present with a maculopapular rash, often accompanied by an inoculation eschar. Skin biopsy specimens are often obtained from these lesions for diagnostic evaluation. However, a species-specific diagnosis is achieved infrequently from pathologic specimens because immunohistochemical stains do not differentiate among the causative agents of spotted fever group rickettsiae, and existing pol
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural sandfly infection by Leishmania spp. in an area endemic for American cutaneous leishmaniasis was analyzed using multiplex polymerase chain reaction (PCR). The sandflies were captured using Falcão light traps in an endemic area of the municipality of Doutor Camargo during March, April, and June 2008. In total, 1803 females were analyzed; 1755 were Nyssomyia neivai (Pinto) and 48 were Nyssomyia whitmani (Antunes and Coutinho). Multiplex PCR analyses using MP3H-MP1L and 5Llcac-3Llcac primers showed the presence of Leishmania (Viannia) spp. in 4/181 pools of sandflies, all Ny. neivai, that…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate detection of malaria infections, particularly asymptomatic and low-density infections, is essential for effective surveillance and control efforts. This study compared the performance of three malaria detection platforms for identifying Plasmodium falciparum infections in a community-based survey setting.
METHODS: Cross-sectional household surveys were conducted in three high-transmission districts in Malawi from February-March in 2022 and 2023. From 2960 participants, samples from 604 children aged 2 months to 14 years were analyzed for P. falciparum infection using thre
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pakistan faces a substantial burden of tropical diseases, including malaria, dengue, and typhoid fever, particularly in Sindh Province, where recent outbreaks and floods have further increased disease incidence, highlighting the urgent need for improved diagnostics and disease control. Currently, diagnosis relies on multiple laboratory tests, contributing to frequent empirical antimicrobial use due to many undiagnosed or misdiagnosed cases. This study aimed to validate a rapid molecular test for the early diagnosis of malaria, dengue, and typhoid infections, thereby facilitating ta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Infectious diseases and high-consequence infectious diseases (HCID), are often present in febrile travelers. Multiplex polymerase chain reaction (PCR) may help to confirm or rule out HCIDs and thus prevent a delay in treatment or undue isolation.
METHODS: The BioFire® FilmArray® Global Fever Panel-RUO was evaluated vs conventional methods in diagnostics in febrile returning travelers.
RESULTS: Eighty-two patients and three simulated patients with HCIDs were analyzed. A total of 10 of the 19 possible pathogens were detected by multiplex PCR. In 30 samples, at least one pathogen wa…
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction (PCR) is the standard in nucleic acid amplification technology for infectious disease pathogen detection and has been the primary diagnostic tool employed during the global COVID-19 pandemic. Various PCR technology adaptations, typically using two-oligonucleotide dye-binding methods or three-oligonucleotide hydrolysis probe systems, enable real-time multiplex target detection or single-base specificity for the identification of single-nucleotide polymorphisms (SNPs). A small number of two-oligonucleotide PCR systems facilitating both multiplex detection and SNP identi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Timely identification of etiological agents of enteric infections is necessary to reduce the burden of infantile diarrheal mortality. Nucleic acid amplification-based detection methods offer a quick, reliable way for diagnosis of microbes in clinical specimens. This study was undertaken to evaluate an easy-to-use, cost-effective multiplex conventional reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) assay developed at the Indian Council of Medical Research-National Institute of Cholera and Enteric Diseases virology laboratory to identify 4 common enteric viruses (rotavirus, norovirus,
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although viruses are the major pathogen that causes upper respiratory tract infection (URTI) and acute bronchitis, antibiotics have been prescribed. This was a prospective observational study in influenza epidemics that enrolled adult outpatients who visited a hospital with respiratory tract infection symptoms. In this study, we evaluated the usefulness of FilmArray respiratory panel (RP). Fifty patients were enrolled. FilmArray RP detected the pathogens in 28 patients. The common pathogens were influenza virus (n = 14), respiratory syncytial virus (n = 6), and human rhinovirus (n = 6). Of the
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current study describes the development of a set of 5 multiplex polymerase chain reaction (mPCR) assays for the simultaneous detection of abortive infection agents in bovine fetal tissues, including Brucella spp., Leptospira spp., and Campylobacter fetus (mPCR1); Hammondia heydorni, Neospora caninum, and Toxoplasma gondii (mPCR2); Coxiella burnetii and Chlamydophila psittaci (mPCR3); Mycoplasma bovis, Mycoplasma bovigenitalium, and Ureaplasma diversum (mPCR4); and Bovine viral diarrhea virus (BVDV) and Bovine herpesvirus-1 (BoHV-1; mPCR5). The protocol was tested on different tissue sample…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex reverse transcription-nested polymerase chain reaction (RT-nPCR) method was developed for the detection and differentiation of wild-type and vaccine strains of canine distemper virus (CDV). A pair of primers (P1 and P4) specific for CDV corresponding to the highly conserved region of the CDV genome were used as a common primer pair in the first-round PCR of the nested PCR. Primers P2 specific for CDV wild-type strains, were used as the forward primer together with the common reverse primer P4 in the second round of nested PCR. Primers P3, P5 specific for CDV wild-type strain or vac
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute infectious gastroenteritis is a major contributor to morbidity and mortality globally. Currently, traditional laboratory diagnostic methods, mainly microscopy and culture, are the mainstay of detecting faecal pathogens in most low- and middle-income countries (LMICs). These methods are time-consuming, laborious, have long turnaround times and poor sensitivity. Carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) have become pathogens of global public health concern. Due to their niche within the human body, CPE can be detected using faecal sampling. Many laboratories use culture-based methods
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background This prospective study assessed the performance of a commercial multiplex polymerase chain reaction (PCR) panel in diagnosing periprosthetic joint infection (PJI). Methods Synovial fluid samples from hip and knee arthroplasties, submitted to a clinical diagnostic laboratory for PJI workup, were tested with multiplex PCR to identify a specific panel of organisms. Clinical biomarker test results and microbiological culture were used to classify samples as 'not infected', 'inconclusive', and 'infected' using a modified 2018 International Consensus Meeting (ICM) criteria for PJI. The pu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: We aimed to assess whether detection of respiratory bacteria by multiplex polymerase chain reaction (PCR) testing associates with clinical outcomes in acutely ill children.
METHODS: This cross-sectional study enrolled children under the age of 18 with a suspected respiratory infection treated in a paediatric emergency department of Oulu University Hospital, Finland from January 2015 through December 2015. Nasopharyngeal samples were routinely analysed for 16 respiratory viruses and later, after storage, analysed with a multiplex PCR panel for seven respiratory bacteria.
RESULTS: At leas…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Accurate etiological diagnosis of meningitis is important, but difficult in resource-limited settings due to prior administration of antibiotics and lack of viral diagnostics. We aimed to develop and validate 2 real-time multiplex PCR (RT-PCR) assays for the detection of common causes of community-acquired bacterial and viral meningitis in South African children.
METHODS: We developed 2 multiplex RT- PCRs for detection of S. pneumoniae, N. meningitidis, H. influenzae, enteroviruses, mumps virus and herpes simplex virus. We tested residual CSF samples from children presenting to
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The BioFire®FilmArray® meningitis/encephalitis panel (ME panel)identifies 14 cerebrospinal fluid (CSF) pathogens. It has not been studied in Thailand,where the epidemiology of central nervous system (CNS) infection may differ from thatof countries with temperate climates. We conducted a study to evaluate theperformance of the ME panel in Thai children.
METHOD: We conducted a prospective study in children suspected of meningitis orencephalitis at the Queen Sirikit National Institute of Child Health in Bangkok, Thailand.In addition to routine tests, CSF was tested simultaneously wit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Goat is one of the major livestock species, plays an important role in the economy of Bangladesh. However, the outbreak of different infectious diseases in goats causes high mortality and economic losses due to lack of proper diagnosis and treatment. Conventional culture-based methods for detecting specific pathogens as confirmatory diagnosis are laborious as well as time-consuming in comparison to multiplex polymerase chain reaction (mPCR), by which multiple pathogens can be detected at a time. The present study was aimed to perform faster molecular identification of bacte…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningoencephalitis is a syndrome of multiple etiologies associated with important morbidity and mortality. It may be caused by various infectious agents (viruses, bacteria, parasites and fungi). Establishing the etiology of meningoencephalitis is crucial for early and specific treatment. Molecular assays such as the multiplex polymerase chain reaction (PCR) offer an alternative in diagnosing central nervous system infections. This study aimed to describe the performance of an automated multiplex molecular test from patients with suspected meningitis and meningoencephalitis in a tertiary refer…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epidemiologic studies with the least selection bias do not support the hypothesis that HPV types 16 and/or 18 are strongly associated with cervical cancer. In this preliminary report, we describe our findings regarding type 16, 18, and 33 detection rates in 323 normal and 71 dysplastic or neoplastic cervical scrapes using fast multiplex PCR. This modified PCR technique has been shown to be the most sensitive, specific, and reproducible DNA detection method for large epidemiologic studies. The results indicate a high relative risk of increasingly severe cervical abnormality associated with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hospital-acquired pneumonia (HAP) and ventilator-associated pneumonia (VAP) are common among critically ill patients, leading to increased morbidity and mortality rates. Conventional culture-based diagnostics require 48-72 hours, which delays pathogen identification and prolongs the use of broad-spectrum antibiotics. Multiplex polymerase chain reaction (mPCR) enables the rapid detection of pathogens and resistance genes, but its effects on real-world antibiotic decision-making remain unclear.
METHODS: This retrospective study included patients in the intensive care unit who were d…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infectious agents associated with community-acquired acute respiratory infections (ARIs) remain understudied in Lebanon. We aim to assess the microbiological profiles of ARIs by employing polymerase chain reaction (PCR) and identifying predictors of positive PCR results among patients admitted for ARI.
METHODS AND RESULTS: We conducted a retrospective single-center study at the American University of Beirut Medical Center, including all respiratory PCR panels performed on pediatric (< 18) and adult (≥ 18) patients presenting with an ARI from January 2015 to March 2018, prior to th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.